EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012204 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6254 bases
Position: chrCCOE01005183.1:1367653-1373906
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000015716	MMR_HSR1	PF01926.23	5.3e-09	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000016130	-	702	-	ENSACIP00000015716	233 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACIG00000012204	-	73	31.937	ENSACIG00000009149	-	63	30.526
ENSACIG00000012204	-	69	46.875	ENSACIG00000000976	-	78	46.875
ENSACIG00000012204	-	72	52.663	ENSACIG00000022370	-	59	52.663
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ENSACIG00000012204	-	76	61.017	ENSACIG00000007178	-	61	61.017
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ENSACIG00000012204	-	73	40.000	ENSACIG00000005587	-	58	40.000
ENSACIG00000012204	-	73	37.143	ENSACIG00000014670	-	66	36.571
ENSACIG00000012204	-	75	47.701	ENSACIG00000008045	-	71	42.593
ENSACIG00000012204	-	72	43.452	ENSACIG00000012061	-	50	43.452
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ENSACIG00000012204	-	72	42.604	ENSACIG00000020244	-	70	42.604
ENSACIG00000012204	-	81	44.560	ENSACIG00000014703	-	79	44.560
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ENSACIG00000012204	-	78	55.495	ENSACIG00000016313	-	57	55.495
ENSACIG00000012204	-	71	73.333	ENSACIG00000012761	-	72	73.333
ENSACIG00000012204	-	74	58.382	ENSACIG00000022222	-	55	58.382
ENSACIG00000012204	-	72	53.571	ENSACIG00000022366	-	60	53.571
ENSACIG00000012204	-	55	45.455	ENSACIG00000001465	-	81	45.455
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ENSACIG00000012204	-	71	45.455	ENSACIG00000004040	-	64	45.455
ENSACIG00000012204	-	78	75.138	ENSACIG00000005223	-	69	75.138
ENSACIG00000012204	-	73	47.647	ENSACIG00000014655	-	63	47.059
ENSACIG00000012204	-	72	49.102	ENSACIG00000003582	-	56	48.000
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ENSACIG00000012204	-	72	35.196	ENSACIG00000009811	-	69	35.196
ENSACIG00000012204	-	72	47.619	ENSACIG00000001596	-	65	47.619
ENSACIG00000012204	-	56	36.957	ENSACIG00000014730	zgc:172131	70	36.957
ENSACIG00000012204	-	70	45.783	ENSACIG00000020225	-	55	45.783

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012204	-	83	61.224	ENSAPOG00000002337	-	63	61.224	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	71	37.349	ENSAPOG00000008529	-	64	37.349	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	53	38.281	ENSAPOG00000008819	-	58	37.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	70	44.311	ENSAPOG00000021365	-	52	44.311	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	69	67.284	ENSAPOG00000007631	-	75	67.284	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	80	61.828	ENSAPOG00000009059	-	92	61.828	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	70	36.686	ENSAPOG00000002517	-	56	36.686	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	82	65.641	ENSAPOG00000018915	-	83	65.641	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	81	64.583	ENSAPOG00000001075	-	88	64.583	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	68	35.220	ENSAPOG00000002527	-	51	34.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	85	58.416	ENSAPOG00000007123	-	74	58.416	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	74	54.913	ENSAPOG00000010738	-	55	54.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	76	37.500	ENSAPOG00000009288	-	65	37.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	82	51.596	ENSAPOG00000022321	-	84	51.596	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012204	-	73	39.766	ENSAOCG00000007815	-	63	39.535	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012204	-	70	41.071	ENSAOCG00000015984	-	52	41.071	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012204	-	72	46.784	ENSAOCG00000013326	-	59	46.784	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012204	-	72	35.714	ENSAOCG00000016099	-	73	35.714	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012204	-	73	65.680	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	67	65.680	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000012204	-	76	59.551	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	76	67.593	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012204	-	74	47.458	ENSAPEG00000019003	-	67	47.458	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012204	-	71	39.157	ENSAPEG00000013508	-	69	39.157	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012204	-	72	35.714	ENSAPEG00000002121	-	73	35.714	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012204	-	72	34.731	ENSAPEG00000002163	-	57	34.731	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012204	-	73	42.286	ENSAPEG00000003513	-	79	50.877	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000012204	-	60	68.345	ENSATEG00000011771	-	78	68.345	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012204	-	70	42.683	ENSATEG00000010966	-	69	42.683	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012204	-	85	69.307	ENSATEG00000011918	-	67	69.307	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012204	-	59	71.739	ENSATEG00000011891	-	86	71.739	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012204	-	76	61.236	ENSATEG00000011789	-	54	61.236	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012204	-	83	70.051	ENSATEG00000011814	-	62	70.984	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000012204	-	79	74.860	ENSATEG00000011635	-	70	74.860	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000012204	-	86	67.157	ENSATEG00000011953	-	57	67.157	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000012204	-	73	66.082	ENSATEG00000011712	-	66	66.082	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012204	-	73	36.686	ENSATEG00000017209	-	63	36.686	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012204	-	72	70.060	ENSATEG00000011978	-	84	70.060	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000012204	-	74	75.723	ENSATEG00000011837	-	54	77.640	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000012204	-	71	43.976	ENSACLG00000003393	-	66	43.976	Astatotilapia_calliptera
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