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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012292 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: prpf38a
Alias: fa04h11|fc83e08|wu:fa04h11|wu:fc83e08|zgc:92059
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30270 bases
Position: chrCCOE01000761.1:53689-83958
Accession: ZDB-GENE-040801-225
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000015851	PRP38	PF03371.15	5.6e-59	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016265	-	906	-	ENSACIP00000015851	301 (aa)	-	-

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSG00000134748	PRPF38A	71	86.425	Homo_sapiens
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	93.851	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	93.851	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	71	86.425	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	93.851	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	93.851	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	93.851	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	93.851	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012292	prpf38a	72	91.855	ENSATEG00000004608	prpf38a	72	91.855	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012292	prpf38a	54	82.530	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	63	83.333	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	75.641	ENSACAG00000008249	PRPF38A	71	86.878	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSANAG00000027839	PRPF38A	71	86.425	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	59.486	ENSANAG00000029204	-	70	55.357	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000012292	prpf38a	72	93.665	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	93.528	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012292	prpf38a	74	91.593	ENSAMXG00000029274	prpf38a	72	91.593	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012292	prpf38a	83	81.853	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	75	86.425	Bos_taurus
ENSACIG00000012292	prpf38a	64	63.077	WBGene00008380	prp-38	59	64.894	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000012292	prpf38a	83	81.853	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	74	86.425	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	71	86.425	Canis_familiaris
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	71	86.425	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	71	86.425	Capra_hircus
ENSACIG00000012292	prpf38a	62	81.915	ENSTSYG00000031994	-	63	82.584	Carlito_syrichta
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSTSYG00000009868	-	71	86.425	Carlito_syrichta
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	83.871	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	71	86.425	Cavia_porcellus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	100	76.527	Cebus_capucinus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCATG00000032296	PRPF38A	71	86.425	Cercocebus_atys
ENSACIG00000012292	prpf38a	93	52.265	ENSCATG00000044190	-	57	55.615	Cercocebus_atys
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	71	86.425	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	86.147	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	71	86.878	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	68.831	ENSCSAVG00000009580	-	71	70.968	Ciona_savignyi
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCANG00000032608	PRPF38A	74	86.425	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000012292	prpf38a	85	71.318	ENSCGRG00001002557	-	74	74.091	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCGRG00001018502	-	71	86.425	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	71	86.425	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000012292	prpf38a	96	95.139	ENSCSEG00000001269	prpf38a	100	95.139	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000012292	prpf38a	73	92.857	ENSCVAG00000012305	prpf38a	72	92.857	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012292	prpf38a	74	89.823	ENSDARG00000039213	prpf38a	72	89.823	Danio_rerio
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	72	86.425	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000012292	prpf38a	85	74.330	ENSDORG00000023691	-	75	80.275	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	70.742	ENSDORG00000023857	-	66	70.776	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000012292	prpf38a	85	74.330	ENSDORG00000025371	-	75	80.275	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000012292	prpf38a	67	70.244	FBgn0050342	Prp38	90	52.365	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000012292	prpf38a	78	78.661	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	78.475	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSEASG00005014427	PRPF38A	71	86.425	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSECAG00000022628	PRPF38A	71	86.425	Equus_caballus
ENSACIG00000012292	prpf38a	73	90.541	ENSELUG00000021094	prpf38a	75	90.541	Esox_lucius
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	71	86.425	Felis_catus
ENSACIG00000012292	prpf38a	99	74.510	ENSFALG00000003612	-	73	82.110	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000012292	prpf38a	62	84.043	ENSFALG00000005598	-	66	84.831	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	83.819	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	72	86.425	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000012292	prpf38a	74	92.478	ENSFHEG00000014317	prpf38a	77	92.478	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012292	prpf38a	54	94.578	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	94.578	Gadus_morhua
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	75.962	ENSGALG00000010627	PRPF38A	71	87.330	Gallus_gallus
ENSACIG00000012292	prpf38a	72	92.760	ENSGAFG00000012422	prpf38a	72	92.760	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012292	prpf38a	72	90.583	ENSGACG00000005423	prpf38a	72	90.583	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	86.147	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	71	86.878	Gopherus_agassizii
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ENSACIG00000012292	prpf38a	62	95.767	ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	95.745	Haplochromis_burtoni
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ENSACIG00000012292	prpf38a	100	74.593	ENSHGLG00100003928	-	71	75.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000012292	prpf38a	59	93.407	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	93.617	Hippocampus_comes
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	89.655	ENSIPUG00000005757	prpf38a	71	89.640	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	71	86.425	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSACIG00000012292	prpf38a	73	92.793	ENSKMAG00000006588	prpf38a	72	92.793	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000012292	prpf38a	96	85.714	ENSLBEG00000020585	prpf38a	72	91.441	Labrus_bergylta
ENSACIG00000012292	prpf38a	74	87.168	ENSLACG00000011495	PRPF38A	72	87.168	Latimeria_chalumnae
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ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	71	86.425	Loxodonta_africana
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ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	71	86.425	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	94.498	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	94.498	Mastacembelus_armatus
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ENSACIG00000012292	prpf38a	76	86.580	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	74	87.330	Meleagris_gallopavo
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ENSACIG00000012292	prpf38a	84	90.661	ENSMMOG00000016972	prpf38a	100	94.079	Mola_mola
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	83.621	ENSMODG00000000644	PRPF38A	71	84.234	Monodelphis_domestica
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ENSACIG00000012292	prpf38a	100	75.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026269	Prpf38a	71	85.973	Mus_caroli
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ENSACIG00000012292	prpf38a	100	75.000	MGP_PahariEiJ_G0028602	Prpf38a	71	85.973	Mus_pahari
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	75.321	MGP_SPRETEiJ_G0027238	Prpf38a	93	90.426	Mus_spretus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSMPUG00000006896	PRPF38A	71	86.425	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	83.117	ENSNGAG00000011884	Prpf38a	72	86.425	Nannospalax_galili
ENSACIG00000012292	prpf38a	100	95.695	ENSNBRG00000004013	prpf38a	98	95.695	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000012292	prpf38a	97	57.000	ENSNLEG00000012592	-	67	56.364	Nomascus_leucogenys
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ENSACIG00000012292	prpf38a	93	51.557	ENSNLEG00000033398	-	60	51.152	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	81.818	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	71	82.353	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000012292	prpf38a	75	85.965	ENSOPRG00000008985	PRPF38A	92	86.425	Ochotona_princeps
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSODEG00000005869	PRPF38A	71	86.425	Octodon_degus
ENSACIG00000012292	prpf38a	72	93.213	ENSONIG00000007816	prpf38a	72	93.213	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	45.259	ENSOANG00000009541	-	71	43.946	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	71	86.425	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACIG00000012292	prpf38a	96	87.415	ENSORLG00015021393	prpf38a	75	93.243	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000012292	prpf38a	96	86.395	ENSOMEG00000016333	prpf38a	72	91.892	Oryzias_melastigma
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ENSACIG00000012292	prpf38a	76	85.714	ENSOARG00000005373	PRPF38A	71	86.425	Ovis_aries
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