EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012648 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6066 bases
Position: chrCCOE01000512.1:9066-15131
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000016258	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016691	-	894	-	ENSACIP00000016258	297 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000012648	-	76	44.589	ENSACIG00000014690	-	88	44.589
ENSACIG00000012648	-	86	65.748	ENSACIG00000006484	-	76	65.748
ENSACIG00000012648	-	60	34.078	ENSACIG00000003050	-	78	34.078
ENSACIG00000012648	-	69	52.941	ENSACIG00000007466	-	81	52.941
ENSACIG00000012648	-	77	39.381	ENSACIG00000005573	-	91	39.381
ENSACIG00000012648	-	88	70.115	ENSACIG00000019149	-	84	67.754
ENSACIG00000012648	-	78	40.693	ENSACIG00000016502	-	98	40.693
ENSACIG00000012648	-	53	46.203	ENSACIG00000000976	-	77	46.203
ENSACIG00000012648	-	74	47.059	ENSACIG00000007494	-	71	47.964
ENSACIG00000012648	-	65	41.089	ENSACIG00000007725	-	70	41.089
ENSACIG00000012648	-	90	64.727	ENSACIG00000005198	-	50	64.727
ENSACIG00000012648	-	77	48.908	ENSACIG00000001070	-	80	48.908
ENSACIG00000012648	-	71	50.476	ENSACIG00000004245	-	74	50.476
ENSACIG00000012648	-	90	92.164	ENSACIG00000022355	-	91	92.164
ENSACIG00000012648	-	69	48.293	ENSACIG00000014646	zgc:113625	79	48.293
ENSACIG00000012648	-	66	32.673	ENSACIG00000003906	-	66	32.673
ENSACIG00000012648	-	83	65.041	ENSACIG00000005780	-	76	64.173
ENSACIG00000012648	-	69	45.854	ENSACIG00000020234	-	71	45.854
ENSACIG00000012648	-	73	40.000	ENSACIG00000012061	-	66	40.000
ENSACIG00000012648	-	69	57.767	ENSACIG00000007178	-	71	57.767
ENSACIG00000012648	-	60	38.172	ENSACIG00000014737	-	84	38.172
ENSACIG00000012648	-	78	54.978	ENSACIG00000002263	-	81	54.978
ENSACIG00000012648	-	84	55.422	ENSACIG00000022222	-	79	55.422
ENSACIG00000012648	-	88	39.867	ENSACIG00000000893	-	79	47.236
ENSACIG00000012648	-	61	41.935	ENSACIG00000014670	-	70	41.935
ENSACIG00000012648	-	57	49.708	ENSACIG00000000631	-	58	49.708
ENSACIG00000012648	-	72	45.833	ENSACIG00000020244	-	90	45.833
ENSACIG00000012648	-	67	46.231	ENSACIG00000014703	-	81	46.231
ENSACIG00000012648	-	67	59.296	ENSACIG00000012707	-	75	59.296
ENSACIG00000012648	-	69	73.171	ENSACIG00000006478	-	76	73.171
ENSACIG00000012648	-	68	50.249	ENSACIG00000019524	-	83	50.249
ENSACIG00000012648	-	71	54.976	ENSACIG00000001455	-	77	54.976
ENSACIG00000012648	-	84	54.941	ENSACIG00000016313	-	79	54.941
ENSACIG00000012648	-	80	51.681	ENSACIG00000023381	-	87	51.681
ENSACIG00000012648	-	62	70.109	ENSACIG00000012204	-	79	70.109
ENSACIG00000012648	-	65	30.876	ENSACIG00000009149	-	72	30.876
ENSACIG00000012648	-	70	60.963	ENSACIG00000007158	-	66	59.585
ENSACIG00000012648	-	88	46.642	ENSACIG00000008001	-	96	46.642
ENSACIG00000012648	-	75	52.838	ENSACIG00000022366	-	82	52.838
ENSACIG00000012648	-	71	53.081	ENSACIG00000022362	-	75	53.081
ENSACIG00000012648	-	67	47.000	ENSACIG00000014655	-	74	47.000
ENSACIG00000012648	-	67	49.500	ENSACIG00000020225	-	77	44.715
ENSACIG00000012648	-	99	80.743	ENSACIG00000016635	-	99	80.743
ENSACIG00000012648	-	53	74.051	ENSACIG00000012761	-	69	74.051
ENSACIG00000012648	-	70	44.444	ENSACIG00000014680	-	89	44.444
ENSACIG00000012648	-	68	34.483	ENSACIG00000019509	-	90	34.483
ENSACIG00000012648	-	61	75.275	ENSACIG00000005223	-	70	75.275
ENSACIG00000012648	-	70	41.284	ENSACIG00000005587	-	75	41.284
ENSACIG00000012648	-	61	34.807	ENSACIG00000007737	-	70	35.106
ENSACIG00000012648	-	68	46.305	ENSACIG00000014634	zgc:113625	94	42.017
ENSACIG00000012648	-	65	48.223	ENSACIG00000001596	-	77	48.223
ENSACIG00000012648	-	62	45.902	ENSACIG00000015088	-	72	45.902
ENSACIG00000012648	-	73	47.511	ENSACIG00000006503	-	68	47.511
ENSACIG00000012648	-	78	47.639	ENSACIG00000012159	-	67	45.076
ENSACIG00000012648	-	79	45.957	ENSACIG00000003582	-	75	45.957
ENSACIG00000012648	-	92	42.182	ENSACIG00000016888	-	87	42.182
ENSACIG00000012648	-	62	36.126	ENSACIG00000009811	-	77	36.126
ENSACIG00000012648	-	72	48.837	ENSACIG00000004040	-	83	48.837
ENSACIG00000012648	-	59	49.432	ENSACIG00000008666	-	84	49.432
ENSACIG00000012648	-	67	46.465	ENSACIG00000014745	-	89	46.465
ENSACIG00000012648	-	91	66.667	ENSACIG00000002950	-	72	66.667
ENSACIG00000012648	-	61	69.444	ENSACIG00000022374	-	92	69.444
ENSACIG00000012648	-	71	53.555	ENSACIG00000022377	-	76	53.081
ENSACIG00000012648	-	73	54.167	ENSACIG00000022370	-	81	52.361
ENSACIG00000012648	-	70	46.635	ENSACIG00000014662	-	84	46.635
ENSACIG00000012648	-	86	55.078	ENSACIG00000007191	-	71	55.078
ENSACIG00000012648	-	70	52.632	ENSACIG00000008045	-	75	53.769
ENSACIG00000012648	-	67	44.444	ENSACIG00000014716	-	79	44.444
ENSACIG00000012648	-	85	40.152	ENSACIG00000012714	-	88	40.152
ENSACIG00000012648	-	93	46.182	ENSACIG00000012718	-	87	58.852

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012648	-	89	50.741	ENSAPOG00000001447	-	90	50.741	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012648	-	72	69.951	ENSAOCG00000022545	-	66	64.286	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012648	-	69	70.103	ENSAOCG00000013686	-	89	70.103	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012648	-	85	57.258	ENSAOCG00000001095	-	66	55.235	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012648	-	73	56.931	ENSAOCG00000002389	-	83	56.931	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012648	-	80	33.500	ENSAOCG00000004245	-	76	33.500	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012648	-	80	54.622	ENSAPEG00000021634	-	79	54.622	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012648	-	86	60.784	ENSATEG00000011735	-	68	60.784	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012648	-	86	57.895	ENSATEG00000011352	-	62	57.895	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012648	-	90	64.202	ENSATEG00000012058	-	68	64.202	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012648	-	86	55.469	ENSATEG00000011330	-	52	53.597	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012648	-	86	56.299	ENSATEG00000011336	-	65	54.135	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012648	-	85	65.737	ENSACLG00000005669	-	88	65.737	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	84	56.800	ENSACLG00000024836	-	91	56.800	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	87	67.829	ENSACLG00000005220	-	62	67.829	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	85	57.312	ENSACLG00000009780	-	77	57.312	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	92	64.000	ENSACLG00000012195	-	66	64.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	85	56.917	ENSACLG00000009774	-	68	56.917	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	88	61.475	ENSACLG00000004980	-	63	61.475	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	70	65.639	ENSACLG00000005066	-	81	65.639	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	90	56.972	ENSACLG00000024857	-	53	55.725	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	85	61.660	ENSACLG00000024854	-	83	61.660	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012648	-	62	49.730	ENSAMXG00000039685	-	78	49.730	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	80	46.862	ENSAMXG00000036745	-	80	46.862	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	71	52.133	ENSAMXG00000030926	-	63	50.877	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	86	49.412	ENSAMXG00000024930	-	84	49.412	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	86	52.756	ENSAMXG00000030783	-	75	52.756	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	87	47.407	ENSAMXG00000030288	-	77	47.407	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	86	58.447	ENSAMXG00000037741	-	98	58.447	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	59	55.172	ENSAMXG00000030826	-	84	55.172	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	86	50.201	ENSAMXG00000041224	-	60	50.201	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	86	40.559	ENSAMXG00000030715	-	68	42.748	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012648	-	94	48.387	ENSCVAG00000018481	-	66	48.387	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012648	-	82	55.042	ENSDARG00000086048	si:ch211-229i14.2	79	52.874	Danio_rerio
ENSACIG00000012648	-	94	53.462	ENSELUG00000005405	-	85	51.087	Esox_lucius
ENSACIG00000012648	-	93	50.385	ENSELUG00000015135	-	68	46.831	Esox_lucius
ENSACIG00000012648	-	91	53.846	ENSELUG00000015076	si:ch211-229i14.2	52	53.846	Esox_lucius
ENSACIG00000012648	-	91	53.077	ENSELUG00000015106	-	64	53.077	Esox_lucius
ENSACIG00000012648	-	86	68.726	ENSFHEG00000011334	-	60	68.726	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012648	-	68	69.951	ENSFHEG00000019202	-	55	65.152	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012648	-	92	66.000	ENSFHEG00000000207	-	62	66.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012648	-	85	37.811	ENSFHEG00000007909	-	78	37.811	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012648	-	71	48.372	ENSFHEG00000021828	-	92	48.372	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012648	-	78	68.670	ENSFHEG00000013865	-	55	68.293	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012648	-	70	31.818	ENSGMOG00000006359	-	94	32.547	Gadus_morhua
ENSACIG00000012648	-	93	61.328	ENSGAFG00000015917	-	70	61.328	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012648	-	86	58.871	ENSGAFG00000001852	-	64	58.871	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012648	-	85	55.696	ENSGAFG00000015999	-	58	55.696	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012648	-	89	61.364	ENSGACG00000013107	-	78	61.364	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012648	-	72	56.744	ENSGACG00000002627	-	89	55.652	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012648	-	92	66.058	ENSHBUG00000011156	-	84	66.058	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012648	-	62	74.457	ENSHBUG00000020672	-	84	74.457	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012648	-	86	56.977	ENSHBUG00000002999	-	92	56.977	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012648	-	67	55.000	ENSHBUG00000003010	-	64	55.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012648	-	84	67.742	ENSHBUG00000006928	-	77	67.742	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012648	-	92	64.000	ENSHBUG00000010247	-	66	64.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012648	-	74	68.493	ENSHBUG00000000157	-	82	68.610	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012648	-	92	51.504	ENSIPUG00000004161	-	59	51.504	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000012648	-	87	47.521	ENSIPUG00000004131	-	73	45.926	Ictalurus_punctatus
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