EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012707 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4879 bases
Position: chrCCOE01000183.1:588823-593701
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000016314	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016748	-	789	-	ENSACIP00000016314	262 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000012707	-	52	45.714	ENSACIG00000001465	-	84	45.714
ENSACIG00000012707	-	79	45.673	ENSACIG00000020234	-	73	45.673
ENSACIG00000012707	-	78	56.522	ENSACIG00000016635	-	78	56.522
ENSACIG00000012707	-	78	58.216	ENSACIG00000006478	-	79	58.216
ENSACIG00000012707	-	76	47.525	ENSACIG00000014634	zgc:113625	80	47.059
ENSACIG00000012707	-	75	63.452	ENSACIG00000007191	-	55	63.452
ENSACIG00000012707	-	76	55.224	ENSACIG00000006484	-	61	55.224
ENSACIG00000012707	-	77	53.398	ENSACIG00000001455	-	74	53.398
ENSACIG00000012707	-	75	48.223	ENSACIG00000004040	-	77	48.223
ENSACIG00000012707	-	76	54.412	ENSACIG00000023381	-	79	54.412
ENSACIG00000012707	-	74	41.951	ENSACIG00000012061	-	61	41.951
ENSACIG00000012707	-	79	45.894	ENSACIG00000000893	-	83	45.894
ENSACIG00000012707	-	77	50.490	ENSACIG00000001070	-	72	50.490
ENSACIG00000012707	-	76	49.010	ENSACIG00000014662	-	81	49.010
ENSACIG00000012707	-	76	50.000	ENSACIG00000022370	-	71	50.000
ENSACIG00000012707	-	76	51.244	ENSACIG00000022377	-	73	51.244
ENSACIG00000012707	-	76	42.211	ENSACIG00000016502	-	85	42.211
ENSACIG00000012707	-	76	49.261	ENSACIG00000014703	-	82	49.261
ENSACIG00000012707	-	79	53.365	ENSACIG00000008045	-	78	53.365
ENSACIG00000012707	-	68	33.146	ENSACIG00000007737	-	70	32.065
ENSACIG00000012707	-	76	61.194	ENSACIG00000019149	-	62	61.084
ENSACIG00000012707	-	85	46.491	ENSACIG00000014655	-	83	46.491
ENSACIG00000012707	-	73	42.268	ENSACIG00000012714	-	63	42.268
ENSACIG00000012707	-	76	55.500	ENSACIG00000012159	-	52	55.500
ENSACIG00000012707	-	61	60.736	ENSACIG00000022374	-	83	60.736
ENSACIG00000012707	-	79	41.346	ENSACIG00000015088	-	81	41.346
ENSACIG00000012707	-	76	45.274	ENSACIG00000020225	-	68	45.274
ENSACIG00000012707	-	60	66.250	ENSACIG00000012761	-	70	66.250
ENSACIG00000012707	-	62	44.785	ENSACIG00000000976	-	81	44.785
ENSACIG00000012707	-	75	48.259	ENSACIG00000014680	-	86	48.259
ENSACIG00000012707	-	79	37.500	ENSACIG00000005573	-	88	37.500
ENSACIG00000012707	-	76	47.549	ENSACIG00000006503	-	62	47.549
ENSACIG00000012707	-	75	59.296	ENSACIG00000012648	-	67	59.296
ENSACIG00000012707	-	77	78.109	ENSACIG00000016313	-	63	78.109
ENSACIG00000012707	-	62	45.062	ENSACIG00000000631	-	56	45.062
ENSACIG00000012707	-	74	65.641	ENSACIG00000007158	-	58	65.482
ENSACIG00000012707	-	77	78.218	ENSACIG00000022222	-	65	78.218
ENSACIG00000012707	-	69	46.995	ENSACIG00000001596	-	71	46.995
ENSACIG00000012707	-	69	62.842	ENSACIG00000005223	-	72	61.497
ENSACIG00000012707	-	72	35.938	ENSACIG00000014670	-	74	35.938
ENSACIG00000012707	-	62	36.416	ENSACIG00000014730	zgc:172131	83	36.416
ENSACIG00000012707	-	72	38.776	ENSACIG00000014737	-	89	38.776
ENSACIG00000012707	-	75	44.221	ENSACIG00000020244	-	84	44.221
ENSACIG00000012707	-	76	50.990	ENSACIG00000004245	-	71	50.990
ENSACIG00000012707	-	76	60.697	ENSACIG00000002950	-	54	60.697
ENSACIG00000012707	-	75	33.498	ENSACIG00000009811	-	82	33.498
ENSACIG00000012707	-	69	34.946	ENSACIG00000007725	-	67	34.946
ENSACIG00000012707	-	72	30.986	ENSACIG00000009149	-	71	30.986
ENSACIG00000012707	-	68	49.724	ENSACIG00000008666	-	86	49.724
ENSACIG00000012707	-	71	32.447	ENSACIG00000019509	-	86	32.447
ENSACIG00000012707	-	75	48.259	ENSACIG00000014745	-	89	48.259
ENSACIG00000012707	-	86	58.079	ENSACIG00000007178	-	80	58.079
ENSACIG00000012707	-	78	45.631	ENSACIG00000008001	-	88	45.631
ENSACIG00000012707	-	76	50.746	ENSACIG00000003582	-	65	50.490
ENSACIG00000012707	-	72	32.804	ENSACIG00000003050	-	84	32.804
ENSACIG00000012707	-	76	51.244	ENSACIG00000014690	-	76	51.244
ENSACIG00000012707	-	76	99.500	ENSACIG00000012718	-	84	99.500
ENSACIG00000012707	-	76	51.244	ENSACIG00000022366	-	72	51.500
ENSACIG00000012707	-	77	50.000	ENSACIG00000022362	-	72	50.000
ENSACIG00000012707	-	77	60.591	ENSACIG00000005780	-	62	60.591
ENSACIG00000012707	-	77	50.244	ENSACIG00000007466	-	80	50.244
ENSACIG00000012707	-	76	48.020	ENSACIG00000014716	-	80	48.020
ENSACIG00000012707	-	81	32.273	ENSACIG00000003906	-	71	32.273
ENSACIG00000012707	-	64	63.314	ENSACIG00000012204	-	73	63.314
ENSACIG00000012707	-	78	47.059	ENSACIG00000019524	-	85	47.059
ENSACIG00000012707	-	76	48.756	ENSACIG00000016888	-	65	48.756
ENSACIG00000012707	-	78	37.674	ENSACIG00000005587	-	74	37.674
ENSACIG00000012707	-	76	54.146	ENSACIG00000002263	-	71	54.146
ENSACIG00000012707	-	76	48.768	ENSACIG00000014646	zgc:113625	78	48.768
ENSACIG00000012707	-	78	47.368	ENSACIG00000007494	-	67	48.325
ENSACIG00000012707	-	76	58.209	ENSACIG00000022355	-	69	58.209

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012707	-	74	67.526	ENSAPOG00000010738	-	63	67.526	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	79	69.231	ENSAPOG00000022321	-	86	69.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	76	63.861	ENSAPOG00000001075	-	93	63.861	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	76	39.706	ENSAPOG00000000066	-	56	39.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	74	38.537	ENSAPOG00000009288	-	76	38.537	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	63	63.095	ENSAPOG00000007631	-	78	63.095	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	75	58.794	ENSAPOG00000007123	-	73	58.794	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	74	34.146	ENSAPOG00000002527	-	66	34.146	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	76	58.706	ENSAPOG00000018915	-	86	58.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	75	43.367	ENSAPOG00000021365	-	64	43.367	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	86	33.333	ENSAPOG00000002517	-	82	33.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	81	57.895	ENSAPOG00000009059	-	90	59.770	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	74	54.872	ENSAPOG00000020108	-	57	54.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	97	61.881	ENSAPOG00000002337	-	77	61.881	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	76	36.000	ENSAPOG00000008529	-	77	36.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	60	33.129	ENSAPOG00000008819	-	72	34.356	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012707	-	61	40.000	ENSAOCG00000007815	-	59	40.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012707	-	74	35.468	ENSAOCG00000016099	-	89	35.468	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012707	-	75	41.327	ENSAOCG00000015984	-	64	41.327	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012707	-	76	46.000	ENSAOCG00000013326	-	71	46.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012707	-	66	60.345	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	69	60.345	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012707	-	74	35.468	ENSAPEG00000002121	-	89	35.468	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	79	65.217	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	77	69.725	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	77	32.353	ENSAPEG00000008662	-	53	32.353	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	82	34.071	ENSAPEG00000002163	-	76	34.071	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	74	36.923	ENSAPEG00000013532	-	99	36.923	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	77	45.274	ENSAPEG00000019003	-	79	45.274	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	78	41.667	ENSAPEG00000003513	-	77	53.571	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	76	37.879	ENSAPEG00000013508	-	83	37.879	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	64	39.881	ENSAPEG00000013378	-	62	40.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012707	-	74	36.500	ENSATEG00000009383	-	66	36.500	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	77	58.824	ENSATEG00000011837	-	64	58.824	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	74	39.409	ENSATEG00000010901	-	52	39.409	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	78	44.660	ENSATEG00000019504	-	69	44.660	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	62	62.195	ENSATEG00000011978	-	82	62.195	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	61.386	ENSATEG00000011979	-	94	61.386	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	61.000	ENSATEG00000011720	-	73	61.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	74	40.887	ENSATEG00000010966	-	86	40.887	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	50	54.615	ENSATEG00000011771	-	73	54.615	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	61.881	ENSATEG00000011953	-	57	61.881	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	41.709	ENSATEG00000017209	-	74	41.709	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	74	39.216	ENSATEG00000010991	-	77	39.216	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	61	59.877	ENSATEG00000012017	-	67	59.877	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	75	35.577	ENSATEG00000011021	-	58	35.577	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	56.716	ENSATEG00000011712	-	77	56.716	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	74.372	ENSATEG00000011635	-	71	74.372	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	78	62.621	ENSATEG00000011820	-	74	62.621	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	78	60.784	ENSATEG00000011594	-	78	60.784	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	83	61.616	ENSATEG00000011931	-	85	61.616	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	77	37.736	ENSATEG00000010978	-	80	37.736	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	77	61.275	ENSATEG00000011814	-	66	61.275	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	50	59.542	ENSATEG00000011891	-	82	59.542	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	60.891	ENSATEG00000011918	-	67	60.891	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	76	74.372	ENSATEG00000011789	-	61	74.372	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	69	34.783	ENSATEG00000020398	-	52	34.783	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012707	-	72	36.842	ENSACLG00000023739	-	82	36.842	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012707	-	76	31.000	ENSACLG00000001341	-	52	31.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012707	-	76	40.191	ENSACLG00000003763	-	61	40.191	Astatotilapia_calliptera
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