EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012714 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8448 bases
Position: chrCCOE01001725.1:6091-14538
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000016329	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016763	-	894	-	ENSACIP00000016329	297 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000012714	-	53	43.038	ENSACIG00000000976	-	79	43.038
ENSACIG00000012714	-	68	41.463	ENSACIG00000014680	-	89	41.463
ENSACIG00000012714	-	75	38.462	ENSACIG00000006503	-	73	38.462
ENSACIG00000012714	-	88	40.152	ENSACIG00000012648	-	85	40.152
ENSACIG00000012714	-	64	42.487	ENSACIG00000016313	-	61	42.487
ENSACIG00000012714	-	59	46.591	ENSACIG00000000631	-	61	46.591
ENSACIG00000012714	-	65	43.979	ENSACIG00000007158	-	68	44.444
ENSACIG00000012714	-	79	42.017	ENSACIG00000022222	-	74	42.017
ENSACIG00000012714	-	61	43.478	ENSACIG00000001596	-	72	43.478
ENSACIG00000012714	-	61	45.503	ENSACIG00000005223	-	71	45.503
ENSACIG00000012714	-	61	36.413	ENSACIG00000014670	-	71	36.413
ENSACIG00000012714	-	53	30.120	ENSACIG00000014730	zgc:172131	82	30.120
ENSACIG00000012714	-	60	33.690	ENSACIG00000014737	-	86	33.690
ENSACIG00000012714	-	77	39.485	ENSACIG00000004040	-	87	39.485
ENSACIG00000012714	-	73	44.344	ENSACIG00000020244	-	90	44.344
ENSACIG00000012714	-	78	39.485	ENSACIG00000004245	-	80	39.485
ENSACIG00000012714	-	85	37.778	ENSACIG00000002950	-	70	39.179
ENSACIG00000012714	-	64	31.980	ENSACIG00000009811	-	80	31.980
ENSACIG00000012714	-	72	31.364	ENSACIG00000007725	-	79	31.364
ENSACIG00000012714	-	63	42.268	ENSACIG00000012707	-	73	42.268
ENSACIG00000012714	-	60	36.216	ENSACIG00000019509	-	83	36.216
ENSACIG00000012714	-	64	42.188	ENSACIG00000014745	-	86	42.188
ENSACIG00000012714	-	70	37.245	ENSACIG00000005573	-	88	37.245
ENSACIG00000012714	-	65	40.500	ENSACIG00000007178	-	68	40.500
ENSACIG00000012714	-	64	45.876	ENSACIG00000008001	-	90	40.000
ENSACIG00000012714	-	70	42.254	ENSACIG00000003582	-	68	42.523
ENSACIG00000012714	-	61	33.333	ENSACIG00000003050	-	81	33.333
ENSACIG00000012714	-	70	41.346	ENSACIG00000014690	-	77	41.346
ENSACIG00000012714	-	73	40.455	ENSACIG00000022366	-	77	40.455
ENSACIG00000012714	-	70	45.972	ENSACIG00000022362	-	75	45.972
ENSACIG00000012714	-	74	35.268	ENSACIG00000007466	-	68	35.268
ENSACIG00000012714	-	81	37.551	ENSACIG00000014716	-	97	37.551
ENSACIG00000012714	-	68	33.333	ENSACIG00000003906	-	69	33.333
ENSACIG00000012714	-	55	47.337	ENSACIG00000012204	-	71	47.337
ENSACIG00000012714	-	76	36.596	ENSACIG00000016888	-	76	36.596
ENSACIG00000012714	-	69	38.889	ENSACIG00000005587	-	75	38.889
ENSACIG00000012714	-	80	43.621	ENSACIG00000002263	-	83	43.621
ENSACIG00000012714	-	68	42.647	ENSACIG00000014646	zgc:113625	80	42.647
ENSACIG00000012714	-	64	40.625	ENSACIG00000007494	-	70	38.636
ENSACIG00000012714	-	85	39.768	ENSACIG00000022355	-	86	39.768
ENSACIG00000012714	-	66	42.929	ENSACIG00000019524	-	83	42.929
ENSACIG00000012714	-	66	43.216	ENSACIG00000020234	-	70	43.216
ENSACIG00000012714	-	86	39.695	ENSACIG00000016635	-	90	39.695
ENSACIG00000012714	-	70	40.278	ENSACIG00000006478	-	76	40.278
ENSACIG00000012714	-	64	46.073	ENSACIG00000014634	zgc:113625	77	46.073
ENSACIG00000012714	-	80	37.238	ENSACIG00000007191	-	67	37.238
ENSACIG00000012714	-	87	38.351	ENSACIG00000006484	-	84	38.351
ENSACIG00000012714	-	71	43.458	ENSACIG00000001455	-	76	43.458
ENSACIG00000012714	-	70	43.128	ENSACIG00000023381	-	83	43.128
ENSACIG00000012714	-	64	37.000	ENSACIG00000012061	-	59	37.000
ENSACIG00000012714	-	58	45.143	ENSACIG00000008666	-	84	45.143
ENSACIG00000012714	-	80	33.688	ENSACIG00000000893	-	77	41.885
ENSACIG00000012714	-	64	43.750	ENSACIG00000001070	-	69	43.750
ENSACIG00000012714	-	68	41.951	ENSACIG00000014662	-	83	41.951
ENSACIG00000012714	-	73	42.601	ENSACIG00000022370	-	77	42.105
ENSACIG00000012714	-	71	41.315	ENSACIG00000022377	-	76	41.743
ENSACIG00000012714	-	54	44.512	ENSACIG00000022374	-	84	44.512
ENSACIG00000012714	-	76	36.842	ENSACIG00000016502	-	98	36.842
ENSACIG00000012714	-	70	39.048	ENSACIG00000008045	-	80	38.785
ENSACIG00000012714	-	60	32.044	ENSACIG00000007737	-	72	32.447
ENSACIG00000012714	-	85	37.066	ENSACIG00000019149	-	78	37.692
ENSACIG00000012714	-	69	40.476	ENSACIG00000014655	-	79	40.476
ENSACIG00000012714	-	72	39.726	ENSACIG00000012718	-	90	39.726
ENSACIG00000012714	-	84	39.453	ENSACIG00000005780	-	82	37.091
ENSACIG00000012714	-	64	39.583	ENSACIG00000012159	-	50	39.583
ENSACIG00000012714	-	65	43.077	ENSACIG00000014703	-	80	43.077
ENSACIG00000012714	-	60	40.556	ENSACIG00000015088	-	72	40.556
ENSACIG00000012714	-	65	48.454	ENSACIG00000020225	-	80	43.750
ENSACIG00000012714	-	53	45.122	ENSACIG00000012761	-	71	45.122

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012714	-	73	34.101	ENSAPOG00000020108	-	76	32.210	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	75	42.291	ENSAPOG00000001444	-	55	38.514	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	85	36.187	ENSAPOG00000002337	-	75	37.931	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	68	34.975	ENSAPOG00000008529	-	79	34.975	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	65	45.685	ENSAPOG00000008819	-	86	46.193	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	82	38.340	ENSAPOG00000010738	-	82	38.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	61	41.436	ENSAPOG00000022321	-	84	41.436	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	73	43.498	ENSAPOG00000001075	-	96	43.498	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	68	38.208	ENSAPOG00000009288	-	79	38.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	54	42.604	ENSAPOG00000007631	-	77	42.604	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	65	46.154	ENSAPOG00000007123	-	72	46.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	73	31.489	ENSAPOG00000002527	-	75	31.489	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	65	43.077	ENSAPOG00000018915	-	84	43.077	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	96	67.832	ENSAPOG00000021365	-	94	67.832	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	80	40.329	ENSAPOG00000000066	-	68	38.583	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	64	35.323	ENSAPOG00000002517	-	70	35.323	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	93	43.478	ENSAPOG00000009059	-	84	43.575	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012714	-	54	43.125	ENSAOCG00000007815	-	60	43.125	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012714	-	62	35.567	ENSAOCG00000016099	-	85	35.567	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012714	-	95	63.475	ENSAOCG00000015984	-	93	63.475	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012714	-	77	40.598	ENSAOCG00000013326	-	84	40.417	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012714	-	57	47.674	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	68	47.674	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012714	-	76	32.099	ENSAOCG00000016082	-	55	32.365	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012714	-	55	43.827	ENSAPEG00000013378	-	59	43.827	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	79	41.667	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	76	55.556	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	65	51.892	ENSAPEG00000008662	-	51	51.892	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	63	36.364	ENSAPEG00000002163	-	68	36.364	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	76	41.202	ENSAPEG00000019003	-	91	41.202	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	97	65.972	ENSAPEG00000003513	-	94	68.235	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	62	33.514	ENSAPEG00000013532	-	95	33.514	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	77	30.870	ENSAPEG00000013508	-	97	30.870	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	62	35.567	ENSAPEG00000002121	-	85	35.567	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012714	-	76	33.755	ENSATEG00000011021	-	67	33.755	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	73	42.661	ENSATEG00000011789	-	66	42.661	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	60	38.587	ENSATEG00000020398	-	51	38.587	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	54	47.826	ENSATEG00000009383	-	54	47.826	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	72	38.288	ENSATEG00000011837	-	76	36.471	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	69	38.785	ENSATEG00000010901	-	55	38.785	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	84	35.573	ENSATEG00000019504	-	78	35.573	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	54	47.024	ENSATEG00000011978	-	83	47.024	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	68	43.128	ENSATEG00000011979	-	93	43.128	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	71	40.179	ENSATEG00000011720	-	77	40.179	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	72	39.640	ENSATEG00000011918	-	81	37.698	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	64	38.424	ENSATEG00000010966	-	85	38.424	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	52	47.059	ENSATEG00000011771	-	84	47.059	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	73	42.857	ENSATEG00000011953	-	71	39.695	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	67	35.000	ENSATEG00000017209	-	76	35.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	72	43.195	ENSATEG00000011635	-	72	42.273	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	69	37.209	ENSATEG00000010991	-	79	37.209	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	54	44.578	ENSATEG00000012017	-	67	44.578	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	65	42.289	ENSATEG00000011712	-	76	42.289	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	75	44.000	ENSATEG00000011931	-	85	44.000	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000012714	-	87	41.989	ENSATEG00000011594	-	86	41.989	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	64	32.338	ENSATEG00000010978	-	77	32.338	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	72	40.455	ENSATEG00000011814	-	79	39.922	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012714	-	74	34.632	ENSACLG00000006534	-	59	34.632	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012714	-	72	36.607	ENSACLG00000001896	-	60	36.607	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012714	-	72	31.818	ENSACLG00000016272	-	79	31.818	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012714	-	70	32.258	ENSACLG00000016242	-	68	32.258	Astatotilapia_calliptera
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