EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012718 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9529 bases
Position: chrCCOE01000183.1:629869-639397
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000016352	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-10	1	1
ENSACIP00000016338	MMR_HSR1	PF01926.23	1.4e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000016772	-	906	-	ENSACIP00000016338	301 (aa)	-	-
ENSACIT00000016786	-	714	-	ENSACIP00000016352	237 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000012718	-	88	53.023	ENSACIG00000002263	-	75	53.023
ENSACIG00000012718	-	84	46.231	ENSACIG00000000893	-	79	46.231
ENSACIG00000012718	-	88	52.113	ENSACIG00000001455	-	77	52.113
ENSACIG00000012718	-	80	38.889	ENSACIG00000014737	-	90	38.889
ENSACIG00000012718	-	59	37.748	ENSACIG00000014730	zgc:172131	76	37.748
ENSACIG00000012718	-	73	62.069	ENSACIG00000012204	-	75	62.069
ENSACIG00000012718	-	78	48.128	ENSACIG00000008666	-	89	48.128
ENSACIG00000012718	-	86	50.242	ENSACIG00000003582	-	66	50.242
ENSACIG00000012718	-	94	30.837	ENSACIG00000007725	-	81	30.837
ENSACIG00000012718	-	86	48.058	ENSACIG00000016888	-	67	48.058
ENSACIG00000012718	-	77	35.676	ENSACIG00000014670	-	71	35.676
ENSACIG00000012718	-	87	54.808	ENSACIG00000006484	-	83	41.935
ENSACIG00000012718	-	88	42.381	ENSACIG00000020244	-	89	42.381
ENSACIG00000012718	-	78	32.258	ENSACIG00000019509	-	85	32.258
ENSACIG00000012718	-	92	59.545	ENSACIG00000002950	-	78	47.797
ENSACIG00000012718	-	83	47.761	ENSACIG00000014745	-	89	47.761
ENSACIG00000012718	-	89	36.916	ENSACIG00000005573	-	90	36.916
ENSACIG00000012718	-	86	63.547	ENSACIG00000007191	-	57	63.547
ENSACIG00000012718	-	89	77.725	ENSACIG00000022222	-	86	67.647
ENSACIG00000012718	-	91	49.099	ENSACIG00000007466	-	90	44.776
ENSACIG00000012718	-	86	46.341	ENSACIG00000004040	-	87	40.090
ENSACIG00000012718	-	69	43.902	ENSACIG00000000976	-	81	43.902
ENSACIG00000012718	-	90	39.726	ENSACIG00000012714	-	72	39.726
ENSACIG00000012718	-	95	43.777	ENSACIG00000014716	-	92	43.777
ENSACIG00000012718	-	79	31.132	ENSACIG00000009149	-	70	31.132
ENSACIG00000012718	-	91	48.165	ENSACIG00000014690	-	83	48.165
ENSACIG00000012718	-	88	37.615	ENSACIG00000005587	-	75	37.615
ENSACIG00000012718	-	83	32.843	ENSACIG00000009811	-	83	32.843
ENSACIG00000012718	-	88	46.479	ENSACIG00000006503	-	65	46.479
ENSACIG00000012718	-	91	39.823	ENSACIG00000012061	-	67	39.823
ENSACIG00000012718	-	81	32.124	ENSACIG00000003050	-	85	32.124
ENSACIG00000012718	-	85	47.761	ENSACIG00000019524	-	84	47.761
ENSACIG00000012718	-	89	46.759	ENSACIG00000007494	-	69	47.685
ENSACIG00000012718	-	88	49.528	ENSACIG00000022362	-	74	49.528
ENSACIG00000012718	-	87	50.481	ENSACIG00000022366	-	75	50.481
ENSACIG00000012718	-	92	51.570	ENSACIG00000023381	-	86	51.570
ENSACIG00000012718	-	90	31.364	ENSACIG00000003906	-	72	31.364
ENSACIG00000012718	-	70	63.314	ENSACIG00000012761	-	74	63.314
ENSACIG00000012718	-	80	65.789	ENSACIG00000007178	-	66	65.789
ENSACIG00000012718	-	89	49.533	ENSACIG00000001070	-	76	49.533
ENSACIG00000012718	-	88	60.476	ENSACIG00000019149	-	87	46.503
ENSACIG00000012718	-	92	45.495	ENSACIG00000014646	zgc:113625	85	45.495
ENSACIG00000012718	-	87	46.154	ENSACIG00000008001	-	89	46.154
ENSACIG00000012718	-	68	45.062	ENSACIG00000000631	-	56	45.062
ENSACIG00000012718	-	87	58.852	ENSACIG00000012648	-	93	46.182
ENSACIG00000012718	-	89	54.762	ENSACIG00000012159	-	72	41.786
ENSACIG00000012718	-	81	40.196	ENSACIG00000015088	-	81	40.196
ENSACIG00000012718	-	76	46.448	ENSACIG00000001596	-	71	46.448
ENSACIG00000012718	-	87	58.373	ENSACIG00000022355	-	87	48.221
ENSACIG00000012718	-	84	48.515	ENSACIG00000014662	-	81	48.515
ENSACIG00000012718	-	87	45.894	ENSACIG00000020234	-	72	45.894
ENSACIG00000012718	-	89	76.415	ENSACIG00000016313	-	82	65.530
ENSACIG00000012718	-	89	57.277	ENSACIG00000016635	-	96	46.097
ENSACIG00000012718	-	83	47.500	ENSACIG00000014634	zgc:113625	86	45.000
ENSACIG00000012718	-	88	41.827	ENSACIG00000016502	-	99	35.345
ENSACIG00000012718	-	80	59.375	ENSACIG00000005223	-	74	59.375
ENSACIG00000012718	-	84	99.500	ENSACIG00000012707	-	76	99.500
ENSACIG00000012718	-	96	44.681	ENSACIG00000014703	-	95	44.681
ENSACIG00000012718	-	74	32.386	ENSACIG00000007737	-	69	31.868
ENSACIG00000012718	-	86	63.725	ENSACIG00000007158	-	63	62.963
ENSACIG00000012718	-	89	59.346	ENSACIG00000005780	-	65	59.346
ENSACIG00000012718	-	87	50.481	ENSACIG00000022377	-	75	50.481
ENSACIG00000012718	-	70	59.524	ENSACIG00000022374	-	86	59.524
ENSACIG00000012718	-	87	49.038	ENSACIG00000022370	-	73	49.038
ENSACIG00000012718	-	88	46.948	ENSACIG00000014655	-	79	46.948
ENSACIG00000012718	-	86	50.732	ENSACIG00000004245	-	72	50.732
ENSACIG00000012718	-	86	58.252	ENSACIG00000005198	-	50	45.035
ENSACIG00000012718	-	57	45.000	ENSACIG00000001465	-	84	45.000
ENSACIG00000012718	-	87	58.852	ENSACIG00000006478	-	78	58.852
ENSACIG00000012718	-	84	44.776	ENSACIG00000020225	-	72	43.396
ENSACIG00000012718	-	87	45.972	ENSACIG00000014680	-	90	45.972
ENSACIG00000012718	-	89	51.869	ENSACIG00000008045	-	77	52.427

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012718	-	91	65.581	ENSAPOG00000017368	-	50	53.710	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012718	-	91	61.395	ENSAPOG00000001447	-	72	61.395	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012718	-	91	58.685	ENSAOCG00000022545	-	67	58.525	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012718	-	85	58.163	ENSAOCG00000013686	-	90	58.163	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012718	-	88	61.538	ENSAOCG00000002389	-	64	61.538	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012718	-	89	60.190	ENSAPEG00000021634	-	85	46.693	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012718	-	89	66.981	ENSATEG00000011352	-	52	51.838	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012718	-	90	57.674	ENSATEG00000012058	-	60	58.768	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012718	-	87	71.498	ENSATEG00000011735	-	73	61.993	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012718	-	88	64.423	ENSATEG00000011330	-	50	48.339	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012718	-	91	61.364	ENSACLG00000024836	-	80	61.364	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	86	61.165	ENSACLG00000005220	-	64	47.566	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	88	67.308	ENSACLG00000024854	-	69	67.308	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	89	79.621	ENSACLG00000009780	-	79	70.196	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	89	59.155	ENSACLG00000005679	-	51	48.561	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	89	65.094	ENSACLG00000012195	-	61	65.094	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	86	58.537	ENSACLG00000005669	-	95	44.118	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	85	56.863	ENSACLG00000005066	-	73	56.863	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	89	79.621	ENSACLG00000009774	-	70	69.884	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012718	-	89	49.528	ENSAMXG00000030926	-	68	42.562	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	90	53.271	ENSAMXG00000037741	-	99	45.495	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	77	48.901	ENSAMXG00000030826	-	89	48.901	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	86	52.885	ENSAMXG00000030288	-	76	41.429	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	77	48.087	ENSAMXG00000039685	-	78	48.087	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	87	54.808	ENSAMXG00000024930	-	86	41.912	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	90	44.651	ENSAMXG00000030715	-	71	46.667	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	87	46.154	ENSAMXG00000036745	-	88	36.923	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	90	51.942	ENSAMXG00000030783	-	66	51.942	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012718	-	62	53.691	ENSCVAG00000023293	-	69	53.691	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012718	-	89	63.033	ENSCVAG00000018481	-	58	63.333	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012718	-	89	65.877	ENSCVAG00000023267	-	50	52.030	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012718	-	92	52.294	ENSDARG00000086048	si:ch211-229i14.2	71	52.294	Danio_rerio
ENSACIG00000012718	-	89	48.341	ENSELUG00000015135	-	56	48.485	Esox_lucius
ENSACIG00000012718	-	90	53.488	ENSELUG00000015076	si:ch211-229i14.2	53	53.488	Esox_lucius
ENSACIG00000012718	-	91	50.463	ENSELUG00000005405	-	81	43.295	Esox_lucius
ENSACIG00000012718	-	89	53.623	ENSELUG00000015106	-	59	53.623	Esox_lucius
ENSACIG00000012718	-	88	57.143	ENSFHEG00000000207	-	51	57.346	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012718	-	83	56.345	ENSFHEG00000021828	-	85	56.345	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012718	-	87	30.493	ENSFHEG00000007909	-	78	30.493	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012718	-	90	55.760	ENSFHEG00000011334	-	61	55.760	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012718	-	86	31.100	ENSGMOG00000006359	-	92	31.100	Gadus_morhua
ENSACIG00000012718	-	88	53.846	ENSGAFG00000001852	-	57	53.846	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012718	-	92	62.264	ENSGAFG00000015999	-	60	62.264	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012718	-	89	64.455	ENSGAFG00000015917	-	56	65.217	Gambusia_affinis
ENSACIG00000012718	-	90	59.813	ENSGACG00000013107	-	62	59.813	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012718	-	95	56.889	ENSGACG00000002627	-	86	56.889	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012718	-	71	60.819	ENSHBUG00000020672	-	80	60.819	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012718	-	87	57.895	ENSHBUG00000011156	-	81	49.416	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012718	-	86	58.454	ENSHBUG00000006928	-	77	49.798	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012718	-	87	57.895	ENSHBUG00000000157	-	88	48.117	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012718	-	86	67.157	ENSHBUG00000002999	-	73	67.157	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012718	-	89	65.094	ENSHBUG00000010247	-	61	65.094	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012718	-	74	66.477	ENSHBUG00000003010	-	58	66.477	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012718	-	89	50.711	ENSIPUG00000004131	-	61	50.711	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000012718	-	88	62.201	ENSKMAG00000010293	-	56	62.201	Kryptolebias_marmoratus
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