EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000012880 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ftsj3
Alias: cb410|ftsj|sb:cb410|wu:fa08a09
Full Name: FtsJ RNA methyltransferase homolog 3
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7355 bases
Position: chrCCOE01000057.1:823349-830703
Accession: ZDB-GENE-030131-9828
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000016614	FtsJ	PF01728.19	3.4e-35	1	2
ENSACIP00000016614	FtsJ	PF01728.19	3.4e-35	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000017059	-	2199	-	ENSACIP00000016614	733 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000012880's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000012880's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	67.778	ENSG00000108592	FTSJ3	100	84.848	Homo_sapiens
ENSACIG00000012880	ftsj3	86	72.124	ENSAPOG00000005543	ftsj3	88	74.558	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	54.320	ENSAMEG00000003148	FTSJ3	63	59.341	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	70.258	ENSAOCG00000023196	ftsj3	63	74.955	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	70.141	ENSAPEG00000004250	ftsj3	64	75.315	Amphiprion_percula
ENSACIG00000012880	ftsj3	91	67.908	ENSATEG00000010069	ftsj3	84	87.958	Anabas_testudineus
ENSACIG00000012880	ftsj3	60	51.812	ENSAPLG00000010362	-	61	51.812	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	76.265	ENSACLG00000019137	ftsj3	97	92.737	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	66.007	ENSAMXG00000021571	ftsj3	83	82.292	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	54.923	ENSBTAG00000021060	FTSJ3	85	68.649	Bos_taurus
ENSACIG00000012880	ftsj3	82	46.316	WBGene00019168	H06I04.3	75	46.316	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	58.135	ENSCJAG00000019631	FTSJ3	63	59.232	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000012880	ftsj3	87	67.196	ENSTSYG00000001393	FTSJ3	84	68.108	Carlito_syrichta
ENSACIG00000012880	ftsj3	66	69.886	ENSCAPG00000016654	FTSJ3	88	69.730	Cavia_aperea
ENSACIG00000012880	ftsj3	94	63.235	ENSCPOG00000011384	FTSJ3	85	69.730	Cavia_porcellus
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	58.318	ENSCCAG00000023533	-	97	59.489	Cebus_capucinus
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	63.874	ENSCATG00000018510	FTSJ3	85	67.027	Cercocebus_atys
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	59.158	ENSCLAG00000003222	FTSJ3	63	59.524	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	53.567	ENSCSAG00000003921	FTSJ3	85	65.946	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000012880	ftsj3	93	68.627	ENSCPBG00000010032	FTSJ3	92	68.852	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	64.398	ENSCANG00000042921	FTSJ3	85	67.568	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	55.742	ENSCGRG00001018068	FTSJ3	63	59.853	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	55.742	ENSCGRG00000010648	FTSJ3	63	59.853	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	66.628	ENSCSEG00000013468	ftsj3	84	88.482	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000012880	ftsj3	100	69.929	ENSCVAG00000007484	ftsj3	99	70.165	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	62.381	ENSDARG00000104938	ftsj3	88	77.000	Danio_rerio
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	58.165	ENSDORG00000004200	Ftsj3	63	60.000	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	47.874	ENSEBUG00000007828	ftsj3	63	52.328	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	57.982	ENSEASG00005013565	FTSJ3	99	57.471	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	59.232	ENSECAG00000011995	FTSJ3	85	69.730	Equus_caballus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	63.066	ENSELUG00000013501	ftsj3	62	64.875	Esox_lucius
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	55.226	ENSFALG00000013635	FTSJ3	65	59.857	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	59.707	ENSFDAG00000010274	FTSJ3	63	59.524	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000012880	ftsj3	100	70.163	ENSFHEG00000007639	ftsj3	87	83.168	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000012880	ftsj3	54	69.248	ENSGMOG00000017184	ftsj3	100	69.027	Gadus_morhua
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	56.138	ENSGALG00000032993	FTSJ3	65	60.753	Gallus_gallus
ENSACIG00000012880	ftsj3	54	69.231	ENSGACG00000009841	ftsj3	100	69.457	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	60.512	ENSGAGG00000006236	FTSJ3	64	61.060	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	67.778	ENSGGOG00000006794	FTSJ3	85	68.649	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	75.148	ENSHBUG00000022331	ftsj3	62	79.781	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	58.716	ENSHGLG00000012282	FTSJ3	85	68.649	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	58.716	ENSHGLG00100003578	FTSJ3	85	68.649	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	68.160	ENSHCOG00000018770	ftsj3	85	89.005	Hippocampus_comes
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	63.072	ENSIPUG00000024942	ftsj3	61	64.791	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	94	64.286	ENSSTOG00000021265	FTSJ3	85	68.649	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	69.668	ENSKMAG00000021997	ftsj3	63	74.182	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	69.928	ENSLBEG00000027142	ftsj3	85	88.482	Labrus_bergylta
ENSACIG00000012880	ftsj3	79	42.416	ENSLACG00000005523	FTSJ3	77	48.313	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	64.376	ENSLOCG00000008979	ftsj3	63	64.738	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	53.864	ENSLAFG00000003252	FTSJ3	86	68.649	Loxodonta_africana
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	55.062	ENSMMUG00000016768	FTSJ3	66	59.455	Macaca_mulatta
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	63.874	ENSMNEG00000029254	FTSJ3	85	67.027	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	54.299	ENSMLEG00000029091	FTSJ3	85	67.027	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	73.225	ENSMAMG00000006408	ftsj3	98	73.457	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	73.746	ENSMZEG00005001992	ftsj3	62	79.781	Maylandia_zebra
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	62.903	ENSMGAG00000000953	FTSJ3	82	63.388	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000012880	ftsj3	91	68.889	ENSMICG00000045996	FTSJ3	85	69.730	Microcebus_murinus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	55.914	ENSMOCG00000017809	Ftsj3	64	59.669	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000012880	ftsj3	94	69.231	ENSMODG00000009901	FTSJ3	86	70.157	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	59.890	MGP_CAROLIEiJ_G0017315	Ftsj3	63	59.598	Mus_caroli
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	55.385	MGP_PahariEiJ_G0018445	Ftsj3	63	59.199	Mus_pahari
ENSACIG00000012880	ftsj3	93	69.312	ENSMPUG00000014911	FTSJ3	85	70.270	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	54.108	ENSMLUG00000011667	FTSJ3	85	68.817	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	76.081	ENSNBRG00000017453	ftsj3	99	92.553	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	65.934	ENSNLEG00000004188	FTSJ3	85	66.486	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	55.576	ENSMEUG00000013252	FTSJ3	63	55.393	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000012880	ftsj3	95	64.878	ENSODEG00000008167	FTSJ3	85	69.730	Octodon_degus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	74.468	ENSONIG00000001654	ftsj3	86	88.177	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	69.836	ENSORLG00000005910	ftsj3	62	74.317	Oryzias_latipes
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	72.396	ENSORLG00020021255	ftsj3	91	89.005	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	68.794	ENSORLG00015018416	ftsj3	86	84.500	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000012880	ftsj3	85	84.080	ENSOMEG00000014432	ftsj3	88	89.529	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000012880	ftsj3	93	68.254	ENSOGAG00000032479	FTSJ3	85	69.189	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	67.778	ENSPPAG00000027297	FTSJ3	85	68.649	Pan_paniscus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	54.289	ENSPPRG00000003042	FTSJ3	85	69.189	Panthera_pardus
ENSACIG00000012880	ftsj3	92	67.778	ENSPTRG00000009524	FTSJ3	85	68.649	Pan_troglodytes
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	54.245	ENSPANG00000020978	FTSJ3	85	67.027	Papio_anubis
ENSACIG00000012880	ftsj3	86	75.806	ENSPKIG00000012838	ftsj3	86	75.124	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000012880	ftsj3	63	77.528	ENSPSIG00000004632	FTSJ3	70	77.451	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	72.930	ENSPMGG00000012959	ftsj3	99	71.879	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	56.295	ENSPEMG00000000248	Ftsj3	64	60.037	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	60.846	ENSPCIG00000009088	FTSJ3	63	60.146	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	68.273	ENSPFOG00000023101	ftsj3	63	73.466	Poecilia_formosa
ENSACIG00000012880	ftsj3	100	68.648	ENSPLAG00000003846	ftsj3	63	73.285	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	68.155	ENSPMEG00000012692	ftsj3	85	87.958	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	67.795	ENSPREG00000014874	ftsj3	87	82.178	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	54.276	ENSPPYG00000008532	FTSJ3	85	67.568	Pongo_abelii
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	54.330	ENSPCAG00000002560	FTSJ3	86	70.492	Procavia_capensis
ENSACIG00000012880	ftsj3	91	68.333	ENSPCOG00000023921	FTSJ3	85	69.189	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000012880	ftsj3	93	67.725	ENSPVAG00000000162	FTSJ3	85	68.649	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	76.786	ENSPNYG00000005108	ftsj3	97	92.973	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000012880	ftsj3	95	61.847	ENSPNAG00000022474	ftsj3	84	81.122	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	54.282	ENSRBIG00000039259	FTSJ3	85	67.027	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000012880	ftsj3	83	38.235	YCL054W	-	61	43.626	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	61.101	ENSSHAG00000013062	FTSJ3	63	59.528	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	62.574	ENSSFOG00015018053	ftsj3	62	65.448	Scleropages_formosus
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	69.763	ENSSMAG00000002863	ftsj3	63	72.678	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	72.340	ENSSDUG00000003385	ftsj3	97	72.653	Seriola_dumerili
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	71.868	ENSSLDG00000017970	ftsj3	97	72.235	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000012880	ftsj3	91	53.411	ENSSPUG00000012959	FTSJ3	86	65.041	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	69.814	ENSSPAG00000002390	ftsj3	98	72.145	Stegastes_partitus
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	55.054	ENSSSCG00000017288	FTSJ3	85	68.649	Sus_scrofa
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	69.873	ENSTRUG00000017550	ftsj3	90	87.435	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	66.825	ENSTNIG00000015549	ftsj3	87	87.895	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	52.205	ENSTBEG00000010295	FTSJ3	85	59.783	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000012880	ftsj3	98	53.571	ENSTTRG00000006973	FTSJ3	85	68.108	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000012880	ftsj3	76	86.139	ENSUAMG00000007332	FTSJ3	76	63.173	Ursus_americanus
ENSACIG00000012880	ftsj3	67	58.824	ENSUMAG00000017450	FTSJ3	63	58.684	Ursus_maritimus
ENSACIG00000012880	ftsj3	89	64.835	ENSXETG00000006939	ftsj3	83	64.835	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	72.050	ENSXCOG00000002999	ftsj3	98	70.849	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000012880	ftsj3	99	68.508	ENSXMAG00000018139	ftsj3	86	83.163	Xiphophorus_maculatus