EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000013149 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 33324 bases
Position: chrCCOE01001831.1:1568-34891
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000016875	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-53	1	10
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ENSACIP00000016875	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-53	4	10
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ENSACIP00000016875	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-53	9	10
ENSACIP00000016875	zf-C2H2	PF00096.26	1.4e-53	10	10
ENSACIP00000016875	zf-met	PF12874.7	1.3e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000017330	-	1383	-	ENSACIP00000016875	460 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000013149	-	82	32.011	ENSACIG00000000406	prdm5	76	32.011
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ENSACIG00000013149	-	79	45.714	ENSACIG00000010637	-	53	45.714
ENSACIG00000013149	-	83	46.602	ENSACIG00000003515	-	93	40.000
ENSACIG00000013149	-	82	43.662	ENSACIG00000006806	-	61	43.662
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ENSACIG00000013149	-	86	38.971	ENSACIG00000021986	-	97	38.971
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ENSACIG00000013149	-	80	33.871	ENSACIG00000015411	-	82	35.338
ENSACIG00000013149	-	78	45.000	ENSACIG00000013604	-	99	39.155
ENSACIG00000013149	-	83	39.655	ENSACIG00000018952	-	64	39.655
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ENSACIG00000013149	-	86	45.161	ENSACIG00000003754	-	96	45.161
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ENSACIG00000013149	-	83	45.714	ENSACIG00000019710	-	72	45.714
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ENSACIG00000013149	-	79	50.000	ENSACIG00000015835	-	73	50.000
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ENSACIG00000013149	-	79	41.304	ENSACIG00000002190	gfi1b	56	41.304
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ENSACIG00000013149	-	81	46.218	ENSACIG00000016182	-	82	44.872
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ENSACIG00000013149	-	86	41.007	ENSACIG00000009755	-	95	41.007
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ENSACIG00000013149	-	83	32.468	ENSACIG00000012263	znf319b	88	33.875
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ENSACIG00000013149	-	82	44.681	ENSACIG00000022658	-	99	37.217
ENSACIG00000013149	-	80	46.715	ENSACIG00000003720	-	63	46.715
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ENSACIG00000013149	-	81	40.260	ENSACIG00000022293	-	99	40.260
ENSACIG00000013149	-	66	51.667	ENSACIG00000010660	-	100	51.667
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ENSACIG00000013149	-	75	35.531	ENSACIG00000017653	-	95	35.531
ENSACIG00000013149	-	79	40.000	ENSACIG00000001369	-	83	40.000
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ENSACIG00000013149	-	73	34.483	ENSACIG00000009443	-	56	34.483
ENSACIG00000013149	-	80	40.000	ENSACIG00000001860	-	55	40.000
ENSACIG00000013149	-	58	45.614	ENSACIG00000018059	-	83	45.614
ENSACIG00000013149	-	72	36.290	ENSACIG00000012604	scrt2	50	36.290
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ENSACIG00000013149	-	80	38.202	ENSACIG00000006228	-	72	39.623
ENSACIG00000013149	-	79	47.541	ENSACIG00000000311	-	64	47.541
ENSACIG00000013149	-	80	40.000	ENSACIG00000014282	znf526	84	35.252
ENSACIG00000013149	-	85	53.425	ENSACIG00000017647	-	93	43.651
ENSACIG00000013149	-	84	37.086	ENSACIG00000017644	-	86	37.466
ENSACIG00000013149	-	84	34.483	ENSACIG00000016117	-	93	33.718
ENSACIG00000013149	-	79	35.714	ENSACIG00000018641	snai2	53	35.714
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ENSACIG00000013149	-	78	43.299	ENSACIG00000008886	znf1164	80	43.299
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ENSACIG00000013149	-	79	43.284	ENSACIG00000009128	-	94	43.284
ENSACIG00000013149	-	79	40.964	ENSACIG00000019815	-	86	33.861
ENSACIG00000013149	-	79	47.305	ENSACIG00000023162	-	54	47.305
ENSACIG00000013149	-	90	30.769	ENSACIG00000016779	patz1	52	32.484
ENSACIG00000013149	-	79	43.066	ENSACIG00000009780	-	73	43.066
ENSACIG00000013149	-	79	41.210	ENSACIG00000004041	-	92	47.015
ENSACIG00000013149	-	78	32.959	ENSACIG00000011516	-	78	30.769
ENSACIG00000013149	-	82	40.000	ENSACIG00000023794	-	79	40.000
ENSACIG00000013149	-	82	47.191	ENSACIG00000013750	-	77	47.191
ENSACIG00000013149	-	93	41.420	ENSACIG00000006755	-	79	41.420
ENSACIG00000013149	-	82	47.945	ENSACIG00000004666	-	97	48.913
ENSACIG00000013149	-	78	38.686	ENSACIG00000016133	-	67	37.107

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000013149	-	88	44.099	ENSAPOG00000002213	-	96	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013149	-	85	44.099	ENSAOCG00000013124	-	92	40.361	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013149	-	85	44.099	ENSAPEG00000009997	-	92	43.704	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013149	-	86	85.333	ENSATEG00000004127	-	96	42.963	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013149	-	86	44.099	ENSACLG00000005708	-	71	44.660	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013149	-	81	45.342	ENSCVAG00000014734	-	91	47.407	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013149	-	84	45.833	ENSFHEG00000014060	-	81	46.479	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013149	-	82	41.781	ENSGMOG00000017526	-	94	41.781	Gadus_morhua
ENSACIG00000013149	-	88	44.099	ENSGAFG00000011174	-	71	44.444	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013149	-	78	85.401	ENSGACG00000019550	-	96	85.401	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013149	-	86	44.218	ENSHBUG00000006662	-	71	44.660	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013149	-	79	45.714	ENSHCOG00000003041	-	96	40.278	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013149	-	87	73.333	ENSKMAG00000009979	-	87	44.720	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000013149	-	84	43.023	ENSLBEG00000010165	-	90	37.429	Labrus_bergylta
ENSACIG00000013149	-	85	80.357	ENSMAMG00000006312	-	92	41.896	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000013149	-	86	44.099	ENSMZEG00005013913	-	71	44.660	Maylandia_zebra
ENSACIG00000013149	-	85	50.000	ENSMMOG00000011282	-	92	50.000	Mola_mola
ENSACIG00000013149	-	79	43.636	ENSMALG00000000494	-	89	44.660	Monopterus_albus
ENSACIG00000013149	-	83	43.200	ENSNBRG00000007602	-	88	42.328	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000013149	-	82	58.289	ENSONIG00000003856	-	100	55.443	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000013149	-	88	42.537	ENSORLG00000010117	-	86	42.537	Oryzias_latipes
ENSACIG00000013149	-	87	40.964	ENSORLG00020000219	-	86	40.964	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000013149	-	80	44.554	ENSORLG00015000258	-	98	44.554	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000013149	-	87	42.593	ENSOMEG00000018262	-	89	42.593	Oryzias_melastigma
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ENSACIG00000013149	-	85	81.333	ENSPLAG00000004027	-	84	44.444	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000013149	-	88	44.099	ENSPMEG00000007589	-	88	44.444	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000013149	-	86	49.173	ENSPREG00000000153	-	92	50.265	Poecilia_reticulata
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ENSACIG00000013149	-	80	83.942	ENSPNYG00000007781	-	99	83.942	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000013149	-	90	49.642	ENSSMAG00000021251	-	97	52.208	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000013149	-	87	44.099	ENSSDUG00000013904	-	72	44.660	Seriola_dumerili
ENSACIG00000013149	-	87	39.899	ENSSLDG00000006994	-	94	48.077	Seriola_lalandi_dorsalis
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ENSACIG00000013149	-	87	49.324	ENSTRUG00000015687	-	96	48.525	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000013149	-	81	48.363	ENSTNIG00000008242	-	99	47.500	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000013149	-	82	46.809	ENSXCOG00000015947	-	95	46.809	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000013149	-	90	44.099	ENSXMAG00000023291	-	98	40.964	Xiphophorus_maculatus