EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000013163 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13266 bases
Position: chrCCOE01001831.1:30845-44110
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	1	8
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	2	8
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	3	8
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	4	8
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	5	8
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	6	8
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	7	8
ENSACIP00000016899	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-43	8	8
ENSACIP00000016899	zf-met	PF12874.7	9.7e-12	1	2
ENSACIP00000016899	zf-met	PF12874.7	9.7e-12	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000017355	-	1092	-	ENSACIP00000016899	363 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000013163	-	81	45.614	ENSACIG00000022625	-	85	39.792
ENSACIG00000013163	-	78	41.964	ENSACIG00000011318	snai1a	54	40.909
ENSACIG00000013163	-	79	35.507	ENSACIG00000012604	scrt2	56	35.507
ENSACIG00000013163	-	84	44.715	ENSACIG00000006228	-	81	44.715
ENSACIG00000013163	-	79	37.383	ENSACIG00000017653	-	93	37.383
ENSACIG00000013163	-	94	43.007	ENSACIG00000013470	-	62	43.007
ENSACIG00000013163	-	78	49.254	ENSACIG00000010660	-	99	49.254
ENSACIG00000013163	-	76	43.902	ENSACIG00000007034	-	98	47.727
ENSACIG00000013163	-	79	44.275	ENSACIG00000004641	-	54	44.275
ENSACIG00000013163	-	77	43.299	ENSACIG00000013946	-	56	43.299
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ENSACIG00000013163	-	80	50.442	ENSACIG00000011153	-	83	50.442
ENSACIG00000013163	-	93	45.299	ENSACIG00000019791	-	94	40.000
ENSACIG00000013163	-	87	30.837	ENSACIG00000016779	patz1	59	30.837
ENSACIG00000013163	-	85	33.218	ENSACIG00000001767	zbtb41	68	33.218
ENSACIG00000013163	-	79	40.196	ENSACIG00000022330	-	83	40.196
ENSACIG00000013163	-	86	43.911	ENSACIG00000019710	-	72	43.911
ENSACIG00000013163	-	85	44.393	ENSACIG00000018440	-	97	44.393
ENSACIG00000013163	-	79	44.402	ENSACIG00000010637	-	53	44.361
ENSACIG00000013163	-	77	45.865	ENSACIG00000009717	-	87	44.961
ENSACIG00000013163	-	84	43.056	ENSACIG00000023212	-	81	43.056
ENSACIG00000013163	-	77	31.818	ENSACIG00000014233	znf407	62	31.818
ENSACIG00000013163	-	79	44.681	ENSACIG00000004041	-	92	44.523
ENSACIG00000013163	-	79	37.786	ENSACIG00000023794	-	71	36.576
ENSACIG00000013163	-	87	33.921	ENSACIG00000015411	-	87	33.921
ENSACIG00000013163	-	80	39.203	ENSACIG00000017644	-	89	39.203
ENSACIG00000013163	-	93	42.105	ENSACIG00000007855	-	95	42.105
ENSACIG00000013163	-	92	39.550	ENSACIG00000013604	-	99	41.696
ENSACIG00000013163	-	79	44.141	ENSACIG00000011515	-	64	43.443
ENSACIG00000013163	-	81	46.897	ENSACIG00000000311	-	65	42.857
ENSACIG00000013163	-	94	44.944	ENSACIG00000017647	-	93	43.671
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ENSACIG00000013163	-	77	42.222	ENSACIG00000002180	-	98	42.222
ENSACIG00000013163	-	97	39.535	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	88	39.535
ENSACIG00000013163	-	97	44.615	ENSACIG00000010647	-	98	47.500
ENSACIG00000013163	-	79	40.580	ENSACIG00000016354	gfi1ab	51	40.580
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ENSACIG00000013163	-	81	48.551	ENSACIG00000018022	-	51	48.551
ENSACIG00000013163	-	90	34.444	ENSACIG00000013149	-	83	42.222
ENSACIG00000013163	-	77	40.580	ENSACIG00000021378	gfi1aa	50	40.580
ENSACIG00000013163	-	88	34.211	ENSACIG00000023049	znf646	99	34.363
ENSACIG00000013163	-	82	45.312	ENSACIG00000004626	-	86	43.210
ENSACIG00000013163	-	85	48.872	ENSACIG00000006755	-	66	48.872
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ENSACIG00000013163	-	93	38.291	ENSACIG00000003515	-	95	40.909
ENSACIG00000013163	-	88	30.769	ENSACIG00000002944	-	98	31.944
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ENSACIG00000013163	-	79	38.554	ENSACIG00000019804	-	83	38.554
ENSACIG00000013163	-	96	46.875	ENSACIG00000017050	-	96	45.455
ENSACIG00000013163	-	79	43.231	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	78	43.231
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ENSACIG00000013163	-	81	34.934	ENSACIG00000007882	-	79	34.934
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ENSACIG00000013163	-	79	44.318	ENSACIG00000023162	-	50	44.318
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ENSACIG00000013163	-	79	47.115	ENSACIG00000016182	-	82	47.115
ENSACIG00000013163	-	80	37.963	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	72	37.963
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ENSACIG00000013163	-	86	44.693	ENSACIG00000022658	-	94	44.061
ENSACIG00000013163	-	77	45.000	ENSACIG00000017013	-	54	45.000
ENSACIG00000013163	-	79	36.301	ENSACIG00000012263	znf319b	84	36.332
ENSACIG00000013163	-	79	42.105	ENSACIG00000008448	-	70	42.105
ENSACIG00000013163	-	79	36.404	ENSACIG00000013508	ZNF384	51	33.455
ENSACIG00000013163	-	79	46.667	ENSACIG00000006806	-	58	46.667
ENSACIG00000013163	-	77	39.904	ENSACIG00000009128	-	79	39.904
ENSACIG00000013163	-	79	45.161	ENSACIG00000007464	-	61	45.161
ENSACIG00000013163	-	79	38.462	ENSACIG00000018641	snai2	54	38.462
ENSACIG00000013163	-	77	46.465	ENSACIG00000003556	-	69	46.465
ENSACIG00000013163	-	78	43.023	ENSACIG00000009755	-	70	41.667
ENSACIG00000013163	-	79	48.529	ENSACIG00000016944	-	86	48.529
ENSACIG00000013163	-	77	43.182	ENSACIG00000007096	-	87	43.182
ENSACIG00000013163	-	93	40.357	ENSACIG00000004745	-	91	40.959
ENSACIG00000013163	-	88	36.179	ENSACIG00000010739	-	79	36.179
ENSACIG00000013163	-	79	38.113	ENSACIG00000024444	-	61	38.113
ENSACIG00000013163	-	79	36.546	ENSACIG00000013750	-	84	36.638
ENSACIG00000013163	-	77	37.313	ENSACIG00000001369	-	81	37.313
ENSACIG00000013163	-	78	45.390	ENSACIG00000019815	-	82	45.390
ENSACIG00000013163	-	82	35.000	ENSACIG00000007000	-	61	35.000
ENSACIG00000013163	-	82	44.151	ENSACIG00000010966	-	50	44.279
ENSACIG00000013163	-	79	46.491	ENSACIG00000019447	-	65	46.352
ENSACIG00000013163	-	77	37.363	ENSACIG00000017166	-	69	36.986
ENSACIG00000013163	-	91	41.667	ENSACIG00000020982	znf710b	57	36.364
ENSACIG00000013163	-	77	42.233	ENSACIG00000009780	-	71	42.233
ENSACIG00000013163	-	82	39.474	ENSACIG00000014123	znf236	67	39.474
ENSACIG00000013163	-	89	43.750	ENSACIG00000014282	znf526	86	31.560
ENSACIG00000013163	-	93	37.131	ENSACIG00000021986	-	92	37.131
ENSACIG00000013163	-	97	44.715	ENSACIG00000004666	-	99	43.902
ENSACIG00000013163	-	94	45.833	ENSACIG00000006172	-	95	39.189
ENSACIG00000013163	-	93	42.177	ENSACIG00000022738	-	90	49.735
ENSACIG00000013163	-	94	39.768	ENSACIG00000017683	-	85	36.842
ENSACIG00000013163	-	86	43.110	ENSACIG00000022293	-	91	43.110
ENSACIG00000013163	-	77	45.139	ENSACIG00000000286	-	72	45.139
ENSACIG00000013163	-	77	39.130	ENSACIG00000002190	gfi1b	55	39.130
ENSACIG00000013163	-	83	51.961	ENSACIG00000015835	-	72	51.961
ENSACIG00000013163	-	77	43.210	ENSACIG00000008886	znf1164	80	43.210
ENSACIG00000013163	-	79	33.775	ENSACIG00000013613	scrt1b	55	33.775
ENSACIG00000013163	-	80	32.432	ENSACIG00000016180	znf341	51	32.432
ENSACIG00000013163	-	85	45.136	ENSACIG00000011541	-	70	45.136
ENSACIG00000013163	-	76	39.070	ENSACIG00000017892	-	86	39.070

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000013163	-	91	88.926	ENSAPOG00000002213	-	97	88.926	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013163	-	87	92.632	ENSAOCG00000013124	-	89	92.632	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013163	-	87	92.632	ENSAPEG00000009997	-	89	92.632	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013163	-	88	91.228	ENSATEG00000004127	-	98	87.931	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013163	-	85	96.377	ENSACLG00000005708	-	72	95.088	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013163	-	92	76.619	ENSCVAG00000014734	-	91	76.619	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013163	-	81	69.481	ENSGMOG00000017526	-	95	69.481	Gadus_morhua
ENSACIG00000013163	-	88	86.713	ENSGAFG00000011174	-	85	86.713	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013163	-	87	98.095	ENSGACG00000019550	-	81	98.095	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013163	-	85	96.043	ENSHBUG00000006662	-	72	95.439	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013163	-	79	89.759	ENSHCOG00000003041	-	91	89.759	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013163	-	90	90.526	ENSKMAG00000009979	-	79	90.526	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000013163	-	93	88.435	ENSLBEG00000010165	-	93	92.275	Labrus_bergylta
ENSACIG00000013163	-	92	85.650	ENSMAMG00000006312	-	98	80.805	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000013163	-	85	96.377	ENSMZEG00005013913	-	72	95.088	Maylandia_zebra
ENSACIG00000013163	-	92	97.899	ENSMMOG00000011282	-	86	97.899	Mola_mola
ENSACIG00000013163	-	88	90.972	ENSMALG00000000494	-	72	90.972	Monopterus_albus
ENSACIG00000013163	-	87	56.738	ENSNBRG00000007602	-	86	56.738	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000013163	-	86	57.003	ENSONIG00000003856	-	99	56.028	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000013163	-	87	89.825	ENSORLG00000010117	-	94	89.825	Oryzias_latipes
ENSACIG00000013163	-	86	90.175	ENSORLG00020000219	-	88	90.175	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000013163	-	86	90.175	ENSORLG00015000258	-	98	85.091	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000013163	-	89	87.075	ENSOMEG00000018262	-	89	93.089	Oryzias_melastigma
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ENSACIG00000013163	-	90	79.635	ENSPREG00000000153	-	93	79.635	Poecilia_reticulata
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ENSACIG00000013163	-	97	39.858	ENSPNYG00000007781	-	89	43.704	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000013163	-	94	86.957	ENSSMAG00000021251	-	98	86.957	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000013163	-	90	89.865	ENSSDUG00000013904	-	89	89.865	Seriola_dumerili
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ENSACIG00000013163	-	88	93.706	ENSSPAG00000011524	-	75	91.156	Stegastes_partitus
ENSACIG00000013163	-	83	90.438	ENSTRUG00000015687	-	91	93.229	Takifugu_rubripes
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ENSACIG00000013163	-	79	89.062	ENSXCOG00000015947	-	92	89.062	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000013163	-	82	93.962	ENSXMAG00000023291	-	93	87.713	Xiphophorus_maculatus