EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000013333 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21366 bases
Position: chrCCOE01001472.1:888051-909416
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000017111	MMR_HSR1	PF01926.23	5.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000017578	-	1212	-	ENSACIP00000017111	403 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000013333	-	94	81.510	ENSACIG00000012690	sept15	96	81.510
ENSACIG00000013333	-	68	48.029	ENSACIG00000008111	sept9a	82	48.029
ENSACIG00000013333	-	72	49.324	ENSACIG00000001821	sept3	70	49.324
ENSACIG00000013333	-	70	59.028	ENSACIG00000002675	SEPT4	73	59.028
ENSACIG00000013333	-	88	43.380	ENSACIG00000006078	sept8b	87	43.122
ENSACIG00000013333	-	83	50.296	ENSACIG00000018748	sept4a	92	50.296
ENSACIG00000013333	-	78	52.830	ENSACIG00000006540	zgc:63587	100	52.830
ENSACIG00000013333	-	69	60.211	ENSACIG00000021718	sept2	83	60.211
ENSACIG00000013333	-	99	38.647	ENSACIG00000013682	sept6	94	38.835
ENSACIG00000013333	-	99	87.811	ENSACIG00000009559	sept7b	100	87.811
ENSACIG00000013333	-	70	56.250	ENSACIG00000000964	-	94	51.506
ENSACIG00000013333	-	99	42.928	ENSACIG00000009699	sept8a	95	42.928
ENSACIG00000013333	-	84	53.333	ENSACIG00000006554	sept5a	95	53.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSG00000122545	SEPT7	100	93.878	Homo_sapiens
ENSACIG00000013333	-	100	93.812	ENSAPOG00000005386	-	93	93.812	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013333	-	100	89.163	ENSAPOG00000020512	sept7b	97	89.163	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSAMEG00000001564	SEPT7	92	91.358	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000013333	-	100	89.163	ENSAOCG00000014184	sept7b	97	89.163	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013333	-	100	93.564	ENSAOCG00000023747	-	93	93.564	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013333	-	100	85.185	ENSAPEG00000007510	-	96	84.293	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013333	-	100	93.564	ENSAPEG00000006477	SEPT7	93	93.564	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013333	-	100	89.163	ENSAPEG00000023951	sept7b	100	86.802	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013333	-	100	86.441	ENSATEG00000004214	sept7b	94	86.441	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013333	-	100	91.832	ENSATEG00000007955	-	93	91.832	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013333	-	100	85.432	ENSATEG00000007365	sept15	94	85.432	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013333	-	100	91.111	ENSAPLG00000009772	SEPT7	97	91.111	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000013333	-	100	91.111	ENSACAG00000007341	SEPT7	92	91.111	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSANAG00000037035	SEPT7	99	90.181	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000013333	-	100	87.685	ENSACLG00000007305	sept7b	97	87.685	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013333	-	100	85.185	ENSACLG00000004253	sept15	94	85.185	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013333	-	100	91.337	ENSAMXG00000017358	sept7a	97	91.337	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000013333	-	95	87.277	ENSAMXG00000024643	sept7b	100	87.277	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000013333	-	100	85.185	ENSAMXG00000039803	sept15	95	84.352	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSBTAG00000001182	SEPT7	97	91.358	Bos_taurus
ENSACIG00000013333	-	90	45.902	WBGene00006793	unc-59	78	45.902	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSCJAG00000012276	SEPT7	100	90.933	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000013333	-	95	90.933	ENSCAFG00000003216	SEPT7	100	90.933	Canis_familiaris
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSCAFG00020006386	SEPT7	92	91.358	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSCHIG00000013805	SEPT7	96	91.358	Capra_hircus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSTSYG00000013189	SEPT7	97	91.358	Carlito_syrichta
ENSACIG00000013333	-	100	91.852	ENSCPOG00000012518	SEPT7	92	91.852	Cavia_porcellus
ENSACIG00000013333	-	100	88.642	ENSCCAG00000027961	-	100	90.933	Cebus_capucinus
ENSACIG00000013333	-	95	90.415	ENSCCAG00000024803	-	94	90.415	Cebus_capucinus
ENSACIG00000013333	-	96	90.979	ENSCATG00000040605	-	95	90.979	Cercocebus_atys
ENSACIG00000013333	-	100	91.852	ENSCLAG00000009369	-	92	91.852	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000013333	-	95	90.674	ENSCSAG00000014993	SEPT7	100	90.674	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000013333	-	100	90.617	ENSCPBG00000024955	SEPT7	97	90.617	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000013333	-	96	72.468	ENSCING00000021379	-	94	70.223	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000013333	-	69	65.644	ENSCSAVG00000007646	-	93	65.644	Ciona_savignyi
ENSACIG00000013333	-	95	61.358	ENSCANG00000037043	-	93	62.141	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000013333	-	100	90.864	ENSCANG00000003669	-	97	90.864	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSCGRG00001005335	Sept7	92	91.358	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSCGRG00000015598	Sept7	97	91.358	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000013333	-	100	85.432	ENSCSEG00000002096	sept15	100	83.979	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000013333	-	95	87.855	ENSCSEG00000004191	sept7b	100	87.855	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000013333	-	100	90.099	ENSCSEG00000010117	-	97	90.099	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000013333	-	100	89.109	ENSCVAG00000006310	-	93	89.109	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013333	-	100	88.177	ENSCVAG00000014145	sept7b	97	88.177	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013333	-	100	85.185	ENSCVAG00000017438	sept15	94	85.185	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013333	-	100	91.832	ENSDARG00000087647	sept7a	93	91.832	Danio_rerio
ENSACIG00000013333	-	100	86.173	ENSDARG00000102889	sept15	95	86.173	Danio_rerio
ENSACIG00000013333	-	95	87.306	ENSDARG00000052673	sept7b	100	90.164	Danio_rerio
ENSACIG00000013333	-	96	89.744	ENSDNOG00000025463	-	100	89.744	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSDORG00000010955	-	91	92.506	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000013333	-	100	85.926	ENSDORG00000029344	-	93	85.926	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000013333	-	94	67.454	FBgn0013726	pnut	70	67.454	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000013333	-	74	73.826	ENSEBUG00000006208	sept7a	93	73.826	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013333	-	100	61.139	ENSEBUG00000016403	sept15	96	61.139	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSEASG00005003853	SEPT7	92	91.358	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSECAG00000022693	SEPT7	95	91.358	Equus_caballus
ENSACIG00000013333	-	100	84.975	ENSELUG00000011800	sept15	100	83.721	Esox_lucius
ENSACIG00000013333	-	100	88.916	ENSELUG00000013781	sept7b	97	88.916	Esox_lucius
ENSACIG00000013333	-	100	89.538	ENSELUG00000008840	sept7a	100	89.141	Esox_lucius
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSFCAG00000028220	SEPT7	100	90.933	Felis_catus
ENSACIG00000013333	-	95	90.674	ENSFALG00000002750	SEPT7	100	90.674	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000013333	-	100	91.852	ENSFDAG00000019012	SEPT7	97	91.852	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000013333	-	100	85.185	ENSFHEG00000021092	sept15	94	85.185	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013333	-	100	89.604	ENSFHEG00000018855	SEPT7	93	89.604	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013333	-	85	85.507	ENSGMOG00000004394	sept15	96	85.507	Gadus_morhua
ENSACIG00000013333	-	100	83.663	ENSGMOG00000008992	SEPT7	97	83.663	Gadus_morhua
ENSACIG00000013333	-	100	86.946	ENSGMOG00000006606	sept7b	97	86.946	Gadus_morhua
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSGALG00000032830	SEPT7	97	91.358	Gallus_gallus
ENSACIG00000013333	-	100	84.938	ENSGAFG00000021944	sept15	94	84.938	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013333	-	100	87.376	ENSGAFG00000002872	-	93	87.376	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013333	-	100	87.438	ENSGACG00000012939	sept7b	96	87.563	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013333	-	100	85.468	ENSGACG00000002265	sept15	93	85.468	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013333	-	100	91.832	ENSGACG00000008060	SEPT7	100	91.429	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013333	-	96	91.990	ENSGAGG00000006002	SEPT7	92	91.990	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000013333	-	95	82.902	ENSHBUG00000022725	sept15	92	82.902	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013333	-	100	87.685	ENSHBUG00000012840	sept7b	97	87.685	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013333	-	100	91.852	ENSHGLG00000007740	SEPT7	92	91.852	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000013333	-	76	80.906	ENSHGLG00000012045	-	82	80.906	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000013333	-	76	80.906	ENSHGLG00100004661	-	82	80.906	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013333	-	99	79.302	ENSHGLG00100001642	-	93	79.302	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013333	-	99	80.446	ENSHGLG00100008397	-	90	80.446	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013333	-	100	91.852	ENSHGLG00100001484	-	97	91.852	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013333	-	100	85.432	ENSHCOG00000016725	sept15	94	85.432	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013333	-	95	87.855	ENSHCOG00000006008	sept7b	100	87.855	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013333	-	100	75.921	ENSIPUG00000014056	sept15	97	75.921	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000013333	-	94	91.339	ENSIPUG00000018053	sept7a	98	91.339	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSSTOG00000021378	SEPT7	92	91.358	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000013333	-	100	91.605	ENSJJAG00000010026	Sept7	94	91.605	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000013333	-	100	88.177	ENSKMAG00000019881	sept7b	97	88.177	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000013333	-	100	85.185	ENSKMAG00000015914	sept15	94	85.185	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000013333	-	100	92.327	ENSLBEG00000027709	SEPT7	93	92.327	Labrus_bergylta
ENSACIG00000013333	-	100	87.685	ENSLBEG00000007109	sept7b	97	87.685	Labrus_bergylta
ENSACIG00000013333	-	100	84.444	ENSLBEG00000006770	sept15	94	84.444	Labrus_bergylta
ENSACIG00000013333	-	95	89.896	ENSLACG00000001210	SEPT7	100	89.896	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000013333	-	100	90.864	ENSLOCG00000006999	sept7b	94	90.864	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000013333	-	100	86.667	ENSLOCG00000003765	sept15	94	85.819	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSLAFG00000011254	SEPT7	92	91.358	Loxodonta_africana
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSMFAG00000045134	-	97	91.358	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSMMUG00000006980	SEPT7	97	91.358	Macaca_mulatta
ENSACIG00000013333	-	100	85.926	ENSMNEG00000030328	-	96	85.926	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000013333	-	100	91.111	ENSMLEG00000040086	-	100	90.674	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000013333	-	100	93.564	ENSMAMG00000001348	-	93	93.564	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000013333	-	100	87.931	ENSMAMG00000011379	sept7b	94	87.931	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000013333	-	100	85.432	ENSMAMG00000013568	sept15	96	84.597	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000013333	-	100	87.685	ENSMZEG00005015670	sept7b	97	87.685	Maylandia_zebra
ENSACIG00000013333	-	100	85.185	ENSMZEG00005015547	sept15	94	85.185	Maylandia_zebra
ENSACIG00000013333	-	95	81.347	ENSMGAG00000012026	SEPT7	96	92.642	Meleagris_gallopavo
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ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSMICG00000009301	SEPT7	97	91.358	Microcebus_murinus
ENSACIG00000013333	-	100	91.605	ENSMOCG00000013002	Sept7	92	91.605	Microtus_ochrogaster
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ENSACIG00000013333	-	100	84.691	ENSMMOG00000010325	sept15	91	84.691	Mola_mola
ENSACIG00000013333	-	100	90.123	ENSMODG00000021167	SEPT7	92	90.123	Monodelphis_domestica
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ENSACIG00000013333	-	100	91.605	MGP_CAROLIEiJ_G0031917	Sept7	90	91.605	Mus_caroli
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ENSACIG00000013333	-	100	91.605	MGP_SPRETEiJ_G0033040	Sept7	92	91.605	Mus_spretus
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ENSACIG00000013333	-	100	91.358	ENSNLEG00000001673	SEPT7	100	90.933	Nomascus_leucogenys
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ENSACIG00000013333	-	95	90.933	ENSOCUG00000004136	SEPT7	100	90.933	Oryctolagus_cuniculus
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ENSACIG00000013333	-	95	87.080	ENSORLG00020012435	sept7b	100	87.080	Oryzias_latipes_hni
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ENSACIG00000013333	-	100	88.969	ENSOGAG00000006015	SEPT7	100	91.192	Otolemur_garnettii
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ENSACIG00000013333	-	100	72.593	ENSPCAG00000002074	SEPT7	92	72.593	Procavia_capensis
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ENSACIG00000013333	-	100	91.605	ENSRNOG00000006545	Sept7	92	91.605	Rattus_norvegicus
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ENSACIG00000013333	-	100	87.376	ENSXMAG00000027369	SEPT7	98	85.233	Xiphophorus_maculatus