EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000013354 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10110 bases
Position: chrCCOE01001432.1:25664-35773
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000017315	DEAD	PF00270.29	4.3e-51	1	1
ENSACIP00000017280	DEAD	PF00270.29	1.2e-50	1	1
ENSACIP00000017244	DEAD	PF00270.29	1.2e-50	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000017785	-	1782	-	ENSACIP00000017315	593 (aa)	-	-
ENSACIT00000017750	-	2049	-	ENSACIP00000017280	682 (aa)	-	-
ENSACIT00000017714	-	2040	-	ENSACIP00000017244	679 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000013354	-	65	32.041	ENSACIG00000000989	eif4a2	89	31.783
ENSACIG00000013354	-	68	33.666	ENSACIG00000009719	eif4a3	91	34.146
ENSACIG00000013354	-	71	31.925	ENSACIG00000009666	ddx59	71	32.093
ENSACIG00000013354	-	61	34.646	ENSACIG00000007580	ddx55	61	34.646
ENSACIG00000013354	-	70	44.153	ENSACIG00000022414	ddx5	83	44.391
ENSACIG00000013354	-	63	31.467	ENSACIG00000004534	ddx39b	81	31.467
ENSACIG00000013354	-	68	31.084	ENSACIG00000020898	DDX39A	92	31.084
ENSACIG00000013354	-	72	39.080	ENSACIG00000008618	DDX41	71	39.080
ENSACIG00000013354	-	77	41.113	ENSACIG00000006502	DDX5	69	42.094
ENSACIG00000013354	-	59	30.707	ENSACIG00000016665	zgc:193690	69	30.829
ENSACIG00000013354	-	90	87.545	ENSACIG00000023986	-	91	79.206
ENSACIG00000013354	-	71	37.882	ENSACIG00000012170	ddx43	68	38.085
ENSACIG00000013354	-	64	36.745	ENSACIG00000014378	ddx27	90	39.899
ENSACIG00000013354	-	63	31.043	ENSACIG00000014804	ddx19	80	30.730
ENSACIG00000013354	-	58	35.511	ENSACIG00000011029	ddx49	69	35.227
ENSACIG00000013354	-	76	42.549	ENSACIG00000001068	-	80	41.928
ENSACIG00000013354	-	81	37.344	ENSACIG00000007376	ddx42	57	37.797
ENSACIG00000013354	-	68	30.843	ENSACIG00000007948	-	92	30.843
ENSACIG00000013354	-	60	44.568	ENSACIG00000007438	-	76	44.568
ENSACIG00000013354	-	67	38.152	ENSACIG00000000022	ddx23	55	38.263
ENSACIG00000013354	-	62	34.501	ENSACIG00000022802	ddx47	72	34.501
ENSACIG00000013354	-	60	58.101	ENSACIG00000017623	ddx4	87	58.101
ENSACIG00000013354	-	56	33.929	ENSACIG00000018534	ddx18	51	33.631

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000013354	-	93	81.152	ENSG00000067048	DDX3Y	92	78.049	Homo_sapiens
ENSACIG00000013354	-	93	82.404	ENSG00000215301	DDX3X	100	84.551	Homo_sapiens
ENSACIG00000013354	-	88	92.190	ENSAPOG00000003652	-	98	79.412	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013354	-	94	84.561	ENSAPOG00000019437	-	96	78.595	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013354	-	93	81.597	ENSAMEG00000006801	DDX3X	91	78.282	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000013354	-	88	92.190	ENSAOCG00000002188	-	98	79.412	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013354	-	77	91.342	ENSAOCG00000018576	-	96	85.690	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013354	-	97	83.759	ENSAPEG00000020102	-	96	81.416	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013354	-	99	96.095	ENSAPEG00000005976	-	100	96.095	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013354	-	94	87.034	ENSATEG00000019116	-	98	78.025	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013354	-	94	95.398	ENSATEG00000019608	-	93	88.936	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013354	-	92	82.447	ENSAPLG00000014240	-	92	78.982	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000013354	-	88	82.332	ENSACAG00000017928	-	90	71.408	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000013354	-	92	74.194	ENSANAG00000000067	-	89	74.074	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000013354	-	93	82.404	ENSANAG00000017441	DDX3X	95	77.922	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000013354	-	100	93.040	ENSACLG00000003774	-	98	93.040	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013354	-	91	89.011	ENSACLG00000013517	-	98	78.711	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013354	-	91	89.416	ENSAMXG00000032415	ddx3xa	98	77.514	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000013354	-	93	90.090	ENSAMXG00000013396	ddx3xb	95	88.384	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000013354	-	93	81.533	ENSBTAG00000035907	DDX3X	96	78.571	Bos_taurus
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSCJAG00000015787	DDX3X	95	78.247	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSCAFG00000014251	DDX3X	92	78.768	Canis_familiaris
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSCAFG00020027227	DDX3X	92	78.768	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000013354	-	93	80.977	ENSCHIG00000010585	-	92	77.850	Capra_hircus
ENSACIG00000013354	-	87	67.113	ENSCHIG00000000047	-	89	66.539	Capra_hircus
ENSACIG00000013354	-	93	81.533	ENSCHIG00000024903	-	92	78.571	Capra_hircus
ENSACIG00000013354	-	88	82.184	ENSTSYG00000029157	-	93	80.812	Carlito_syrichta
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSTSYG00000003895	DDX3X	79	82.118	Carlito_syrichta
ENSACIG00000013354	-	93	80.139	ENSCAPG00000010945	-	93	76.797	Cavia_aperea
ENSACIG00000013354	-	99	58.050	ENSCAPG00000014373	-	92	62.193	Cavia_aperea
ENSACIG00000013354	-	92	65.603	ENSCPOG00000039190	-	92	63.279	Cavia_porcellus
ENSACIG00000013354	-	93	79.791	ENSCPOG00000020978	-	92	76.471	Cavia_porcellus
ENSACIG00000013354	-	93	81.913	ENSCPOG00000013557	-	92	78.606	Cavia_porcellus
ENSACIG00000013354	-	89	80.819	ENSCCAG00000036904	-	99	75.367	Cebus_capucinus
ENSACIG00000013354	-	93	82.404	ENSCCAG00000023934	DDX3X	95	78.247	Cebus_capucinus
ENSACIG00000013354	-	93	81.851	ENSCCAG00000000872	-	88	80.736	Cebus_capucinus
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSCATG00000010148	DDX3X	95	78.247	Cercocebus_atys
ENSACIG00000013354	-	92	80.526	ENSCLAG00000000993	DDX3X	92	76.823	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000013354	-	93	81.961	ENSCSAG00000018317	DDX3Y	92	78.303	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000013354	-	59	76.011	ENSCSAG00000013949	DDX3X	83	76.011	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000013354	-	69	87.571	ENSCHOG00000011076	DDX3X	69	89.326	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000013354	-	92	80.000	ENSCPBG00000019916	-	92	75.355	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSCANG00000031127	DDX3X	95	78.247	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000013354	-	81	89.027	ENSCGRG00001002373	D1Pas1	95	82.904	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000013354	-	93	81.043	ENSCGRG00001022185	Ddx3x	92	78.120	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000013354	-	93	81.043	ENSCGRG00000010880	Ddx3x	92	78.120	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000013354	-	93	90.161	ENSCSEG00000003352	-	97	80.055	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000013354	-	90	88.561	ENSCSEG00000000900	-	98	77.406	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000013354	-	100	78.098	ENSCVAG00000001784	-	96	79.728	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013354	-	100	87.624	ENSCVAG00000011003	-	97	87.767	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013354	-	91	88.525	ENSDARG00000020573	ddx3xa	97	79.030	Danio_rerio
ENSACIG00000013354	-	96	82.246	ENSDARG00000005774	ddx3xb	99	96.271	Danio_rerio
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSDNOG00000007452	-	87	91.738	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000013354	-	92	80.210	ENSDNOG00000005693	-	92	76.661	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000013354	-	93	82.230	ENSDORG00000029882	Ddx3x	92	77.760	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000013354	-	71	89.125	ENSETEG00000006882	DDX3X	65	89.858	Echinops_telfairi
ENSACIG00000013354	-	76	68.219	ENSEBUG00000007692	ddx3xa	91	68.826	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013354	-	93	81.152	ENSEASG00005012087	DDX3Y	92	77.398	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000013354	-	70	90.431	ENSEASG00005009841	DDX3X	100	84.375	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSECAG00000009901	DDX3X	90	82.143	Equus_caballus
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSEEUG00000002817	DDX3X	95	78.120	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000013354	-	100	79.637	ENSELUG00000004613	-	98	80.056	Esox_lucius
ENSACIG00000013354	-	99	75.718	ENSELUG00000023518	-	99	75.144	Esox_lucius
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSFCAG00000025339	DDX3X	92	78.606	Felis_catus
ENSACIG00000013354	-	85	85.941	ENSFALG00000001530	-	93	83.764	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000013354	-	92	80.610	ENSFDAG00000013328	DDX3Y	95	76.578	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000013354	-	92	57.038	ENSFDAG00000006053	-	93	54.153	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000013354	-	93	81.391	ENSFDAG00000011500	-	92	78.768	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000013354	-	92	85.538	ENSFHEG00000010407	-	93	82.736	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013354	-	91	85.502	ENSFHEG00000012643	-	95	84.014	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013354	-	96	77.027	ENSGMOG00000003944	DDX3X	100	76.276	Gadus_morhua
ENSACIG00000013354	-	92	83.452	ENSGALG00000016231	DDX3X	94	79.470	Gallus_gallus
ENSACIG00000013354	-	95	85.590	ENSGAFG00000022047	-	97	78.035	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013354	-	100	85.380	ENSGAFG00000003155	ddx3xb	96	86.222	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013354	-	96	85.862	ENSGACG00000014407	-	97	80.258	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013354	-	100	72.805	ENSGACG00000008206	-	97	71.831	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013354	-	92	80.000	ENSGAGG00000004207	-	87	79.557	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000013354	-	93	81.565	ENSGGOG00000003181	DDX3X	95	78.247	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000013354	-	100	93.040	ENSHBUG00000009486	-	98	93.040	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013354	-	91	89.011	ENSHBUG00000002311	-	92	88.192	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013354	-	92	80.877	ENSHGLG00000010084	-	92	77.634	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000013354	-	93	82.056	ENSHGLG00000004805	Ddx3x	92	78.247	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000013354	-	94	60.104	ENSHGLG00100013600	-	91	58.843	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013354	-	93	81.391	ENSHGLG00100005685	-	92	77.958	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013354	-	81	92.424	ENSHGLG00100005604	-	95	92.424	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013354	-	92	77.915	ENSHGLG00100000759	-	88	77.425	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000013354	-	99	81.525	ENSHCOG00000016890	-	95	81.113	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013354	-	100	87.801	ENSHCOG00000006275	-	97	86.809	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013354	-	100	79.571	ENSIPUG00000023024	ddx3xa	98	78.429	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000013354	-	100	78.479	ENSIPUG00000009936	ddx3xb	97	79.760	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000013354	-	93	81.217	ENSSTOG00000008094	DDX3X	88	78.282	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000013354	-	93	81.043	ENSJJAG00000019645	Ddx3x	92	78.155	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000013354	-	99	88.841	ENSKMAG00000012633	-	96	88.126	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000013354	-	100	79.365	ENSKMAG00000011081	-	97	78.355	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACIG00000013354	-	100	79.683	ENSXMAG00000006761	-	97	78.530	Xiphophorus_maculatus
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