EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000013359 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: arl4d
Alias: fc03d05|wu:fc03d05|zgc:77741
Full Name: ADP-ribosylation factor-like 4D
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 606 bases
Position: chrCCOE01000143.1:2546372-2546977
Accession: ZDB-GENE-030131-2293
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000017135	MMR_HSR1	PF01926.23	8.7e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000017601	-	606	-	ENSACIP00000017135	201 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000013359	arl4d	84	39.181	ENSACIG00000016662	arl8	92	39.181
ENSACIG00000013359	arl4d	83	36.207	ENSACIG00000009740	arfrp1	85	36.207
ENSACIG00000013359	arl4d	81	44.444	ENSACIG00000012192	-	87	44.444
ENSACIG00000013359	arl4d	90	31.148	ENSACIG00000009595	arl8bb	89	31.148
ENSACIG00000013359	arl4d	85	47.059	ENSACIG00000014610	zgc:110286	91	47.059
ENSACIG00000013359	arl4d	59	30.579	ENSACIG00000003092	rab11a	54	30.579
ENSACIG00000013359	arl4d	80	35.625	ENSACIG00000007953	arl1	86	35.625
ENSACIG00000013359	arl4d	86	63.793	ENSACIG00000024420	-	95	61.497
ENSACIG00000013359	arl4d	60	35.246	ENSACIG00000019049	rab1ab	79	35.833
ENSACIG00000013359	arl4d	84	36.095	ENSACIG00000000612	arl2	89	36.095
ENSACIG00000013359	arl4d	84	30.000	ENSACIG00000008102	rab18b	80	30.000
ENSACIG00000013359	arl4d	54	31.193	ENSACIG00000008614	arl8ba	70	31.193
ENSACIG00000013359	arl4d	65	31.159	ENSACIG00000006949	RAB17	58	31.159
ENSACIG00000013359	arl4d	72	31.373	ENSACIG00000007154	rab6ba	71	31.373
ENSACIG00000013359	arl4d	86	37.572	ENSACIG00000019225	-	96	37.572
ENSACIG00000013359	arl4d	59	30.833	ENSACIG00000014094	rab6bb	58	30.833
ENSACIG00000013359	arl4d	60	34.426	ENSACIG00000014625	-	59	34.426
ENSACIG00000013359	arl4d	58	33.051	ENSACIG00000021459	zgc:101559	51	33.051
ENSACIG00000013359	arl4d	66	30.435	ENSACIG00000014012	rab22a	67	30.435
ENSACIG00000013359	arl4d	82	32.386	ENSACIG00000013634	sar1b	86	32.386
ENSACIG00000013359	arl4d	99	61.692	ENSACIG00000000949	-	100	61.692
ENSACIG00000013359	arl4d	81	33.133	ENSACIG00000000945	-	87	33.133
ENSACIG00000013359	arl4d	81	46.914	ENSACIG00000000467	-	87	46.914
ENSACIG00000013359	arl4d	61	32.800	ENSACIG00000009006	zgc:171927	57	32.800
ENSACIG00000013359	arl4d	60	37.190	ENSACIG00000024513	-	59	37.190
ENSACIG00000013359	arl4d	83	31.176	ENSACIG00000022050	ARL6	70	31.176
ENSACIG00000013359	arl4d	63	30.709	ENSACIG00000003157	-	66	30.709
ENSACIG00000013359	arl4d	84	40.000	ENSACIG00000008975	arl5c	94	40.000
ENSACIG00000013359	arl4d	86	39.884	ENSACIG00000016407	arl3l2	90	39.884
ENSACIG00000013359	arl4d	99	57.286	ENSACIG00000000312	arl4cb	100	57.286
ENSACIG00000013359	arl4d	84	45.562	ENSACIG00000005843	arf5	91	45.562
ENSACIG00000013359	arl4d	82	32.386	ENSACIG00000019827	sar1ab	86	32.386
ENSACIG00000013359	arl4d	59	31.405	ENSACIG00000024376	-	54	31.405
ENSACIG00000013359	arl4d	69	30.935	ENSACIG00000014605	rab6a	66	30.935
ENSACIG00000013359	arl4d	81	43.827	ENSACIG00000019050	-	87	43.827
ENSACIG00000013359	arl4d	95	41.885	ENSACIG00000022896	arf3b	100	41.885
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.782	ENSACIG00000018839	-	100	71.782
ENSACIG00000013359	arl4d	85	42.353	ENSACIG00000012912	arf2b	74	42.353
ENSACIG00000013359	arl4d	99	58.500	ENSACIG00000009110	arl4aa	100	58.500
ENSACIG00000013359	arl4d	95	41.885	ENSACIG00000016782	-	100	41.885
ENSACIG00000013359	arl4d	86	40.000	ENSACIG00000023231	arl11	95	40.000
ENSACIG00000013359	arl4d	79	38.889	ENSACIG00000003228	arl5a	89	38.889
ENSACIG00000013359	arl4d	86	39.535	ENSACIG00000013244	arl14	81	39.535
ENSACIG00000013359	arl4d	76	34.416	ENSACIG00000017582	arl13b	62	34.416
ENSACIG00000013359	arl4d	59	31.933	ENSACIG00000010914	RAB41	55	31.933

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSG00000175906	ARL4D	100	72.139	Homo_sapiens
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSAMEG00000019914	ARL4D	100	72.139	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000013359	arl4d	99	75.248	ENSATEG00000010065	-	100	75.248	Anabas_testudineus
ENSACIG00000013359	arl4d	100	70.647	ENSACAG00000013300	ARL4D	100	70.647	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.637	ENSANAG00000009266	ARL4D	100	72.637	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.642	ENSACLG00000011811	-	99	71.642	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013359	arl4d	100	97.015	ENSACLG00000024991	arl4d	100	97.015	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000013359	arl4d	99	73.500	ENSBTAG00000016847	ARL4D	100	73.500	Bos_taurus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSCJAG00000010785	ARL4D	100	72.139	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSCAFG00000014581	ARL4D	100	72.139	Canis_familiaris
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSCAFG00020012929	ARL4D	100	72.139	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000013359	arl4d	99	73.000	ENSCHIG00000005944	ARL4D	100	73.000	Capra_hircus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	65.500	ENSCPOG00000000435	ARL4D	100	65.500	Cavia_porcellus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSCCAG00000014166	ARL4D	100	72.139	Cebus_capucinus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSCATG00000020255	ARL4D	100	72.139	Cercocebus_atys
ENSACIG00000013359	arl4d	89	66.480	ENSCLAG00000018100	ARL4D	100	64.500	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSCSAG00000019024	ARL4D	100	72.139	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000013359	arl4d	66	76.692	ENSCHOG00000007836	ARL4D	100	76.692	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000013359	arl4d	100	77.114	ENSCPBG00000016255	ARL4D	100	77.114	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSCANG00000022595	ARL4D	100	72.139	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.637	ENSCGRG00001011460	Arl4d	100	72.637	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.637	ENSCGRG00000019127	-	100	72.637	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.637	ENSCGRG00000000260	-	100	72.637	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000013359	arl4d	99	76.238	ENSCSEG00000012307	-	100	76.238	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000013359	arl4d	99	83.000	ENSDARG00000045074	arl4d	100	83.000	Danio_rerio
ENSACIG00000013359	arl4d	93	75.936	ENSDNOG00000018767	ARL4D	100	73.000	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.000	ENSDORG00000023792	Arl4d	100	72.000	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000013359	arl4d	97	72.821	ENSECAG00000001021	ARL4D	89	72.821	Equus_caballus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.000	ENSEEUG00000007390	ARL4D	100	71.000	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSFCAG00000009907	-	100	72.139	Felis_catus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	68.159	ENSFCAG00000045027	-	100	68.159	Felis_catus
ENSACIG00000013359	arl4d	100	76.355	ENSGMOG00000002137	ARL4D	100	76.355	Gadus_morhua
ENSACIG00000013359	arl4d	100	89.552	ENSGAFG00000012473	arl4d	100	89.552	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013359	arl4d	100	89.552	ENSGACG00000003710	arl4d	100	89.552	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	68.000	ENSGACG00000000500	-	100	68.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	76.500	ENSGAGG00000024318	ARL4D	100	76.500	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSGGOG00000042970	ARL4D	100	72.139	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000013359	arl4d	100	96.517	ENSHBUG00000005802	arl4d	100	96.517	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013359	arl4d	99	70.647	ENSHBUG00000013721	-	99	70.647	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.429	ENSHCOG00000008536	-	100	71.429	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013359	arl4d	99	78.000	ENSHCOG00000011881	arl4d	99	78.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013359	arl4d	99	81.500	ENSIPUG00000019342	Arl4d	100	81.500	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	73.000	ENSSTOG00000000518	ARL4D	100	73.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	74.000	ENSJJAG00000004698	Arl4d	100	74.000	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000013359	arl4d	90	90.608	ENSLBEG00000011152	arl4d	91	90.608	Labrus_bergylta
ENSACIG00000013359	arl4d	99	83.000	ENSLACG00000003905	ARL4D	100	83.000	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000013359	arl4d	99	82.500	ENSLOCG00000017515	arl4d	100	82.500	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.000	ENSLAFG00000002606	ARL4D	100	71.000	Loxodonta_africana
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSMFAG00000029966	ARL4D	100	72.139	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSMMUG00000021324	ARL4D	100	72.139	Macaca_mulatta
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSMNEG00000001796	ARL4D	100	72.139	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSMLEG00000026779	ARL4D	100	72.139	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.642	ENSMZEG00005008617	-	99	71.642	Maylandia_zebra
ENSACIG00000013359	arl4d	100	97.015	ENSMZEG00005007392	arl4d	100	97.015	Maylandia_zebra
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSMAUG00000017839	Arl4d	100	72.139	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.500	ENSMICG00000046097	ARL4D	100	71.500	Microcebus_murinus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.637	ENSMOCG00000002133	Arl4d	100	72.637	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000013359	arl4d	99	77.723	ENSMMOG00000004941	-	100	77.723	Mola_mola
ENSACIG00000013359	arl4d	100	71.782	ENSMODG00000024202	ARL4D	100	71.782	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000013359	arl4d	99	73.892	ENSMALG00000010932	-	100	73.892	Monopterus_albus
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.144	MGP_CAROLIEiJ_G0017227	Arl4d	100	71.144	Mus_caroli
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ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.144	MGP_PahariEiJ_G0018357	Arl4d	100	71.144	Mus_pahari
ENSACIG00000013359	arl4d	99	71.144	MGP_SPRETEiJ_G0018070	Arl4d	100	71.144	Mus_spretus
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ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.139	ENSNLEG00000032904	ARL4D	100	72.139	Nomascus_leucogenys
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ENSACIG00000013359	arl4d	99	72.772	ENSONIG00000003403	ARL4D	100	72.772	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000013359	arl4d	100	97.015	ENSONIG00000021238	arl4d	100	97.015	Oreochromis_niloticus
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