EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000013470 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11393 bases
Position: chrCCOE01000444.1:900138-911530
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000017267	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-53	9	9
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ENSACIP00000017267	zf-met	PF12874.7	3.1e-25	6	6

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000017737	-	1539	-	ENSACIP00000017267	512 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000013470	-	64	42.564	ENSACIG00000017892	-	85	42.564
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ENSACIG00000013470	-	64	34.722	ENSACIG00000013613	scrt1b	57	34.722
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ENSACIG00000013470	-	64	50.655	ENSACIG00000019447	-	80	50.655
ENSACIG00000013470	-	54	43.709	ENSACIG00000008886	znf1164	86	43.709
ENSACIG00000013470	-	67	43.860	ENSACIG00000021986	-	93	43.860
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ENSACIG00000013470	-	93	51.176	ENSACIG00000017013	-	80	51.176
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ENSACIG00000013470	-	65	37.615	ENSACIG00000000406	prdm5	75	37.615
ENSACIG00000013470	-	63	51.111	ENSACIG00000015835	-	79	51.111
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ENSACIG00000013470	-	62	41.304	ENSACIG00000002180	-	94	41.304
ENSACIG00000013470	-	97	53.025	ENSACIG00000010966	-	72	53.025
ENSACIG00000013470	-	61	40.708	ENSACIG00000014282	znf526	84	32.872
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ENSACIG00000013470	-	80	45.333	ENSACIG00000022625	-	99	45.333
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ENSACIG00000013470	-	97	50.345	ENSACIG00000018022	-	84	50.685
ENSACIG00000013470	-	64	43.979	ENSACIG00000007882	-	77	43.979
ENSACIG00000013470	-	94	45.536	ENSACIG00000019710	-	92	42.545
ENSACIG00000013470	-	96	48.746	ENSACIG00000016182	-	98	48.746
ENSACIG00000013470	-	55	30.672	ENSACIG00000002944	-	86	30.672
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ENSACIG00000013470	-	64	45.399	ENSACIG00000020938	zbtb47b	74	46.875
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ENSACIG00000013470	-	95	47.917	ENSACIG00000004745	-	96	45.704
ENSACIG00000013470	-	65	40.254	ENSACIG00000017683	-	88	40.254
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ENSACIG00000013470	-	88	44.538	ENSACIG00000006826	-	82	44.167
ENSACIG00000013470	-	56	53.476	ENSACIG00000000286	-	70	53.476
ENSACIG00000013470	-	92	55.621	ENSACIG00000009717	-	96	53.640
ENSACIG00000013470	-	99	49.333	ENSACIG00000007464	-	88	48.795
ENSACIG00000013470	-	65	46.067	ENSACIG00000017653	-	99	46.067
ENSACIG00000013470	-	64	48.848	ENSACIG00000023794	-	70	48.848
ENSACIG00000013470	-	64	42.793	ENSACIG00000010739	-	79	42.793
ENSACIG00000013470	-	96	51.095	ENSACIG00000019102	-	67	53.913
ENSACIG00000013470	-	75	48.837	ENSACIG00000019804	-	82	54.412
ENSACIG00000013470	-	65	36.422	ENSACIG00000012263	znf319b	93	36.422
ENSACIG00000013470	-	55	41.071	ENSACIG00000013946	-	57	41.071
ENSACIG00000013470	-	64	46.575	ENSACIG00000022330	-	85	46.575
ENSACIG00000013470	-	64	52.632	ENSACIG00000018440	-	94	52.632
ENSACIG00000013470	-	79	36.900	ENSACIG00000007000	-	63	36.170
ENSACIG00000013470	-	70	51.282	ENSACIG00000007096	-	90	51.282
ENSACIG00000013470	-	64	53.431	ENSACIG00000003754	-	83	53.431
ENSACIG00000013470	-	64	37.500	ENSACIG00000015411	-	83	37.500
ENSACIG00000013470	-	96	48.305	ENSACIG00000018059	-	84	48.305
ENSACIG00000013470	-	70	48.772	ENSACIG00000019791	-	92	43.007

Orthologs

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ENSACIG00000013470	-	97	53.275	ENSAPOG00000018490	-	66	54.911	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	97	56.796	ENSAPOG00000021367	-	90	53.081	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	66	42.138	ENSAPOG00000003193	znf1056	89	42.138	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	94	55.828	ENSAPOG00000022273	-	76	55.828	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	97	55.276	ENSAPOG00000022007	-	90	47.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	97	55.010	ENSAPOG00000020125	-	92	55.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	92	49.497	ENSAPOG00000021997	-	98	47.510	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	97	51.872	ENSAPOG00000022267	-	88	51.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013470	-	97	57.767	ENSAOCG00000017588	-	90	52.885	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013470	-	97	53.275	ENSAOCG00000012829	-	75	54.667	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013470	-	67	42.545	ENSAOCG00000003494	si:dkey-7i4.5	94	42.601	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013470	-	92	50.202	ENSAOCG00000000655	-	91	49.209	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000013470	-	97	55.215	ENSAOCG00000007146	-	80	55.215	Amphiprion_ocellaris
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