EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000013946 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3565 bases
Position: chrCCOE01000806.1:1380971-1384535
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000017876	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-14	1	3
ENSACIP00000017876	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-14	2	3
ENSACIP00000017876	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-14	3	3
ENSACIP00000017876	zf-met	PF12874.7	4e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000018361	-	951	-	ENSACIP00000017876	316 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000013946	-	67	41.905	ENSACIG00000016117	-	80	44.286
ENSACIG00000013946	-	61	40.816	ENSACIG00000006806	-	70	40.816
ENSACIG00000013946	-	75	38.889	ENSACIG00000019791	-	90	38.211
ENSACIG00000013946	-	80	33.987	ENSACIG00000016133	-	52	39.130
ENSACIG00000013946	-	55	41.053	ENSACIG00000017892	-	69	41.053
ENSACIG00000013946	-	59	35.802	ENSACIG00000017644	-	80	37.681
ENSACIG00000013946	-	57	36.111	ENSACIG00000021986	-	89	36.111
ENSACIG00000013946	-	53	45.370	ENSACIG00000023212	-	66	45.045
ENSACIG00000013946	-	90	42.857	ENSACIG00000017050	-	91	53.731
ENSACIG00000013946	-	53	43.529	ENSACIG00000009780	-	90	43.529
ENSACIG00000013946	-	66	39.000	ENSACIG00000003556	-	77	39.000
ENSACIG00000013946	-	95	38.144	ENSACIG00000017683	-	78	38.144
ENSACIG00000013946	-	58	37.374	ENSACIG00000009128	-	86	36.634
ENSACIG00000013946	-	54	41.121	ENSACIG00000009755	-	64	43.396
ENSACIG00000013946	-	56	44.444	ENSACIG00000019815	-	85	44.444
ENSACIG00000013946	-	64	37.008	ENSACIG00000020938	zbtb47b	50	36.800
ENSACIG00000013946	-	72	44.118	ENSACIG00000014123	znf236	57	44.118
ENSACIG00000013946	-	62	39.048	ENSACIG00000022625	-	86	44.681
ENSACIG00000013946	-	69	40.952	ENSACIG00000019447	-	78	40.952
ENSACIG00000013946	-	64	51.429	ENSACIG00000012636	ZNF319	60	55.814
ENSACIG00000013946	-	70	42.241	ENSACIG00000013604	-	84	41.880
ENSACIG00000013946	-	65	43.396	ENSACIG00000010739	-	74	43.396
ENSACIG00000013946	-	60	41.935	ENSACIG00000004041	-	91	42.276
ENSACIG00000013946	-	50	42.500	ENSACIG00000022738	-	91	39.506
ENSACIG00000013946	-	56	37.600	ENSACIG00000003720	-	63	37.963
ENSACIG00000013946	-	56	51.429	ENSACIG00000012263	znf319b	84	51.429
ENSACIG00000013946	-	62	44.444	ENSACIG00000023313	-	91	37.126
ENSACIG00000013946	-	56	43.299	ENSACIG00000013163	-	77	43.299
ENSACIG00000013946	-	50	37.895	ENSACIG00000012084	-	90	40.230
ENSACIG00000013946	-	62	40.000	ENSACIG00000015429	-	85	40.000
ENSACIG00000013946	-	62	38.095	ENSACIG00000002944	-	52	38.095
ENSACIG00000013946	-	73	47.253	ENSACIG00000011541	-	67	47.253
ENSACIG00000013946	-	71	36.066	ENSACIG00000006172	-	91	39.231
ENSACIG00000013946	-	50	47.727	ENSACIG00000022658	-	88	47.727
ENSACIG00000013946	-	59	42.857	ENSACIG00000016182	-	90	41.935
ENSACIG00000013946	-	75	40.187	ENSACIG00000004745	-	93	50.000
ENSACIG00000013946	-	65	39.048	ENSACIG00000003515	-	85	51.064
ENSACIG00000013946	-	61	43.810	ENSACIG00000017647	-	90	41.600
ENSACIG00000013946	-	61	34.375	ENSACIG00000018022	-	67	34.375
ENSACIG00000013946	-	63	46.226	ENSACIG00000009717	-	91	46.226
ENSACIG00000013946	-	56	42.391	ENSACIG00000022330	-	85	40.952
ENSACIG00000013946	-	52	38.679	ENSACIG00000000406	prdm5	58	39.623
ENSACIG00000013946	-	65	42.105	ENSACIG00000010647	-	94	45.263
ENSACIG00000013946	-	68	44.444	ENSACIG00000015835	-	75	41.667
ENSACIG00000013946	-	59	40.566	ENSACIG00000022293	-	91	40.566
ENSACIG00000013946	-	60	40.909	ENSACIG00000004666	-	99	40.845
ENSACIG00000013946	-	66	35.484	ENSACIG00000003754	-	80	39.024
ENSACIG00000013946	-	60	48.958	ENSACIG00000011515	-	62	48.958
ENSACIG00000013946	-	73	36.066	ENSACIG00000019710	-	62	36.170
ENSACIG00000013946	-	57	41.071	ENSACIG00000013470	-	55	41.071
ENSACIG00000013946	-	50	33.036	ENSACIG00000023049	znf646	88	33.036
ENSACIG00000013946	-	63	32.195	ENSACIG00000007464	-	61	36.036
ENSACIG00000013946	-	56	39.175	ENSACIG00000024444	-	60	39.175

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000013946	-	57	41.053	ENSAPOG00000005023	-	75	41.053	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000013946	-	57	51.220	ENSAPEG00000010602	-	76	51.220	Amphiprion_percula
ENSACIG00000013946	-	63	44.068	ENSBTAG00000053591	-	96	40.187	Bos_taurus
ENSACIG00000013946	-	59	45.283	ENSCING00000021875	-	88	45.283	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000013946	-	52	38.679	ENSCING00000024222	-	94	38.679	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000013946	-	72	41.905	ENSCVAG00000001369	-	82	41.905	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	57	40.000	ENSCVAG00000011469	-	78	40.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	52	40.506	ENSCVAG00000011213	-	95	38.182	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	51	46.809	ENSCVAG00000006460	-	68	46.809	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	54	39.241	ENSCVAG00000000419	-	68	39.241	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	87	38.542	ENSCVAG00000002488	-	97	38.542	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	70	43.810	ENSCVAG00000020119	-	66	43.810	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	77	46.667	ENSCVAG00000012216	-	94	46.667	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	95	42.593	ENSCVAG00000000227	-	74	42.593	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000013946	-	60	45.283	ENSEBUG00000003512	-	74	45.283	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	64	45.833	ENSEBUG00000004026	-	72	45.833	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	66	39.252	ENSEBUG00000005785	-	65	40.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	74	45.872	ENSEBUG00000016944	-	59	45.872	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	50	49.524	ENSEBUG00000004839	-	87	49.524	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	56	41.985	ENSEBUG00000005131	-	64	41.985	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	81	46.875	ENSEBUG00000006112	-	63	46.875	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	59	46.875	ENSEBUG00000012502	-	83	46.875	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	61	46.316	ENSEBUG00000009436	-	79	46.316	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	60	50.000	ENSEBUG00000003954	-	70	50.000	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	51	47.368	ENSEBUG00000002146	-	59	47.368	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000013946	-	58	43.373	ENSELUG00000013311	-	83	43.373	Esox_lucius
ENSACIG00000013946	-	56	44.792	ENSFHEG00000013103	-	66	44.792	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	63	41.509	ENSFHEG00000007350	-	90	41.509	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	60	50.000	ENSFHEG00000000851	-	97	50.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	54	52.381	ENSFHEG00000019159	-	98	54.348	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	50	40.000	ENSFHEG00000019953	-	69	40.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	55	40.789	ENSFHEG00000012558	-	84	40.789	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	72	39.091	ENSFHEG00000002625	-	83	44.681	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	51	43.590	ENSFHEG00000013114	-	69	44.860	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	53	42.991	ENSFHEG00000013064	-	68	42.991	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	57	41.732	ENSFHEG00000000843	-	68	41.600	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	66	39.252	ENSFHEG00000011944	-	99	39.252	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	72	41.818	ENSFHEG00000013735	-	74	41.818	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	54	42.708	ENSFHEG00000016749	-	99	42.708	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	56	40.566	ENSFHEG00000021772	-	77	40.566	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	56	37.273	ENSFHEG00000021570	-	71	37.273	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	51	41.667	ENSFHEG00000013129	-	56	41.667	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	60	42.105	ENSFHEG00000016699	-	74	42.105	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	56	44.211	ENSFHEG00000000627	-	77	44.211	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	72	42.453	ENSFHEG00000012468	-	94	42.453	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000013946	-	51	47.872	ENSGAFG00000013616	-	65	47.872	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	65	42.424	ENSGAFG00000013408	-	91	42.424	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	85	38.318	ENSGAFG00000013677	-	85	43.662	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	56	45.833	ENSGAFG00000013471	-	71	45.833	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	71	40.367	ENSGAFG00000012035	-	90	42.718	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	51	43.396	ENSGAFG00000014088	-	61	43.396	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	71	39.831	ENSGAFG00000012987	-	84	39.831	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	53	43.925	ENSGAFG00000013420	-	66	43.925	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	56	50.000	ENSGAFG00000013396	-	74	50.000	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	58	44.681	ENSGAFG00000013055	-	65	39.216	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	56	41.053	ENSGAFG00000013462	-	64	38.947	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	56	40.964	ENSGAFG00000013452	-	68	40.964	Gambusia_affinis
ENSACIG00000013946	-	50	33.051	ENSHBUG00000014494	-	56	33.051	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000013946	-	61	41.667	ENSHCOG00000003085	-	67	41.667	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	57	43.956	ENSHCOG00000020879	-	64	43.956	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	56	41.121	ENSHCOG00000020856	-	84	41.121	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	74	38.095	ENSHCOG00000015386	-	86	38.095	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	69	40.206	ENSHCOG00000014986	-	78	40.206	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	66	40.952	ENSHCOG00000007664	-	96	39.815	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	51	37.615	ENSHCOG00000020846	-	61	37.615	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	72	41.237	ENSHCOG00000007485	-	95	45.217	Hippocampus_comes
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ENSACIG00000013946	-	69	40.000	ENSHCOG00000015105	-	85	46.154	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	61	40.566	ENSHCOG00000019438	-	83	40.566	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	56	38.938	ENSHCOG00000021073	-	68	38.318	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	54	40.426	ENSHCOG00000007990	-	70	40.000	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	72	41.237	ENSHCOG00000008168	-	89	52.174	Hippocampus_comes
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ENSACIG00000013946	-	52	39.450	ENSHCOG00000019541	-	59	40.000	Hippocampus_comes
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ENSACIG00000013946	-	62	47.619	ENSHCOG00000000517	-	61	47.619	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	57	45.205	ENSHCOG00000019385	-	68	45.205	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	55	41.509	ENSHCOG00000020909	-	65	41.509	Hippocampus_comes
ENSACIG00000013946	-	69	37.113	ENSKMAG00000000462	-	80	37.113	Kryptolebias_marmoratus
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ENSACIG00000013946	-	69	40.404	ENSMALG00000012056	-	83	40.404	Monopterus_albus
ENSACIG00000013946	-	52	40.000	ENSMLUG00000003468	-	93	40.000	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000013946	-	64	52.381	ENSONIG00000002024	-	95	52.381	Oreochromis_niloticus
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ENSACIG00000013946	-	64	41.346	ENSOMEG00000022915	-	91	40.909	Oryzias_melastigma
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ENSACIG00000013946	-	51	43.119	ENSPREG00000012539	-	74	43.119	Poecilia_reticulata
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ENSACIG00000013946	-	63	48.837	ENSXMAG00000026295	-	88	46.032	Xiphophorus_maculatus
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ENSACIG00000013946	-	51	44.444	ENSXMAG00000022422	-	69	44.444	Xiphophorus_maculatus