EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014158 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpf1
Alias: bxdc5|zgc:86604
Full Name: ribosome production factor 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5727 bases
Position: chrCCOE01000057.1:931775-937501
Accession: ZDB-GENE-040625-177
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018164	Brix	PF04427.18	2e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000018651	-	1062	-	ENSACIP00000018164	353 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014158	rpf1	63	35.808	ENSACIG00000010761	imp4	86	35.808

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014158	rpf1	90	78.056	ENSG00000117133	RPF1	93	77.538	Homo_sapiens
ENSACIG00000014158	rpf1	100	84.181	ENSAPOG00000022055	rpf1	100	84.789	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.498	ENSAPOG00000005211	imp4	96	31.834	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014158	rpf1	65	79.913	ENSAMEG00000008531	RPF1	100	79.913	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000014158	rpf1	80	30.420	ENSAMEG00000002918	IMP4	96	30.796	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000014158	rpf1	100	83.193	ENSAOCG00000012163	rpf1	100	84.594	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.934	ENSAOCG00000019092	imp4	96	32.180	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.934	ENSAPEG00000017240	imp4	98	32.990	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014158	rpf1	100	83.898	ENSAPEG00000004908	rpf1	100	85.915	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014158	rpf1	100	87.535	ENSATEG00000010855	rpf1	100	87.535	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.498	ENSATEG00000012019	imp4	97	32.759	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014158	rpf1	78	83.942	ENSAPLG00000016382	RPF1	100	83.942	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000014158	rpf1	82	31.379	ENSACAG00000005882	IMP4	97	31.379	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000014158	rpf1	96	72.222	ENSACAG00000005753	RPF1	94	75.617	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000014158	rpf1	64	33.617	ENSANAG00000025384	-	96	30.314	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014158	rpf1	92	69.789	ENSANAG00000035829	-	89	73.052	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014158	rpf1	91	77.259	ENSANAG00000035706	-	93	76.615	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014158	rpf1	100	92.351	ENSACLG00000001707	rpf1	100	93.768	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.934	ENSACLG00000006695	imp4	96	32.180	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014158	rpf1	78	31.317	ENSAMXG00000009639	imp4	93	31.783	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014158	rpf1	86	88.197	ENSAMXG00000041217	rpf1	100	78.711	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014158	rpf1	95	74.184	ENSBTAG00000008118	RPF1	92	76.453	Bos_taurus
ENSACIG00000014158	rpf1	60	35.681	ENSBTAG00000003225	IMP4	96	31.359	Bos_taurus
ENSACIG00000014158	rpf1	79	54.448	WBGene00009711	F44G4.1	73	54.448	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000014158	rpf1	82	32.203	WBGene00014083	ZK795.3	95	32.203	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000014158	rpf1	96	74.926	ENSCJAG00000007400	RPF1	91	77.570	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000014158	rpf1	88	78.710	ENSCAFG00000020311	RPF1	93	76.308	Canis_familiaris
ENSACIG00000014158	rpf1	78	31.541	ENSCAFG00000031902	IMP4	96	31.142	Canis_familiaris
ENSACIG00000014158	rpf1	88	78.710	ENSCAFG00020014296	RPF1	93	76.308	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.081	ENSCAFG00020003191	-	85	33.621	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000014158	rpf1	97	73.684	ENSCHIG00000012566	-	92	76.147	Capra_hircus
ENSACIG00000014158	rpf1	81	30.208	ENSCHIG00000027227	IMP4	96	30.450	Capra_hircus
ENSACIG00000014158	rpf1	97	73.392	ENSCHIG00000006618	-	92	75.841	Capra_hircus
ENSACIG00000014158	rpf1	99	71.348	ENSTSYG00000009961	RPF1	89	78.065	Carlito_syrichta
ENSACIG00000014158	rpf1	55	83.590	ENSCAPG00000011740	RPF1	91	83.590	Cavia_aperea
ENSACIG00000014158	rpf1	97	73.977	ENSCPOG00000014316	RPF1	93	76.000	Cavia_porcellus
ENSACIG00000014158	rpf1	91	77.259	ENSCCAG00000038077	RPF1	93	76.615	Cebus_capucinus
ENSACIG00000014158	rpf1	80	30.634	ENSCCAG00000021659	IMP4	96	31.010	Cebus_capucinus
ENSACIG00000014158	rpf1	60	34.742	ENSCATG00000034658	IMP4	96	31.507	Cercocebus_atys
ENSACIG00000014158	rpf1	96	66.764	ENSCATG00000010531	RPF1	93	79.038	Cercocebus_atys
ENSACIG00000014158	rpf1	99	73.219	ENSCLAG00000007607	RPF1	93	76.923	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000014158	rpf1	76	30.741	ENSCLAG00000003199	IMP4	91	31.136	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000014158	rpf1	60	34.742	ENSCSAG00000016928	IMP4	96	31.507	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000014158	rpf1	92	76.615	ENSCSAG00000018855	-	93	76.615	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000014158	rpf1	92	70.462	ENSCSAG00000001417	-	89	72.756	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000014158	rpf1	80	30.450	ENSCHOG00000009212	IMP4	96	30.822	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000014158	rpf1	61	63.084	ENSCHOG00000011775	-	100	63.084	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000014158	rpf1	84	78.859	ENSCHOG00000003320	-	98	76.235	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000014158	rpf1	92	77.709	ENSCPBG00000025911	RPF1	96	77.709	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014158	rpf1	85	61.667	ENSCING00000007514	-	85	61.667	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000014158	rpf1	85	61.667	ENSCSAVG00000003642	-	100	66.827	Ciona_savignyi
ENSACIG00000014158	rpf1	78	30.108	ENSCSAVG00000000625	-	93	30.108	Ciona_savignyi
ENSACIG00000014158	rpf1	60	30.233	ENSCANG00000034095	-	71	30.233	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000014158	rpf1	92	77.160	ENSCANG00000042634	RPF1	93	76.923	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000014158	rpf1	60	34.742	ENSCGRG00001010494	Imp4	96	30.662	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000014158	rpf1	88	79.677	ENSCGRG00001001189	Rpf1	91	77.709	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000014158	rpf1	74	83.142	ENSCGRG00000008483	Rpf1	95	80.144	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000014158	rpf1	60	34.742	ENSCGRG00000017820	Imp4	96	30.662	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.061	ENSCSEG00000016100	imp4	78	34.061	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014158	rpf1	100	82.768	ENSCSEG00000009153	rpf1	100	82.768	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014158	rpf1	100	85.393	ENSCVAG00000000086	rpf1	100	85.393	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014158	rpf1	78	33.688	ENSCVAG00000011844	imp4	96	32.534	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014158	rpf1	100	77.159	ENSDARG00000005738	rpf1	88	85.032	Danio_rerio
ENSACIG00000014158	rpf1	81	31.834	ENSDARG00000054540	imp4	96	31.834	Danio_rerio
ENSACIG00000014158	rpf1	80	30.450	ENSDNOG00000019221	IMP4	88	30.822	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000014158	rpf1	97	71.512	ENSDNOG00000004140	-	91	74.383	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000014158	rpf1	60	35.211	ENSDORG00000010685	Imp4	96	31.164	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000014158	rpf1	84	80.872	ENSDORG00000000607	Rpf1	87	80.656	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000014158	rpf1	85	49.837	FBgn0032408	CG6712	82	46.809	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000014158	rpf1	78	32.258	FBgn0039274	CG11920	89	32.258	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000014158	rpf1	60	34.272	ENSETEG00000016200	IMP4	94	34.272	Echinops_telfairi
ENSACIG00000014158	rpf1	52	74.176	ENSETEG00000002755	-	54	74.074	Echinops_telfairi
ENSACIG00000014158	rpf1	75	59.470	ENSEBUG00000010623	rpf1	100	59.470	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000014158	rpf1	97	74.063	ENSEASG00005014158	RPF1	92	76.758	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000014158	rpf1	97	74.063	ENSECAG00000019661	RPF1	92	76.758	Equus_caballus
ENSACIG00000014158	rpf1	64	79.295	ENSEEUG00000014950	-	100	79.295	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000014158	rpf1	98	68.786	ENSEEUG00000001097	-	92	71.865	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000014158	rpf1	83	31.864	ENSELUG00000004487	imp4	97	31.864	Esox_lucius
ENSACIG00000014158	rpf1	86	85.809	ENSELUG00000001464	rpf1	83	82.414	Esox_lucius
ENSACIG00000014158	rpf1	80	30.070	ENSFCAG00000031008	IMP4	96	30.450	Felis_catus
ENSACIG00000014158	rpf1	97	72.832	ENSFCAG00000025546	RPF1	92	75.229	Felis_catus
ENSACIG00000014158	rpf1	92	80.495	ENSFALG00000006037	RPF1	89	79.091	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000014158	rpf1	97	74.854	ENSFDAG00000011922	RPF1	91	76.780	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000014158	rpf1	56	34.673	ENSFDAG00000014358	IMP4	91	30.216	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000014158	rpf1	100	86.798	ENSFHEG00000004209	rpf1	100	86.517	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014158	rpf1	63	35.556	ENSFHEG00000022246	imp4	97	34.444	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014158	rpf1	86	87.417	ENSGMOG00000016281	rpf1	86	87.417	Gadus_morhua
ENSACIG00000014158	rpf1	83	31.544	ENSGALG00000029152	IMP4	97	31.879	Gallus_gallus
ENSACIG00000014158	rpf1	87	81.350	ENSGALG00000008796	RPF1	87	78.704	Gallus_gallus
ENSACIG00000014158	rpf1	53	36.170	ENSGAFG00000013585	imp4	80	36.170	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014158	rpf1	100	86.402	ENSGAFG00000016123	rpf1	100	86.402	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014158	rpf1	100	82.436	ENSGACG00000009686	rpf1	100	82.436	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.934	ENSGACG00000005210	imp4	96	32.526	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014158	rpf1	75	32.210	ENSGAGG00000017003	IMP4	96	31.488	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000014158	rpf1	90	75.862	ENSGAGG00000007145	RPF1	93	76.997	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000014158	rpf1	60	34.742	ENSGGOG00000001595	IMP4	96	30.314	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000014158	rpf1	98	73.563	ENSGGOG00000015862	RPF1	93	77.538	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000014158	rpf1	63	34.934	ENSHBUG00000014205	imp4	96	32.180	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000014158	rpf1	100	92.351	ENSHBUG00000013582	rpf1	100	93.768	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000014158	rpf1	97	74.269	ENSHGLG00000006653	RPF1	92	76.074	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000014158	rpf1	56	34.673	ENSHGLG00000017709	IMP4	91	30.403	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000014158	rpf1	97	74.269	ENSHGLG00100007263	RPF1	92	76.074	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000014158	rpf1	56	34.673	ENSHGLG00100015453	IMP4	91	30.403	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000014158	rpf1	86	87.789	ENSHCOG00000017548	rpf1	100	82.153	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014158	rpf1	62	36.073	ENSHCOG00000001797	imp4	89	32.180	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014158	rpf1	100	82.303	ENSIPUG00000003197	rpf1	100	82.303	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000014158	rpf1	82	30.303	ENSIPUG00000019326	Imp4	98	30.303	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000014158	rpf1	99	71.795	ENSSTOG00000008635	RPF1	93	76.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000014158	rpf1	98	73.926	ENSJJAG00000018873	Rpf1	92	76.758	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000014158	rpf1	60	34.272	ENSJJAG00000010983	-	96	30.137	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000014158	rpf1	100	85.915	ENSKMAG00000010792	rpf1	100	85.915	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000014158	rpf1	59	36.744	ENSKMAG00000010490	imp4	91	33.455	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000014158	rpf1	100	85.714	ENSLBEG00000026810	rpf1	100	85.714	Labrus_bergylta
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ENSACIG00000014158	rpf1	59	34.419	ENSLACG00000010815	IMP4	91	30.909	Latimeria_chalumnae
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ENSACIG00000014158	rpf1	99	73.143	MGP_SPRETEiJ_G0026679	Rpf1	89	88.462	Mus_spretus
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ENSACIG00000014158	rpf1	90	78.056	ENSPTRG00000000901	RPF1	93	77.538	Pan_troglodytes
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ENSACIG00000014158	rpf1	83	45.485	YHR088W	-	97	45.485	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSACIG00000014158	rpf1	92	56.481	ENSSBOG00000023599	-	89	56.481	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSACIG00000014158	rpf1	77	30.249	ENSSHAG00000015070	-	91	30.249	Sarcophilus_harrisii
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ENSACIG00000014158	rpf1	87	76.299	ENSVVUG00000017435	-	91	76.299	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000014158	rpf1	97	69.006	ENSVVUG00000024183	-	92	72.000	Vulpes_vulpes
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ENSACIG00000014158	rpf1	69	33.198	ENSXCOG00000014886	imp4	97	31.907	Xiphophorus_couchianus
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