EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014233 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: znf407
Alias: si:ch73-173g15.1
Full Name: zinc finger protein 407
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 146976 bases
Position: chrCCOE01000317.1:1016386-1163361
Accession: ZDB-GENE-110411-123
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018241	zf-C2H2	PF00096.26	9.6e-19	1	3
ENSACIP00000018241	zf-C2H2	PF00096.26	9.6e-19	2	3
ENSACIP00000018241	zf-C2H2	PF00096.26	9.6e-19	3	3
ENSACIP00000018241	zf-met	PF12874.7	0.00045	1	2
ENSACIP00000018241	zf-met	PF12874.7	0.00045	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000018730	-	1701	-	ENSACIP00000018241	567 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014233	znf407	54	34.532	ENSACIG00000008886	znf1164	80	34.532
ENSACIG00000014233	znf407	71	36.683	ENSACIG00000013604	-	97	36.683
ENSACIG00000014233	znf407	65	31.556	ENSACIG00000011541	-	67	31.556
ENSACIG00000014233	znf407	62	31.818	ENSACIG00000013163	-	77	31.818
ENSACIG00000014233	znf407	68	33.178	ENSACIG00000020938	zbtb47b	97	33.178
ENSACIG00000014233	znf407	60	38.095	ENSACIG00000019815	-	84	38.095
ENSACIG00000014233	znf407	68	36.634	ENSACIG00000011153	-	78	40.625
ENSACIG00000014233	znf407	54	30.978	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	87	33.333
ENSACIG00000014233	znf407	79	33.173	ENSACIG00000010647	-	99	37.241
ENSACIG00000014233	znf407	64	33.862	ENSACIG00000019710	-	72	33.516
ENSACIG00000014233	znf407	67	36.508	ENSACIG00000022293	-	93	36.508
ENSACIG00000014233	znf407	66	34.146	ENSACIG00000011515	-	63	34.146
ENSACIG00000014233	znf407	53	36.022	ENSACIG00000017892	-	71	36.022
ENSACIG00000014233	znf407	68	31.783	ENSACIG00000015429	-	84	43.836
ENSACIG00000014233	znf407	61	34.940	ENSACIG00000006755	-	67	34.940
ENSACIG00000014233	znf407	86	40.698	ENSACIG00000014123	znf236	62	36.842
ENSACIG00000014233	znf407	66	36.614	ENSACIG00000019447	-	66	36.614
ENSACIG00000014233	znf407	66	35.165	ENSACIG00000004041	-	88	34.286
ENSACIG00000014233	znf407	58	33.333	ENSACIG00000006377	-	56	33.333
ENSACIG00000014233	znf407	65	46.341	ENSACIG00000006172	-	88	39.597
ENSACIG00000014233	znf407	66	35.122	ENSACIG00000003556	-	65	35.122
ENSACIG00000014233	znf407	69	31.365	ENSACIG00000004626	-	83	33.182
ENSACIG00000014233	znf407	73	32.850	ENSACIG00000016117	-	84	32.850
ENSACIG00000014233	znf407	68	38.158	ENSACIG00000017647	-	88	33.721
ENSACIG00000014233	znf407	65	36.538	ENSACIG00000012084	-	91	34.375
ENSACIG00000014233	znf407	70	35.714	ENSACIG00000017050	-	97	32.227
ENSACIG00000014233	znf407	68	38.462	ENSACIG00000016944	-	79	38.462
ENSACIG00000014233	znf407	56	37.821	ENSACIG00000018641	snai2	55	37.821
ENSACIG00000014233	znf407	66	32.836	ENSACIG00000009717	-	86	33.202
ENSACIG00000014233	znf407	70	36.290	ENSACIG00000004666	-	97	33.533
ENSACIG00000014233	znf407	71	31.731	ENSACIG00000023313	-	88	31.731
ENSACIG00000014233	znf407	66	30.028	ENSACIG00000000406	prdm5	70	30.028
ENSACIG00000014233	znf407	66	39.062	ENSACIG00000022658	-	91	35.211
ENSACIG00000014233	znf407	66	32.569	ENSACIG00000006806	-	66	37.500
ENSACIG00000014233	znf407	60	33.562	ENSACIG00000018404	-	78	33.562
ENSACIG00000014233	znf407	71	34.857	ENSACIG00000008448	-	67	35.256
ENSACIG00000014233	znf407	66	34.146	ENSACIG00000015411	-	81	31.944
ENSACIG00000014233	znf407	67	33.803	ENSACIG00000003515	-	94	33.803
ENSACIG00000014233	znf407	64	34.158	ENSACIG00000023794	-	78	34.158
ENSACIG00000014233	znf407	64	34.555	ENSACIG00000024444	-	72	34.555
ENSACIG00000014233	znf407	70	33.088	ENSACIG00000016133	-	58	33.088
ENSACIG00000014233	znf407	60	37.903	ENSACIG00000019804	-	83	37.903
ENSACIG00000014233	znf407	65	37.915	ENSACIG00000018440	-	94	37.915
ENSACIG00000014233	znf407	70	35.965	ENSACIG00000022625	-	90	35.766
ENSACIG00000014233	znf407	71	37.395	ENSACIG00000019791	-	96	34.470
ENSACIG00000014233	znf407	63	36.601	ENSACIG00000003720	-	65	36.601
ENSACIG00000014233	znf407	60	36.464	ENSACIG00000007855	-	85	33.043
ENSACIG00000014233	znf407	69	36.214	ENSACIG00000016182	-	99	37.097
ENSACIG00000014233	znf407	65	32.143	ENSACIG00000017653	-	93	32.143
ENSACIG00000014233	znf407	61	33.014	ENSACIG00000013750	-	64	33.014
ENSACIG00000014233	znf407	67	33.987	ENSACIG00000002190	gfi1b	57	33.987
ENSACIG00000014233	znf407	68	35.838	ENSACIG00000010637	-	54	35.577
ENSACIG00000014233	znf407	70	37.255	ENSACIG00000004745	-	85	37.255
ENSACIG00000014233	znf407	62	38.012	ENSACIG00000000286	-	70	38.012
ENSACIG00000014233	znf407	60	36.842	ENSACIG00000015835	-	71	43.210
ENSACIG00000014233	znf407	66	36.310	ENSACIG00000003754	-	95	36.310
ENSACIG00000014233	znf407	89	33.688	ENSACIG00000022738	-	91	37.234
ENSACIG00000014233	znf407	70	34.783	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	79	34.783
ENSACIG00000014233	znf407	69	30.841	ENSACIG00000017683	-	78	30.841
ENSACIG00000014233	znf407	61	31.381	ENSACIG00000022330	-	86	32.759
ENSACIG00000014233	znf407	66	35.323	ENSACIG00000009780	-	73	35.323
ENSACIG00000014233	znf407	66	40.000	ENSACIG00000017013	-	52	40.000
ENSACIG00000014233	znf407	66	36.000	ENSACIG00000009755	-	78	36.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014233	znf407	98	94.224	ENSAPOG00000004966	znf407	88	94.224	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014233	znf407	99	93.474	ENSAOCG00000010173	znf407	88	93.474	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014233	znf407	99	93.474	ENSAPEG00000018919	znf407	88	93.474	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014233	znf407	100	93.662	ENSATEG00000024492	znf407	89	93.662	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014233	znf407	100	96.296	ENSACLG00000022191	znf407	99	96.296	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014233	znf407	98	79.152	ENSDARG00000087536	znf407	93	88.542	Danio_rerio
ENSACIG00000014233	znf407	98	80.674	ENSELUG00000020080	znf407	58	81.383	Esox_lucius
ENSACIG00000014233	znf407	100	84.507	ENSSPAG00000016199	znf407	88	87.324	Stegastes_partitus