EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014265 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1119 bases
Position: chrCCOE01001571.1:851148-852266
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018277	Endonuclease_NS	PF01223.23	2.5e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000018766	-	894	-	ENSACIP00000018277	297 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014265	-	87	53.462	ENSACIG00000022027	-	88	53.462
ENSACIG00000014265	-	92	47.099	ENSACIG00000022024	si:dkey-85k7.11	92	47.099
ENSACIG00000014265	-	78	34.959	ENSACIG00000009432	-	89	34.959
ENSACIG00000014265	-	55	66.071	ENSACIG00000022031	si:dkey-85k7.10	76	66.071
ENSACIG00000014265	-	71	35.047	ENSACIG00000008299	-	69	35.047
ENSACIG00000014265	-	66	32.850	ENSACIG00000007813	-	71	32.850
ENSACIG00000014265	-	79	30.962	ENSACIG00000008317	-	82	30.962
ENSACIG00000014265	-	85	35.659	ENSACIG00000015751	-	88	35.659
ENSACIG00000014265	-	88	60.837	ENSACIG00000001431	-	93	60.837
ENSACIG00000014265	-	84	36.863	ENSACIG00000006055	-	80	36.863
ENSACIG00000014265	-	76	37.288	ENSACIG00000022595	-	88	37.288
ENSACIG00000014265	-	93	35.690	ENSACIG00000012712	-	95	35.690
ENSACIG00000014265	-	87	33.333	ENSACIG00000016021	si:dkey-243k1.3	96	33.333

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014265	-	96	51.042	ENSAPOG00000010299	-	98	51.042	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	87	48.921	ENSAPOG00000010331	si:dkey-85k7.11	91	48.921	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	69	32.719	ENSAPOG00000022953	-	71	31.336	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	88	36.364	ENSAPOG00000022205	-	84	36.364	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	99	88.255	ENSAPOG00000008291	-	100	88.255	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	89	30.451	ENSAPOG00000006928	si:dkey-243k1.3	98	30.249	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	93	36.027	ENSAPOG00000023293	-	99	36.027	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	95	56.690	ENSAPOG00000008666	-	94	56.690	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	51	68.182	ENSAPOG00000010286	si:dkey-85k7.10	86	68.182	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	67	32.701	ENSAPOG00000022923	-	70	32.701	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014265	-	96	50.523	ENSAOCG00000021294	-	95	50.523	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	94	51.408	ENSAOCG00000021316	si:dkey-85k7.11	95	51.408	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	93	37.037	ENSAOCG00000007227	-	99	37.037	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	100	89.333	ENSAOCG00000005015	-	100	89.333	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	89	32.734	ENSAOCG00000015199	-	98	32.423	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	89	33.088	ENSAOCG00000002456	si:dkey-243k1.3	98	32.753	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	74	32.174	ENSAOCG00000008016	si:ch211-133n4.4	70	32.536	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	96	59.516	ENSAOCG00000021283	si:dkey-85k7.10	97	59.516	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	94	56.537	ENSAOCG00000013137	-	94	56.537	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	86	37.838	ENSAOCG00000000850	-	80	37.838	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014265	-	74	32.174	ENSAPEG00000023828	-	81	32.174	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	85	52.918	ENSAPEG00000018889	si:dkey-85k7.11	96	52.918	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	91	32.609	ENSAPEG00000024409	si:dkey-243k1.3	98	32.753	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	89	32.734	ENSAPEG00000024402	-	98	32.423	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	94	56.537	ENSAPEG00000007291	-	94	56.537	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	86	37.597	ENSAPEG00000012445	-	80	37.597	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	100	89.333	ENSAPEG00000008708	-	100	89.333	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	93	36.364	ENSAPEG00000013928	-	99	36.364	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	86	37.838	ENSAPEG00000018986	-	80	37.838	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	87	54.615	ENSAPEG00000018878	-	89	54.615	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	96	59.516	ENSAPEG00000018856	si:dkey-85k7.10	97	59.516	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014265	-	90	52.941	ENSATEG00000017500	si:dkey-85k7.11	88	52.941	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	74	33.333	ENSATEG00000014652	-	86	33.333	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	72	31.507	ENSATEG00000014686	-	54	31.507	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	70	36.239	ENSATEG00000014477	-	59	35.498	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	87	32.836	ENSATEG00000014502	-	61	32.836	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	58	37.363	ENSATEG00000014589	-	56	37.363	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	70	31.718	ENSATEG00000014672	-	76	31.405	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	93	37.710	ENSATEG00000009957	-	96	37.710	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	66	31.455	ENSATEG00000014621	-	74	31.455	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	100	88.449	ENSATEG00000008791	-	99	88.449	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	82	32.653	ENSATEG00000021350	-	73	32.653	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	89	36.749	ENSATEG00000011941	-	94	36.082	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	83	32.046	ENSATEG00000014484	-	80	32.601	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	67	35.407	ENSATEG00000014488	-	66	35.407	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	70	33.043	ENSATEG00000014520	-	66	32.917	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	70	33.628	ENSATEG00000014526	-	64	33.333	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	67	34.722	ENSATEG00000014573	-	68	34.177	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	88	30.882	ENSATEG00000014579	-	74	34.043	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	83	32.308	ENSATEG00000014430	-	67	32.103	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	94	57.801	ENSATEG00000019243	-	93	57.801	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	94	54.770	ENSATEG00000017521	-	95	54.770	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	70	33.480	ENSATEG00000014542	-	69	33.613	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	67	35.023	ENSATEG00000014635	-	77	33.333	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	70	34.071	ENSATEG00000014514	-	67	33.891	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	95	33.562	ENSATEG00000022068	si:dkey-243k1.3	99	33.562	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	75	31.646	ENSATEG00000014701	-	58	31.646	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	88	33.333	ENSATEG00000014512	-	74	32.646	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014265	-	85	36.742	ENSAPLG00000004064	-	91	35.740	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000014265	-	90	35.165	ENSACAG00000005752	-	94	35.165	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000014265	-	95	32.095	ENSACAG00000005411	-	99	32.095	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000014265	-	85	56.471	ENSACLG00000018928	-	89	56.471	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	88	36.170	ENSACLG00000021771	-	93	34.539	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	69	35.268	ENSACLG00000015425	-	61	35.268	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	94	60.424	ENSACLG00000018914	si:dkey-85k7.10	93	60.424	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	93	30.405	ENSACLG00000016915	-	93	30.405	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	99	97.315	ENSACLG00000008439	-	99	97.315	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	82	32.669	ENSACLG00000011404	si:dkey-243k1.3	87	32.669	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	96	55.401	ENSACLG00000026586	-	96	55.401	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	66	35.681	ENSACLG00000017798	-	74	34.167	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	68	33.178	ENSACLG00000017744	-	75	33.178	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	80	38.017	ENSACLG00000013353	-	80	37.450	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	91	32.740	ENSACLG00000001104	-	94	32.740	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	95	49.135	ENSACLG00000018957	si:dkey-85k7.11	93	49.135	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	68	33.484	ENSACLG00000017733	-	63	31.855	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014265	-	73	34.361	ENSAMXG00000038214	-	71	34.361	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	88	36.170	ENSAMXG00000037172	-	90	36.170	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	54	37.037	ENSAMXG00000043591	-	65	36.905	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	90	63.469	ENSAMXG00000037726	si:dkey-85k7.10	92	63.469	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	65	33.014	ENSAMXG00000010981	-	70	33.014	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	62	34.434	ENSAMXG00000043661	-	68	34.434	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	62	35.263	ENSAMXG00000034695	-	68	35.263	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	62	38.000	ENSAMXG00000036403	-	67	38.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	76	31.873	ENSAMXG00000040657	-	85	31.873	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	85	32.959	ENSAMXG00000040929	-	96	31.915	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	86	52.140	ENSAMXG00000040926	-	93	50.730	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	90	56.985	ENSAMXG00000036738	si:dkey-85k7.11	91	56.985	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	75	34.764	ENSAMXG00000030013	-	81	34.764	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	91	63.370	ENSAMXG00000032585	-	99	61.189	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	89	60.674	ENSAMXG00000019995	zgc:172339	96	57.544	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	100	81.667	ENSAMXG00000019998	-	100	81.667	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	75	31.984	ENSAMXG00000019466	-	79	31.984	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	70	30.357	ENSAMXG00000037387	-	80	30.126	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	90	34.520	ENSAMXG00000007611	si:dkey-243k1.3	94	34.520	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	95	55.944	ENSAMXG00000003411	-	96	55.944	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014265	-	97	30.976	ENSCPBG00000024041	ENDOD1	56	30.976	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014265	-	97	32.899	ENSCPBG00000009952	-	53	32.899	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014265	-	97	32.248	ENSCPBG00000005639	-	53	32.248	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014265	-	76	36.017	ENSCPBG00000019841	-	90	35.556	Chrysemys_picta_bellii
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