EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014376 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8139 bases
Position: chrCCOE01000426.1:208709-216847
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018433	RRM_1	PF00076.22	7.2e-58	1	3
ENSACIP00000018433	RRM_1	PF00076.22	7.2e-58	2	3
ENSACIP00000018433	RRM_1	PF00076.22	7.2e-58	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000018928	-	1053	-	ENSACIP00000018433	350 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014376	-	68	35.443	ENSACIG00000007698	celf3b	66	32.955
ENSACIG00000014376	-	100	81.408	ENSACIG00000016352	tia1l	98	81.408
ENSACIG00000014376	-	76	30.769	ENSACIG00000004685	pabpc1a	58	30.769
ENSACIG00000014376	-	73	35.897	ENSACIG00000010855	ELAVL2	96	35.897
ENSACIG00000014376	-	67	36.709	ENSACIG00000010932	celf3a	66	34.091
ENSACIG00000014376	-	76	30.208	ENSACIG00000018366	pabpc1b	60	30.208
ENSACIG00000014376	-	69	34.591	ENSACIG00000018455	sf3b4	53	34.591
ENSACIG00000014376	-	76	31.548	ENSACIG00000021004	-	60	31.548
ENSACIG00000014376	-	72	30.814	ENSACIG00000001863	trnau1apb	53	31.707
ENSACIG00000014376	-	73	32.051	ENSACIG00000018226	elavl1a	89	32.051
ENSACIG00000014376	-	76	30.220	ENSACIG00000023343	pabpc4	63	30.220
ENSACIG00000014376	-	73	33.333	ENSACIG00000000511	-	96	33.333
ENSACIG00000014376	-	77	82.609	ENSACIG00000003734	tial1	83	82.609
ENSACIG00000014376	-	73	36.364	ENSACIG00000008793	elavl4	91	36.364

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSG00000116001	TIA1	98	91.304	Homo_sapiens
ENSACIG00000014376	-	100	92.204	ENSAPOG00000001876	tia1	96	92.204	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014376	-	100	69.189	ENSAPOG00000015534	tial1	96	69.189	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014376	-	92	79.456	ENSAPOG00000007089	tia1l	89	78.834	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014376	-	100	79.947	ENSAMEG00000016025	TIA1	98	79.947	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000014376	-	100	92.204	ENSAOCG00000011133	-	100	91.977	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014376	-	100	87.391	ENSAOCG00000018765	tia1l	97	87.391	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014376	-	90	76.582	ENSAOCG00000004685	tial1	94	81.416	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014376	-	100	98.000	ENSAPEG00000002524	-	96	98.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014376	-	100	87.391	ENSAPEG00000003200	tia1l	97	87.391	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014376	-	90	76.308	ENSAPEG00000024742	tial1	85	75.915	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014376	-	90	78.864	ENSATEG00000012273	tial1	84	78.864	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014376	-	100	90.361	ENSATEG00000014593	-	100	89.685	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014376	-	100	77.358	ENSATEG00000008865	tia1l	98	78.495	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014376	-	100	78.495	ENSAPLG00000009953	TIA1	98	78.495	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSANAG00000026081	TIA1	98	91.304	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014376	-	100	93.280	ENSACLG00000002317	-	98	93.280	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014376	-	100	70.411	ENSACLG00000020596	tial1	85	82.609	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014376	-	100	87.879	ENSACLG00000026467	tia1l	97	87.879	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014376	-	90	81.846	ENSAMXG00000037884	tia1l	95	81.846	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014376	-	100	71.196	ENSAMXG00000038511	tial1	96	71.196	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014376	-	100	82.320	ENSBTAG00000019182	TIA1	98	82.320	Bos_taurus
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSCJAG00000019278	TIA1	98	91.304	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000014376	-	91	84.894	ENSCAFG00000003341	TIA1	86	84.894	Canis_familiaris
ENSACIG00000014376	-	100	82.873	ENSCAFG00020001832	TIA1	98	82.873	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000014376	-	100	91.739	ENSCHIG00000020214	TIA1	99	91.739	Capra_hircus
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSTSYG00000005276	TIA1	98	91.304	Carlito_syrichta
ENSACIG00000014376	-	100	85.652	ENSCAPG00000017278	TIA1	100	85.652	Cavia_aperea
ENSACIG00000014376	-	100	90.870	ENSCPOG00000008327	TIA1	98	90.870	Cavia_porcellus
ENSACIG00000014376	-	61	84.762	ENSCPOG00000006074	-	93	88.462	Cavia_porcellus
ENSACIG00000014376	-	100	78.261	ENSCCAG00000036430	TIA1	94	78.261	Cebus_capucinus
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSCATG00000041446	TIA1	98	91.304	Cercocebus_atys
ENSACIG00000014376	-	100	90.870	ENSCLAG00000009857	TIA1	98	90.870	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000014376	-	100	80.161	ENSCSAG00000015135	TIA1	98	80.161	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000014376	-	100	62.735	ENSCHOG00000003904	TIA1	98	62.735	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000014376	-	100	79.189	ENSCPBG00000003611	TIA1	98	79.189	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSCANG00000031460	TIA1	98	91.304	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000014376	-	100	89.565	ENSCGRG00001013417	Tia1	98	89.565	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000014376	-	100	89.565	ENSCGRG00000002902	Tia1	98	89.565	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000014376	-	100	89.779	ENSCSEG00000010018	-	91	89.779	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014376	-	99	65.054	ENSCSEG00000010695	tial1	98	65.416	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014376	-	100	86.559	ENSCSEG00000014166	-	98	87.366	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014376	-	100	76.613	ENSCSEG00000014331	tia1l	98	76.613	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014376	-	73	84.615	ENSCVAG00000006051	-	99	84.615	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014376	-	100	89.544	ENSCVAG00000015489	tia1	96	89.544	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014376	-	90	76.562	ENSCVAG00000005689	tial1	85	76.562	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014376	-	91	84.375	ENSCVAG00000013609	tia1l	87	84.375	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014376	-	90	80.368	ENSDARG00000026476	tia1l	95	80.368	Danio_rerio
ENSACIG00000014376	-	100	83.288	ENSDARG00000052536	tia1	98	84.097	Danio_rerio
ENSACIG00000014376	-	100	73.889	ENSDARG00000009525	tial1	96	73.889	Danio_rerio
ENSACIG00000014376	-	100	71.913	ENSDNOG00000016356	TIA1	99	71.913	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000014376	-	100	77.391	ENSDORG00000008601	Tia1	99	75.691	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000014376	-	100	80.161	ENSETEG00000010021	TIA1	98	80.161	Echinops_telfairi
ENSACIG00000014376	-	89	56.875	ENSEBUG00000001843	tia1l	99	56.962	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000014376	-	100	82.873	ENSEASG00005007393	TIA1	99	82.873	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000014376	-	100	80.161	ENSECAG00000022361	TIA1	98	80.161	Equus_caballus
ENSACIG00000014376	-	92	63.037	ENSEEUG00000002964	TIA1	89	63.037	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000014376	-	100	72.802	ENSELUG00000020994	tial1	96	72.802	Esox_lucius
ENSACIG00000014376	-	100	82.480	ENSELUG00000006377	tia1	98	83.019	Esox_lucius
ENSACIG00000014376	-	100	96.070	ENSELUG00000005615	-	98	96.070	Esox_lucius
ENSACIG00000014376	-	100	91.739	ENSFCAG00000023732	TIA1	98	91.739	Felis_catus
ENSACIG00000014376	-	79	88.971	ENSFALG00000008322	-	97	88.971	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000014376	-	100	75.535	ENSFALG00000002173	TIA1	98	75.535	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000014376	-	100	90.870	ENSFDAG00000014427	-	98	90.870	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000014376	-	90	74.691	ENSFHEG00000007703	tial1	86	74.691	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014376	-	100	81.127	ENSFHEG00000002832	tia1l	93	81.127	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014376	-	100	89.960	ENSFHEG00000006161	tia1	97	89.960	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014376	-	99	72.414	ENSGMOG00000008423	tia1l	100	75.332	Gadus_morhua
ENSACIG00000014376	-	100	71.229	ENSGMOG00000005612	tial1	96	71.229	Gadus_morhua
ENSACIG00000014376	-	88	89.375	ENSGMOG00000008843	tia1	99	89.375	Gadus_morhua
ENSACIG00000014376	-	100	81.616	ENSGALG00000013879	TIA1	90	89.815	Gallus_gallus
ENSACIG00000014376	-	100	90.054	ENSGAFG00000011317	-	96	90.054	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014376	-	91	74.540	ENSGAFG00000001124	tial1	86	81.739	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014376	-	90	76.656	ENSGACG00000003365	tial1	84	76.656	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014376	-	88	93.125	ENSGACG00000013294	-	99	93.125	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014376	-	100	77.067	ENSGACG00000015800	tia1l	98	77.067	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014376	-	100	81.894	ENSGAGG00000007529	TIA1	98	81.894	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000014376	-	100	78.261	ENSGGOG00000037511	TIA1	94	78.261	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000014376	-	100	77.480	ENSHBUG00000006676	tia1l	98	77.480	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000014376	-	100	70.604	ENSHBUG00000000813	tial1	90	80.531	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000014376	-	100	93.280	ENSHBUG00000023154	-	100	92.837	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000014376	-	100	90.870	ENSHGLG00000005927	TIA1	98	90.870	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000014376	-	100	90.870	ENSHGLG00100001107	TIA1	98	90.870	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000014376	-	90	78.816	ENSHCOG00000004701	tial1	83	83.478	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014376	-	100	77.898	ENSHCOG00000005609	tia1l	98	77.898	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014376	-	100	89.200	ENSHCOG00000005356	-	97	89.200	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014376	-	91	82.965	ENSIPUG00000016702	tia1	95	81.155	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000014376	-	100	71.429	ENSIPUG00000021261	tial1	96	71.429	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000014376	-	100	91.266	ENSSTOG00000008309	TIA1	98	91.266	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000014376	-	100	90.870	ENSJJAG00000017978	Tia1	98	90.870	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000014376	-	59	68.376	ENSJJAG00000006909	-	83	68.376	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000014376	-	100	77.212	ENSKMAG00000011643	-	96	77.212	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000014376	-	100	90.860	ENSKMAG00000008202	tia1	96	90.860	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000014376	-	100	91.566	ENSLBEG00000000122	-	98	91.129	Labrus_bergylta
ENSACIG00000014376	-	100	88.646	ENSLBEG00000023092	tia1l	97	88.646	Labrus_bergylta
ENSACIG00000014376	-	90	75.312	ENSLBEG00000012865	tial1	89	74.797	Labrus_bergylta
ENSACIG00000014376	-	100	78.100	ENSLACG00000017828	TIA1	97	78.100	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000014376	-	100	83.288	ENSLOCG00000015324	tia1l	98	84.658	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000014376	-	100	70.769	ENSLOCG00000011405	tial1	85	70.769	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000014376	-	100	80.697	ENSLAFG00000003463	TIA1	98	80.697	Loxodonta_africana
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSMFAG00000045951	TIA1	98	91.304	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSMMUG00000001126	TIA1	98	91.304	Macaca_mulatta
ENSACIG00000014376	-	100	91.304	ENSMNEG00000030316	TIA1	98	91.304	Macaca_nemestrina
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