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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014386 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pelo
Alias: wu:fa12c12|wu:fb97f07|zgc:56550
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5603 bases
Position: chrCCOE01000086.1:2408729-2414331
Accession: ZDB-GENE-040426-1074
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018543	eRF1_2	PF03464.15	2.8e-34	1	1
ENSACIP00000018519	eRF1_2	PF03464.15	1.7e-29	1	1
ENSACIP00000018519	eRF1_3	PF03465.15	1.5e-17	1	1
ENSACIP00000018543	eRF1_3	PF03465.15	1.4e-12	1	1
ENSACIP00000018543	eRF1_1	PF03463.15	2.4e-52	1	1
ENSACIP00000018519	eRF1_1	PF03463.15	8e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019041	-	1047	-	ENSACIP00000018543	348 (aa)	-	-
ENSACIT00000019017	-	1089	-	ENSACIP00000018519	362 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	ENSG00000152684	PELO	97	77.212	Homo_sapiens
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSAPOG00000023072	pelo	97	88.740	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014386	pelo	71	93.927	ENSAPOG00000000616	pelo	90	93.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014386	pelo	71	93.927	ENSAPOG00000023700	-	90	93.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSAMEG00000007734	PELO	97	76.944	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000014386	pelo	97	94.083	ENSAOCG00000023717	pelo	97	89.008	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014386	pelo	97	94.083	ENSAPEG00000011235	pelo	97	89.008	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014386	pelo	97	94.675	ENSATEG00000019550	pelo	97	89.544	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014386	pelo	72	69.721	ENSAPLG00000013265	PELO	96	65.385	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000014386	pelo	97	79.290	ENSACAG00000004352	PELO	97	74.799	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.361	ENSANAG00000014096	PELO	97	76.676	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.491	ENSACLG00000010305	pelo	97	88.740	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014386	pelo	97	92.899	ENSAMXG00000020299	pelo	97	87.131	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	ENSBTAG00000003268	PELO	97	76.944	Bos_taurus
ENSACIG00000014386	pelo	97	59.763	WBGene00011280	pelo-1	98	57.373	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSCJAG00000035190	PELO	96	81.743	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSCAFG00020023234	PELO	97	77.212	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSCHIG00000016410	PELO	97	76.676	Capra_hircus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.544	ENSTSYG00000005203	PELO	97	77.480	Carlito_syrichta
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	ENSCPOG00000027406	PELO	97	77.480	Cavia_porcellus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSCCAG00000035600	PELO	96	81.743	Cebus_capucinus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSCATG00000011829	PELO	97	76.944	Cercocebus_atys
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSCLAG00000005043	PELO	97	76.944	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSCSAG00000016692	PELO	97	76.944	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	ENSCHOG00000000523	PELO	97	77.480	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000014386	pelo	97	79.882	ENSCPBG00000007544	PELO	97	75.603	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014386	pelo	97	63.422	ENSCING00000001979	-	97	59.517	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000014386	pelo	97	66.667	ENSCSAVG00000006158	-	97	62.198	Ciona_savignyi
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSCANG00000023382	PELO	97	76.944	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSCGRG00001024665	Pelo	97	76.676	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.544	ENSCGRG00000004570	Pelo	97	77.480	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSCSEG00000008807	pelo	97	88.472	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSCVAG00000016082	pelo	97	89.008	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014386	pelo	97	89.053	ENSDARG00000055477	pelo	97	84.718	Danio_rerio
ENSACIG00000014386	pelo	97	78.466	ENSDNOG00000036721	PELO	97	74.064	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.544	ENSDORG00000016689	Pelo	97	78.016	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000014386	pelo	97	67.847	FBgn0011207	pelo	94	63.539	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000014386	pelo	69	77.778	ENSEBUG00000004955	pelo	87	77.778	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSEASG00005013348	PELO	97	76.944	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000014386	pelo	97	90.237	ENSELUG00000023229	pelo	93	90.476	Esox_lucius
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSFCAG00000032341	PELO	97	77.212	Felis_catus
ENSACIG00000014386	pelo	97	80.473	ENSFALG00000004559	PELO	97	75.871	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000014386	pelo	82	83.099	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.099	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000014386	pelo	97	92.604	ENSFHEG00000009769	pelo	97	87.131	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014386	pelo	97	89.645	ENSGMOG00000005849	pelo	97	84.718	Gadus_morhua
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSGAFG00000019350	pelo	97	90.934	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014386	pelo	97	91.716	ENSGACG00000007245	pelo	97	93.407	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014386	pelo	97	79.882	ENSGAGG00000004018	PELO	97	75.603	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSGGOG00000012635	PELO	97	76.944	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.491	ENSHBUG00000005866	pelo	97	88.740	Haplochromis_burtoni
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ENSACIG00000014386	pelo	97	79.882	ENSHGLG00100017627	PELO	97	75.067	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000014386	pelo	97	91.150	ENSHCOG00000016782	pelo	97	86.059	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014386	pelo	97	89.645	ENSIPUG00000020627	pelo	97	84.182	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	ENSSTOG00000027378	PELO	97	77.212	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000014386	pelo	97	79.351	ENSJJAG00000015032	Pelo	97	74.531	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.491	ENSKMAG00000021305	pelo	97	88.204	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.195	ENSLBEG00000022399	pelo	97	87.936	Labrus_bergylta
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.544	ENSLAFG00000020551	PELO	97	77.748	Loxodonta_africana
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSMFAG00000000651	PELO	97	76.944	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSMMUG00000039101	PELO	94	81.301	Macaca_mulatta
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSMNEG00000035538	PELO	97	76.944	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSMLEG00000039113	PELO	97	76.944	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000014386	pelo	97	95.266	ENSMAMG00000013260	pelo	97	90.349	Mastacembelus_armatus
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ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSMAUG00000009770	Pelo	97	76.944	Mesocricetus_auratus
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ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSMMOG00000001324	pelo	97	87.936	Mola_mola
ENSACIG00000014386	pelo	97	94.675	ENSMALG00000008194	pelo	97	89.276	Monopterus_albus
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ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSMUSG00000042275	Pelo	97	76.944	Mus_musculus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	97	77.212	Mus_pahari
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	97	76.944	Mus_spretus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.361	ENSMLUG00000024132	PELO	97	76.408	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000014386	pelo	97	83.136	ENSNGAG00000019331	Pelo	97	78.016	Nannospalax_galili
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSNBRG00000011799	pelo	97	88.740	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSNLEG00000035970	PELO	95	81.301	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000014386	pelo	97	80.060	ENSMEUG00000005468	PELO	97	74.799	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.361	ENSOPRG00000018793	PELO	98	76.819	Ochotona_princeps
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSODEG00000017579	PELO	97	77.212	Octodon_degus
ENSACIG00000014386	pelo	97	94.083	ENSONIG00000011511	pelo	97	89.276	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	ENSOCUG00000023902	PELO	97	77.480	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000014386	pelo	97	92.604	ENSORLG00000005827	pelo	97	86.863	Oryzias_latipes
ENSACIG00000014386	pelo	97	92.899	ENSORLG00020016456	pelo	97	87.131	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000014386	pelo	97	92.899	ENSORLG00015014447	pelo	97	87.131	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSOMEG00000021567	pelo	97	88.740	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSOGAG00000027940	PELO	97	77.212	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.249	ENSOARG00000008324	PELO	97	76.944	Ovis_aries
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSPPAG00000038951	PELO	97	76.944	Pan_paniscus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSPPRG00000018800	PELO	97	77.212	Panthera_pardus
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSPTIG00000019988	PELO	97	77.212	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSPTRG00000034409	PELO	93	82.158	Pan_troglodytes
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSPANG00000010902	PELO	97	76.944	Papio_anubis
ENSACIG00000014386	pelo	97	89.941	ENSPKIG00000015190	pelo	97	84.450	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000014386	pelo	97	79.290	ENSPSIG00000004971	PELO	97	75.335	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000014386	pelo	73	92.913	ENSPMGG00000014561	pelo	94	92.913	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000014386	pelo	97	82.544	ENSPEMG00000015584	Pelo	97	77.212	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000014386	pelo	97	81.657	ENSPCIG00000004880	PELO	97	76.676	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	ENSPFOG00000007277	pelo	97	89.008	Poecilia_formosa
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ENSACIG00000014386	pelo	97	81.953	ENSRROG00000035507	PELO	97	76.944	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000014386	pelo	98	31.510	YNL001W	-	97	31.300	Saccharomyces_cerevisiae
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ENSACIG00000014386	pelo	57	77.157	ENSSHAG00000010770	PELO	95	71.121	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000014386	pelo	97	90.828	ENSSFOG00015013399	pelo	97	85.255	Scleropages_formosus
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