EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014480 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: snrpb
Alias: zgc:77315
Full Name: small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3950 bases
Position: chrCCOE01001734.1:124898-128847
Accession: ZDB-GENE-040426-1819
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018559	LSM	PF01423.22	5.5e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019058	-	678	-	ENSACIP00000018559	225 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSG00000125835	SNRPB	76	92.571	Homo_sapiens
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSAPOG00000019606	snrpb	76	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSAMEG00000011353	SNRPB	72	92.571	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSAOCG00000006876	snrpb	93	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSAPEG00000021585	snrpb	96	100.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014480	snrpb	99	99.099	ENSATEG00000009836	snrpb	93	99.099	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014480	snrpb	70	95.625	ENSACAG00000002053	SNRPB	75	92.486	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000014480	snrpb	71	87.037	ENSANAG00000036271	-	71	84.000	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSANAG00000024443	-	76	92.571	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSACLG00000014707	snrpb	93	100.000	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014480	snrpb	99	97.768	ENSAMXG00000029434	snrpb	94	97.768	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014480	snrpb	88	85.644	ENSBTAG00000001038	SNRPB	76	92.571	Bos_taurus
ENSACIG00000014480	snrpb	92	83.810	ENSCJAG00000023097	-	73	84.571	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCJAG00000020971	-	76	92.571	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000014480	snrpb	61	84.672	ENSCAFG00000031109	-	72	80.925	Canis_familiaris
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCAFG00000006693	-	76	92.571	Canis_familiaris
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCAFG00020016981	-	73	92.000	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCHIG00000025449	-	76	92.571	Capra_hircus
ENSACIG00000014480	snrpb	77	74.286	ENSTSYG00000032303	-	63	72.254	Carlito_syrichta
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSTSYG00000014498	-	76	92.571	Carlito_syrichta
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCAPG00000012669	SNRPB	76	92.571	Cavia_aperea
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCPOG00000039408	SNRPB	76	92.571	Cavia_porcellus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCCAG00000026002	SNRPB	76	92.571	Cebus_capucinus
ENSACIG00000014480	snrpb	54	82.787	ENSCCAG00000035140	-	81	82.609	Cebus_capucinus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCATG00000030230	SNRPB	76	92.571	Cercocebus_atys
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCLAG00000012442	SNRPB	74	92.000	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCSAG00000010840	SNRPB	76	92.571	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	96.296	ENSCPBG00000026801	SNRPB	76	93.714	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCANG00000019461	SNRPB	76	92.571	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCGRG00001023046	Snrpb	76	92.571	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSCGRG00000010423	Snrpb	77	92.486	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000014480	snrpb	99	98.214	ENSCSEG00000020328	snrpb	92	98.198	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014480	snrpb	99	97.309	ENSDARG00000011125	snrpb	92	97.309	Danio_rerio
ENSACIG00000014480	snrpb	71	88.889	ENSDNOG00000007896	-	72	86.286	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSDNOG00000015545	-	73	92.000	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSDORG00000029558	Snrpb	76	92.571	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000014480	snrpb	79	62.304	FBgn0262601	SmB	71	69.231	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000014480	snrpb	71	72.840	ENSETEG00000006830	SNRPB	77	71.429	Echinops_telfairi
ENSACIG00000014480	snrpb	79	79.096	ENSEBUG00000007467	SNRPB	60	88.112	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000014480	snrpb	71	93.827	ENSEASG00005012991	SNRPB	76	92.000	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSECAG00000011944	SNRPB	76	92.571	Equus_caballus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSEEUG00000015568	SNRPB	62	92.000	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	97.748	ENSELUG00000014564	snrpb	99	97.321	Esox_lucius
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSFCAG00000034090	-	76	92.571	Felis_catus
ENSACIG00000014480	snrpb	70	96.250	ENSFALG00000004866	SNRPB	73	93.491	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSFDAG00000009937	SNRPB	76	92.571	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000014480	snrpb	71	96.296	ENSGALG00000035421	SNRPN	71	94.152	Gallus_gallus
ENSACIG00000014480	snrpb	98	98.190	ENSGAFG00000019558	snrpb	96	98.190	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014480	snrpb	99	98.198	ENSGACG00000003262	snrpb	92	98.198	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	96.296	ENSGAGG00000001308	SNRPB	73	93.714	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSGGOG00000016138	SNRPB	76	92.571	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000014480	snrpb	100	99.111	ENSHBUG00000008369	snrpb	93	100.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000014480	snrpb	64	86.111	ENSHGLG00000016505	-	81	81.657	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSHGLG00000016241	-	76	92.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000014480	snrpb	64	86.111	ENSHGLG00100004178	-	81	81.657	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSHGLG00100012877	-	76	92.571	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000014480	snrpb	99	99.099	ENSHCOG00000014888	snrpb	92	99.099	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014480	snrpb	99	97.309	ENSIPUG00000024569	SNRPB	93	97.309	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	92.593	ENSSTOG00000033664	-	73	90.286	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000014480	snrpb	83	77.005	ENSSTOG00000027821	-	61	95.556	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSJJAG00000024170	Snrpb	76	92.571	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	98.214	ENSKMAG00000014494	snrpb	92	98.214	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	99.107	ENSLBEG00000005678	snrpb	92	99.099	Labrus_bergylta
ENSACIG00000014480	snrpb	77	94.350	ENSLACG00000011459	SNRPB	73	93.143	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000014480	snrpb	99	97.758	ENSLOCG00000002687	snrpb	93	97.758	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	90.123	ENSLAFG00000017588	SNRPB	75	88.571	Loxodonta_africana
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMFAG00000038756	SNRPB	76	92.571	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMMUG00000010050	SNRPB	76	92.571	Macaca_mulatta
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMNEG00000027954	SNRPB	76	92.571	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMLEG00000022346	SNRPB	76	92.571	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSMAMG00000009294	snrpb	90	100.000	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSMZEG00005011856	snrpb	93	100.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000014480	snrpb	76	83.429	ENSMICG00000015983	-	80	82.286	Microcebus_murinus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMICG00000016519	SNRPB	76	92.571	Microcebus_murinus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	93.827	ENSMOCG00000002892	-	76	92.000	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000014480	snrpb	59	78.195	ENSMOCG00000021362	-	73	74.566	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000014480	snrpb	99	98.661	ENSMMOG00000013226	snrpb	95	98.661	Mola_mola
ENSACIG00000014480	snrpb	99	99.099	ENSMALG00000020839	snrpb	75	99.099	Monopterus_albus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	MGP_CAROLIEiJ_G0024293	Snrpb	76	92.571	Mus_caroli
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMUSG00000027404	Snrpb	76	92.571	Mus_musculus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	MGP_PahariEiJ_G0025738	Snrpb	76	92.571	Mus_pahari
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	MGP_SPRETEiJ_G0025213	Snrpb	76	92.571	Mus_spretus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMPUG00000009283	SNRPB	76	92.571	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000014480	snrpb	71	90.741	ENSMLUG00000016951	SNRPB	72	89.143	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSNGAG00000012051	Snrpb	76	92.571	Nannospalax_galili
ENSACIG00000014480	snrpb	100	99.111	ENSNBRG00000006353	snrpb	86	99.111	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSNLEG00000029067	SNRPB	74	92.000	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSMEUG00000015625	SNRPB	78	92.571	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000014480	snrpb	71	88.889	ENSODEG00000016060	-	73	86.857	Octodon_degus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSODEG00000004305	-	76	92.571	Octodon_degus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSONIG00000000248	snrpb	93	100.000	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000014480	snrpb	92	64.286	ENSOCUG00000026813	-	75	62.644	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000014480	snrpb	76	88.439	ENSOCUG00000022423	-	89	86.127	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000014480	snrpb	92	87.204	ENSOCUG00000021456	-	73	88.571	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	91.975	ENSOCUG00000028215	-	73	90.286	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSOCUG00000014042	-	73	92.571	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	99.099	ENSORLG00000021862	snrpb	93	99.099	Oryzias_latipes
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSOGAG00000016149	SNRPB	73	92.000	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSOARG00000006740	SNRPB	76	92.571	Ovis_aries
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPPAG00000036314	SNRPB	76	92.571	Pan_paniscus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPPRG00000003233	-	76	92.571	Panthera_pardus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPTIG00000007468	SNRPB	76	92.571	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPTRG00000013176	SNRPB	76	92.571	Pan_troglodytes
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPANG00000020362	SNRPB	73	92.000	Papio_anubis
ENSACIG00000014480	snrpb	99	96.413	ENSPKIG00000002865	snrpb	93	96.413	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000014480	snrpb	71	96.296	ENSPSIG00000014125	SNRPB	72	93.714	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000014480	snrpb	99	96.413	ENSPMGG00000016349	snrpb	94	96.413	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPEMG00000007948	Snrpb	76	92.571	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000014480	snrpb	71	93.827	ENSPCIG00000004694	SNRPB	73	92.000	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000014480	snrpb	64	100.000	ENSPFOG00000011802	snrpb	61	100.000	Poecilia_formosa
ENSACIG00000014480	snrpb	96	81.448	ENSPLAG00000014130	snrpb	59	100.000	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000014480	snrpb	96	78.605	ENSPREG00000015515	snrpb	63	100.000	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPPYG00000010841	SNRPB	76	92.571	Pongo_abelii
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSPCOG00000013686	SNRPB	76	92.571	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000014480	snrpb	71	93.210	ENSPVAG00000017013	SNRPB	61	90.857	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000014480	snrpb	99	100.000	ENSPNYG00000014788	snrpb	93	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000014480	snrpb	99	97.333	ENSPNAG00000016126	snrpb	93	97.309	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSRNOG00000006961	Snrpb	76	92.571	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000014480	snrpb	71	94.444	ENSRBIG00000040505	SNRPB	76	93.103	Rhinopithecus_bieti
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ENSACIG00000014480	snrpb	64	95.172	ENSXMAG00000028767	snrpb	58	100.000	Xiphophorus_maculatus