EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014655 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3976 bases
Position: chrCCOE01000465.1:1069165-1073140
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018812	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019317	-	801	-	ENSACIP00000018812	266 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014655	-	89	65.823	ENSACIG00000014703	-	94	65.823
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ENSACIG00000014655	-	79	38.028	ENSACIG00000016502	-	91	38.028
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ENSACIG00000014655	-	79	45.238	ENSACIG00000003582	-	67	45.024
ENSACIG00000014655	-	60	47.205	ENSACIG00000022374	-	82	47.205
ENSACIG00000014655	-	79	47.907	ENSACIG00000022377	-	76	47.907
ENSACIG00000014655	-	75	45.813	ENSACIG00000019149	-	61	45.545
ENSACIG00000014655	-	76	67.822	ENSACIG00000014745	-	90	67.822
ENSACIG00000014655	-	76	42.574	ENSACIG00000006484	-	62	42.574
ENSACIG00000014655	-	93	66.129	ENSACIG00000014662	-	100	66.129
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ENSACIG00000014655	-	78	45.714	ENSACIG00000022355	-	72	45.714
ENSACIG00000014655	-	78	43.541	ENSACIG00000020244	-	88	43.541
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ENSACIG00000014655	-	74	47.000	ENSACIG00000012648	-	67	47.000
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ENSACIG00000014655	-	79	44.444	ENSACIG00000001455	-	79	44.444
ENSACIG00000014655	-	74	35.484	ENSACIG00000009149	-	73	35.484
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ENSACIG00000014655	-	75	45.588	ENSACIG00000022222	-	64	45.588
ENSACIG00000014655	-	75	37.441	ENSACIG00000012061	-	62	37.441
ENSACIG00000014655	-	78	41.860	ENSACIG00000006503	-	66	41.860
ENSACIG00000014655	-	67	35.135	ENSACIG00000014737	-	84	35.135
ENSACIG00000014655	-	56	33.121	ENSACIG00000014730	zgc:172131	80	33.121
ENSACIG00000014655	-	80	46.729	ENSACIG00000022370	-	78	46.606
ENSACIG00000014655	-	72	50.000	ENSACIG00000007158	-	61	47.887
ENSACIG00000014655	-	75	46.569	ENSACIG00000016313	-	63	46.569
ENSACIG00000014655	-	77	44.712	ENSACIG00000006478	-	77	44.712
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ENSACIG00000014655	-	69	36.559	ENSACIG00000014670	-	71	36.559
ENSACIG00000014655	-	89	55.274	ENSACIG00000019524	-	95	55.274

Orthologs

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ENSACIG00000014655	-	74	45.960	ENSAPOG00000011509	-	71	44.076	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	76	47.030	ENSAPOG00000006488	-	82	45.116	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	79	45.070	ENSAPOG00000008063	-	68	45.070	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	79	46.698	ENSAPOG00000007322	-	71	46.698	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	77	44.928	ENSAPOG00000014759	-	67	44.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	76	44.828	ENSAPOG00000007333	-	60	44.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	83	44.395	ENSAPOG00000012716	-	74	44.395	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	76	46.798	ENSAPOG00000006169	-	59	44.907	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	75	43.781	ENSAPOG00000022240	-	57	43.781	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	79	38.679	ENSAPOG00000001315	-	65	38.679	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	78	49.767	ENSAPOG00000021159	-	69	49.767	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	93	64.516	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	87	64.516	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	89	65.401	ENSAPOG00000014243	-	98	65.401	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	70	44.681	ENSAPOG00000001262	-	88	44.681	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	79	39.524	ENSAPOG00000001268	-	51	39.524	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014655	-	79	41.981	ENSAOCG00000023240	-	74	43.350	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000014655	-	74	44.444	ENSAOCG00000001993	-	83	41.743	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	77	42.512	ENSAOCG00000021905	-	61	42.512	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	77	43.478	ENSAOCG00000023255	-	72	43.478	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	78	42.925	ENSAOCG00000008522	-	69	42.925	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	53	42.657	ENSAOCG00000011143	-	82	42.657	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	78	41.429	ENSAOCG00000012651	-	89	40.741	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	89	43.096	ENSAOCG00000008525	-	69	43.096	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	79	38.208	ENSAOCG00000011794	-	63	38.208	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	79	45.972	ENSAOCG00000011167	-	69	45.972	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014655	-	76	44.828	ENSAOCG00000011155	-	60	44.286	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000014655	-	79	45.972	ENSAPEG00000012179	-	71	45.972	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014655	-	75	41.294	ENSAPEG00000013651	-	78	41.294	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000014655	-	79	38.208	ENSAPEG00000000770	-	63	38.208	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000014655	-	77	45.631	ENSAPEG00000022386	-	77	45.631	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014655	-	84	42.982	ENSAPEG00000022382	-	76	42.982	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014655	-	77	54.589	ENSATEG00000020431	zgc:113625	87	51.786	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	79	42.254	ENSATEG00000019003	-	79	42.254	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	78	44.651	ENSATEG00000014085	-	72	44.651	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	78	46.977	ENSATEG00000013008	-	73	46.977	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	76	44.335	ENSATEG00000017193	-	60	43.810	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	89	48.963	ENSATEG00000020391	-	96	48.963	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	76	45.813	ENSATEG00000017202	-	56	44.762	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	74	38.071	ENSATEG00000016536	-	59	38.071	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000014655	-	75	47.030	ENSATEG00000017198	-	67	47.030	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	75	46.766	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	76	42.857	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	81	43.182	ENSATEG00000014028	-	70	46.250	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014655	-	79	46.262	ENSACLG00000027607	-	64	46.262	Astatotilapia_calliptera
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