EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014662 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1374 bases
Position: chrCCOE01000465.1:1093345-1094718
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018822	MMR_HSR1	PF01926.23	2.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019327	-	741	-	ENSACIP00000018822	246 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014662	-	81	49.010	ENSACIG00000012707	-	76	49.010
ENSACIG00000014662	-	98	67.635	ENSACIG00000014703	-	96	67.635
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ENSACIG00000014662	-	80	35.354	ENSACIG00000007737	-	76	35.354
ENSACIG00000014662	-	89	44.292	ENSACIG00000004040	-	85	44.292
ENSACIG00000014662	-	65	44.025	ENSACIG00000000976	-	78	44.025
ENSACIG00000014662	-	83	46.829	ENSACIG00000020244	-	86	46.829
ENSACIG00000014662	-	78	50.000	ENSACIG00000007158	-	61	50.000
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ENSACIG00000014662	-	79	42.051	ENSACIG00000012159	-	50	42.051
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ENSACIG00000014662	-	100	66.129	ENSACIG00000014655	-	93	66.129
ENSACIG00000014662	-	85	44.340	ENSACIG00000022222	-	67	44.131
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ENSACIG00000014662	-	50	43.089	ENSACIG00000001465	-	75	43.089
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ENSACIG00000014662	-	87	32.093	ENSACIG00000003050	-	91	32.093
ENSACIG00000014662	-	84	85.922	ENSACIG00000014680	-	89	85.922
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ENSACIG00000014662	-	90	43.243	ENSACIG00000001455	-	80	43.243
ENSACIG00000014662	-	85	44.131	ENSACIG00000016313	-	67	43.779
ENSACIG00000014662	-	80	49.239	ENSACIG00000007191	-	55	49.239
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ENSACIG00000014662	-	77	49.474	ENSACIG00000007178	-	66	49.474
ENSACIG00000014662	-	73	35.294	ENSACIG00000014737	-	85	35.294
ENSACIG00000014662	-	53	36.957	ENSACIG00000014730	zgc:172131	70	36.957
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ENSACIG00000014662	-	87	46.479	ENSACIG00000022366	-	81	44.783
ENSACIG00000014662	-	85	30.374	ENSACIG00000003906	-	70	30.374
ENSACIG00000014662	-	68	46.154	ENSACIG00000012204	-	73	46.154
ENSACIG00000014662	-	72	46.067	ENSACIG00000008666	-	85	46.067
ENSACIG00000014662	-	78	34.343	ENSACIG00000007725	-	70	34.343
ENSACIG00000014662	-	98	42.083	ENSACIG00000016888	-	77	42.083
ENSACIG00000014662	-	75	47.849	ENSACIG00000005223	-	71	47.849
ENSACIG00000014662	-	76	34.737	ENSACIG00000014670	-	72	34.737
ENSACIG00000014662	-	86	45.755	ENSACIG00000022355	-	73	45.972
ENSACIG00000014662	-	90	44.395	ENSACIG00000020234	-	78	44.395
ENSACIG00000014662	-	83	66.829	ENSACIG00000014745	-	92	66.829
ENSACIG00000014662	-	89	37.186	ENSACIG00000005573	-	92	37.186
ENSACIG00000014662	-	84	36.967	ENSACIG00000016502	-	88	36.967
ENSACIG00000014662	-	85	47.847	ENSACIG00000005780	-	63	47.847
ENSACIG00000014662	-	93	43.860	ENSACIG00000007466	-	69	43.860
ENSACIG00000014662	-	85	45.933	ENSACIG00000004245	-	74	45.933
ENSACIG00000014662	-	81	48.515	ENSACIG00000012718	-	84	48.515
ENSACIG00000014662	-	83	41.951	ENSACIG00000012714	-	68	41.951
ENSACIG00000014662	-	98	65.145	ENSACIG00000014716	-	97	65.145
ENSACIG00000014662	-	82	35.747	ENSACIG00000009149	-	75	35.747
ENSACIG00000014662	-	98	67.917	ENSACIG00000014690	-	91	67.917
ENSACIG00000014662	-	90	47.297	ENSACIG00000023381	-	85	47.297
ENSACIG00000014662	-	96	35.510	ENSACIG00000005587	-	84	35.510
ENSACIG00000014662	-	65	48.125	ENSACIG00000012761	-	70	48.125
ENSACIG00000014662	-	85	49.048	ENSACIG00000006478	-	78	49.048
ENSACIG00000014662	-	82	46.569	ENSACIG00000000893	-	81	46.569
ENSACIG00000014662	-	81	39.234	ENSACIG00000012061	-	61	39.234
ENSACIG00000014662	-	93	45.652	ENSACIG00000022377	-	82	45.652
ENSACIG00000014662	-	65	49.383	ENSACIG00000022374	-	82	49.383
ENSACIG00000014662	-	85	48.804	ENSACIG00000022370	-	77	48.624
ENSACIG00000014662	-	93	40.693	ENSACIG00000007494	-	73	41.558
ENSACIG00000014662	-	86	46.919	ENSACIG00000001070	-	75	46.919
ENSACIG00000014662	-	99	61.290	ENSACIG00000014646	zgc:113625	95	61.290
ENSACIG00000014662	-	87	44.240	ENSACIG00000008001	-	93	44.240
ENSACIG00000014662	-	74	40.110	ENSACIG00000000631	-	63	40.110
ENSACIG00000014662	-	84	46.635	ENSACIG00000012648	-	70	46.635
ENSACIG00000014662	-	78	41.885	ENSACIG00000015088	-	75	41.885
ENSACIG00000014662	-	87	44.860	ENSACIG00000006484	-	66	44.860
ENSACIG00000014662	-	76	42.021	ENSACIG00000001596	-	74	42.021
ENSACIG00000014662	-	83	44.976	ENSACIG00000020225	-	69	44.976
ENSACIG00000014662	-	92	44.493	ENSACIG00000002263	-	78	44.843
ENSACIG00000014662	-	73	35.196	ENSACIG00000019509	-	82	35.196
ENSACIG00000014662	-	80	65.152	ENSACIG00000014634	zgc:113625	96	56.846

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014662	-	84	46.377	ENSAPOG00000007322	-	68	47.739	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	87	44.545	ENSAPOG00000014759	-	71	44.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	92	38.528	ENSAPOG00000001268	-	56	38.528	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	84	44.928	ENSAPOG00000012716	-	69	44.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	85	47.368	ENSAPOG00000006488	-	80	47.368	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	83	45.411	ENSAPOG00000007333	-	62	43.779	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	80	45.226	ENSAPOG00000022240	-	57	45.226	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	94	68.376	ENSAPOG00000014243	-	96	68.376	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	85	41.827	ENSAPOG00000020897	-	78	41.827	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	86	47.170	ENSAPOG00000006169	-	58	47.170	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	84	38.835	ENSAPOG00000001315	-	63	38.835	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	83	46.341	ENSAPOG00000011509	-	69	46.341	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	98	67.755	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	86	67.755	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	85	46.411	ENSAPOG00000021159	-	67	46.411	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	94	46.154	ENSAPOG00000008063	-	74	46.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	76	43.548	ENSAPOG00000001262	-	88	43.548	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014662	-	81	40.196	ENSAOCG00000011794	-	59	40.196	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	87	44.601	ENSAOCG00000023240	-	77	44.811	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	83	45.894	ENSAOCG00000011155	-	62	44.240	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	88	43.779	ENSAOCG00000021905	-	65	43.779	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	81	43.500	ENSAOCG00000001993	-	83	43.119	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	86	45.070	ENSAOCG00000023255	-	74	45.070	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	86	45.755	ENSAOCG00000008525	-	61	45.755	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	84	46.377	ENSAOCG00000011167	-	65	47.739	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	92	45.022	ENSAOCG00000014702	-	74	45.022	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	82	48.039	ENSAOCG00000012651	-	85	47.573	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	65	43.827	ENSAOCG00000011143	-	81	43.827	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	86	43.868	ENSAOCG00000008522	-	69	43.868	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014662	-	81	44.221	ENSAPEG00000016554	-	81	43.779	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014662	-	83	44.878	ENSAPEG00000013651	-	80	44.878	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014662	-	81	40.196	ENSAPEG00000000770	-	59	40.196	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014662	-	83	45.411	ENSAPEG00000012184	-	62	43.779	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014662	-	84	45.894	ENSAPEG00000012179	-	67	47.236	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000014662	-	83	45.588	ENSAPEG00000022386	-	76	45.588	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000014662	-	86	49.065	ENSAPEG00000012191	-	72	49.065	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014662	-	85	44.976	ENSAPEG00000003884	-	67	44.976	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014662	-	92	45.022	ENSAPEG00000016533	-	75	45.022	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014662	-	84	38.863	ENSATEG00000005844	-	60	38.863	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	81	50.000	ENSATEG00000017198	-	67	50.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	87	42.342	ENSATEG00000014085	-	75	42.793	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	81	47.264	ENSATEG00000017202	-	57	46.047	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	79	38.660	ENSATEG00000016536	-	58	38.660	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	87	45.161	ENSATEG00000014028	-	74	48.214	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	90	47.964	ENSATEG00000013008	-	74	47.964	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	85	44.976	ENSATEG00000019003	-	78	44.976	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	87	55.607	ENSATEG00000020431	zgc:113625	82	55.607	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	92	44.934	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	79	43.541	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	83	44.878	ENSATEG00000017193	-	61	43.779	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	97	50.420	ENSATEG00000020391	-	97	50.420	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014662	-	81	37.745	ENSACLG00000011913	-	58	37.745	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014662	-	77	71.053	ENSACLG00000003276	-	72	71.053	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014662	-	91	43.966	ENSACLG00000001976	-	76	43.966	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014662	-	85	36.620	ENSACLG00000011921	-	67	37.864	Astatotilapia_calliptera
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