EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014703 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2924 bases
Position: chrCCOE01000465.1:1148024-1150947
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018890	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019398	-	729	-	ENSACIP00000018890	242 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014703	-	96	51.282	ENSACIG00000019524	-	97	51.282
ENSACIG00000014703	-	83	46.078	ENSACIG00000016635	-	77	45.813
ENSACIG00000014703	-	82	49.261	ENSACIG00000012707	-	76	49.261
ENSACIG00000014703	-	67	43.478	ENSACIG00000000976	-	79	43.478
ENSACIG00000014703	-	83	46.040	ENSACIG00000020225	-	68	46.040
ENSACIG00000014703	-	84	46.305	ENSACIG00000002263	-	73	46.305
ENSACIG00000014703	-	91	38.288	ENSACIG00000016502	-	95	38.288
ENSACIG00000014703	-	81	47.236	ENSACIG00000007191	-	55	47.236
ENSACIG00000014703	-	80	43.077	ENSACIG00000012714	-	65	43.077
ENSACIG00000014703	-	84	48.529	ENSACIG00000023381	-	80	48.529
ENSACIG00000014703	-	83	45.500	ENSACIG00000022366	-	72	45.500
ENSACIG00000014703	-	83	48.000	ENSACIG00000022362	-	72	48.000
ENSACIG00000014703	-	82	46.269	ENSACIG00000002950	-	54	46.269
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ENSACIG00000014703	-	82	45.771	ENSACIG00000019149	-	61	45.771
ENSACIG00000014703	-	96	67.635	ENSACIG00000014662	-	98	67.635
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ENSACIG00000014703	-	66	47.500	ENSACIG00000012761	-	70	47.500
ENSACIG00000014703	-	81	32.512	ENSACIG00000009811	-	83	32.512
ENSACIG00000014703	-	77	42.246	ENSACIG00000001596	-	74	42.246
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ENSACIG00000014703	-	69	30.588	ENSACIG00000007737	-	71	30.159
ENSACIG00000014703	-	82	37.019	ENSACIG00000005587	-	72	37.019
ENSACIG00000014703	-	84	64.706	ENSACIG00000014680	-	88	64.706
ENSACIG00000014703	-	81	40.102	ENSACIG00000015088	-	77	40.102
ENSACIG00000014703	-	81	69.697	ENSACIG00000014634	zgc:113625	79	69.000
ENSACIG00000014703	-	81	44.390	ENSACIG00000012159	-	53	44.390
ENSACIG00000014703	-	83	45.098	ENSACIG00000008001	-	87	45.098
ENSACIG00000014703	-	94	65.823	ENSACIG00000014655	-	89	65.823
ENSACIG00000014703	-	83	45.000	ENSACIG00000003582	-	64	45.000
ENSACIG00000014703	-	67	46.296	ENSACIG00000022374	-	83	46.296
ENSACIG00000014703	-	83	45.050	ENSACIG00000022377	-	73	45.050
ENSACIG00000014703	-	84	83.824	ENSACIG00000014745	-	92	83.824
ENSACIG00000014703	-	83	44.500	ENSACIG00000016888	-	65	44.500
ENSACIG00000014703	-	83	44.554	ENSACIG00000006484	-	62	44.554
ENSACIG00000014703	-	97	73.333	ENSACIG00000014690	-	92	73.333
ENSACIG00000014703	-	87	42.723	ENSACIG00000007494	-	69	43.662
ENSACIG00000014703	-	98	69.262	ENSACIG00000014716	-	98	69.262
ENSACIG00000014703	-	95	44.681	ENSACIG00000012718	-	96	44.681
ENSACIG00000014703	-	85	45.146	ENSACIG00000020234	-	72	45.146
ENSACIG00000014703	-	85	35.500	ENSACIG00000005573	-	89	35.500
ENSACIG00000014703	-	85	33.023	ENSACIG00000007725	-	77	33.023
ENSACIG00000014703	-	83	45.500	ENSACIG00000001070	-	71	45.500
ENSACIG00000014703	-	83	44.000	ENSACIG00000004245	-	71	44.000
ENSACIG00000014703	-	83	46.535	ENSACIG00000022355	-	69	46.535
ENSACIG00000014703	-	82	44.776	ENSACIG00000020244	-	84	44.776
ENSACIG00000014703	-	84	32.850	ENSACIG00000003050	-	91	32.850
ENSACIG00000014703	-	81	46.231	ENSACIG00000012648	-	67	46.231
ENSACIG00000014703	-	82	46.305	ENSACIG00000016313	-	67	44.907
ENSACIG00000014703	-	83	33.632	ENSACIG00000009149	-	75	33.632
ENSACIG00000014703	-	97	63.445	ENSACIG00000014646	zgc:113625	93	63.445
ENSACIG00000014703	-	83	44.878	ENSACIG00000022222	-	64	44.878
ENSACIG00000014703	-	87	34.842	ENSACIG00000012061	-	65	34.842
ENSACIG00000014703	-	83	41.584	ENSACIG00000006503	-	63	41.584
ENSACIG00000014703	-	82	48.259	ENSACIG00000005780	-	61	48.259
ENSACIG00000014703	-	67	41.104	ENSACIG00000000631	-	56	41.104
ENSACIG00000014703	-	74	36.559	ENSACIG00000014737	-	85	36.559
ENSACIG00000014703	-	53	33.577	ENSACIG00000014730	zgc:172131	70	33.577
ENSACIG00000014703	-	80	51.295	ENSACIG00000007158	-	60	50.990
ENSACIG00000014703	-	84	47.087	ENSACIG00000006478	-	77	47.087
ENSACIG00000014703	-	85	43.961	ENSACIG00000008045	-	82	41.935
ENSACIG00000014703	-	86	46.411	ENSACIG00000007466	-	83	46.411
ENSACIG00000014703	-	75	34.595	ENSACIG00000014670	-	71	34.595

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014703	-	82	43.939	ENSAPOG00000012716	-	66	43.939	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	83	45.000	ENSAPOG00000008063	-	64	45.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	87	45.540	ENSAPOG00000007322	-	72	45.755	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	77	44.920	ENSAPOG00000001262	-	89	44.920	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	90	38.914	ENSAPOG00000001268	-	54	38.914	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	83	44.554	ENSAPOG00000014759	-	66	44.554	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	83	47.030	ENSAPOG00000007333	-	58	47.030	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	83	49.505	ENSAPOG00000006169	-	56	49.505	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	51	45.238	ENSAPOG00000007361	-	71	45.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	81	46.734	ENSAPOG00000022240	-	57	46.734	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	86	39.713	ENSAPOG00000001315	-	64	39.713	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	95	66.390	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	85	66.390	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	94	64.557	ENSAPOG00000014243	-	98	64.557	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	83	49.000	ENSAPOG00000021159	-	65	49.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	85	45.366	ENSAPOG00000020897	-	76	45.366	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	81	48.980	ENSAPOG00000011509	-	67	48.980	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014703	-	83	50.000	ENSAPOG00000006488	-	77	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000014703	-	90	45.701	ENSAOCG00000014702	-	71	45.701	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	83	45.000	ENSAOCG00000021905	-	60	45.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	81	45.641	ENSAOCG00000001993	-	76	46.000	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	83	47.030	ENSAOCG00000023255	-	71	47.030	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	82	44.059	ENSAOCG00000012651	-	86	43.269	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	83	46.040	ENSAOCG00000008522	-	66	46.040	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	83	49.505	ENSAOCG00000008525	-	58	49.505	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	84	39.512	ENSAOCG00000011794	-	61	39.512	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	87	46.009	ENSAOCG00000011167	-	70	46.226	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	83	48.020	ENSAOCG00000011155	-	58	48.020	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014703	-	87	46.009	ENSAPEG00000012179	-	72	46.226	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014703	-	84	40.580	ENSAPEG00000013651	-	81	40.580	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000014703	-	83	46.000	ENSAPEG00000022374	-	68	46.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014703	-	83	47.525	ENSAPEG00000012184	-	58	47.525	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000014703	-	83	46.000	ENSAPEG00000022386	-	75	46.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014703	-	83	46.000	ENSAPEG00000022382	-	67	46.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014703	-	90	45.701	ENSAPEG00000016533	-	72	45.701	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000014703	-	84	39.706	ENSATEG00000005844	-	60	39.706	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	83	43.000	ENSATEG00000014085	-	68	43.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	83	46.000	ENSATEG00000013008	-	69	46.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	87	48.357	ENSATEG00000017198	-	71	48.585	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	83	46.535	ENSATEG00000017193	-	59	45.673	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	83	53.960	ENSATEG00000020391	-	83	53.960	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	82	45.050	ENSATEG00000017202	-	54	44.878	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	81	38.776	ENSATEG00000016536	-	59	38.776	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	82	48.241	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	79	44.231	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	83	45.098	ENSATEG00000014028	-	72	46.012	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	83	56.931	ENSATEG00000020431	zgc:113625	79	56.931	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014703	-	55	46.667	ENSACLG00000003287	-	69	46.667	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000014703	-	83	46.535	ENSACLG00000008599	-	66	46.535	Astatotilapia_calliptera
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