EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014716 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7670 bases
Position: chrCCOE01000465.1:1150958-1158627
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000018904	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-09	1	1

Transcripts

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ENSACIT00000019414	-	747	-	ENSACIP00000018904	248 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014716	-	82	47.059	ENSACIG00000003582	-	66	47.059
ENSACIG00000014716	-	78	37.037	ENSACIG00000009149	-	73	37.037
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ENSACIG00000014716	-	94	67.227	ENSACIG00000014655	-	89	67.227
ENSACIG00000014716	-	88	35.407	ENSACIG00000005573	-	89	35.407
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ENSACIG00000014716	-	84	44.712	ENSACIG00000007466	-	63	44.712
ENSACIG00000014716	-	97	37.551	ENSACIG00000012714	-	81	37.551
ENSACIG00000014716	-	92	43.777	ENSACIG00000012718	-	95	43.777
ENSACIG00000014716	-	97	70.445	ENSACIG00000014690	-	94	70.445
ENSACIG00000014716	-	76	50.526	ENSACIG00000007178	-	66	50.526
ENSACIG00000014716	-	82	49.020	ENSACIG00000022370	-	72	49.020
ENSACIG00000014716	-	83	44.660	ENSACIG00000022377	-	75	44.660
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ENSACIG00000014716	-	64	43.125	ENSACIG00000012761	-	70	43.125
ENSACIG00000014716	-	50	39.837	ENSACIG00000001465	-	75	39.837
ENSACIG00000014716	-	80	45.500	ENSACIG00000019149	-	61	45.500
ENSACIG00000014716	-	83	46.635	ENSACIG00000020234	-	73	46.635
ENSACIG00000014716	-	97	65.145	ENSACIG00000014662	-	98	65.145
ENSACIG00000014716	-	80	45.050	ENSACIG00000016313	-	62	45.050
ENSACIG00000014716	-	84	45.024	ENSACIG00000006478	-	78	45.024
ENSACIG00000014716	-	79	44.444	ENSACIG00000012648	-	67	44.444
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ENSACIG00000014716	-	82	46.569	ENSACIG00000002263	-	73	46.569
ENSACIG00000014716	-	96	63.333	ENSACIG00000014646	zgc:113625	92	63.333
ENSACIG00000014716	-	90	40.359	ENSACIG00000007494	-	71	41.256
ENSACIG00000014716	-	84	44.712	ENSACIG00000001455	-	76	44.712
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ENSACIG00000014716	-	93	61.017	ENSACIG00000014634	zgc:113625	94	61.017
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ENSACIG00000014716	-	81	45.320	ENSACIG00000002950	-	54	45.320
ENSACIG00000014716	-	73	35.714	ENSACIG00000019509	-	84	35.714
ENSACIG00000014716	-	79	33.824	ENSACIG00000009811	-	83	33.824
ENSACIG00000014716	-	81	47.805	ENSACIG00000000893	-	80	47.805
ENSACIG00000014716	-	73	44.262	ENSACIG00000012204	-	79	44.262
ENSACIG00000014716	-	82	46.078	ENSACIG00000004245	-	72	46.078
ENSACIG00000014716	-	81	44.118	ENSACIG00000020225	-	69	43.689

Orthologs

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ENSACIG00000014716	-	81	45.545	ENSAPOG00000012716	-	68	45.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	83	50.000	ENSAPOG00000006488	-	80	50.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	81	46.535	ENSAPOG00000022240	-	58	46.535	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	83	46.602	ENSAPOG00000020897	-	77	46.602	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	81	39.216	ENSAPOG00000001315	-	62	39.216	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	82	49.020	ENSAPOG00000011509	-	69	49.020	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	83	43.478	ENSAPOG00000007333	-	61	41.256	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	50	46.825	ENSAPOG00000007361	-	71	46.825	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	82	47.549	ENSAPOG00000021159	-	66	47.549	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	93	66.524	ENSAPOG00000014243	-	96	66.524	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	81	42.927	ENSAPOG00000014759	-	67	42.927	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	82	40.000	ENSAPOG00000001268	-	50	40.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	85	49.057	ENSAPOG00000006169	-	58	49.057	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	95	67.227	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	84	67.227	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	85	43.868	ENSAPOG00000008063	-	68	43.868	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	76	45.213	ENSAPOG00000001262	-	89	45.213	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014716	-	89	45.536	ENSAPOG00000007322	-	76	45.536	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000014716	-	82	38.537	ENSAOCG00000011794	-	61	38.537	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	81	41.667	ENSAOCG00000012651	-	89	39.815	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	63	40.506	ENSAOCG00000011143	-	86	40.506	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	80	46.465	ENSAOCG00000001993	-	78	46.305	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	86	46.729	ENSAOCG00000023255	-	75	46.729	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	83	44.444	ENSAOCG00000011155	-	61	42.152	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	83	46.377	ENSAOCG00000008522	-	68	46.377	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	99	45.161	ENSAOCG00000008525	-	72	45.161	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	85	45.238	ENSAOCG00000023240	-	77	45.238	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014716	-	89	45.536	ENSAOCG00000011167	-	74	45.536	Amphiprion_ocellaris
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ENSACIG00000014716	-	81	48.020	ENSATEG00000013008	-	69	48.020	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000014716	-	82	44.231	ENSATEG00000014028	-	72	44.785	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000014716	-	80	45.274	ENSATEG00000017202	-	55	44.019	Anabas_testudineus
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