EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014783 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: nrde2
Alias: c14orf102
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10364 bases
Position: chrCCOE01001620.1:1592845-1603208
Accession: ZDB-GENE-111117-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019062	NRDE-2	PF08424.10	4.1e-102	1	1
ENSACIP00000019042	NRDE-2	PF08424.10	8.5e-101	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019575	-	2607	-	ENSACIP00000019062	868 (aa)	-	-
ENSACIT00000019555	-	3345	-	ENSACIP00000019042	1114 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000014783's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000014783's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.384	ENSG00000119720	NRDE2	100	69.118	Homo_sapiens
ENSACIG00000014783	nrde2	100	76.949	ENSAPOG00000009202	nrde2	97	77.635	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.677	ENSAMEG00000001807	NRDE2	89	47.575	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000014783	nrde2	100	78.036	ENSAOCG00000015576	nrde2	96	78.898	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000014783	nrde2	100	78.163	ENSAPEG00000001711	nrde2	97	79.029	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014783	nrde2	100	74.419	ENSATEG00000010247	nrde2	97	73.988	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	50.000	ENSAPLG00000015870	NRDE2	97	48.893	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.802	ENSACAG00000014571	NRDE2	87	47.678	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000014783	nrde2	97	45.262	ENSANAG00000025313	NRDE2	90	46.147	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000014783	nrde2	100	84.115	ENSACLG00000025154	nrde2	97	84.462	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014783	nrde2	89	77.419	ENSAMXG00000034642	nrde2	93	47.838	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.052	ENSBTAG00000005427	NRDE2	91	48.574	Bos_taurus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.718	ENSCJAG00000017711	NRDE2	90	49.118	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	45.575	ENSCAFG00000017515	NRDE2	92	45.295	Canis_familiaris
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.841	ENSCAFG00020016346	NRDE2	89	47.989	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.606	ENSCHIG00000005876	NRDE2	91	48.801	Capra_hircus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.610	ENSTSYG00000000161	NRDE2	91	48.529	Carlito_syrichta
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.219	ENSCAPG00000012039	NRDE2	88	49.471	Cavia_aperea
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.107	ENSCPOG00000002428	NRDE2	87	49.374	Cavia_porcellus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.495	ENSCCAG00000024917	NRDE2	93	46.967	Cebus_capucinus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.330	ENSCLAG00000015185	NRDE2	87	49.278	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.161	ENSCSAG00000011451	NRDE2	91	48.070	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000014783	nrde2	66	54.167	ENSCHOG00000006165	NRDE2	64	54.167	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.780	ENSCPBG00000008537	NRDE2	88	48.432	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.049	ENSCANG00000029067	NRDE2	91	47.978	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.401	ENSCGRG00001015658	Nrde2	90	48.614	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.886	ENSCGRG00000005062	Nrde2	90	49.115	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000014783	nrde2	98	70.822	ENSCSEG00000000089	nrde2	99	70.996	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000014783	nrde2	100	72.878	ENSCVAG00000023105	nrde2	97	73.124	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014783	nrde2	98	55.886	ENSDARG00000074726	nrde2	97	55.947	Danio_rerio
ENSACIG00000014783	nrde2	96	48.438	ENSDNOG00000024057	NRDE2	91	47.846	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.058	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	49.465	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000014783	nrde2	74	43.705	ENSETEG00000000198	NRDE2	63	52.632	Echinops_telfairi
ENSACIG00000014783	nrde2	97	39.348	ENSEBUG00000014552	nrde2	90	39.142	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.387	ENSEASG00005020675	NRDE2	91	49.171	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.778	ENSECAG00000003862	NRDE2	91	48.991	Equus_caballus
ENSACIG00000014783	nrde2	56	70.526	ENSEEUG00000004026	-	59	63.158	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	60.366	ENSELUG00000005973	nrde2	97	60.017	Esox_lucius
ENSACIG00000014783	nrde2	98	49.285	ENSFCAG00000011312	NRDE2	91	48.720	Felis_catus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.780	ENSFALG00000012260	NRDE2	87	50.144	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.448	ENSFDAG00000021350	NRDE2	87	48.558	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000014783	nrde2	100	72.672	ENSFHEG00000021385	nrde2	97	73.017	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014783	nrde2	81	73.013	ENSGMOG00000015815	nrde2	100	65.824	Gadus_morhua
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.670	ENSGALG00000010677	NRDE2	91	48.739	Gallus_gallus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	71.969	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	75.328	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014783	nrde2	100	72.420	ENSGACG00000012619	nrde2	97	72.435	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.119	ENSGAGG00000003252	NRDE2	91	48.521	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.049	ENSGGOG00000008835	NRDE2	91	48.097	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000014783	nrde2	100	84.375	ENSHBUG00000016736	nrde2	97	84.722	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.275	ENSHGLG00000006731	NRDE2	88	49.615	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.275	ENSHGLG00100017736	NRDE2	88	49.615	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000014783	nrde2	95	67.224	ENSHCOG00000009559	nrde2	98	67.006	Hippocampus_comes
ENSACIG00000014783	nrde2	100	50.925	ENSIPUG00000016129	nrde2	97	50.617	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.664	ENSSTOG00000001678	NRDE2	87	49.089	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.723	ENSJJAG00000000907	Nrde2	90	49.441	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	74.274	ENSKMAG00000008647	nrde2	97	74.786	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000014783	nrde2	96	75.786	ENSLBEG00000021428	nrde2	97	75.139	Labrus_bergylta
ENSACIG00000014783	nrde2	89	51.526	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	53.519	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000014783	nrde2	98	55.912	ENSLOCG00000009037	nrde2	97	53.534	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000014783	nrde2	98	47.516	ENSLAFG00000004966	NRDE2	93	48.301	Loxodonta_africana
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.826	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	68.627	Macaca_mulatta
ENSACIG00000014783	nrde2	100	75.043	ENSMAMG00000013452	nrde2	97	74.613	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	84.201	ENSMZEG00005008319	nrde2	97	84.549	Maylandia_zebra
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.449	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	48.751	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.998	ENSMAUG00000018578	Nrde2	89	48.692	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.718	ENSMICG00000016741	NRDE2	91	48.482	Microcebus_murinus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.582	ENSMOCG00000014472	Nrde2	90	46.240	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000014783	nrde2	91	66.743	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	72.018	Mola_mola
ENSACIG00000014783	nrde2	93	46.125	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	48.311	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000014783	nrde2	98	72.717	ENSMALG00000021869	nrde2	95	73.284	Monopterus_albus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.499	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	91	49.081	Mus_caroli
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.889	ENSMUSG00000021179	Nrde2	87	50.288	Mus_musculus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.498	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	91	49.126	Mus_pahari
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.499	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	96	67.347	Mus_spretus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.235	ENSMPUG00000008135	NRDE2	89	47.097	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.161	ENSMLUG00000007484	NRDE2	88	48.390	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.222	ENSNGAG00000002993	Nrde2	87	49.040	Nannospalax_galili
ENSACIG00000014783	nrde2	99	80.507	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	84.372	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000014783	nrde2	98	46.645	ENSNLEG00000017032	NRDE2	90	47.394	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000014783	nrde2	91	48.178	ENSMEUG00000011097	NRDE2	74	48.178	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000014783	nrde2	64	66.265	ENSOPRG00000001375	-	60	67.327	Ochotona_princeps
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.661	ENSODEG00000012422	NRDE2	89	47.981	Octodon_degus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	84.723	ENSONIG00000019512	nrde2	97	84.899	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.891	ENSOCUG00000010083	NRDE2	88	48.857	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000014783	nrde2	98	70.783	ENSORLG00000017730	nrde2	96	70.336	Oryzias_latipes
ENSACIG00000014783	nrde2	100	69.159	ENSORLG00020015965	nrde2	97	69.676	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000014783	nrde2	100	69.558	ENSORLG00015012437	nrde2	96	71.249	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000014783	nrde2	100	70.784	ENSOMEG00000010890	nrde2	97	70.880	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.610	ENSOGAG00000006624	NRDE2	91	48.213	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000014783	nrde2	96	46.697	ENSOARG00000003475	NRDE2	92	46.773	Ovis_aries
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.394	ENSPPAG00000034133	NRDE2	98	50.216	Pan_paniscus
ENSACIG00000014783	nrde2	98	49.395	ENSPPRG00000006422	NRDE2	91	48.807	Panthera_pardus
ENSACIG00000014783	nrde2	98	49.395	ENSPTIG00000009989	NRDE2	91	48.807	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.384	ENSPTRG00000023399	NRDE2	91	48.375	Pan_troglodytes
ENSACIG00000014783	nrde2	100	52.227	ENSPKIG00000009331	nrde2	97	52.448	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.559	ENSPSIG00000005588	NRDE2	87	49.328	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000014783	nrde2	100	65.371	ENSPMGG00000024089	nrde2	99	65.194	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.002	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	49.808	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000014783	nrde2	96	49.775	ENSPCIG00000018567	NRDE2	94	49.760	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	71.997	ENSPFOG00000013217	nrde2	97	71.737	Poecilia_formosa
ENSACIG00000014783	nrde2	100	73.567	ENSPLAG00000022350	nrde2	97	73.311	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000014783	nrde2	100	73.225	ENSPMEG00000000778	nrde2	97	72.968	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000014783	nrde2	100	73.973	ENSPREG00000009066	nrde2	97	73.801	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.439	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	47.757	Pongo_abelii
ENSACIG00000014783	nrde2	78	73.846	ENSPCAG00000016399	NRDE2	72	73.846	Procavia_capensis
ENSACIG00000014783	nrde2	90	46.975	ENSPCOG00000024684	NRDE2	87	47.508	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000014783	nrde2	93	45.339	ENSPVAG00000010023	NRDE2	89	45.703	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	83.115	ENSPNYG00000022833	nrde2	98	83.465	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000014783	nrde2	99	54.013	ENSPNAG00000015807	nrde2	97	55.166	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000014783	nrde2	86	49.485	ENSRNOG00000004004	Nrde2	90	47.077	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000014783	nrde2	98	47.881	ENSSBOG00000024346	NRDE2	90	48.839	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000014783	nrde2	96	48.546	ENSSHAG00000016736	NRDE2	88	48.145	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000014783	nrde2	98	56.498	ENSSFOG00015011794	nrde2	94	55.585	Scleropages_formosus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	72.564	ENSSMAG00000011671	nrde2	96	72.564	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	76.154	ENSSDUG00000017948	nrde2	97	75.726	Seriola_dumerili
ENSACIG00000014783	nrde2	99	74.648	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	77.948	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.443	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	48.762	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000014783	nrde2	96	79.531	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	79.204	Stegastes_partitus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	48.998	ENSSSCG00000002434	NRDE2	91	48.577	Sus_scrofa
ENSACIG00000014783	nrde2	97	50.222	ENSTGUG00000012462	-	93	49.072	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000014783	nrde2	99	66.921	ENSTRUG00000002798	nrde2	98	70.595	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000014783	nrde2	90	57.877	ENSTBEG00000011834	NRDE2	86	49.353	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000014783	nrde2	97	49.168	ENSTTRG00000013583	NRDE2	91	48.901	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	46.930	ENSUAMG00000004159	NRDE2	95	47.335	Ursus_americanus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	46.444	ENSUMAG00000006393	NRDE2	92	47.086	Ursus_maritimus
ENSACIG00000014783	nrde2	97	47.951	ENSVVUG00000018202	NRDE2	88	48.011	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000014783	nrde2	96	47.404	ENSXETG00000015708	nrde2	92	46.332	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000014783	nrde2	97	73.333	ENSXCOG00000013298	nrde2	98	72.456	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000014783	nrde2	100	73.738	ENSXMAG00000009320	nrde2	97	73.653	Xiphophorus_maculatus