EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014973 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8636 bases
Position: chrCCOE01000387.1:30605-39240
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019225	MMR_HSR1	PF01926.23	3.1e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019744	-	1506	-	ENSACIP00000019225	501 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014973	-	88	33.264	ENSACIG00000022228	-	81	33.264
ENSACIG00000014973	-	98	61.686	ENSACIG00000001022	-	98	61.686
ENSACIG00000014973	-	88	34.774	ENSACIG00000009923	-	77	34.774
ENSACIG00000014973	-	96	61.553	ENSACIG00000014961	-	94	61.553
ENSACIG00000014973	-	95	65.686	ENSACIG00000010569	-	94	65.686
ENSACIG00000014973	-	96	64.440	ENSACIG00000003888	-	96	64.440
ENSACIG00000014973	-	95	61.355	ENSACIG00000008585	-	98	61.355
ENSACIG00000014973	-	96	66.667	ENSACIG00000023726	-	96	66.667
ENSACIG00000014973	-	97	62.818	ENSACIG00000014982	-	97	62.818
ENSACIG00000014973	-	99	60.305	ENSACIG00000008246	-	96	60.305
ENSACIG00000014973	-	99	60.152	ENSACIG00000002240	-	99	60.152
ENSACIG00000014973	-	72	65.116	ENSACIG00000023712	-	97	65.116
ENSACIG00000014973	-	96	64.522	ENSACIG00000003168	-	95	64.522
ENSACIG00000014973	-	95	64.158	ENSACIG00000012148	-	93	64.158
ENSACIG00000014973	-	87	35.181	ENSACIG00000009814	-	85	35.181
ENSACIG00000014973	-	94	61.355	ENSACIG00000014898	-	95	60.769
ENSACIG00000014973	-	94	62.828	ENSACIG00000021882	-	93	62.702
ENSACIG00000014973	-	95	77.000	ENSACIG00000021889	-	91	77.000
ENSACIG00000014973	-	96	66.602	ENSACIG00000008256	-	95	66.602
ENSACIG00000014973	-	96	63.439	ENSACIG00000021449	-	94	63.439

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014973	-	95	57.143	ENSAPOG00000005749	-	92	57.143	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014973	-	87	31.992	ENSAPOG00000016636	-	93	32.203	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014973	-	94	58.468	ENSAPOG00000021040	-	83	58.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014973	-	95	59.600	ENSAPOG00000005726	-	93	59.600	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014973	-	95	56.660	ENSAPEG00000000062	-	94	56.660	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014973	-	95	54.000	ENSATEG00000017635	-	92	54.000	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014973	-	93	61.303	ENSATEG00000019965	-	91	61.303	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014973	-	93	61.258	ENSATEG00000012558	-	91	61.258	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014973	-	93	62.475	ENSATEG00000023346	-	91	62.475	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014973	-	95	55.912	ENSACLG00000018271	-	92	55.912	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	92	60.722	ENSACLG00000006543	-	89	61.042	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	71	58.047	ENSACLG00000015361	-	94	58.047	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	96	57.087	ENSACLG00000021761	-	95	57.087	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	95	33.269	ENSACLG00000023126	-	97	33.140	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	96	32.030	ENSACLG00000023468	-	89	32.030	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	73	67.474	ENSACLG00000009330	-	78	67.474	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	94	60.729	ENSACLG00000010007	-	75	60.729	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	66	34.677	ENSACLG00000023033	-	92	34.677	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	90	64.762	ENSACLG00000017259	-	91	64.762	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	99	66.535	ENSACLG00000009261	-	98	66.535	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	93	60.042	ENSACLG00000018599	-	94	60.042	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	84	72.619	ENSACLG00000006285	-	96	72.619	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	94	73.810	ENSACLG00000006538	-	96	73.810	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014973	-	93	37.044	ENSAMXG00000034407	-	94	37.996	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	88	43.182	ENSAMXG00000029346	-	90	44.262	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	88	40.461	ENSAMXG00000039672	-	91	41.004	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	94	35.375	ENSAMXG00000041770	-	92	35.375	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	92	37.305	ENSAMXG00000032695	-	93	37.305	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	95	39.842	ENSAMXG00000037920	-	95	40.246	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	93	49.065	ENSAMXG00000030535	-	93	49.065	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	86	32.000	ENSAMXG00000036353	-	82	32.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	90	42.769	ENSAMXG00000033407	-	92	43.299	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	88	32.917	ENSAMXG00000035937	-	86	32.917	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014973	-	51	56.777	ENSCVAG00000022669	-	96	56.777	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	96	54.672	ENSCVAG00000008134	-	95	54.672	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	94	51.004	ENSCVAG00000006308	-	90	51.004	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	97	59.608	ENSCVAG00000007803	-	97	59.804	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	94	54.980	ENSCVAG00000007251	-	98	54.980	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	97	52.805	ENSCVAG00000007256	-	97	52.805	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	95	57.285	ENSCVAG00000009446	-	97	57.285	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	93	31.115	ENSCVAG00000011261	-	93	31.115	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	62	56.805	ENSCVAG00000022676	-	100	56.805	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	95	53.770	ENSCVAG00000008127	-	95	54.960	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	96	59.286	ENSCVAG00000007794	-	98	59.286	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	68	60.218	ENSCVAG00000014791	-	100	60.218	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	90	31.048	ENSCVAG00000015205	-	86	31.048	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000014973	-	96	56.445	ENSCVAG00000007269	-	95	56.445	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	91	48.361	ENSCVAG00000013384	-	99	48.361	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	95	54.819	ENSCVAG00000000224	-	85	54.819	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	87	59.013	ENSCVAG00000005819	-	99	59.013	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000014973	-	97	59.766	ENSCVAG00000004690	-	95	60.078	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	90	62.105	ENSCVAG00000007831	-	97	59.722	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014973	-	88	31.723	ENSDARG00000100370	CT955963.1	75	31.723	Danio_rerio
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ENSACIG00000014973	-	59	41.214	ENSDARG00000039888	CR855393.1	87	41.214	Danio_rerio
ENSACIG00000014973	-	85	33.405	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	82	33.405	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000014973	-	86	47.854	ENSELUG00000009611	-	96	47.789	Esox_lucius
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ENSACIG00000014973	-	95	46.245	ENSELUG00000009603	-	97	46.245	Esox_lucius
ENSACIG00000014973	-	87	34.917	ENSFHEG00000021963	-	88	34.917	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	96	57.200	ENSFHEG00000006430	-	97	57.200	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	96	57.000	ENSFHEG00000006408	-	97	57.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	96	57.957	ENSFHEG00000006403	-	96	57.957	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	94	48.697	ENSFHEG00000012343	-	98	48.697	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	94	55.847	ENSFHEG00000006425	-	96	55.847	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	94	58.669	ENSFHEG00000006385	-	91	58.669	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	94	51.904	ENSFHEG00000016342	-	98	51.904	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	95	56.972	ENSFHEG00000006411	-	95	56.972	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	95	52.000	ENSFHEG00000023034	-	97	52.000	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014973	-	51	33.333	ENSGMOG00000019529	-	60	33.935	Gadus_morhua
ENSACIG00000014973	-	88	32.510	ENSGMOG00000017552	-	80	32.510	Gadus_morhua
ENSACIG00000014973	-	95	30.966	ENSGMOG00000011319	-	98	30.966	Gadus_morhua
ENSACIG00000014973	-	88	32.305	ENSGMOG00000019330	-	80	32.305	Gadus_morhua
ENSACIG00000014973	-	86	31.416	ENSGMOG00000008232	-	98	31.416	Gadus_morhua
ENSACIG00000014973	-	87	33.193	ENSGMOG00000005680	-	79	33.193	Gadus_morhua
ENSACIG00000014973	-	88	30.928	ENSGMOG00000019825	-	99	31.753	Gadus_morhua
ENSACIG00000014973	-	94	56.674	ENSGAFG00000005023	-	94	56.592	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014973	-	95	57.030	ENSGAFG00000005032	-	93	57.030	Gambusia_affinis
ENSACIG00000014973	-	71	55.381	ENSGACG00000005035	-	96	55.381	Gasterosteus_aculeatus
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