EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000014982 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2804 bases
Position: chrCCOE01000387.1:73945-76748
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019238	MMR_HSR1	PF01926.23	2.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019756	-	1584	-	ENSACIP00000019238	527 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000014982	-	96	64.822	ENSACIG00000008585	-	99	64.822
ENSACIG00000014982	-	96	67.456	ENSACIG00000021449	-	94	67.456
ENSACIG00000014982	-	98	65.643	ENSACIG00000001022	-	98	65.643
ENSACIG00000014982	-	97	68.846	ENSACIG00000023726	-	97	68.846
ENSACIG00000014982	-	93	66.126	ENSACIG00000021882	-	93	65.992
ENSACIG00000014982	-	96	62.475	ENSACIG00000014898	-	96	62.049
ENSACIG00000014982	-	99	59.465	ENSACIG00000008246	-	94	59.465
ENSACIG00000014982	-	96	68.182	ENSACIG00000021889	-	92	68.182
ENSACIG00000014982	-	94	31.774	ENSACIG00000022269	-	85	32.296
ENSACIG00000014982	-	96	64.660	ENSACIG00000010569	-	95	64.660
ENSACIG00000014982	-	88	35.256	ENSACIG00000009814	-	85	35.256
ENSACIG00000014982	-	96	69.396	ENSACIG00000008256	-	95	69.396
ENSACIG00000014982	-	98	82.592	ENSACIG00000002240	-	97	82.592
ENSACIG00000014982	-	99	67.614	ENSACIG00000014961	-	96	67.614
ENSACIG00000014982	-	98	66.224	ENSACIG00000003168	-	98	66.224
ENSACIG00000014982	-	74	66.667	ENSACIG00000023712	-	98	66.667
ENSACIG00000014982	-	85	35.504	ENSACIG00000022228	-	78	35.504
ENSACIG00000014982	-	96	63.743	ENSACIG00000012148	-	94	63.938
ENSACIG00000014982	-	85	36.933	ENSACIG00000009923	-	74	37.149
ENSACIG00000014982	-	99	65.019	ENSACIG00000003888	-	99	65.019
ENSACIG00000014982	-	97	62.818	ENSACIG00000014973	-	97	62.818

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000014982	-	98	60.928	ENSAPOG00000005749	-	95	60.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014982	-	84	34.773	ENSAPOG00000016636	-	91	34.989	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014982	-	98	63.689	ENSAPOG00000021040	-	86	63.689	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014982	-	98	62.524	ENSAPOG00000005726	-	95	62.524	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000014982	-	95	62.227	ENSAPEG00000000062	-	94	62.227	Amphiprion_percula
ENSACIG00000014982	-	97	55.664	ENSATEG00000017635	-	94	55.664	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014982	-	93	66.463	ENSATEG00000019965	-	91	66.463	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014982	-	93	65.789	ENSATEG00000012558	-	91	65.789	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014982	-	96	66.272	ENSATEG00000023346	-	94	66.272	Anabas_testudineus
ENSACIG00000014982	-	98	59.357	ENSACLG00000021761	-	98	59.357	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	98	61.261	ENSACLG00000017259	-	96	61.261	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	94	63.347	ENSACLG00000010007	-	75	62.351	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	94	57.172	ENSACLG00000018599	-	95	57.172	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	89	34.483	ENSACLG00000023468	-	82	34.686	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	72	62.205	ENSACLG00000015361	-	94	62.205	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	93	71.617	ENSACLG00000006538	-	96	71.617	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	83	65.789	ENSACLG00000006285	-	97	65.789	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	97	68.056	ENSACLG00000009261	-	97	68.056	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	96	57.030	ENSACLG00000018271	-	93	57.030	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	95	34.749	ENSACLG00000023126	-	97	35.135	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	92	60.206	ENSACLG00000006543	-	90	59.921	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	73	65.753	ENSACLG00000009330	-	80	65.753	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	69	36.436	ENSACLG00000023033	-	94	36.436	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000014982	-	93	32.171	ENSAMXG00000036353	-	89	32.752	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	93	33.075	ENSAMXG00000035937	-	91	33.075	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	92	43.763	ENSAMXG00000033407	-	93	43.763	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	96	40.755	ENSAMXG00000034407	-	95	40.832	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	89	43.396	ENSAMXG00000039672	-	91	43.816	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	93	40.347	ENSAMXG00000032695	-	94	40.347	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	93	56.279	ENSAMXG00000030535	-	93	56.279	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	88	45.135	ENSAMXG00000029346	-	92	45.582	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	95	38.791	ENSAMXG00000041770	-	93	38.596	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	98	39.619	ENSAMXG00000037920	-	97	40.762	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000014982	-	94	59.759	ENSCVAG00000007251	-	97	59.759	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	69	65.395	ENSCVAG00000014791	-	100	65.395	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	92	50.202	ENSCVAG00000013384	-	99	50.202	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	91	62.656	ENSCVAG00000007831	-	99	60.274	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	93	32.143	ENSCVAG00000008633	-	93	32.738	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	96	56.299	ENSCVAG00000008127	-	95	56.299	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	87	62.635	ENSCVAG00000005819	-	99	62.635	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	98	60.465	ENSCVAG00000004690	-	96	60.465	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	97	54.420	ENSCVAG00000000224	-	86	54.617	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	91	34.132	ENSCVAG00000015205	-	89	34.132	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	94	60.479	ENSCVAG00000007256	-	94	60.479	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000014982	-	98	56.311	ENSCVAG00000008134	-	97	56.311	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	95	64.935	ENSCVAG00000007794	-	96	64.935	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000014982	-	97	53.411	ENSCVAG00000006308	-	94	53.089	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000014982	-	50	64.151	ENSCVAG00000022669	-	93	64.504	Cyprinodon_variegatus
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ENSACIG00000014982	-	85	35.652	ENSEBUG00000008009	zgc:171695	81	35.652	Eptatretus_burgeri
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ENSACIG00000014982	-	86	51.620	ENSELUG00000009611	-	96	51.695	Esox_lucius
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ENSACIG00000014982	-	57	44.516	ENSELUG00000008413	-	61	49.004	Esox_lucius
ENSACIG00000014982	-	96	58.532	ENSFHEG00000006408	-	97	58.532	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000014982	-	99	59.619	ENSFHEG00000006411	-	98	59.619	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014982	-	89	35.234	ENSFHEG00000021963	-	90	35.234	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014982	-	95	57.171	ENSFHEG00000023034	-	97	57.171	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014982	-	95	56.088	ENSFHEG00000016342	-	98	56.088	Fundulus_heteroclitus
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ENSACIG00000014982	-	93	55.263	ENSFHEG00000012343	-	97	55.263	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000014982	-	89	35.062	ENSGMOG00000019330	-	81	35.062	Gadus_morhua
ENSACIG00000014982	-	95	32.220	ENSGMOG00000011319	-	96	32.220	Gadus_morhua
ENSACIG00000014982	-	89	35.628	ENSGMOG00000005680	-	81	35.628	Gadus_morhua
ENSACIG00000014982	-	87	33.766	ENSGMOG00000008232	-	98	33.766	Gadus_morhua
ENSACIG00000014982	-	88	33.540	ENSGMOG00000019825	-	99	33.540	Gadus_morhua
ENSACIG00000014982	-	62	33.036	ENSGMOG00000019529	-	73	33.333	Gadus_morhua
ENSACIG00000014982	-	88	33.538	ENSGMOG00000017552	-	80	33.538	Gadus_morhua
ENSACIG00000014982	-	96	56.859	ENSGAFG00000005023	-	96	56.556	Gambusia_affinis
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