EuRBPDB

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RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015088 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4692 bases
Position: chrCCOE01001344.1:28513-33204
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019363	MMR_HSR1	PF01926.23	3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000019882	-	747	-	ENSACIP00000019363	248 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000015088	-	74	38.191	ENSACIG00000005587	-	69	38.191
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ENSACIG00000015088	-	75	45.789	ENSACIG00000016888	-	62	45.789
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ENSACIG00000015088	-	79	44.828	ENSACIG00000005780	-	59	44.828
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ENSACIG00000015088	-	75	44.737	ENSACIG00000022362	-	68	44.737
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ENSACIG00000015088	-	74	45.405	ENSACIG00000007466	-	75	45.405
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ENSACIG00000015088	-	74	43.085	ENSACIG00000020244	-	80	43.085
ENSACIG00000015088	-	72	40.556	ENSACIG00000012714	-	60	40.556
ENSACIG00000015088	-	81	40.196	ENSACIG00000012718	-	81	40.196
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ENSACIG00000015088	-	72	45.902	ENSACIG00000019149	-	56	46.448
ENSACIG00000015088	-	72	47.778	ENSACIG00000003582	-	60	46.774
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ENSACIG00000015088	-	76	40.838	ENSACIG00000016502	-	82	40.838
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ENSACIG00000015088	-	72	42.623	ENSACIG00000014655	-	68	42.623
ENSACIG00000015088	-	76	43.523	ENSACIG00000022222	-	61	43.684
ENSACIG00000015088	-	75	42.021	ENSACIG00000014634	zgc:113625	75	42.021
ENSACIG00000015088	-	76	40.206	ENSACIG00000007191	-	54	40.206
ENSACIG00000015088	-	75	44.041	ENSACIG00000008045	-	73	44.041
ENSACIG00000015088	-	75	48.677	ENSACIG00000016635	-	70	49.189
ENSACIG00000015088	-	74	45.989	ENSACIG00000022355	-	64	45.989
ENSACIG00000015088	-	74	42.162	ENSACIG00000007494	-	60	42.391

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015088	-	60	30.921	ENSAPOG00000008819	-	68	32.468	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	80	44.335	ENSAPOG00000018915	-	87	44.335	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	65	46.061	ENSAPOG00000007631	-	77	46.061	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	75	41.758	ENSAPOG00000022321	-	83	41.758	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	77	40.104	ENSAPOG00000021365	-	63	40.104	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	72	38.547	ENSAPOG00000020108	-	54	38.587	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	67	36.905	ENSAPOG00000009288	-	63	36.905	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	75	41.146	ENSAPOG00000000066	-	54	41.146	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	73	48.913	ENSAPOG00000001075	-	84	48.913	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	75	36.702	ENSAPOG00000008529	-	73	36.702	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	76	41.753	ENSAPOG00000010738	-	63	41.753	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	73	32.990	ENSAPOG00000002527	-	63	32.990	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	73	45.109	ENSAPOG00000009059	-	83	44.253	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	75	45.745	ENSAPOG00000007123	-	70	45.745	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	76	33.663	ENSAPOG00000002517	-	70	33.663	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015088	-	74	46.448	ENSAPOG00000002337	-	58	46.448	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSACIG00000015088	-	71	40.782	ENSAOCG00000013326	-	63	40.782	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015088	-	69	46.243	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	69	46.243	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015088	-	75	39.894	ENSAOCG00000015984	-	61	39.894	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015088	-	72	41.989	ENSAPEG00000019003	-	71	41.989	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015088	-	75	44.737	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	87	47.967	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015088	-	74	40.323	ENSAPEG00000013508	-	79	40.323	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015088	-	75	41.799	ENSAPEG00000003513	-	82	42.857	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015088	-	75	33.000	ENSAPEG00000002121	-	88	33.000	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015088	-	68	40.828	ENSAPEG00000013378	-	58	42.405	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015088	-	74	40.323	ENSAPEG00000013532	-	96	40.323	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000015088	-	75	44.792	ENSATEG00000011720	-	70	44.792	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015088	-	75	39.791	ENSATEG00000019504	-	65	39.791	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015088	-	64	43.210	ENSATEG00000012017	-	67	43.210	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000015088	-	79	41.500	ENSATEG00000011789	-	61	41.500	Anabas_testudineus
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ENSACIG00000015088	-	54	46.667	ENSATEG00000011891	-	84	46.667	Anabas_testudineus
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