EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015237 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1650 bases
Position: chrCCOE01000465.1:1667065-1668714
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019589	MMR_HSR1	PF01926.23	4.1e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000020111	-	762	-	ENSACIP00000019589	253 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000015237	-	90	32.377	ENSACIG00000018021	zgc:153654	54	32.377
ENSACIG00000015237	-	92	43.145	ENSACIG00000015684	-	88	43.145
ENSACIG00000015237	-	89	33.607	ENSACIG00000009430	-	54	33.607
ENSACIG00000015237	-	92	43.725	ENSACIG00000004501	-	86	43.725
ENSACIG00000015237	-	92	46.800	ENSACIG00000015616	-	97	45.076
ENSACIG00000015237	-	89	45.868	ENSACIG00000000741	-	85	45.868
ENSACIG00000015237	-	92	45.749	ENSACIG00000004426	-	84	45.749
ENSACIG00000015237	-	92	41.200	ENSACIG00000004408	-	86	41.200
ENSACIG00000015237	-	92	41.803	ENSACIG00000004521	-	87	41.803
ENSACIG00000015237	-	93	45.817	ENSACIG00000004444	-	91	45.817

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015237	-	91	44.841	ENSAOCG00000002056	-	82	44.841	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015237	-	92	43.200	ENSAPEG00000021053	-	87	43.200	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015237	-	93	47.390	ENSATEG00000002869	-	89	47.390	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015237	-	94	53.696	ENSATEG00000002718	-	80	53.696	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015237	-	92	41.600	ENSACLG00000016487	-	82	41.600	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015237	-	91	39.056	ENSACLG00000002020	-	89	39.056	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015237	-	94	64.885	ENSACLG00000010292	-	90	64.885	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015237	-	94	65.217	ENSACLG00000018321	-	89	65.217	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015237	-	83	35.683	ENSACLG00000016390	-	91	34.310	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015237	-	92	41.200	ENSACLG00000027615	-	93	41.200	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015237	-	90	31.950	ENSAMXG00000037563	-	85	31.950	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000015237	-	89	35.950	ENSCSEG00000018832	-	89	35.950	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015237	-	56	64.085	ENSCVAG00000014640	-	66	64.085	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015237	-	92	38.710	ENSCVAG00000007214	-	97	38.710	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015237	-	92	52.000	ENSCVAG00000016719	-	87	52.000	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015237	-	91	39.431	ENSCVAG00000023166	-	93	39.431	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015237	-	92	35.178	ENSDARG00000093857	si:dkey-79f11.10	77	35.178	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	56	35.211	ENSDARG00000092361	si:dkey-79f11.7	59	35.211	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	90	36.842	ENSDARG00000095673	si:dkey-79f11.8	74	36.842	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	68	38.251	ENSDARG00000015678	si:dkeyp-75b4.9	86	38.251	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	89	35.510	ENSDARG00000107486	CR855320.3	81	35.510	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	88	36.214	ENSDARG00000010729	CABZ01073795.1	82	36.214	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	89	36.214	ENSDARG00000075791	si:dkey-79f11.5	76	36.214	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	92	35.573	ENSDARG00000092634	CABZ01000634.1	83	35.573	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	89	35.223	ENSDARG00000095309	si:dkey-79f11.9	87	35.223	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	89	34.008	ENSDARG00000029720	si:dkeyp-9d4.2	89	33.704	Danio_rerio
ENSACIG00000015237	-	90	41.322	ENSFHEG00000018078	-	87	41.322	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015237	-	96	40.351	ENSFHEG00000018069	-	83	42.339	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015237	-	69	43.316	ENSFHEG00000019992	-	60	44.199	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015237	-	89	42.562	ENSFHEG00000021105	-	81	42.562	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015237	-	93	45.238	ENSGAFG00000019423	-	55	45.238	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015237	-	95	47.674	ENSGAFG00000019422	-	93	48.560	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015237	-	90	43.265	ENSGACG00000001319	-	97	41.353	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015237	-	90	42.857	ENSGACG00000012556	-	77	42.857	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015237	-	90	41.975	ENSGACG00000012548	-	89	40.152	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015237	-	92	42.683	ENSHBUG00000010945	-	91	42.683	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000015237	-	88	39.004	ENSIPUG00000005624	-	87	39.004	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015237	-	56	34.507	ENSIPUG00000006725	-	66	34.507	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015237	-	88	38.174	ENSIPUG00000007632	-	68	38.174	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015237	-	88	40.249	ENSIPUG00000006852	-	74	40.249	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015237	-	92	40.711	ENSKMAG00000000325	-	88	40.711	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015237	-	92	42.972	ENSKMAG00000006729	-	92	42.972	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015237	-	92	41.700	ENSKMAG00000000369	-	92	41.700	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015237	-	92	51.220	ENSMAMG00000003570	-	86	51.220	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015237	-	92	52.964	ENSMAMG00000003546	-	84	52.964	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015237	-	92	43.600	ENSMZEG00005008301	-	93	42.742	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015237	-	94	66.535	ENSMZEG00005015498	-	90	66.535	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015237	-	92	42.000	ENSMZEG00005008329	-	93	42.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015237	-	92	45.339	ENSNBRG00000006414	-	83	45.339	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	92	44.000	ENSNBRG00000020806	-	84	44.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	86	44.635	ENSNBRG00000020781	-	93	44.635	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	92	45.600	ENSNBRG00000006386	-	93	45.600	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	92	43.089	ENSNBRG00000022075	-	87	43.089	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	94	62.745	ENSNBRG00000023290	-	86	62.745	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	94	62.891	ENSNBRG00000024253	-	84	63.855	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	92	37.959	ENSNBRG00000020744	-	83	37.959	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015237	-	91	42.623	ENSONIG00000016843	-	98	42.623	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	89	40.833	ENSONIG00000017465	-	96	40.833	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	92	47.809	ENSONIG00000018790	-	85	47.809	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	92	42.800	ENSONIG00000015167	-	95	42.800	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	92	40.400	ENSONIG00000015371	-	96	40.400	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	92	42.800	ENSONIG00000012319	-	95	42.800	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	89	40.574	ENSONIG00000012317	-	96	40.574	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	65	45.455	ENSONIG00000013227	-	96	45.455	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	92	42.400	ENSONIG00000015247	-	87	42.400	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015237	-	87	36.441	ENSPMGG00000002695	-	89	36.441	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015237	-	92	39.919	ENSPMGG00000022341	-	74	39.919	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015237	-	91	39.759	ENSPMGG00000004994	-	85	39.759	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015237	-	91	44.255	ENSPMGG00000012906	-	86	44.255	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015237	-	90	40.741	ENSPFOG00000003807	-	83	41.423	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015237	-	91	45.565	ENSPFOG00000015455	-	82	45.565	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015237	-	96	48.763	ENSPFOG00000015382	-	91	51.145	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015237	-	91	41.870	ENSPFOG00000003841	-	84	41.463	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015237	-	94	46.275	ENSPFOG00000015493	-	88	45.882	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015237	-	93	41.036	ENSPLAG00000018274	-	89	41.036	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000015237	-	91	45.161	ENSPMEG00000018626	-	86	45.161	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015237	-	98	48.780	ENSPMEG00000018635	-	93	51.128	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015237	-	92	40.323	ENSPREG00000005137	-	89	40.323	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000015237	-	92	43.089	ENSPNYG00000005478	-	86	43.089	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015237	-	92	41.463	ENSPNYG00000024019	-	83	41.463	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015237	-	94	67.589	ENSPNYG00000001584	-	89	67.589	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015237	-	98	36.226	ENSPNAG00000009266	-	97	36.226	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000015237	-	97	31.690	ENSPNAG00000006327	-	63	33.206	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000015237	-	92	55.061	ENSSDUG00000002417	-	98	52.453	Seriola_dumerili
ENSACIG00000015237	-	92	53.441	ENSSDUG00000002359	-	98	50.943	Seriola_dumerili
ENSACIG00000015237	-	97	51.685	ENSSLDG00000008952	-	92	51.685	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000015237	-	91	41.870	ENSSLDG00000016397	-	90	41.870	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000015237	-	92	41.600	ENSSPAG00000012915	-	94	41.600	Stegastes_partitus
ENSACIG00000015237	-	92	42.742	ENSSPAG00000012856	-	87	42.742	Stegastes_partitus
ENSACIG00000015237	-	70	48.663	ENSXCOG00000019639	-	72	48.663	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000015237	-	59	44.000	ENSXCOG00000003913	-	77	44.000	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000015237	-	92	47.390	ENSXMAG00000009971	-	66	47.390	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000015237	-	93	43.529	ENSXMAG00000029117	-	89	43.529	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000015237	-	92	51.200	ENSXMAG00000009973	-	89	51.200	Xiphophorus_maculatus