EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015240 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pusl1
Alias: -
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14976 bases
Position: chrCCOE01001043.1:852895-867870
Accession: ZDB-GENE-101110-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019616	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.4e-32	1	2
ENSACIP00000019616	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.4e-32	2	2
ENSACIP00000019603	PseudoU_synth_1	PF01416.20	2.3e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000020138	-	810	-	ENSACIP00000019616	270 (aa)	-	-
ENSACIT00000020125	-	783	-	ENSACIP00000019603	260 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015240	pusl1	99	48.162	ENSG00000169972	PUSL1	98	49.600	Homo_sapiens
ENSACIG00000015240	pusl1	99	75.824	ENSAPOG00000016290	pusl1	92	75.824	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.059	ENSAMEG00000013752	PUSL1	93	44.681	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000015240	pusl1	99	74.725	ENSAOCG00000019419	pusl1	84	73.462	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015240	pusl1	99	74.359	ENSAPEG00000005452	pusl1	91	74.359	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015240	pusl1	100	76.642	ENSATEG00000024154	pusl1	92	76.642	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	50.000	ENSAPLG00000004946	PUSL1	92	50.000	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000015240	pusl1	95	53.846	ENSACAG00000014111	PUSL1	98	53.846	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	ENSANAG00000037456	PUSL1	89	47.794	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000015240	pusl1	100	90.511	ENSACLG00000008675	pusl1	95	88.048	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015240	pusl1	100	60.584	ENSAMXG00000044007	pusl1	95	60.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.324	ENSBTAG00000007619	PUSL1	96	44.681	Bos_taurus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	ENSCJAG00000010972	PUSL1	89	47.794	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	45.421	ENSCAFG00000019291	PUSL1	89	45.421	Canis_familiaris
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.154	ENSCAFG00020011568	PUSL1	91	44.840	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.324	ENSCHIG00000012615	PUSL1	98	44.170	Capra_hircus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.182	ENSCPOG00000005149	PUSL1	89	46.182	Cavia_porcellus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	ENSCCAG00000027475	PUSL1	89	47.794	Cebus_capucinus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	ENSCATG00000018260	PUSL1	92	45.714	Cercocebus_atys
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.715	ENSCLAG00000005232	PUSL1	91	45.520	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	ENSCSAG00000000680	PUSL1	92	45.357	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	56.044	ENSCPBG00000022621	PUSL1	93	56.044	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.426	ENSCANG00000034373	PUSL1	92	45.357	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	45.620	ENSCGRG00001012429	Pusl1	96	43.571	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000015240	pusl1	99	45.620	ENSCGRG00000006466	Pusl1	96	43.571	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000015240	pusl1	100	73.723	ENSCSEG00000005159	pusl1	92	73.723	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015240	pusl1	91	64.706	ENSCVAG00000012923	pusl1	91	64.706	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	62.044	ENSDARG00000074565	pusl1	95	65.025	Danio_rerio
ENSACIG00000015240	pusl1	100	31.894	FBgn0083976	CG34140	98	31.894	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.059	ENSECAG00000006248	PUSL1	92	44.484	Equus_caballus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.909	ENSEEUG00000000837	PUSL1	92	46.909	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	63.838	ENSELUG00000015945	pusl1	92	63.838	Esox_lucius
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.232	ENSFCAG00000007617	PUSL1	90	47.232	Felis_catus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	77.007	ENSFHEG00000006370	pusl1	92	77.007	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	75.368	ENSGMOG00000019388	pusl1	96	75.368	Gadus_morhua
ENSACIG00000015240	pusl1	99	50.183	ENSGALG00000001714	PUSL1	94	50.183	Gallus_gallus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	75.547	ENSGAFG00000007546	pusl1	93	75.547	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015240	pusl1	100	72.727	ENSGACG00000007848	pusl1	91	72.727	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	54.945	ENSGAGG00000004730	PUSL1	93	54.945	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000015240	pusl1	90	49.153	ENSGGOG00000005364	PUSL1	93	48.133	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000015240	pusl1	100	90.876	ENSHBUG00000001264	pusl1	91	90.876	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000015240	pusl1	99	45.818	ENSHGLG00000017570	PUSL1	89	45.818	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000015240	pusl1	91	47.012	ENSHGLG00100007641	PUSL1	82	47.012	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000015240	pusl1	100	74.170	ENSHCOG00000010077	pusl1	99	74.170	Hippocampus_comes
ENSACIG00000015240	pusl1	100	62.044	ENSIPUG00000023921	pusl1	94	62.044	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.691	ENSSTOG00000001783	PUSL1	89	44.406	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.810	ENSJJAG00000020471	Pusl1	92	47.810	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000015240	pusl1	97	66.792	ENSKMAG00000005154	pusl1	90	66.792	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	75.547	ENSLBEG00000013469	pusl1	94	75.547	Labrus_bergylta
ENSACIG00000015240	pusl1	74	51.813	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	54.124	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000015240	pusl1	100	55.636	ENSLOCG00000002210	pusl1	93	55.636	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000015240	pusl1	95	48.193	ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.403	Loxodonta_africana
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.426	ENSMFAG00000046288	PUSL1	92	45.357	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000015240	pusl1	99	41.328	ENSMMUG00000016279	PUSL1	91	41.762	Macaca_mulatta
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.426	ENSMNEG00000037989	PUSL1	92	45.357	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000015240	pusl1	100	78.467	ENSMAMG00000016538	pusl1	90	78.467	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	90.511	ENSMZEG00005026990	pusl1	99	89.961	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015240	pusl1	100	50.000	ENSMGAG00000003037	PUSL1	96	47.350	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000015240	pusl1	99	45.985	ENSMAUG00000019924	Pusl1	96	43.571	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	49.077	ENSMICG00000014171	PUSL1	95	46.263	Microcebus_murinus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.080	ENSMOCG00000005602	Pusl1	96	45.000	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000015240	pusl1	100	79.487	ENSMMOG00000003269	pusl1	99	79.487	Mola_mola
ENSACIG00000015240	pusl1	99	76.642	ENSMALG00000021686	pusl1	90	76.642	Monopterus_albus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	45.985	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	97	44.014	Mus_caroli
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.324	ENSMUSG00000051557	Pusl1	96	44.286	Mus_musculus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.350	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	96	44.286	Mus_pahari
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.059	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	97	44.718	Mus_spretus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.886	ENSMPUG00000014313	PUSL1	92	44.840	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.182	ENSNGAG00000004647	Pusl1	84	44.326	Nannospalax_galili
ENSACIG00000015240	pusl1	99	83.271	ENSNBRG00000014762	pusl1	98	83.271	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015240	pusl1	90	50.213	ENSNLEG00000000051	PUSL1	90	48.996	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000015240	pusl1	99	41.697	ENSMEUG00000005176	-	98	43.775	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000015240	pusl1	99	50.000	ENSMEUG00000011649	-	95	50.000	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.715	ENSODEG00000008247	PUSL1	88	46.715	Octodon_degus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	90.511	ENSONIG00000019361	pusl1	91	90.511	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	71.533	ENSORLG00000016228	pusl1	93	71.533	Oryzias_latipes
ENSACIG00000015240	pusl1	100	71.533	ENSORLG00020013710	pusl1	93	71.533	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000015240	pusl1	100	71.533	ENSORLG00015008715	pusl1	96	71.533	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000015240	pusl1	100	72.263	ENSOMEG00000018897	pusl1	94	72.263	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.426	ENSOGAG00000031692	PUSL1	94	47.426	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000015240	pusl1	90	48.511	ENSOARG00000004905	PUSL1	92	47.984	Ovis_aries
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	ENSPPAG00000029283	PUSL1	92	45.714	Pan_paniscus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.601	ENSPPRG00000023329	PUSL1	90	47.601	Panthera_pardus
ENSACIG00000015240	pusl1	91	48.739	ENSPTIG00000018532	PUSL1	91	48.988	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.426	ENSPTRG00000000021	PUSL1	92	45.357	Pan_troglodytes
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.426	ENSPANG00000000591	PUSL1	92	45.357	Papio_anubis
ENSACIG00000015240	pusl1	100	59.273	ENSPKIG00000002447	pusl1	95	59.273	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000015240	pusl1	91	59.036	ENSPSIG00000002781	PUSL1	92	59.036	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000015240	pusl1	99	70.260	ENSPMGG00000011051	pusl1	99	70.260	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.715	ENSPEMG00000013541	Pusl1	96	45.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000015240	pusl1	99	48.000	ENSPCIG00000007816	-	65	45.965	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	73.723	ENSPFOG00000015448	pusl1	92	73.282	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015240	pusl1	100	73.723	ENSPLAG00000004348	pusl1	92	73.723	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000015240	pusl1	100	73.723	ENSPMEG00000000931	pusl1	100	66.182	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015240	pusl1	100	71.898	ENSPREG00000002324	pusl1	92	71.898	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000015240	pusl1	90	47.881	ENSPPYG00000002014	PUSL1	86	46.914	Pongo_abelii
ENSACIG00000015240	pusl1	90	42.194	ENSPCAG00000002272	PUSL1	96	42.194	Procavia_capensis
ENSACIG00000015240	pusl1	72	48.529	ENSPVAG00000001016	PUSL1	66	47.287	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000015240	pusl1	85	90.129	ENSPNYG00000006588	pusl1	97	90.129	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015240	pusl1	99	63.004	ENSPNAG00000024441	pusl1	94	63.004	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.794	ENSRNOG00000022354	Pusl1	100	48.062	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.691	ENSRBIG00000036842	PUSL1	92	45.000	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.691	ENSRROG00000030704	PUSL1	92	45.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000015240	pusl1	90	48.790	ENSSBOG00000032249	PUSL1	89	48.790	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000015240	pusl1	54	50.336	ENSSHAG00000004840	-	76	50.336	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000015240	pusl1	100	60.727	ENSSFOG00015008281	pusl1	91	60.727	Scleropages_formosus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	76.190	ENSSMAG00000007187	pusl1	90	76.190	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	77.737	ENSSDUG00000000287	pusl1	96	78.077	Seriola_dumerili
ENSACIG00000015240	pusl1	100	77.737	ENSSLDG00000009605	pusl1	88	77.737	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000015240	pusl1	61	46.988	ENSSARG00000005323	-	88	46.988	Sorex_araneus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	72.593	ENSSPAG00000002528	pusl1	100	72.593	Stegastes_partitus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	47.292	ENSSSCG00000003338	PUSL1	89	47.292	Sus_scrofa
ENSACIG00000015240	pusl1	99	51.292	ENSTGUG00000003214	PUSL1	95	51.292	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000015240	pusl1	100	74.088	ENSTRUG00000010102	pusl1	92	74.088	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000015240	pusl1	69	71.667	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	71.667	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000015240	pusl1	95	37.600	ENSTBEG00000005001	PUSL1	88	37.600	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000015240	pusl1	90	43.775	ENSTTRG00000017030	PUSL1	82	43.775	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000015240	pusl1	90	48.523	ENSUAMG00000012801	PUSL1	78	48.523	Ursus_americanus
ENSACIG00000015240	pusl1	90	48.523	ENSUMAG00000002084	PUSL1	78	48.523	Ursus_maritimus
ENSACIG00000015240	pusl1	99	46.154	ENSVVUG00000004320	PUSL1	90	40.705	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000015240	pusl1	80	53.182	ENSXETG00000011145	pusl1	96	53.182	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000015240	pusl1	100	70.696	ENSXCOG00000017748	pusl1	100	71.480	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000015240	pusl1	100	75.912	ENSXMAG00000018846	pusl1	92	75.912	Xiphophorus_maculatus