EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015411 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7979 bases
Position: chrCCOE01001351.1:155781-163759
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019831	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-36	1	4
ENSACIP00000019831	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-36	2	4
ENSACIP00000019831	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-36	3	4
ENSACIP00000019831	zf-C2H2	PF00096.26	2.3e-36	4	4
ENSACIP00000019831	zf-met	PF12874.7	4.6e-11	1	3
ENSACIP00000019831	zf-met	PF12874.7	4.6e-11	2	3
ENSACIP00000019831	zf-met	PF12874.7	4.6e-11	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000020358	-	1605	-	ENSACIP00000019831	534 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000015411	-	84	38.424	ENSACIG00000012263	znf319b	88	38.424
ENSACIG00000015411	-	82	31.148	ENSACIG00000001767	zbtb41	67	31.148
ENSACIG00000015411	-	87	40.594	ENSACIG00000001860	-	51	40.594
ENSACIG00000015411	-	78	30.337	ENSACIG00000000406	prdm5	73	32.766
ENSACIG00000015411	-	86	37.241	ENSACIG00000001369	-	85	37.241
ENSACIG00000015411	-	79	38.037	ENSACIG00000018404	-	93	40.310
ENSACIG00000015411	-	83	42.568	ENSACIG00000009755	-	88	42.568
ENSACIG00000015411	-	70	42.857	ENSACIG00000000311	-	58	42.857
ENSACIG00000015411	-	83	39.416	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	92	39.416
ENSACIG00000015411	-	85	35.809	ENSACIG00000019710	-	72	35.092
ENSACIG00000015411	-	83	35.938	ENSACIG00000017653	-	93	36.620
ENSACIG00000015411	-	58	34.951	ENSACIG00000013613	scrt1b	52	34.951
ENSACIG00000015411	-	85	44.444	ENSACIG00000022330	-	91	44.444
ENSACIG00000015411	-	70	34.545	ENSACIG00000018732	zic1	55	34.545
ENSACIG00000015411	-	83	41.135	ENSACIG00000004041	-	92	41.135
ENSACIG00000015411	-	84	41.905	ENSACIG00000014123	znf236	64	40.678
ENSACIG00000015411	-	83	40.523	ENSACIG00000007096	-	82	40.523
ENSACIG00000015411	-	81	31.944	ENSACIG00000014233	znf407	66	34.146
ENSACIG00000015411	-	82	46.296	ENSACIG00000012084	-	93	46.296
ENSACIG00000015411	-	82	40.278	ENSACIG00000003720	-	65	40.278
ENSACIG00000015411	-	69	38.889	ENSACIG00000006377	-	63	38.889
ENSACIG00000015411	-	82	44.828	ENSACIG00000016133	-	55	44.828
ENSACIG00000015411	-	88	42.975	ENSACIG00000015429	-	89	42.975
ENSACIG00000015411	-	87	38.194	ENSACIG00000019815	-	83	38.194
ENSACIG00000015411	-	85	35.931	ENSACIG00000010739	-	83	35.931
ENSACIG00000015411	-	87	38.140	ENSACIG00000023212	-	81	38.140
ENSACIG00000015411	-	73	40.769	ENSACIG00000017892	-	83	40.152
ENSACIG00000015411	-	85	41.772	ENSACIG00000010966	-	53	41.772
ENSACIG00000015411	-	84	43.636	ENSACIG00000009717	-	94	40.876
ENSACIG00000015411	-	83	45.872	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	81	45.872
ENSACIG00000015411	-	82	36.486	ENSACIG00000013604	-	97	32.955
ENSACIG00000015411	-	84	45.736	ENSACIG00000013750	-	83	45.736
ENSACIG00000015411	-	67	41.129	ENSACIG00000002190	gfi1b	57	41.129
ENSACIG00000015411	-	82	39.850	ENSACIG00000009128	-	94	39.850
ENSACIG00000015411	-	83	34.773	ENSACIG00000022293	-	96	34.773
ENSACIG00000015411	-	56	41.111	ENSACIG00000007034	-	96	41.111
ENSACIG00000015411	-	50	47.368	ENSACIG00000010660	-	93	47.368
ENSACIG00000015411	-	87	34.694	ENSACIG00000019804	-	90	34.694
ENSACIG00000015411	-	68	43.307	ENSACIG00000022645	-	63	43.307
ENSACIG00000015411	-	68	41.667	ENSACIG00000006228	-	87	41.667
ENSACIG00000015411	-	90	41.880	ENSACIG00000013508	ZNF384	54	39.474
ENSACIG00000015411	-	87	33.921	ENSACIG00000013163	-	87	33.921
ENSACIG00000015411	-	83	39.815	ENSACIG00000003556	-	75	39.815
ENSACIG00000015411	-	83	42.647	ENSACIG00000006806	-	71	42.647
ENSACIG00000015411	-	83	44.604	ENSACIG00000004745	-	88	44.604
ENSACIG00000015411	-	60	44.000	ENSACIG00000011318	snai1a	67	44.000
ENSACIG00000015411	-	83	37.500	ENSACIG00000013470	-	64	37.500
ENSACIG00000015411	-	81	44.643	ENSACIG00000007464	-	58	44.643
ENSACIG00000015411	-	84	36.471	ENSACIG00000017644	-	85	36.471
ENSACIG00000015411	-	84	37.226	ENSACIG00000019534	-	89	37.226
ENSACIG00000015411	-	83	35.256	ENSACIG00000007000	-	61	32.013
ENSACIG00000015411	-	90	44.444	ENSACIG00000004666	-	92	46.617
ENSACIG00000015411	-	81	41.727	ENSACIG00000018022	-	66	40.496
ENSACIG00000015411	-	85	41.781	ENSACIG00000017647	-	96	41.727
ENSACIG00000015411	-	83	46.341	ENSACIG00000022625	-	85	46.341
ENSACIG00000015411	-	71	37.391	ENSACIG00000008611	-	50	37.391
ENSACIG00000015411	-	84	41.611	ENSACIG00000011153	-	75	40.994
ENSACIG00000015411	-	71	39.597	ENSACIG00000023513	znf384l	50	39.597
ENSACIG00000015411	-	83	33.014	ENSACIG00000014282	znf526	66	33.014
ENSACIG00000015411	-	83	45.283	ENSACIG00000022738	-	95	45.283
ENSACIG00000015411	-	74	42.069	ENSACIG00000020938	zbtb47b	69	42.069
ENSACIG00000015411	-	81	42.149	ENSACIG00000016932	-	66	42.149
ENSACIG00000015411	-	87	33.438	ENSACIG00000004626	-	79	39.815
ENSACIG00000015411	-	91	40.299	ENSACIG00000010647	-	99	42.857
ENSACIG00000015411	-	75	34.000	ENSACIG00000017166	-	66	34.000
ENSACIG00000015411	-	83	39.785	ENSACIG00000019791	-	97	35.884
ENSACIG00000015411	-	82	35.338	ENSACIG00000013149	-	80	33.871
ENSACIG00000015411	-	82	44.521	ENSACIG00000008448	-	83	44.521
ENSACIG00000015411	-	87	47.619	ENSACIG00000018440	-	95	47.619
ENSACIG00000015411	-	83	40.541	ENSACIG00000017013	-	57	40.541
ENSACIG00000015411	-	65	32.857	ENSACIG00000018641	snai2	72	32.857
ENSACIG00000015411	-	70	41.463	ENSACIG00000015835	-	84	45.263
ENSACIG00000015411	-	73	37.931	ENSACIG00000002180	-	99	37.931
ENSACIG00000015411	-	88	41.727	ENSACIG00000017050	-	99	40.667
ENSACIG00000015411	-	88	45.000	ENSACIG00000022658	-	89	42.568
ENSACIG00000015411	-	94	37.209	ENSACIG00000023049	znf646	95	37.838
ENSACIG00000015411	-	87	50.649	ENSACIG00000007882	-	84	50.649
ENSACIG00000015411	-	59	39.604	ENSACIG00000009443	-	55	39.604
ENSACIG00000015411	-	86	37.143	ENSACIG00000011515	-	68	37.500
ENSACIG00000015411	-	72	41.104	ENSACIG00000023162	-	54	41.104
ENSACIG00000015411	-	83	47.287	ENSACIG00000016944	-	78	47.287
ENSACIG00000015411	-	85	45.000	ENSACIG00000006172	-	91	45.000
ENSACIG00000015411	-	85	45.139	ENSACIG00000000286	-	76	45.139
ENSACIG00000015411	-	90	41.667	ENSACIG00000011541	-	67	41.667
ENSACIG00000015411	-	88	31.064	ENSACIG00000023313	-	93	31.064
ENSACIG00000015411	-	83	38.679	ENSACIG00000010637	-	53	38.679
ENSACIG00000015411	-	84	44.776	ENSACIG00000006755	-	74	44.776
ENSACIG00000015411	-	82	44.898	ENSACIG00000003754	-	82	44.898
ENSACIG00000015411	-	82	37.727	ENSACIG00000003515	-	94	47.727
ENSACIG00000015411	-	83	43.590	ENSACIG00000016182	-	81	43.590
ENSACIG00000015411	-	82	42.857	ENSACIG00000019447	-	66	42.857
ENSACIG00000015411	-	77	45.833	ENSACIG00000004641	-	59	45.833
ENSACIG00000015411	-	82	40.884	ENSACIG00000007855	-	88	43.434
ENSACIG00000015411	-	84	36.530	ENSACIG00000021986	-	95	37.821
ENSACIG00000015411	-	83	36.702	ENSACIG00000024444	-	64	36.702
ENSACIG00000015411	-	81	33.333	ENSACIG00000002944	-	89	35.644
ENSACIG00000015411	-	62	42.574	ENSACIG00000018059	-	57	42.574
ENSACIG00000015411	-	82	31.618	ENSACIG00000011516	-	81	31.618
ENSACIG00000015411	-	82	43.137	ENSACIG00000009780	-	71	43.137
ENSACIG00000015411	-	84	36.946	ENSACIG00000012636	ZNF319	95	36.946
ENSACIG00000015411	-	85	37.037	ENSACIG00000017683	-	77	36.022
ENSACIG00000015411	-	84	41.791	ENSACIG00000008886	znf1164	83	41.481
ENSACIG00000015411	-	83	40.972	ENSACIG00000023794	-	80	40.972
ENSACIG00000015411	-	85	31.627	ENSACIG00000016117	-	93	42.308

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015411	-	88	71.805	ENSAPOG00000001563	-	84	68.860	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015411	-	84	59.857	ENSAOCG00000013589	-	98	59.857	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015411	-	84	83.486	ENSAOCG00000013505	-	50	83.182	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015411	-	84	83.486	ENSAPEG00000022756	-	61	71.324	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015411	-	84	77.320	ENSAPEG00000022774	-	96	77.320	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015411	-	84	87.097	ENSATEG00000019261	-	83	87.097	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015411	-	88	91.279	ENSACLG00000008624	-	84	91.429	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015411	-	83	73.737	ENSACLG00000008606	-	91	73.737	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015411	-	88	64.242	ENSCSEG00000008903	-	93	47.582	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015411	-	83	81.364	ENSCVAG00000016534	-	54	81.364	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015411	-	83	50.142	ENSGMOG00000000494	-	98	49.575	Gadus_morhua
ENSACIG00000015411	-	90	65.415	ENSGAFG00000002659	-	73	58.233	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015411	-	88	68.072	ENSGACG00000001377	-	93	69.892	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015411	-	87	63.799	ENSHBUG00000008502	-	90	63.799	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000015411	-	90	63.095	ENSHCOG00000000511	-	91	41.096	Hippocampus_comes
ENSACIG00000015411	-	88	60.558	ENSLBEG00000018509	-	93	48.725	Labrus_bergylta
ENSACIG00000015411	-	88	70.385	ENSMAMG00000018137	-	63	68.824	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015411	-	87	63.799	ENSMZEG00005002583	-	89	63.799	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015411	-	82	63.359	ENSMMOG00000009733	-	87	63.670	Mola_mola
ENSACIG00000015411	-	84	77.852	ENSMALG00000019991	-	96	55.160	Monopterus_albus
ENSACIG00000015411	-	88	83.000	ENSNBRG00000008223	-	70	96.429	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015411	-	86	77.495	ENSONIG00000017233	-	99	77.707	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015411	-	69	75.000	ENSOMEG00000016463	-	79	61.372	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000015411	-	96	43.415	ENSPMGG00000002384	-	99	34.387	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015411	-	88	66.331	ENSPFOG00000006287	-	71	51.473	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015411	-	83	80.095	ENSPLAG00000003412	-	50	80.095	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000015411	-	88	66.331	ENSPMEG00000005897	-	65	51.473	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015411	-	88	66.736	ENSPREG00000021246	-	99	66.736	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000015411	-	82	94.340	ENSPNYG00000023088	-	90	64.158	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015411	-	88	70.341	ENSSDUG00000004892	-	88	57.714	Seriola_dumerili
ENSACIG00000015411	-	87	68.271	ENSSLDG00000005670	-	91	67.177	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000015411	-	99	64.364	ENSSPAG00000022219	-	85	75.676	Stegastes_partitus
ENSACIG00000015411	-	84	67.770	ENSTNIG00000011188	-	99	54.608	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000015411	-	90	65.613	ENSXMAG00000000866	-	59	47.778	Xiphophorus_maculatus