EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015420 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: oscp1a
Alias: oscp1|zgc:171454
Full Name: organic solute carrier partner 1a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5953 bases
Position: chrCCOE01001473.1:1668886-1674838
Accession: ZDB-GENE-080204-2
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000019829	LSM	PF01423.22	2.4e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000020356	-	456	-	ENSACIP00000019829	151 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000015420's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000015420's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSG00000181817	LSM10	95	66.667	Homo_sapiens
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSAMEG00000019854	LSM10	94	67.241	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	87.288	ENSAOCG00000015618	LSM10	98	87.288	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	87.288	ENSAOCG00000014654	-	98	87.288	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015420	oscp1a	72	86.486	ENSAOCG00000015607	LSM10	86	86.486	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015420	oscp1a	72	86.486	ENSAPEG00000021851	LSM10	86	86.486	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	87.288	ENSAPEG00000021845	-	98	87.288	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015420	oscp1a	74	85.714	ENSATEG00000006310	oscp1a	83	85.714	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	61.947	ENSACAG00000001231	LSM10	92	61.947	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	65.812	ENSANAG00000031489	-	96	65.812	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSANAG00000018759	-	95	66.667	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	89.431	ENSACLG00000004728	oscp1a	100	89.431	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	74.359	ENSAMXG00000025301	oscp1a	97	74.359	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	64.957	ENSBTAG00000024096	LSM10	96	64.957	Bos_taurus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.521	ENSCJAG00000044880	LSM10	95	67.521	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSCAFG00000003382	LSM10	94	67.241	Canis_familiaris
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSCAFG00020008920	LSM10	94	67.241	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	64.957	ENSCHIG00000009398	LSM10	96	64.957	Capra_hircus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	68.103	ENSCAPG00000012567	LSM10	94	68.103	Cavia_aperea
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	68.103	ENSCPOG00000039302	LSM10	94	68.103	Cavia_porcellus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSCCAG00000018913	-	95	66.667	Cebus_capucinus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	64.103	ENSCCAG00000008378	-	95	64.103	Cebus_capucinus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSCATG00000006589	LSM10	97	65.546	Cercocebus_atys
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.379	ENSCLAG00000008633	LSM10	94	66.379	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSCSAG00000000134	LSM10	97	65.546	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	65.254	ENSCHOG00000008615	LSM10	94	65.254	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000015420	oscp1a	68	30.392	ENSCSAVG00000001896	-	87	30.392	Ciona_savignyi
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSCANG00000019928	LSM10	97	65.546	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.949	ENSCGRG00001004317	-	97	66.949	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	62.069	ENSCGRG00001022673	-	93	62.069	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	62.069	ENSCGRG00000015514	-	93	62.069	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.949	ENSCGRG00000014935	-	97	66.949	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	80.328	ENSCSEG00000010374	oscp1a	82	80.328	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015420	oscp1a	80	78.512	ENSCVAG00000001536	oscp1a	91	78.512	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	54	76.543	ENSDARG00000109563	CABZ01074453.1	94	76.543	Danio_rerio
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	73.984	ENSDARG00000101222	oscp1a	96	77.586	Danio_rerio
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.521	ENSDNOG00000036662	LSM10	95	67.521	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	67.797	ENSDORG00000007579	Lsm10	96	67.797	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	66.116	ENSETEG00000005703	LSM10	98	66.116	Echinops_telfairi
ENSACIG00000015420	oscp1a	74	48.214	ENSEBUG00000001312	oscp1a	92	48.214	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	68.103	ENSEASG00005012194	LSM10	94	68.103	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	68.103	ENSECAG00000005071	LSM10	94	68.103	Equus_caballus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSEEUG00000012032	LSM10	94	67.241	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	82.203	ENSELUG00000007452	oscp1a	97	82.203	Esox_lucius
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	66.372	ENSFALG00000000851	LSM10	92	66.372	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSFDAG00000021056	LSM10	94	67.241	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	77.193	ENSFHEG00000001058	oscp1a	98	77.193	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	68.067	ENSGMOG00000019832	oscp1a	100	68.067	Gadus_morhua
ENSACIG00000015420	oscp1a	76	66.957	ENSGALG00000002127	LSM10	93	66.957	Gallus_gallus
ENSACIG00000015420	oscp1a	71	69.159	ENSGAFG00000016445	oscp1a	87	69.159	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	84.426	ENSGACG00000002329	oscp1a	100	84.426	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	67.257	ENSGAGG00000024848	LSM10	92	67.257	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSGGOG00000003556	LSM10	95	66.667	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	90.244	ENSHBUG00000001722	oscp1a	100	90.244	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.379	ENSHGLG00000011625	LSM10	94	66.379	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.379	ENSHGLG00100001769	LSM10	94	66.379	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000015420	oscp1a	68	72.816	ENSIPUG00000005808	oscp1a	90	72.816	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSSTOG00000000606	LSM10	94	67.241	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	84.167	ENSKMAG00000012143	oscp1a	99	84.167	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	83.186	ENSLBEG00000017764	oscp1a	93	83.186	Labrus_bergylta
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	65.517	ENSLACG00000015904	LSM10	89	65.517	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	72.881	ENSLOCG00000018277	oscp1a	97	72.881	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSLAFG00000009600	LSM10	97	65.546	Loxodonta_africana
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSMFAG00000009115	LSM10	97	65.546	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSMMUG00000017338	LSM10	97	65.546	Macaca_mulatta
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSMNEG00000020023	LSM10	97	65.546	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSMLEG00000025150	LSM10	97	65.546	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000015420	oscp1a	80	84.298	ENSMAMG00000004427	oscp1a	99	84.298	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	89.431	ENSMZEG00005026307	oscp1a	100	89.431	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015420	oscp1a	76	66.087	ENSMGAG00000015707	LSM10	93	66.087	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	67.797	ENSMAUG00000016624	Lsm10	97	67.797	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.949	ENSMOCG00000021943	Lsm10	97	66.949	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	85.965	ENSMMOG00000013597	oscp1a	85	85.965	Mola_mola
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	71.429	ENSMODG00000023328	LSM10	97	71.429	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.949	MGP_CAROLIEiJ_G0026467	Lsm10	97	66.949	Mus_caroli
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.949	ENSMUSG00000050188	Lsm10	97	66.949	Mus_musculus
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.949	MGP_PahariEiJ_G0028798	Lsm10	97	66.949	Mus_pahari
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.949	MGP_SPRETEiJ_G0027446	Lsm10	97	66.949	Mus_spretus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSMPUG00000018593	LSM10	94	67.241	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.379	ENSMLUG00000023895	LSM10	94	66.379	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.000	ENSNGAG00000015011	Lsm10	98	65.000	Nannospalax_galili
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	91.057	ENSNBRG00000014306	oscp1a	100	91.057	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSNLEG00000033754	LSM10	95	66.667	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	72.566	ENSMEUG00000006313	LSM10	92	72.566	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.102	ENSOPRG00000001699	LSM10	96	66.102	Ochotona_princeps
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.379	ENSODEG00000019161	LSM10	94	66.379	Octodon_degus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	92.500	ENSONIG00000020904	oscp1a	98	92.500	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	69.748	ENSOANG00000002066	LSM10	97	69.748	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.379	ENSOCUG00000005333	LSM10	94	66.379	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	82.500	ENSORLG00000009504	oscp1a	99	82.500	Oryzias_latipes
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	82.500	ENSORLG00020016201	oscp1a	99	82.500	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	80.000	ENSORLG00015007794	oscp1a	99	80.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	68.103	ENSOGAG00000002653	LSM10	94	68.103	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	64.957	ENSOARG00000009596	LSM10	96	64.957	Ovis_aries
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSPPAG00000023465	LSM10	95	66.667	Pan_paniscus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	68.103	ENSPPRG00000014619	LSM10	94	68.103	Panthera_pardus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	68.103	ENSPTIG00000004613	LSM10	94	68.103	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSPTRG00000000539	LSM10	95	66.667	Pan_troglodytes
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSPANG00000023172	LSM10	97	65.546	Papio_anubis
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	72.269	ENSPKIG00000003728	oscp1a	96	72.269	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	66.372	ENSPSIG00000000590	LSM10	92	66.372	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000015420	oscp1a	50	71.053	ENSPMGG00000015718	oscp1a	99	71.053	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015420	oscp1a	66	71.717	ENSPCIG00000014865	LSM10	73	71.717	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	72.807	ENSPFOG00000020490	oscp1a	97	72.807	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	71.795	ENSPLAG00000016537	oscp1a	89	71.795	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	70.796	ENSPMEG00000000174	oscp1a	98	70.796	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	72.650	ENSPREG00000009899	oscp1a	89	72.650	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSPPYG00000001539	LSM10	95	66.667	Pongo_abelii
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.000	ENSPCAG00000002520	LSM10	98	65.000	Procavia_capensis
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSPVAG00000008644	LSM10	94	67.241	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000015420	oscp1a	81	90.244	ENSPNYG00000003138	oscp1a	100	90.244	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	75.630	ENSPNAG00000028829	oscp1a	98	75.630	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	66.102	ENSRNOG00000025716	Lsm10	97	66.102	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSRBIG00000001561	LSM10	97	65.546	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	65.546	ENSRROG00000011414	LSM10	97	65.546	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	66.667	ENSSBOG00000036413	-	95	66.667	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	72.566	ENSSHAG00000018056	LSM10	92	72.566	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	71.186	ENSSFOG00015019954	lsm10	97	71.186	Scleropages_formosus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	87.179	ENSSMAG00000001297	oscp1a	100	87.179	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	82.203	ENSSDUG00000007090	oscp1a	96	82.203	Seriola_dumerili
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	83.051	ENSSLDG00000000800	oscp1a	98	83.051	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000015420	oscp1a	68	68.932	ENSSARG00000004211	LSM10	94	66.949	Sorex_araneus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	90.598	ENSSPAG00000009229	oscp1a	97	90.598	Stegastes_partitus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	65.812	ENSSSCG00000038916	LSM10	95	65.812	Sus_scrofa
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	66.372	ENSTGUG00000001600	-	93	66.372	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000015420	oscp1a	75	67.257	ENSTGUG00000001602	-	93	67.257	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000015420	oscp1a	78	78.814	ENSTRUG00000010531	oscp1a	95	78.814	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000015420	oscp1a	79	67.227	ENSTBEG00000016674	LSM10	97	67.227	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSUAMG00000020265	LSM10	94	67.241	Ursus_americanus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSUMAG00000001438	LSM10	53	67.241	Ursus_maritimus
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	67.241	ENSVVUG00000023209	LSM10	94	67.241	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000015420	oscp1a	77	62.931	ENSXETG00000027631	lsm10	94	62.931	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000015420	oscp1a	86	65.385	ENSXCOG00000018776	oscp1a	86	64.234	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000015420	oscp1a	74	70.536	ENSXMAG00000019963	oscp1a	90	70.536	Xiphophorus_maculatus