EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015429 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 80832 bases
Position: chrCCOE01005865.1:282376-363207
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

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ENSACIP00000019908	zf-C2H2	PF00096.26	8.7e-31	4	4
ENSACIP00000019870	zf-met	PF12874.7	5.1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000015429	-	78	42.188	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	89	30.542
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ENSACIG00000015429	-	79	50.340	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	91	46.795
ENSACIG00000015429	-	81	47.297	ENSACIG00000006806	-	70	44.856
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ENSACIG00000015429	-	93	47.586	ENSACIG00000003720	-	68	45.087
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ENSACIG00000015429	-	89	46.575	ENSACIG00000022658	-	95	48.263
ENSACIG00000015429	-	84	51.007	ENSACIG00000008448	-	97	47.534
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ENSACIG00000015429	-	92	51.370	ENSACIG00000010647	-	98	56.044
ENSACIG00000015429	-	86	44.762	ENSACIG00000016331	ZBTB14	56	44.762
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ENSACIG00000015429	-	81	43.902	ENSACIG00000007096	-	89	45.517
ENSACIG00000015429	-	76	48.529	ENSACIG00000002180	-	99	48.529
ENSACIG00000015429	-	72	41.667	ENSACIG00000009443	-	60	38.095
ENSACIG00000015429	-	82	49.180	ENSACIG00000022645	-	58	43.750
ENSACIG00000015429	-	67	46.000	ENSACIG00000016180	znf341	51	46.000
ENSACIG00000015429	-	93	47.619	ENSACIG00000004745	-	91	48.227
ENSACIG00000015429	-	76	56.429	ENSACIG00000000286	-	79	45.960
ENSACIG00000015429	-	93	46.207	ENSACIG00000013604	-	98	47.826
ENSACIG00000015429	-	76	51.370	ENSACIG00000003754	-	88	49.261

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
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