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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015607 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 67408 bases
Position: chrCCOE01000446.1:1740478-1807885
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000020164	ResIII	PF04851.15	6.9e-08	1	1
ENSACIP00000020164	BRK	PF07533.16	1.8e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000020698	SMARCA2-201	4710	-	ENSACIP00000020164	1569 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000015607	SMARCA2	91	73.379	ENSACIG00000003035	-	97	72.793
ENSACIG00000015607	SMARCA2	93	70.995	ENSACIG00000021550	smarca4a	98	70.434

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.743	ENSG00000080503	SMARCA2	97	95.238	Homo_sapiens
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.670	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	92.023	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	88	76.292	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	84.305	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.574	ENSAOCG00000009647	-	99	92.456	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.232	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	99	91.548	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	90.823	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	90.759	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	87	77.921	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.507	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.275	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.356	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.832	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	79.774	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	94.331	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	94.650	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	84.129	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	82.846	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.429	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	80.355	Bos_taurus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.974	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	99	80.309	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.702	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	80.557	Canis_familiaris
ENSACIG00000015607	SMARCA2	75	85.945	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	85.520	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.559	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	80.418	Capra_hircus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	77.568	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	100	78.403	Carlito_syrichta
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.080	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	77.580	Cavia_aperea
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.637	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	79.535	Cavia_porcellus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.910	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	79.849	Cebus_capucinus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.446	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	79.724	Cercocebus_atys
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.250	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	79.537	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000015607	SMARCA2	91	81.492	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	80.981	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	83	81.818	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	81.818	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.949	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	98	84.470	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.129	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.063	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	74.758	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	73.404	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	87.894	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	98	87.283	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	85	88.161	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	88.161	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	83.302	ENSDARG00000008904	smarca2	100	82.158	Danio_rerio
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.052	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	79.276	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.537	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	79.737	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000015607	SMARCA2	78	61.582	FBgn0000212	brm	72	60.591	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000015607	SMARCA2	95	69.332	ENSEBUG00000011442	-	97	69.444	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000015607	SMARCA2	87	61.222	ENSEBUG00000002449	-	93	63.764	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.377	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	80.304	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	62	88.235	ENSEEUG00000015540	-	69	80.822	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	96	81.510	ENSELUG00000010318	smarca2	99	80.757	Esox_lucius
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.442	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	80.241	Felis_catus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.153	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	80.660	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.686	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	77.396	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.308	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	90.075	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	82.138	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	81.318	Gadus_morhua
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.330	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	79.737	Gallus_gallus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	95	83.267	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	83.058	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	86.802	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	86.389	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.756	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	79.737	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	72.070	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	78.299	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	94.441	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	93.009	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.944	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	79.064	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.469	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	80.520	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000015607	SMARCA2	89	82.470	ENSHCOG00000015348	-	100	82.470	Hippocampus_comes
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	80.871	ENSIPUG00000011060	smarca2	100	80.741	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.640	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	79.612	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.537	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	79.423	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	89.261	ENSKMAG00000015844	-	100	89.882	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.900	ENSLOCG00000011499	smarca2	100	80.037	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.608	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	78.331	Loxodonta_africana
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.985	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	80.253	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.077	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.013	Macaca_mulatta
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.317	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	79.849	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.613	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	79.632	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.099	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	90.037	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	94.441	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	92.946	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015607	SMARCA2	74	66.971	ENSMGAG00000005160	-	100	66.710	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.259	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	80.189	Microcebus_murinus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.051	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	79.674	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	87.004	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	86.407	Mola_mola
ENSACIG00000015607	SMARCA2	96	79.571	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	79.261	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	91.597	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	91.597	Monopterus_albus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.159	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	78.253	Mus_caroli
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.246	ENSMUSG00000024921	Smarca2	94	98.000	Mus_musculus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.577	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	78.594	Mus_pahari
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.954	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	81	84.186	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	84.186	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	75.000	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	73.483	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.755	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	78.562	Nannospalax_galili
ENSACIG00000015607	SMARCA2	95	78.742	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	99.364	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.167	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.442	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000015607	SMARCA2	93	81.818	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	72.761	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000015607	SMARCA2	81	79.812	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.422	Ochotona_princeps
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.489	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	78.788	Octodon_degus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	92.090	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	92.028	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	81	85.220	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	78.745	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	88.353	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	88.541	Oryzias_latipes
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	88.312	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	88.534	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	89.001	ENSOMEG00000009736	-	100	89.037	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000015607	SMARCA2	80	84.822	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	77.917	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.416	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	79.633	Ovis_aries
ENSACIG00000015607	SMARCA2	80	85.203	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	79.378	Pan_paniscus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	80.507	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	80.304	Panthera_pardus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.319	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	79.461	Pan_troglodytes
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	76.425	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	76.515	Papio_anubis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	83.397	ENSPKIG00000018469	-	100	82.551	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000015607	SMARCA2	96	79.351	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	79.148	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	83.817	ENSPMGG00000013696	-	98	83.946	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.127	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	78.647	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	68.860	ENSPMAG00000005337	-	98	68.438	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.922	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	79.861	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	88.639	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	88.702	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	89.052	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	98	89.111	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000015607	SMARCA2	99	88.133	ENSPMEG00000001815	-	99	87.990	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	87.918	ENSPREG00000013800	SMARCA2	100	87.886	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	79.677	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	79.648	Pongo_abelii
ENSACIG00000015607	SMARCA2	76	74.296	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	74.296	Procavia_capensis
ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.202	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	78.058	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000015607	SMARCA2	90	82.456	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	82.137	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.290	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	100	90.428	Pundamilia_nyererei
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