EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015616 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6405 bases
Position: chrCCOE01001475.1:57176-63580
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000020125	MMR_HSR1	PF01926.23	2e-06	1	1
ENSACIP00000020162	MMR_HSR1	PF01926.23	3.3e-06	1	1
ENSACIP00000020156	MMR_HSR1	PF01926.23	6.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000020659	-	816	-	ENSACIP00000020125	271 (aa)	-	-
ENSACIT00000020696	-	933	-	ENSACIP00000020162	310 (aa)	-	-
ENSACIT00000020690	-	882	-	ENSACIP00000020156	293 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000015616	-	97	45.076	ENSACIG00000015237	-	92	46.800
ENSACIG00000015616	-	96	78.161	ENSACIG00000004521	-	98	77.617
ENSACIG00000015616	-	96	81.226	ENSACIG00000004444	-	95	79.545
ENSACIG00000015616	-	99	79.401	ENSACIG00000004426	-	90	82.443
ENSACIG00000015616	-	97	74.340	ENSACIG00000004501	-	95	73.432
ENSACIG00000015616	-	97	81.132	ENSACIG00000015684	-	99	87.097
ENSACIG00000015616	-	97	36.000	ENSACIG00000018021	zgc:153654	61	36.691
ENSACIG00000015616	-	97	36.823	ENSACIG00000009430	-	64	36.082
ENSACIG00000015616	-	97	58.427	ENSACIG00000000741	-	93	59.542
ENSACIG00000015616	-	97	76.208	ENSACIG00000004408	-	92	76.208

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015616	-	100	62.724	ENSAOCG00000002056	-	89	66.171	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015616	-	97	62.082	ENSAPEG00000021053	-	98	62.500	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015616	-	96	50.558	ENSATEG00000002869	-	93	52.896	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015616	-	100	46.237	ENSATEG00000002718	-	88	44.251	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015616	-	94	50.763	ENSACLG00000018321	-	94	49.442	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015616	-	97	66.667	ENSACLG00000027615	-	100	69.173	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015616	-	96	49.819	ENSACLG00000010292	-	98	49.286	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015616	-	96	69.466	ENSACLG00000016487	-	86	72.763	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015616	-	96	48.120	ENSACLG00000002020	-	97	48.120	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015616	-	88	59.751	ENSACLG00000016390	-	92	62.185	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015616	-	90	36.694	ENSAMXG00000037563	-	86	37.449	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000015616	-	98	48.519	ENSCSEG00000018832	-	97	50.575	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015616	-	95	46.947	ENSCVAG00000023166	-	97	49.416	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015616	-	61	45.562	ENSCVAG00000014640	-	85	43.716	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015616	-	96	46.209	ENSCVAG00000016719	-	94	47.037	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015616	-	94	46.947	ENSCVAG00000007214	-	99	47.692	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015616	-	61	37.725	ENSDARG00000092361	si:dkey-79f11.7	82	35.385	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	97	41.516	ENSDARG00000095673	si:dkey-79f11.8	84	43.525	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	98	38.849	ENSDARG00000010729	CABZ01073795.1	94	40.000	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	90	39.921	ENSDARG00000095309	si:dkey-79f11.9	88	39.921	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	75	45.673	ENSDARG00000015678	si:dkeyp-75b4.9	99	46.667	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	97	39.711	ENSDARG00000107486	CR855320.3	92	40.433	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	98	38.214	ENSDARG00000093857	si:dkey-79f11.10	86	39.858	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	97	40.000	ENSDARG00000075791	si:dkey-79f11.5	87	40.502	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	98	38.434	ENSDARG00000092634	CABZ01000634.1	93	39.286	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	93	37.546	ENSDARG00000029720	si:dkeyp-9d4.2	89	39.777	Danio_rerio
ENSACIG00000015616	-	97	49.275	ENSFHEG00000018069	-	94	48.043	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015616	-	94	45.736	ENSFHEG00000018078	-	96	45.627	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015616	-	76	49.091	ENSFHEG00000019992	-	80	44.856	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015616	-	96	48.872	ENSFHEG00000021105	-	88	50.958	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015616	-	91	43.922	ENSGAFG00000019422	-	95	45.344	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015616	-	97	44.853	ENSGAFG00000019423	-	58	44.853	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015616	-	97	56.877	ENSGACG00000012556	-	84	59.770	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015616	-	98	55.147	ENSGACG00000012548	-	89	57.576	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015616	-	98	56.250	ENSGACG00000001319	-	98	59.091	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015616	-	97	70.076	ENSHBUG00000010945	-	97	70.076	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000015616	-	70	34.826	ENSIPUG00000006725	-	99	34.826	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015616	-	97	43.956	ENSIPUG00000006852	-	83	43.956	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015616	-	97	44.649	ENSIPUG00000005624	-	97	44.649	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015616	-	90	44.800	ENSIPUG00000007632	-	77	41.392	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015616	-	94	50.385	ENSKMAG00000000325	-	97	49.084	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015616	-	94	51.737	ENSKMAG00000006729	-	99	51.103	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015616	-	94	50.193	ENSKMAG00000000369	-	97	47.191	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015616	-	96	56.654	ENSMAMG00000003570	-	90	58.755	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015616	-	99	44.876	ENSMAMG00000003546	-	93	45.614	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015616	-	96	72.556	ENSMZEG00005008329	-	99	76.426	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015616	-	94	51.145	ENSMZEG00005015498	-	97	49.091	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015616	-	97	72.075	ENSMZEG00005008301	-	100	74.717	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015616	-	96	71.483	ENSNBRG00000022075	-	92	72.180	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	97	72.180	ENSNBRG00000006386	-	100	75.472	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	96	69.962	ENSNBRG00000020806	-	90	71.591	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	97	64.885	ENSNBRG00000006414	-	88	65.769	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	96	50.741	ENSNBRG00000023290	-	89	50.741	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	97	65.428	ENSNBRG00000020744	-	91	65.428	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	94	50.382	ENSNBRG00000024253	-	91	49.814	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	90	70.445	ENSNBRG00000020781	-	99	73.577	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015616	-	95	70.498	ENSONIG00000015371	-	100	72.656	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	96	71.970	ENSONIG00000012319	-	100	74.517	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	96	72.624	ENSONIG00000015167	-	100	75.969	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	90	49.593	ENSONIG00000016843	-	98	52.282	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	92	70.635	ENSONIG00000017465	-	100	71.255	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	91	71.825	ENSONIG00000012317	-	98	74.694	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	66	76.243	ENSONIG00000013227	-	100	77.901	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	96	43.321	ENSONIG00000018790	-	94	44.803	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	96	73.384	ENSONIG00000015247	-	94	76.604	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015616	-	96	45.756	ENSPMGG00000022341	-	80	45.756	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015616	-	94	45.627	ENSPMGG00000002695	-	95	49.004	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015616	-	96	53.257	ENSPMGG00000012906	-	94	53.585	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015616	-	99	41.993	ENSPMGG00000004994	-	97	42.143	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000015616	-	96	45.693	ENSPFOG00000015493	-	93	45.018	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015616	-	96	48.120	ENSPFOG00000003841	-	94	47.292	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015616	-	96	48.881	ENSPFOG00000015382	-	92	49.810	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015616	-	96	44.238	ENSPFOG00000015455	-	95	42.333	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015616	-	97	48.727	ENSPFOG00000003807	-	99	49.296	Poecilia_formosa
ENSACIG00000015616	-	95	47.710	ENSPLAG00000018274	-	91	49.612	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000015616	-	96	48.699	ENSPMEG00000018635	-	92	49.621	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015616	-	95	44.231	ENSPMEG00000018626	-	95	44.776	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000015616	-	97	45.699	ENSPREG00000005137	-	95	46.296	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000015616	-	94	50.763	ENSPNYG00000001584	-	95	47.500	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015616	-	96	70.769	ENSPNYG00000024019	-	88	71.429	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015616	-	97	69.118	ENSPNYG00000005478	-	93	69.118	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000015616	-	97	39.259	ENSPNAG00000009266	-	97	41.573	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000015616	-	94	32.721	ENSPNAG00000006327	-	67	33.935	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000015616	-	94	51.737	ENSSDUG00000002359	-	98	50.575	Seriola_dumerili
ENSACIG00000015616	-	94	52.510	ENSSDUG00000002417	-	98	50.000	Seriola_dumerili
ENSACIG00000015616	-	96	50.763	ENSSLDG00000008952	-	96	49.077	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000015616	-	97	49.814	ENSSLDG00000016397	-	96	52.692	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000015616	-	96	59.245	ENSSPAG00000012915	-	98	60.769	Stegastes_partitus
ENSACIG00000015616	-	97	60.821	ENSSPAG00000012856	-	91	63.178	Stegastes_partitus
ENSACIG00000015616	-	68	48.744	ENSXCOG00000008517	-	61	48.744	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000015616	-	60	48.171	ENSXCOG00000003913	-	87	47.619	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000015616	-	75	46.635	ENSXCOG00000019639	-	88	45.259	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000015616	-	96	49.270	ENSXMAG00000029117	-	94	50.943	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000015616	-	95	47.547	ENSXMAG00000009973	-	95	47.566	Xiphophorus_maculatus
ENSACIG00000015616	-	96	45.489	ENSXMAG00000009971	-	71	44.776	Xiphophorus_maculatus