EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015795 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: srrt
Alias: CHUNP6881|ars2|zgc:92060
Full Name: serrate RNA effector molecule homolog (Arabidopsis)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8612 bases
Position: chrCCOE01000034.1:1010181-1018792
Accession: ZDB-GENE-020419-13
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000020354	ARS2	PF04959.13	7.3e-90	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000020890	-	2427	-	ENSACIP00000020354	808 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000015795	srrt	90	75.974	ENSG00000087087	SRRT	98	83.871	Homo_sapiens
ENSACIG00000015795	srrt	89	96.280	ENSAPOG00000002304	srrt	95	86.135	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	ENSAMEG00000014506	SRRT	76	76.923	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000015795	srrt	86	65.171	ENSAOCG00000009189	-	77	67.391	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015795	srrt	90	96.280	ENSAOCG00000009693	srrt	95	90.116	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000015795	srrt	95	91.276	ENSAPEG00000003646	srrt	95	90.755	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015795	srrt	86	65.171	ENSAPEG00000020016	-	77	67.391	Amphiprion_percula
ENSACIG00000015795	srrt	58	62.729	ENSATEG00000003652	-	85	66.094	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015795	srrt	95	87.548	ENSATEG00000014425	srrt	95	87.802	Anabas_testudineus
ENSACIG00000015795	srrt	90	75.922	ENSACAG00000001014	SRRT	85	76.805	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSANAG00000031718	SRRT	79	75.699	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000015795	srrt	90	97.363	ENSACLG00000013156	srrt	82	97.479	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015795	srrt	83	65.106	ENSACLG00000009423	-	76	65.652	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000015795	srrt	89	81.292	ENSAMXG00000016671	srrt	81	82.851	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.269	ENSBTAG00000001134	SRRT	79	75.269	Bos_taurus
ENSACIG00000015795	srrt	70	41.443	WBGene00017085	E01A2.2	85	42.593	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.484	ENSCJAG00000014917	SRRT	79	75.484	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSCAFG00000023538	SRRT	79	75.699	Canis_familiaris
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.974	ENSCAFG00020013358	SRRT	79	75.974	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000015795	srrt	87	75.758	ENSCHIG00000010495	SRRT	79	75.758	Capra_hircus
ENSACIG00000015795	srrt	84	75.974	ENSTSYG00000036426	SRRT	82	75.974	Carlito_syrichta
ENSACIG00000015795	srrt	88	76.484	ENSCAPG00000013586	SRRT	89	71.519	Cavia_aperea
ENSACIG00000015795	srrt	86	75.107	ENSCPOG00000001739	SRRT	79	75.107	Cavia_porcellus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSCCAG00000015877	SRRT	79	75.699	Cebus_capucinus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.758	ENSCATG00000036306	SRRT	81	73.996	Cercocebus_atys
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.484	ENSCLAG00000007568	SRRT	89	71.949	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSCSAG00000017996	SRRT	79	75.699	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000015795	srrt	55	73.333	ENSCHOG00000007815	SRRT	62	72.794	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000015795	srrt	95	53.766	ENSCPBG00000011553	SRRT	94	54.416	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000015795	srrt	100	41.842	ENSCING00000003506	-	54	51.245	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000015795	srrt	93	50.545	ENSCSAVG00000008394	-	91	47.563	Ciona_savignyi
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.974	ENSCANG00000034556	SRRT	79	75.974	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.914	ENSCGRG00001001594	Srrt	79	75.914	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000015795	srrt	75	79.739	ENSCGRG00000007292	Srrt	89	72.377	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000015795	srrt	57	64.516	ENSCSEG00000005233	-	94	56.101	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015795	srrt	98	80.828	ENSCSEG00000017878	srrt	95	68.986	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000015795	srrt	89	55.917	ENSCVAG00000017344	-	94	56.850	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015795	srrt	92	92.178	ENSCVAG00000019848	srrt	95	85.536	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000015795	srrt	95	85.590	ENSDARG00000017762	srrt	81	86.374	Danio_rerio
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSDNOG00000003851	SRRT	79	75.699	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.922	ENSDORG00000005584	Srrt	89	72.570	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000015795	srrt	100	47.173	FBgn0033062	Ars2	68	53.404	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000015795	srrt	80	73.150	ENSETEG00000016175	SRRT	71	73.150	Echinops_telfairi
ENSACIG00000015795	srrt	76	55.102	ENSEBUG00000008517	-	88	55.449	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSEASG00005016956	SRRT	79	75.699	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSECAG00000012292	SRRT	79	75.699	Equus_caballus
ENSACIG00000015795	srrt	70	76.042	ENSEEUG00000009117	SRRT	65	81.081	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000015795	srrt	89	84.382	ENSELUG00000006651	srrt	82	83.333	Esox_lucius
ENSACIG00000015795	srrt	87	69.083	ENSELUG00000021216	-	83	68.443	Esox_lucius
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.914	ENSFCAG00000006855	SRRT	79	75.914	Felis_catus
ENSACIG00000015795	srrt	85	72.845	ENSFDAG00000021347	SRRT	88	69.316	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000015795	srrt	84	89.157	ENSFHEG00000002756	srrt	94	71.521	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015795	srrt	58	56.612	ENSFHEG00000004105	-	93	56.780	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000015795	srrt	90	81.319	ENSGMOG00000018619	srrt	86	77.014	Gadus_morhua
ENSACIG00000015795	srrt	71	66.216	ENSGMOG00000018694	-	70	65.541	Gadus_morhua
ENSACIG00000015795	srrt	90	91.685	ENSGAFG00000005423	srrt	85	91.176	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015795	srrt	92	55.612	ENSGAFG00000020383	-	94	56.156	Gambusia_affinis
ENSACIG00000015795	srrt	94	90.511	ENSGACG00000020387	srrt	86	90.441	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015795	srrt	84	63.158	ENSGACG00000001100	-	85	64.009	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000015795	srrt	90	75.699	ENSGGOG00000001508	SRRT	79	75.974	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000015795	srrt	90	97.143	ENSHBUG00000002942	srrt	84	97.269	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000015795	srrt	85	74.946	ENSHGLG00000008344	Srrt	89	71.734	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.758	ENSHGLG00100018857	Srrt	89	72.511	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000015795	srrt	95	86.765	ENSHCOG00000005403	srrt	95	81.841	Hippocampus_comes
ENSACIG00000015795	srrt	92	57.143	ENSHCOG00000008904	-	94	56.996	Hippocampus_comes
ENSACIG00000015795	srrt	87	82.135	ENSIPUG00000021150	srrt	82	82.456	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.974	ENSSTOG00000013776	SRRT	79	75.974	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	ENSJJAG00000010446	Srrt	89	73.160	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000015795	srrt	92	91.045	ENSKMAG00000013599	srrt	95	85.063	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015795	srrt	82	64.301	ENSKMAG00000008468	-	94	53.349	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000015795	srrt	55	65.461	ENSLBEG00000028983	-	71	67.719	Labrus_bergylta
ENSACIG00000015795	srrt	98	85.938	ENSLBEG00000016308	srrt	95	85.820	Labrus_bergylta
ENSACIG00000015795	srrt	95	55.879	ENSLACG00000001089	SRRT	95	57.143	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000015795	srrt	69	86.275	ENSLOCG00000013658	srrt	78	86.275	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000015795	srrt	85	73.276	ENSLAFG00000007725	SRRT	95	64.868	Loxodonta_africana
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.974	ENSMFAG00000033745	SRRT	83	74.207	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSMMUG00000021255	SRRT	79	75.699	Macaca_mulatta
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSMNEG00000041864	SRRT	81	74.207	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.974	ENSMLEG00000029479	SRRT	81	74.207	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000015795	srrt	82	66.738	ENSMAMG00000010681	-	82	67.100	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015795	srrt	90	92.123	ENSMAMG00000014311	srrt	84	93.407	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000015795	srrt	90	97.363	ENSMZEG00005016135	srrt	82	97.479	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015795	srrt	83	65.319	ENSMZEG00005028002	-	76	65.870	Maylandia_zebra
ENSACIG00000015795	srrt	56	75.269	ENSMAUG00000011386	Srrt	89	71.915	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.484	ENSMICG00000009471	SRRT	81	73.996	Microcebus_murinus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSMOCG00000001971	Srrt	89	72.903	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000015795	srrt	82	66.242	ENSMMOG00000011137	-	86	66.883	Mola_mola
ENSACIG00000015795	srrt	95	85.786	ENSMMOG00000016399	srrt	95	86.038	Mola_mola
ENSACIG00000015795	srrt	56	71.795	ENSMODG00000004862	SRRT	89	72.436	Monodelphis_domestica
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ENSACIG00000015795	srrt	68	48.736	ENSMALG00000005567	-	100	47.928	Monopterus_albus
ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	MGP_CAROLIEiJ_G0027870	Srrt	99	73.881	Mus_caroli
ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	ENSMUSG00000037364	Srrt	99	73.881	Mus_musculus
ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	MGP_PahariEiJ_G0024456	Srrt	99	73.881	Mus_pahari
ENSACIG00000015795	srrt	85	76.923	MGP_SPRETEiJ_G0028875	Srrt	99	73.881	Mus_spretus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSMPUG00000015839	SRRT	79	75.699	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000015795	srrt	89	75.484	ENSMLUG00000009975	SRRT	79	75.484	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000015795	srrt	86	75.699	ENSNGAG00000023715	Srrt	81	76.033	Nannospalax_galili
ENSACIG00000015795	srrt	94	95.824	ENSNBRG00000019100	srrt	87	96.008	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000015795	srrt	83	71.875	ENSNLEG00000011987	SRRT	82	70.833	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000015795	srrt	86	62.069	ENSMEUG00000011941	SRRT	77	62.284	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000015795	srrt	66	71.970	ENSOPRG00000002502	-	67	72.727	Ochotona_princeps
ENSACIG00000015795	srrt	56	76.703	ENSODEG00000016856	SRRT	89	72.727	Octodon_degus
ENSACIG00000015795	srrt	82	67.164	ENSONIG00000016080	-	76	66.882	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015795	srrt	90	97.802	ENSONIG00000004242	srrt	85	97.899	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000015795	srrt	95	91.966	ENSORLG00000008120	srrt	85	91.387	Oryzias_latipes
ENSACIG00000015795	srrt	94	91.702	ENSORLG00020003058	srrt	85	91.176	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000015795	srrt	95	91.755	ENSORLG00015008062	srrt	85	91.176	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000015795	srrt	98	87.326	ENSOMEG00000003155	srrt	95	86.849	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000015795	srrt	92	58.794	ENSOMEG00000006963	-	94	58.706	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.699	ENSOGAG00000017242	SRRT	79	75.699	Otolemur_garnettii
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ENSACIG00000015795	srrt	85	76.190	ENSPPRG00000009557	SRRT	79	75.758	Panthera_pardus
ENSACIG00000015795	srrt	85	75.914	ENSPTIG00000014355	SRRT	79	75.914	Panthera_tigris_altaica
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