EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000015835 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13919 bases
Position: chrCCOE01000587.1:493504-507422
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000020398	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-31	2	5
ENSACIP00000020398	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-31	3	5
ENSACIP00000020398	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-31	4	5
ENSACIP00000020398	zf-C2H2	PF00096.26	2.6e-31	5	5
ENSACIP00000020374	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-13	1	2
ENSACIP00000020374	zf-C2H2	PF00096.26	4.5e-13	2	2
ENSACIP00000020398	zf-met	PF12874.7	2.5e-10	1	1
ENSACIP00000020374	zf-met	PF12874.7	4.7e-05	1	1

Transcripts

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSACIG00000015835	-	67	44.444	ENSACIG00000002190	gfi1b	58	49.138
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ENSACIG00000015835	-	97	50.943	ENSACIG00000022645	-	98	46.269
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ENSACIG00000015835	-	72	51.020	ENSACIG00000016944	-	75	50.769
ENSACIG00000015835	-	79	51.111	ENSACIG00000013470	-	63	51.111
ENSACIG00000015835	-	93	53.061	ENSACIG00000004041	-	97	53.061
ENSACIG00000015835	-	73	53.535	ENSACIG00000000406	prdm5	75	41.304
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ENSACIG00000015835	-	75	36.364	ENSACIG00000018641	snai2	52	40.708
ENSACIG00000015835	-	70	52.830	ENSACIG00000012084	-	97	47.475
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ENSACIG00000015835	-	70	54.444	ENSACIG00000022293	-	91	54.444
ENSACIG00000015835	-	68	48.889	ENSACIG00000017892	-	74	45.000
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ENSACIG00000015835	-	76	36.765	ENSACIG00000006826	-	77	36.765
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ENSACIG00000015835	-	95	47.475	ENSACIG00000003515	-	85	47.475
ENSACIG00000015835	-	70	52.041	ENSACIG00000019815	-	85	52.041
ENSACIG00000015835	-	82	42.529	ENSACIG00000012636	ZNF319	87	36.923
ENSACIG00000015835	-	97	53.125	ENSACIG00000009717	-	85	53.125
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Orthologs

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ENSACIG00000015835	-	66	52.439	ENSAPOG00000013212	-	99	52.439	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	67	54.688	ENSAPOG00000007955	-	71	48.529	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	82	51.685	ENSAPOG00000002691	-	91	37.562	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	84	50.000	ENSAPOG00000008053	-	71	39.634	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	84	45.963	ENSAPOG00000000503	-	79	45.963	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	99	51.948	ENSAPOG00000018127	-	85	44.068	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	99	70.000	ENSAPOG00000001742	-	76	70.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	81	48.000	ENSAPOG00000014714	-	97	38.855	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	73	48.276	ENSAPOG00000020343	-	91	44.651	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	71	54.321	ENSAPOG00000022086	-	99	50.515	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	84	43.439	ENSAPOG00000007528	-	68	43.439	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	99	37.037	ENSAPOG00000022234	-	99	46.486	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	84	52.222	ENSAPOG00000007983	-	72	46.114	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	99	50.459	ENSAPOG00000005986	-	99	46.948	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	70	48.718	ENSAPOG00000024038	-	90	48.718	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	67	51.685	ENSAPOG00000015096	-	99	51.685	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	76	51.111	ENSAPOG00000021690	-	97	51.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	88	48.718	ENSAPOG00000023479	-	84	42.484	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000015835	-	64	53.247	ENSAPOG00000013065	-	94	53.247	Acanthochromis_polyacanthus
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