EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016003 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: cnot1
Alias: cdc39-like|im:7141761|kiaa1007l|wu:fc58h04|zgc:152902
Full Name: CCR4-NOT transcription complex%2C subunit 1
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15978 bases
Position: chrCCOE01001624.1:301914-317891
Accession: ZDB-GENE-040915-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000020713	Not1	PF04054.15	3.1e-153	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000021252	-	6405	-	ENSACIP00000020713	2134 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.565	ENSG00000125107	CNOT1	100	90.433	Homo_sapiens
ENSACIG00000016003	cnot1	97	98.036	ENSAPOG00000005042	cnot1	90	98.036	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.518	ENSAMEG00000017298	CNOT1	90	90.238	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000016003	cnot1	100	95.792	ENSAPEG00000022342	cnot1	90	95.792	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016003	cnot1	97	98.177	ENSATEG00000012892	cnot1	90	98.177	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.297	ENSAPLG00000007162	CNOT1	90	89.390	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000016003	cnot1	90	88.745	ENSACAG00000001602	CNOT1	88	88.519	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000016003	cnot1	100	87.158	ENSANAG00000038198	CNOT1	90	86.880	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000016003	cnot1	97	98.177	ENSACLG00000014234	cnot1	90	98.177	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.925	ENSAMXG00000013170	cnot1	90	93.972	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016003	cnot1	94	97.521	ENSBTAG00000020782	CNOT1	89	97.521	Bos_taurus
ENSACIG00000016003	cnot1	86	41.065	WBGene00002845	let-711	92	54.008	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.214	ENSCJAG00000011318	CNOT1	100	90.182	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.819	ENSCAFG00000008426	CNOT1	90	89.540	Canis_familiaris
ENSACIG00000016003	cnot1	97	92.105	ENSCAFG00020010156	CNOT1	89	94.239	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSCHIG00000010452	CNOT1	90	89.981	Capra_hircus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSTSYG00000006888	CNOT1	90	89.981	Carlito_syrichta
ENSACIG00000016003	cnot1	100	86.234	ENSCPOG00000013026	CNOT1	90	85.908	Cavia_porcellus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	88.490	ENSCCAG00000026333	CNOT1	90	88.211	Cebus_capucinus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSCATG00000032625	CNOT1	90	89.981	Cercocebus_atys
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSCLAG00000006289	CNOT1	90	89.935	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSCSAG00000004731	CNOT1	90	89.981	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000016003	cnot1	78	97.727	ENSCHOG00000009712	CNOT1	72	97.527	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000016003	cnot1	94	97.727	ENSCPBG00000026222	CNOT1	90	97.727	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000016003	cnot1	100	59.418	ENSCING00000009149	-	90	59.051	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000016003	cnot1	99	62.261	ENSCSAVG00000002414	-	95	79.470	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016003	cnot1	100	88.211	ENSCANG00000040534	CNOT1	90	87.933	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.842	ENSCGRG00001016365	Cnot1	90	89.702	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.842	ENSCGRG00000001714	Cnot1	90	89.702	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000016003	cnot1	97	97.335	ENSCVAG00000018930	cnot1	90	97.335	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	92.505	ENSDARG00000004174	cnot1	90	92.644	Danio_rerio
ENSACIG00000016003	cnot1	100	87.797	ENSDNOG00000013250	CNOT1	90	87.611	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000016003	cnot1	99	47.692	FBgn0085436	Not1	99	47.281	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000016003	cnot1	82	92.922	ENSETEG00000012806	CNOT1	74	92.922	Echinops_telfairi
ENSACIG00000016003	cnot1	79	74.256	ENSEBUG00000011534	cnot1	83	74.256	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000016003	cnot1	94	97.521	ENSEASG00005005819	CNOT1	89	97.521	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000016003	cnot1	97	95.231	ENSECAG00000009889	CNOT1	100	89.935	Equus_caballus
ENSACIG00000016003	cnot1	88	88.528	ENSEEUG00000006015	CNOT1	80	88.249	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.578	ENSELUG00000014085	cnot1	90	93.578	Esox_lucius
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSFCAG00000025155	CNOT1	92	89.981	Felis_catus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.842	ENSFALG00000007285	CNOT1	90	89.609	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.214	ENSFDAG00000013399	CNOT1	90	89.888	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000016003	cnot1	100	94.501	ENSFHEG00000020574	cnot1	90	94.129	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000016003	cnot1	89	94.274	ENSGMOG00000012864	cnot1	89	94.118	Gadus_morhua
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.655	ENSGALG00000002301	CNOT1	90	89.422	Gallus_gallus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	92.810	ENSGAFG00000015005	cnot1	90	92.717	Gambusia_affinis
ENSACIG00000016003	cnot1	90	95.682	ENSGACG00000002606	cnot1	100	97.573	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSGAGG00000022646	CNOT1	90	91.105	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.308	ENSGGOG00000009547	CNOT1	90	90.028	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000016003	cnot1	97	98.177	ENSHBUG00000001729	cnot1	90	98.177	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.121	ENSHGLG00000014322	CNOT1	90	89.795	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.652	ENSHCOG00000006501	cnot1	90	93.820	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016003	cnot1	100	91.841	ENSIPUG00000011915	cnot1	90	91.841	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.168	ENSSTOG00000005490	CNOT1	90	89.888	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.655	ENSJJAG00000000633	Cnot1	90	89.329	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	95.482	ENSKMAG00000006149	cnot1	90	95.482	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000016003	cnot1	94	100.000	ENSLBEG00000004740	cnot1	89	100.000	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.820	ENSLACG00000010869	CNOT1	90	90.401	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.669	ENSLOCG00000006324	cnot1	90	93.762	Lepisosteus_oculatus
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ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.911	ENSMGAG00000001908	CNOT1	90	89.678	Meleagris_gallopavo
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ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.121	ENSNGAG00000018628	Cnot1	90	89.795	Nannospalax_galili
ENSACIG00000016003	cnot1	93	98.177	ENSNBRG00000019358	cnot1	90	98.177	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.350	ENSNLEG00000003566	CNOT1	90	90.117	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000016003	cnot1	88	91.765	ENSMEUG00000006145	CNOT1	80	91.765	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000016003	cnot1	90	97.778	ENSOPRG00000005604	CNOT1	81	97.778	Ochotona_princeps
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.168	ENSODEG00000016337	CNOT1	90	89.842	Octodon_degus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	96.322	ENSONIG00000007358	cnot1	90	96.322	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000016003	cnot1	99	89.962	ENSOANG00000012109	CNOT1	100	89.869	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSOCUG00000006911	CNOT1	90	89.981	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000016003	cnot1	100	95.105	ENSORLG00000013734	cnot1	90	94.732	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.181	ENSORLG00020017012	cnot1	90	92.807	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.041	ENSORLG00015007091	cnot1	90	92.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000016003	cnot1	99	93.221	ENSOMEG00000015124	cnot1	90	93.128	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.214	ENSOGAG00000000543	CNOT1	90	90.028	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.261	ENSOARG00000001567	CNOT1	90	89.981	Ovis_aries
ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.308	ENSPPAG00000022013	CNOT1	90	90.028	Pan_paniscus
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ENSACIG00000016003	cnot1	100	90.014	ENSPTRG00000008183	CNOT1	90	89.735	Pan_troglodytes
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ENSACIG00000016003	cnot1	100	93.336	ENSPKIG00000023538	CNOT1	90	93.476	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000016003	cnot1	97	93.258	ENSPKIG00000002914	CNOT1	90	93.128	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000016003	cnot1	100	89.981	ENSPSIG00000005499	CNOT1	90	89.795	Pelodiscus_sinensis
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