EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016078 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: polrmt
Alias: si:dkey-21e2.1|si:dkeyp-74c5.5|wu:fb73g10
Full Name: polymerase (RNA) mitochondrial (DNA directed)
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 55259 bases
Position: chrCCOE01000692.1:2031255-2086513
Accession: ZDB-GENE-030131-1528
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000020735	RNA_pol	PF00940.19	1.2e-163	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000021275	-	3420	-	ENSACIP00000020735	1139 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016078	polrmt	98	47.520	ENSG00000099821	POLRMT	66	73.810	Homo_sapiens
ENSACIG00000016078	polrmt	100	78.981	ENSAPOG00000003942	polrmt	93	78.416	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	48.700	ENSAMEG00000002745	POLRMT	92	48.524	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000016078	polrmt	98	83.520	ENSAOCG00000020208	polrmt	90	83.520	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016078	polrmt	98	82.597	ENSAPEG00000007949	polrmt	93	78.820	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016078	polrmt	100	79.863	ENSATEG00000024025	polrmt	93	79.863	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016078	polrmt	88	58.439	ENSAPLG00000003051	POLRMT	99	58.658	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000016078	polrmt	100	47.279	ENSANAG00000032916	POLRMT	94	47.279	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000016078	polrmt	100	85.323	ENSACLG00000003766	polrmt	95	84.194	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016078	polrmt	100	63.441	ENSAMXG00000018258	polrmt	93	63.441	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	49.957	ENSBTAG00000015051	POLRMT	92	50.043	Bos_taurus
ENSACIG00000016078	polrmt	51	42.903	WBGene00013680	rpom-1	54	42.016	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000016078	polrmt	100	46.329	ENSCJAG00000012913	POLRMT	94	46.329	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	49.013	ENSCAFG00000019711	POLRMT	94	49.058	Canis_familiaris
ENSACIG00000016078	polrmt	99	49.013	ENSCAFG00020016843	POLRMT	96	49.058	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000016078	polrmt	99	50.524	ENSCHIG00000013267	POLRMT	92	50.611	Capra_hircus
ENSACIG00000016078	polrmt	85	56.899	ENSCAPG00000016900	POLRMT	88	56.899	Cavia_aperea
ENSACIG00000016078	polrmt	88	48.771	ENSCPOG00000023061	POLRMT	94	44.454	Cavia_porcellus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	47.154	ENSCCAG00000025014	POLRMT	94	47.154	Cebus_capucinus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	46.593	ENSCATG00000040393	POLRMT	93	46.593	Cercocebus_atys
ENSACIG00000016078	polrmt	88	50.049	ENSCLAG00000007473	POLRMT	73	49.431	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000016078	polrmt	88	49.373	ENSCSAG00000012942	POLRMT	83	49.373	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000016078	polrmt	98	60.743	ENSCPBG00000009869	POLRMT	98	60.831	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000016078	polrmt	69	44.293	ENSCSAVG00000000440	-	99	44.293	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016078	polrmt	99	46.853	ENSCANG00000038011	POLRMT	91	46.853	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000016078	polrmt	98	61.111	ENSCGRG00001021311	Polrmt	95	61.111	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000016078	polrmt	100	48.376	ENSCGRG00000011134	Polrmt	95	48.376	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000016078	polrmt	100	63.561	ENSCSEG00000002734	polrmt	93	63.561	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000016078	polrmt	97	82.923	ENSCVAG00000005949	polrmt	93	82.923	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	63.758	ENSDARG00000101220	polrmt	93	63.758	Danio_rerio
ENSACIG00000016078	polrmt	93	64.736	ENSDORG00000014125	Polrmt	91	64.736	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000016078	polrmt	93	42.157	FBgn0261938	mtRNApol	80	42.157	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000016078	polrmt	98	46.684	ENSETEG00000003476	POLRMT	91	46.771	Echinops_telfairi
ENSACIG00000016078	polrmt	80	52.043	ENSEBUG00000013453	-	99	52.043	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000016078	polrmt	99	49.267	ENSEASG00005021493	POLRMT	92	49.265	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	49.215	ENSECAG00000032711	POLRMT	92	49.215	Equus_caballus
ENSACIG00000016078	polrmt	92	74.011	ENSELUG00000019319	polrmt	93	66.056	Esox_lucius
ENSACIG00000016078	polrmt	99	49.651	ENSFCAG00000018808	POLRMT	92	49.651	Felis_catus
ENSACIG00000016078	polrmt	77	59.444	ENSFALG00000013910	POLRMT	87	58.378	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000016078	polrmt	100	44.163	ENSFDAG00000020312	POLRMT	94	44.127	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000016078	polrmt	99	77.383	ENSFHEG00000021239	polrmt	97	80.736	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	68.864	ENSGMOG00000011829	polrmt	99	67.481	Gadus_morhua
ENSACIG00000016078	polrmt	93	58.457	ENSGALG00000001377	POLRMT	92	56.446	Gallus_gallus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	77.904	ENSGAFG00000003953	polrmt	93	77.742	Gambusia_affinis
ENSACIG00000016078	polrmt	100	75.462	ENSGACG00000012957	polrmt	99	75.546	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016078	polrmt	98	61.846	ENSGAGG00000005522	POLRMT	95	61.846	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000016078	polrmt	84	69.255	ENSGGOG00000023264	-	90	69.255	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000016078	polrmt	100	85.081	ENSHBUG00000010005	polrmt	93	83.952	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016078	polrmt	87	50.099	ENSHGLG00000019286	POLRMT	84	47.195	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000016078	polrmt	87	49.358	ENSHGLG00100005762	POLRMT	91	46.283	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000016078	polrmt	100	74.893	ENSHCOG00000001565	polrmt	95	74.720	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016078	polrmt	100	66.667	ENSIPUG00000000789	polrmt	99	66.694	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016078	polrmt	91	65.077	ENSSTOG00000003431	POLRMT	89	65.188	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000016078	polrmt	96	59.524	ENSJJAG00000012916	Polrmt	95	59.524	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	75.610	ENSKMAG00000004426	polrmt	93	75.610	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	77.368	ENSLBEG00000016529	polrmt	93	76.812	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016078	polrmt	98	64.154	ENSLACG00000011518	POLRMT	92	64.154	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000016078	polrmt	99	60.663	ENSLOCG00000005222	polrmt	89	60.663	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000016078	polrmt	98	48.373	ENSLAFG00000001860	POLRMT	92	48.729	Loxodonta_africana
ENSACIG00000016078	polrmt	98	47.304	ENSMFAG00000031466	POLRMT	91	47.304	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000016078	polrmt	99	46.404	ENSMNEG00000039129	POLRMT	95	46.187	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000016078	polrmt	86	66.384	ENSMLEG00000037404	POLRMT	92	66.384	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	80.526	ENSMAMG00000019284	polrmt	93	80.690	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	85.323	ENSMZEG00005009932	polrmt	95	84.194	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016078	polrmt	88	60.352	ENSMGAG00000003243	POLRMT	97	56.038	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000016078	polrmt	97	62.381	ENSMAUG00000019392	Polrmt	95	62.540	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	47.797	ENSMICG00000016701	POLRMT	94	47.391	Microcebus_murinus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	46.633	ENSMOCG00000008868	Polrmt	95	46.627	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000016078	polrmt	96	76.236	ENSMMOG00000000705	polrmt	93	76.236	Mola_mola
ENSACIG00000016078	polrmt	98	52.136	ENSMODG00000006478	POLRMT	90	52.269	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000016078	polrmt	99	76.225	ENSMALG00000021224	polrmt	93	76.389	Monopterus_albus
ENSACIG00000016078	polrmt	97	62.540	MGP_CAROLIEiJ_G0015538	Polrmt	100	61.432	Mus_caroli
ENSACIG00000016078	polrmt	95	62.381	ENSMUSG00000020329	Polrmt	99	61.201	Mus_musculus
ENSACIG00000016078	polrmt	95	62.857	MGP_PahariEiJ_G0030951	Polrmt	100	61.201	Mus_pahari
ENSACIG00000016078	polrmt	95	62.381	MGP_SPRETEiJ_G0016356	Polrmt	100	61.201	Mus_spretus
ENSACIG00000016078	polrmt	91	50.231	ENSMPUG00000009910	POLRMT	87	50.231	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000016078	polrmt	99	49.215	ENSMLUG00000009223	POLRMT	92	49.215	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000016078	polrmt	84	63.016	ENSNGAG00000005498	Polrmt	92	63.175	Nannospalax_galili
ENSACIG00000016078	polrmt	98	86.451	ENSNBRG00000023530	polrmt	92	85.128	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016078	polrmt	98	47.815	ENSNLEG00000000718	POLRMT	91	47.815	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000016078	polrmt	70	56.110	ENSOPRG00000013579	POLRMT	67	56.767	Ochotona_princeps
ENSACIG00000016078	polrmt	100	86.840	ENSONIG00000002405	polrmt	99	86.667	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	77.017	ENSORLG00000004329	polrmt	91	77.017	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016078	polrmt	99	77.099	ENSORLG00020003896	polrmt	93	78.577	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000016078	polrmt	99	76.642	ENSORLG00015022238	polrmt	91	76.642	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000016078	polrmt	99	74.344	ENSOMEG00000008292	polrmt	93	74.344	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000016078	polrmt	99	48.674	ENSOGAG00000007912	POLRMT	92	48.674	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000016078	polrmt	98	42.969	ENSOARG00000008898	POLRMT	92	43.142	Ovis_aries
ENSACIG00000016078	polrmt	99	45.283	ENSPPAG00000043321	-	93	45.283	Pan_paniscus
ENSACIG00000016078	polrmt	98	47.266	ENSPPAG00000030853	POLRMT	90	47.266	Pan_paniscus
ENSACIG00000016078	polrmt	82	61.071	ENSPPRG00000001547	POLRMT	85	60.313	Panthera_pardus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	45.579	ENSPTRG00000039638	-	93	45.579	Pan_troglodytes
ENSACIG00000016078	polrmt	98	47.799	ENSPTRG00000010157	POLRMT	87	47.799	Pan_troglodytes
ENSACIG00000016078	polrmt	99	46.371	ENSPANG00000006649	POLRMT	93	46.371	Papio_anubis
ENSACIG00000016078	polrmt	100	62.812	ENSPKIG00000024580	polrmt	93	62.812	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000016078	polrmt	98	76.805	ENSPMGG00000014627	polrmt	99	76.520	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000016078	polrmt	96	61.429	ENSPEMG00000011671	Polrmt	93	61.429	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000016078	polrmt	76	56.946	ENSPMAG00000005070	-	99	56.946	Petromyzon_marinus
ENSACIG00000016078	polrmt	98	54.181	ENSPCIG00000006103	POLRMT	92	54.181	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	78.307	ENSPFOG00000003911	polrmt	99	80.021	Poecilia_formosa
ENSACIG00000016078	polrmt	93	77.376	ENSPLAG00000005743	polrmt	95	77.187	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000016078	polrmt	74	74.078	ENSPMEG00000011484	polrmt	93	74.078	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000016078	polrmt	100	81.191	ENSPMEG00000008947	polrmt	97	81.191	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000016078	polrmt	100	77.516	ENSPREG00000007650	polrmt	93	77.845	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000016078	polrmt	91	61.803	ENSPPYG00000009282	POLRMT	90	61.803	Pongo_abelii
ENSACIG00000016078	polrmt	92	60.656	ENSPCAG00000010816	POLRMT	86	60.656	Procavia_capensis
ENSACIG00000016078	polrmt	99	46.221	ENSPCOG00000014539	POLRMT	92	46.469	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000016078	polrmt	99	48.384	ENSPVAG00000008403	POLRMT	92	48.472	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000016078	polrmt	100	85.161	ENSPNYG00000020790	polrmt	93	84.032	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000016078	polrmt	98	67.273	ENSPNAG00000019790	polrmt	92	67.532	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000016078	polrmt	99	48.872	ENSRNOG00000024879	Polrmt	93	48.872	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000016078	polrmt	99	46.735	ENSRBIG00000006728	POLRMT	91	46.735	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000016078	polrmt	99	45.998	ENSRROG00000040809	POLRMT	93	45.998	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000016078	polrmt	67	38.734	YFL036W	-	57	38.734	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000016078	polrmt	88	51.317	ENSSBOG00000025388	POLRMT	82	51.317	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSACIG00000016078	polrmt	100	63.406	ENSSFOG00015005074	polrmt	96	63.053	Scleropages_formosus
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ENSACIG00000016078	polrmt	100	81.049	ENSXMAG00000012464	polrmt	94	81.049	Xiphophorus_maculatus