EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016133 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1594 bases
Position: chrCCOE01001530.1:100677-102270
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000020765	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-26	1	4
ENSACIP00000020765	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-26	2	4
ENSACIP00000020765	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-26	3	4
ENSACIP00000020765	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-26	4	4
ENSACIP00000020765	zf-met	PF12874.7	1.3e-11	1	2
ENSACIP00000020765	zf-met	PF12874.7	1.3e-11	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000021306	-	915	-	ENSACIP00000020765	304 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016133	-	73	39.884	ENSACIG00000019791	-	91	41.718
ENSACIG00000016133	-	75	32.164	ENSACIG00000004096	PRDM15	53	32.164
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ENSACIG00000016133	-	80	41.045	ENSACIG00000022645	-	65	41.045
ENSACIG00000016133	-	64	43.871	ENSACIG00000019447	-	64	43.871
ENSACIG00000016133	-	79	43.787	ENSACIG00000022738	-	93	43.357
ENSACIG00000016133	-	56	39.815	ENSACIG00000009780	-	87	39.815
ENSACIG00000016133	-	54	41.975	ENSACIG00000023794	-	65	41.975
ENSACIG00000016133	-	53	40.367	ENSACIG00000011318	snai1a	71	32.620
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ENSACIG00000016133	-	55	43.506	ENSACIG00000022658	-	90	42.857
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ENSACIG00000016133	-	55	40.972	ENSACIG00000000406	prdm5	75	40.972
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ENSACIG00000016133	-	74	38.060	ENSACIG00000012636	ZNF319	88	38.060
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ENSACIG00000016133	-	69	41.414	ENSACIG00000023049	znf646	100	35.928
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ENSACIG00000016133	-	64	41.667	ENSACIG00000004745	-	96	41.667
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ENSACIG00000016133	-	70	37.500	ENSACIG00000009717	-	90	37.500
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ENSACIG00000016133	-	60	39.752	ENSACIG00000018440	-	99	39.752
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ENSACIG00000016133	-	85	39.884	ENSACIG00000015429	-	96	42.384
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ENSACIG00000016133	-	56	39.521	ENSACIG00000011541	-	71	39.521
ENSACIG00000016133	-	59	34.375	ENSACIG00000020938	zbtb47b	75	34.375
ENSACIG00000016133	-	74	34.167	ENSACIG00000002944	-	79	34.167
ENSACIG00000016133	-	82	34.483	ENSACIG00000023513	znf384l	51	36.649
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ENSACIG00000016133	-	93	38.365	ENSACIG00000004666	-	99	42.857
ENSACIG00000016133	-	63	39.552	ENSACIG00000010637	-	53	39.552
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ENSACIG00000016133	-	69	38.889	ENSACIG00000012263	znf319b	95	39.855
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ENSACIG00000016133	-	67	42.857	ENSACIG00000003515	-	98	42.857
ENSACIG00000016133	-	58	40.541	ENSACIG00000009128	-	85	40.541
ENSACIG00000016133	-	67	42.373	ENSACIG00000014123	znf236	60	42.373
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ENSACIG00000016133	-	53	38.931	ENSACIG00000007882	-	73	38.931
ENSACIG00000016133	-	53	40.000	ENSACIG00000007855	-	93	40.000
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ENSACIG00000016133	-	67	37.107	ENSACIG00000013149	-	78	38.686
ENSACIG00000016133	-	55	44.828	ENSACIG00000015411	-	82	44.828
ENSACIG00000016133	-	69	41.279	ENSACIG00000013604	-	97	39.759
ENSACIG00000016133	-	62	36.364	ENSACIG00000021986	-	97	36.585
ENSACIG00000016133	-	56	37.725	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	91	37.195
ENSACIG00000016133	-	61	36.310	ENSACIG00000018404	-	82	48.529
ENSACIG00000016133	-	67	39.130	ENSACIG00000017644	-	90	39.130
ENSACIG00000016133	-	55	33.333	ENSACIG00000012604	scrt2	50	33.333
ENSACIG00000016133	-	53	35.172	ENSACIG00000008886	znf1164	80	35.172
ENSACIG00000016133	-	52	39.130	ENSACIG00000013946	-	80	33.987
ENSACIG00000016133	-	63	39.252	ENSACIG00000023162	-	61	39.252
ENSACIG00000016133	-	61	41.317	ENSACIG00000004041	-	90	42.236
ENSACIG00000016133	-	72	37.168	ENSACIG00000018952	-	59	37.168
ENSACIG00000016133	-	75	46.457	ENSACIG00000006172	-	94	41.880
ENSACIG00000016133	-	64	42.222	ENSACIG00000017050	-	96	47.059
ENSACIG00000016133	-	62	35.366	ENSACIG00000018641	snai2	63	35.366
ENSACIG00000016133	-	58	36.628	ENSACIG00000020982	znf710b	50	36.628

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016133	-	59	36.313	ENSAPOG00000021496	-	53	36.313	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016133	-	59	36.872	ENSAPEG00000010478	-	54	36.872	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016133	-	57	41.667	ENSAPEG00000011635	-	59	40.196	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016133	-	69	37.654	ENSATEG00000011235	-	68	37.654	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016133	-	56	30.374	ENSATEG00000015828	-	70	30.275	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016133	-	73	43.925	ENSATEG00000011202	-	64	43.925	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016133	-	57	37.572	ENSATEG00000024551	-	56	37.572	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016133	-	75	40.000	ENSAMXG00000035090	-	56	40.000	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016133	-	55	42.963	ENSCVAG00000003630	-	59	42.963	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016133	-	89	39.286	ENSCVAG00000004508	-	85	39.286	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016133	-	55	32.000	ENSHBUG00000000731	-	58	32.000	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016133	-	55	40.385	ENSHBUG00000002878	-	53	40.385	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016133	-	53	40.506	ENSHCOG00000008205	-	66	40.506	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016133	-	64	31.532	ENSIPUG00000009577	-	51	31.532	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016133	-	54	35.172	ENSKMAG00000000520	-	52	36.283	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000016133	-	61	37.500	ENSLBEG00000014676	-	55	37.500	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016133	-	54	36.747	ENSLBEG00000026552	-	50	41.441	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016133	-	57	38.217	ENSMAMG00000022152	-	52	38.217	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000016133	-	55	32.000	ENSMZEG00005004047	-	58	32.000	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016133	-	56	42.222	ENSMALG00000014761	-	62	42.222	Monopterus_albus
ENSACIG00000016133	-	56	43.103	ENSNBRG00000004381	-	88	43.103	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016133	-	55	40.000	ENSNBRG00000024051	-	51	40.000	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016133	-	85	38.393	ENSORLG00000025719	-	76	38.393	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016133	-	65	38.021	ENSORLG00020009554	-	83	38.021	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000016133	-	85	38.393	ENSORLG00015012599	-	77	38.393	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000016133	-	53	41.284	ENSOMEG00000010906	-	52	41.284	Oryzias_melastigma
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ENSACIG00000016133	-	59	36.872	ENSSPAG00000010524	-	51	36.872	Stegastes_partitus
ENSACIG00000016133	-	58	40.994	ENSXETG00000002690	-	66	40.994	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000016133	-	57	37.654	ENSXCOG00000018315	-	87	37.654	Xiphophorus_couchianus