EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016182 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5533 bases
Position: chrCCOE01001020.1:31160-36692
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSACIP00000020959	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-65	7	11
ENSACIP00000020959	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-65	8	11
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ENSACIP00000020959	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-65	10	11
ENSACIP00000020959	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-65	11	11
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ENSACIP00000021001	zf-C2H2	PF00096.26	5.6e-39	3	7
ENSACIP00000021001	zf-C2H2	PF00096.26	5.6e-39	4	7
ENSACIP00000021001	zf-C2H2	PF00096.26	5.6e-39	5	7
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ENSACIP00000020959	zf-met	PF12874.7	5.4e-30	5	6
ENSACIP00000020959	zf-met	PF12874.7	5.4e-30	6	6
ENSACIP00000020893	zf-met	PF12874.7	1e-28	1	6
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ENSACIP00000020893	zf-met	PF12874.7	1e-28	5	6
ENSACIP00000020893	zf-met	PF12874.7	1e-28	6	6
ENSACIP00000020933	zf-met	PF12874.7	5.7e-28	1	5
ENSACIP00000020933	zf-met	PF12874.7	5.7e-28	2	5
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ENSACIP00000020933	zf-met	PF12874.7	5.7e-28	4	5
ENSACIP00000020933	zf-met	PF12874.7	5.7e-28	5	5
ENSACIP00000021001	zf-met	PF12874.7	3e-15	1	4
ENSACIP00000021001	zf-met	PF12874.7	3e-15	2	4
ENSACIP00000021001	zf-met	PF12874.7	3e-15	3	4
ENSACIP00000021001	zf-met	PF12874.7	3e-15	4	4

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSACIT00000021436	-	1071	-	ENSACIP00000020893	356 (aa)	-	-
ENSACIT00000021479	-	1212	-	ENSACIP00000020933	403 (aa)	-	-
ENSACIT00000021505	-	1341	-	ENSACIP00000020959	446 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016182	-	82	40.952	ENSACIG00000009443	-	61	38.835
ENSACIG00000016182	-	95	55.085	ENSACIG00000018059	-	84	55.085
ENSACIG00000016182	-	89	31.461	ENSACIG00000002944	-	93	30.488
ENSACIG00000016182	-	98	52.326	ENSACIG00000003720	-	97	52.326
ENSACIG00000016182	-	94	50.459	ENSACIG00000006806	-	81	50.459
ENSACIG00000016182	-	81	41.830	ENSACIG00000000406	prdm5	87	41.053
ENSACIG00000016182	-	98	49.643	ENSACIG00000011541	-	94	49.643
ENSACIG00000016182	-	81	50.000	ENSACIG00000022330	-	98	44.344
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ENSACIG00000016182	-	81	37.799	ENSACIG00000001767	zbtb41	64	37.102
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ENSACIG00000016182	-	94	47.222	ENSACIG00000022738	-	98	49.718
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ENSACIG00000016182	-	78	40.698	ENSACIG00000013613	scrt1b	55	37.821
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ENSACIG00000016182	-	81	38.235	ENSACIG00000016180	znf341	51	40.351
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ENSACIG00000016182	-	86	47.273	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	92	49.265
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ENSACIG00000016182	-	99	50.442	ENSACIG00000013604	-	98	54.229
ENSACIG00000016182	-	90	55.405	ENSACIG00000019447	-	84	55.405
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