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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016370 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: apobec2a
Alias: apo2a|zgc:110762
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme%2C catalytic polypeptide-like 2a
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6724 bases
Position: chrCCOE01001534.1:466-7189
Accession: ZDB-GENE-050306-15
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021082	APOBEC_N	PF08210.11	8.8e-47	1	1
ENSACIP00000021082	APOBEC_C	PF05240.14	7.4e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000021630	-	774	-	ENSACIP00000021082	257 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016370	apobec2a	65	33.721	ENSACIG00000012301	aicda	88	33.721
ENSACIG00000016370	apobec2a	67	58.960	ENSACIG00000002472	APOBEC2	72	58.960

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSG00000124701	APOBEC2	85	55.729	Homo_sapiens
ENSACIG00000016370	apobec2a	75	53.646	ENSAPOG00000019390	apobec2b	71	53.646	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016370	apobec2a	68	56.354	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	71	56.354	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000016370	apobec2a	83	75.926	ENSAOCG00000003291	apobec2a	77	83.598	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016370	apobec2a	75	54.167	ENSAOCG00000023355	apobec2b	78	50.476	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016370	apobec2a	83	75.463	ENSAPEG00000003630	apobec2a	77	83.069	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016370	apobec2a	75	54.167	ENSAPEG00000004591	apobec2b	78	50.476	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016370	apobec2a	83	51.643	ENSATEG00000023043	APOBEC2	71	55.208	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016370	apobec2a	70	83.333	ENSATEG00000000956	apobec2a	99	84.181	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016370	apobec2a	70	53.005	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	81	53.005	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000016370	apobec2a	68	56.180	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	56.180	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSANAG00000026993	APOBEC2	85	55.729	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000016370	apobec2a	68	81.609	ENSACLG00000026736	-	97	81.609	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016370	apobec2a	67	58.960	ENSACLG00000007634	APOBEC2	64	58.960	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	58.201	ENSAMXG00000015966	apobec2b	67	58.201	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016370	apobec2a	68	63.687	ENSAMXG00000042992	apobec2a	70	65.922	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.688	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	61	54.688	Bos_taurus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	85	55.729	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	53.646	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	85	53.646	Canis_familiaris
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	53.646	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	85	53.646	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	85	54.167	Capra_hircus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	84	55.729	Carlito_syrichta
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	84	54.167	Cavia_aperea
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	84	54.167	Cavia_porcellus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	85	55.729	Cebus_capucinus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSCATG00000010691	APOBEC2	85	55.729	Cercocebus_atys
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	84	54.167	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	85	55.729	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000016370	apobec2a	68	57.459	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	100	57.459	Choloepus_hoffmanni
ENSACIG00000016370	apobec2a	63	56.364	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	83	55.495	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.208	ENSCANG00000035072	APOBEC2	85	55.208	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.250	ENSCGRG00001014983	Apobec2	85	56.250	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.250	ENSCGRG00000007835	Apobec2	85	56.250	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000016370	apobec2a	93	67.227	ENSCSEG00000020201	apobec2a	87	67.227	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.301	ENSCSEG00000000690	-	72	53.125	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	55.897	ENSCVAG00000012342	apobec2b	71	56.250	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	68	70.286	ENSDARG00000018881	apobec2a	65	70.286	Danio_rerio
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	60.317	ENSDARG00000113992	apobec2b	69	60.317	Danio_rerio
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSDORG00000006447	Apobec2	83	55.729	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	ENSETEG00000000624	APOBEC2	83	54.167	Echinops_telfairi
ENSACIG00000016370	apobec2a	61	56.875	ENSEASG00005002937	APOBEC2	83	56.875	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.208	ENSECAG00000006576	APOBEC2	85	55.208	Equus_caballus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	52.880	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	85	52.880	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	67.568	ENSELUG00000003736	apobec2a	65	67.568	Esox_lucius
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	52.604	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	85	52.604	Felis_catus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	42.021	ENSFALG00000003910	APOBEC2	82	42.246	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.450	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	85	54.450	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.872	ENSFHEG00000005492	apobec2b	81	55.208	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000016370	apobec2a	75	50.256	ENSGMOG00000006819	apobec2b	78	50.777	Gadus_morhua
ENSACIG00000016370	apobec2a	68	77.714	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	77.714	Gadus_morhua
ENSACIG00000016370	apobec2a	70	52.717	ENSGALG00000003226	APOBEC2	83	52.717	Gallus_gallus
ENSACIG00000016370	apobec2a	93	47.500	ENSGAFG00000007634	apobec2b	71	47.917	Gambusia_affinis
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	79.570	ENSGACG00000011671	apobec2a	99	79.570	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	53.846	ENSGACG00000009663	apobec2b	100	48.908	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	63	56.970	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	82	56.044	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	83	55.729	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.872	ENSHBUG00000005993	apobec2b	88	48.361	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	84.324	ENSHBUG00000015890	apobec2a	75	84.324	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.688	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	84	54.688	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.688	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	84	54.688	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000016370	apobec2a	74	78.307	ENSHCOG00000020319	apobec2a	77	78.307	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016370	apobec2a	91	48.927	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	88	48.927	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	61.170	ENSIPUG00000013784	Apobec2	70	61.170	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	73	63.158	ENSIPUG00000017355	apobec2a	54	63.158	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.688	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	85	54.688	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	ENSJJAG00000009733	Apobec2	85	54.167	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000016370	apobec2a	75	54.359	ENSKMAG00000020631	apobec2b	72	54.688	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000016370	apobec2a	74	81.481	ENSLBEG00000025214	apobec2a	78	81.481	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016370	apobec2a	83	49.765	ENSLBEG00000009422	-	75	50.237	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016370	apobec2a	73	56.684	ENSLACG00000015985	APOBEC2	81	56.684	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	60.215	ENSLOCG00000012415	apobec2b	67	60.215	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	85	55.729	Loxodonta_africana
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	85	55.729	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	85	55.729	Macaca_mulatta
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	85	55.729	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	85	55.729	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.359	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	88	47.500	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	74	79.894	ENSMAMG00000023685	apobec2a	74	79.894	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	83.243	ENSMZEG00005005240	-	90	85.632	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.359	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	71	54.688	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016370	apobec2a	70	52.717	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	94	53.631	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.250	ENSMAUG00000011016	Apobec2	85	56.250	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.688	ENSMICG00000043339	APOBEC2	85	54.688	Microcebus_murinus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.021	ENSMOCG00000001904	Apobec2	85	56.021	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000016370	apobec2a	67	57.803	ENSMMOG00000008681	apobec2b	65	57.803	Mola_mola
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	52.632	ENSMODG00000013090	APOBEC2	86	52.632	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000016370	apobec2a	75	52.604	ENSMALG00000013779	APOBEC2	75	52.604	Monopterus_albus
ENSACIG00000016370	apobec2a	92	65.401	ENSMALG00000020523	apobec2a	96	65.401	Monopterus_albus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.250	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	85	56.250	Mus_caroli
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.250	ENSMUSG00000040694	Apobec2	85	56.250	Mus_musculus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	56.250	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	85	56.250	Mus_pahari
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	53.125	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	82	53.125	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.167	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	83	54.167	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSNGAG00000013717	Apobec2	85	55.729	Nannospalax_galili
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	53.333	ENSNBRG00000018806	apobec2b	79	46.721	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	84.865	ENSNBRG00000021776	apobec2a	75	84.865	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.729	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	85	55.729	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	53.684	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	86	53.684	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	55.208	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	84	55.208	Ochotona_princeps
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.688	ENSODEG00000016183	APOBEC2	83	54.688	Octodon_degus
ENSACIG00000016370	apobec2a	75	82.902	ENSONIG00000004644	-	75	85.946	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.359	ENSONIG00000012289	apobec2b	71	54.688	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000016370	apobec2a	65	55.882	ENSOANG00000000824	APOBEC2	95	55.882	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	54.688	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	84	54.688	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	75.806	ENSORLG00000010752	apobec2a	78	75.806	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016370	apobec2a	76	55.897	ENSORLG00000022372	APOBEC2	71	56.771	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016370	apobec2a	72	76.344	ENSORLG00020004153	apobec2a	78	76.344	Oryzias_latipes_hni
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ENSACIG00000016370	apobec2a	76	56.410	ENSORLG00015022089	-	71	57.292	Oryzias_latipes_hsok
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ENSACIG00000016370	apobec2a	76	54.359	ENSXCOG00000007398	apobec2b	73	55.914	Xiphophorus_couchianus
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