EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016635 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7763 bases
Position: chrCCOE01000595.1:7322-15084
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021431	MMR_HSR1	PF01926.23	2.7e-10	1	1
ENSACIP00000021467	MMR_HSR1	PF01926.23	7.4e-10	1	1
ENSACIP00000021451	MMR_HSR1	PF01926.23	8.4e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022005	-	834	-	ENSACIP00000021451	277 (aa)	-	-
ENSACIT00000021984	-	795	-	ENSACIP00000021431	264 (aa)	-	-
ENSACIT00000022021	-	843	-	ENSACIP00000021467	280 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016635	-	81	51.852	ENSACIG00000022362	-	77	51.852
ENSACIG00000016635	-	84	53.540	ENSACIG00000022366	-	81	53.540
ENSACIG00000016635	-	77	45.813	ENSACIG00000014703	-	83	46.078
ENSACIG00000016635	-	75	60.309	ENSACIG00000007158	-	66	57.732
ENSACIG00000016635	-	91	69.531	ENSACIG00000019149	-	78	69.531
ENSACIG00000016635	-	92	52.490	ENSACIG00000016313	-	81	52.490
ENSACIG00000016635	-	67	35.955	ENSACIG00000007737	-	69	36.216
ENSACIG00000016635	-	77	49.261	ENSACIG00000019524	-	85	49.029
ENSACIG00000016635	-	90	39.695	ENSACIG00000012714	-	86	39.695
ENSACIG00000016635	-	96	46.097	ENSACIG00000012718	-	89	57.277
ENSACIG00000016635	-	50	49.624	ENSACIG00000001465	-	82	49.624
ENSACIG00000016635	-	94	67.557	ENSACIG00000002950	-	70	67.557
ENSACIG00000016635	-	95	61.798	ENSACIG00000005780	-	83	59.636
ENSACIG00000016635	-	67	50.000	ENSACIG00000008666	-	85	50.000
ENSACIG00000016635	-	70	49.189	ENSACIG00000015088	-	75	48.677
ENSACIG00000016635	-	80	52.607	ENSACIG00000008045	-	75	53.731
ENSACIG00000016635	-	80	50.000	ENSACIG00000004245	-	74	50.000
ENSACIG00000016635	-	86	47.479	ENSACIG00000012159	-	66	45.736
ENSACIG00000016635	-	78	45.894	ENSACIG00000014655	-	78	44.976
ENSACIG00000016635	-	84	48.198	ENSACIG00000003582	-	72	48.230
ENSACIG00000016635	-	64	51.163	ENSACIG00000000631	-	59	51.163
ENSACIG00000016635	-	77	47.368	ENSACIG00000001596	-	85	46.330
ENSACIG00000016635	-	71	33.508	ENSACIG00000003050	-	83	33.508
ENSACIG00000016635	-	99	80.743	ENSACIG00000012648	-	99	80.743
ENSACIG00000016635	-	80	42.857	ENSACIG00000014680	-	91	42.925
ENSACIG00000016635	-	89	65.217	ENSACIG00000006484	-	77	65.217
ENSACIG00000016635	-	72	34.896	ENSACIG00000019509	-	88	34.896
ENSACIG00000016635	-	75	31.222	ENSACIG00000009149	-	73	31.507
ENSACIG00000016635	-	80	50.000	ENSACIG00000007494	-	72	48.879
ENSACIG00000016635	-	83	54.128	ENSACIG00000022370	-	83	51.883
ENSACIG00000016635	-	65	71.512	ENSACIG00000022374	-	88	71.512
ENSACIG00000016635	-	81	53.953	ENSACIG00000022377	-	77	53.991
ENSACIG00000016635	-	71	36.598	ENSACIG00000009811	-	78	36.598
ENSACIG00000016635	-	83	48.918	ENSACIG00000001070	-	81	48.918
ENSACIG00000016635	-	85	53.571	ENSACIG00000002263	-	82	53.648
ENSACIG00000016635	-	71	40.722	ENSACIG00000007725	-	69	40.722
ENSACIG00000016635	-	88	42.857	ENSACIG00000014634	zgc:113625	93	42.735
ENSACIG00000016635	-	81	53.271	ENSACIG00000023381	-	85	52.294
ENSACIG00000016635	-	78	56.522	ENSACIG00000012707	-	78	56.522
ENSACIG00000016635	-	92	54.297	ENSACIG00000007191	-	71	54.297
ENSACIG00000016635	-	79	45.455	ENSACIG00000020234	-	72	45.455
ENSACIG00000016635	-	75	46.231	ENSACIG00000014745	-	89	46.231
ENSACIG00000016635	-	83	40.789	ENSACIG00000005587	-	78	40.789
ENSACIG00000016635	-	80	45.498	ENSACIG00000014662	-	85	45.498
ENSACIG00000016635	-	80	40.724	ENSACIG00000012061	-	65	40.724
ENSACIG00000016635	-	92	90.698	ENSACIG00000022355	-	94	85.870
ENSACIG00000016635	-	89	44.958	ENSACIG00000020244	-	99	44.958
ENSACIG00000016635	-	80	47.619	ENSACIG00000006503	-	65	47.619
ENSACIG00000016635	-	76	33.010	ENSACIG00000003906	-	67	33.010
ENSACIG00000016635	-	87	49.593	ENSACIG00000008001	-	91	49.593
ENSACIG00000016635	-	77	44.554	ENSACIG00000014716	-	81	44.554
ENSACIG00000016635	-	87	43.590	ENSACIG00000014690	-	92	43.154
ENSACIG00000016635	-	63	71.856	ENSACIG00000012761	-	93	71.856
ENSACIG00000016635	-	98	51.648	ENSACIG00000022222	-	85	51.648
ENSACIG00000016635	-	81	52.113	ENSACIG00000001455	-	77	52.133
ENSACIG00000016635	-	79	72.249	ENSACIG00000006478	-	78	72.249
ENSACIG00000016635	-	80	52.133	ENSACIG00000007466	-	65	51.628
ENSACIG00000016635	-	81	47.442	ENSACIG00000004040	-	83	47.442
ENSACIG00000016635	-	61	47.531	ENSACIG00000000976	-	83	46.154
ENSACIG00000016635	-	70	73.370	ENSACIG00000005223	-	71	72.581
ENSACIG00000016635	-	73	58.763	ENSACIG00000007178	-	69	58.291
ENSACIG00000016635	-	83	44.635	ENSACIG00000014646	zgc:113625	91	44.635
ENSACIG00000016635	-	86	46.835	ENSACIG00000016888	-	75	46.835
ENSACIG00000016635	-	66	70.286	ENSACIG00000012204	-	75	70.286
ENSACIG00000016635	-	76	49.505	ENSACIG00000020225	-	85	42.688
ENSACIG00000016635	-	85	42.478	ENSACIG00000016502	-	99	41.026
ENSACIG00000016635	-	85	39.207	ENSACIG00000005573	-	92	39.207
ENSACIG00000016635	-	63	35.955	ENSACIG00000014730	zgc:172131	85	36.517
ENSACIG00000016635	-	68	37.766	ENSACIG00000014737	-	85	37.766
ENSACIG00000016635	-	70	41.579	ENSACIG00000014670	-	71	41.579
ENSACIG00000016635	-	89	41.463	ENSACIG00000000893	-	81	47.549

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016635	-	75	71.859	ENSAPOG00000018915	-	85	71.859	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	75	33.498	ENSAPOG00000008819	-	87	34.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	84	47.085	ENSAPOG00000020108	-	71	46.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	77	67.980	ENSAPOG00000007123	-	74	69.154	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	91	68.750	ENSAPOG00000002337	-	74	68.750	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	79	43.750	ENSAPOG00000007181	-	53	40.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	86	44.351	ENSAPOG00000021365	-	74	44.351	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	81	47.945	ENSAPOG00000000066	-	71	43.798	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	81	39.252	ENSAPOG00000008529	-	82	39.252	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	91	34.783	ENSAPOG00000002517	-	84	34.783	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	84	36.576	ENSAPOG00000009288	-	95	36.576	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	79	69.378	ENSAPOG00000001075	-	97	69.194	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	80	37.054	ENSAPOG00000002527	-	74	36.481	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	90	51.793	ENSAPOG00000010738	-	77	51.793	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	63	69.643	ENSAPOG00000007631	-	78	69.643	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	85	58.427	ENSAPOG00000022321	-	87	58.427	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	73	69.110	ENSAPOG00000009059	-	91	70.520	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016635	-	88	41.935	ENSAOCG00000015984	-	77	41.935	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016635	-	61	50.617	ENSAOCG00000007815	-	59	50.617	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016635	-	85	36.820	ENSAOCG00000016082	-	55	36.364	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016635	-	84	42.128	ENSAOCG00000013326	-	89	40.541	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016635	-	71	41.206	ENSAOCG00000016099	-	88	40.686	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016635	-	73	67.188	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	76	67.188	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016635	-	75	36.082	ENSAPEG00000008662	-	52	36.082	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	74	41.538	ENSAPEG00000013532	-	98	41.538	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	75	35.437	ENSAPEG00000002163	-	70	35.437	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	87	57.377	ENSAPEG00000021653	si:dkey-73p2.1	93	57.438	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	85	44.053	ENSAPEG00000019003	-	93	42.975	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	80	41.232	ENSAPEG00000013508	-	88	41.232	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	71	41.206	ENSAPEG00000002121	-	88	40.686	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	61	51.235	ENSAPEG00000013378	-	58	51.235	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	91	43.651	ENSAPEG00000003513	-	79	57.018	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016635	-	76	40.191	ENSATEG00000010966	-	88	40.191	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	82	71.759	ENSATEG00000011918	-	83	69.076	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	91	41.339	ENSATEG00000019504	-	86	38.376	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	89	70.400	ENSATEG00000011814	-	80	70.400	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	92	53.552	ENSATEG00000011594	-	87	54.435	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	77	71.429	ENSATEG00000011720	-	74	71.429	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	84	40.000	ENSATEG00000010901	-	61	40.249	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	78	70.732	ENSATEG00000011931	-	84	69.458	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	51	71.852	ENSATEG00000011891	-	84	71.852	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	71	45.455	ENSATEG00000009383	-	73	40.756	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	88	42.672	ENSATEG00000017209	-	87	41.810	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	75	37.681	ENSATEG00000010978	-	78	37.681	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	79	71.770	ENSATEG00000011820	-	75	71.770	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	91	53.516	ENSATEG00000011789	-	87	51.568	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	64	70.833	ENSATEG00000012017	-	87	70.909	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	91	70.079	ENSATEG00000011953	-	71	70.079	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	82	40.889	ENSATEG00000010991	-	86	40.611	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	93	35.094	ENSATEG00000011021	-	70	35.094	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	71	37.755	ENSATEG00000020398	-	56	37.755	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	90	56.917	ENSATEG00000011341	-	50	56.917	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	77	67.488	ENSATEG00000011712	-	80	65.865	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	63	71.257	ENSATEG00000011978	-	84	71.257	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016635	-	75	73.604	ENSATEG00000011979	-	92	73.604	Anabas_testudineus
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