EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016719 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: SKI2 homolog%2C superkiller viralicidic activity 2-like
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25039 bases
Position: chrCCOE01001488.1:124161-149199
Accession: ZDB-GENE-010430-5
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021613	rRNA_proc-arch	PF13234.6	4.3e-31	1	1
ENSACIP00000021613	DEAD	PF00270.29	2.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022176	-	3642	-	ENSACIP00000021613	1213 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSACIG00000016719's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSACIG00000016719's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016719	skiv2l	77	35.447	ENSACIG00000015117	mtrex	93	35.031

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.355	ENSG00000204351	SKIV2L	99	59.888	Homo_sapiens
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.240	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	88.240	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.952	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.128	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.808	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	88.889	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.646	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	88.727	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	88.862	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	88.943	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	62.047	ENSACAG00000011746	SKIV2L	99	62.470	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.516	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	60.096	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	92.214	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	92.376	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	80.810	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	80.968	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.629	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	59.856	Bos_taurus
ENSACIG00000016719	skiv2l	93	41.734	WBGene00008502	skih-2	96	42.058	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.596	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.208	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.790	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	59.856	Canis_familiaris
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.790	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	59.856	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.113	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	60.288	Capra_hircus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.790	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	59.648	Carlito_syrichta
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.081	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	60.145	Cavia_porcellus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.596	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	60.128	Cebus_capucinus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.274	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	59.968	Cercocebus_atys
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.113	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	60.128	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.596	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	60.128	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000016719	skiv2l	89	57.112	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	98	56.816	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000016719	skiv2l	93	50.731	ENSCING00000005576	-	99	50.560	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.435	ENSCANG00000039709	SKIV2L	99	60.128	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.064	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	59.888	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	84.372	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	84.372	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.178	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	88.178	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	82.272	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	82.031	Danio_rerio
ENSACIG00000016719	skiv2l	93	63.613	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	99	56.532	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000016719	skiv2l	94	45.047	FBgn0039117	tst	97	45.178	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000016719	skiv2l	68	80.556	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	80.556	Echinops_telfairi
ENSACIG00000016719	skiv2l	91	54.091	ENSEBUG00000013680	-	98	53.591	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000016719	skiv2l	93	60.754	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	61.301	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000016719	skiv2l	94	59.830	ENSECAG00000021823	SKIV2L	94	60.270	Equus_caballus
ENSACIG00000016719	skiv2l	50	68.775	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	68.775	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	83.199	ENSELUG00000000181	skiv2l	99	82.714	Esox_lucius
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.064	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	60.320	Felis_catus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.003	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.054	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.016	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	88.016	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	79.383	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	79.058	Gadus_morhua
ENSACIG00000016719	skiv2l	77	55.683	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	55.533	Gallus_gallus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.502	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	88.583	Gambusia_affinis
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	86.360	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	86.360	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.596	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	60.128	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	92.133	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	92.295	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.032	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	59.792	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	58.427	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	58.193	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	79.657	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	79.984	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	80.407	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	80.422	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	60.176	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.064	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	57	63.605	ENSLACG00000002986	-	59	63.605	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.871	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	59.648	Loxodonta_africana
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.435	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	60.128	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.435	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	60.128	Macaca_mulatta
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.516	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.208	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.274	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	59.968	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	88.412	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	88.493	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	92.214	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	92.376	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016719	skiv2l	69	46.827	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	45.824	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.855	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	59.522	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.952	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	59.968	Microcebus_murinus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	58.999	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.828	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	83.374	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	83.374	Mola_mola
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	60.016	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.657	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	82.927	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	82.846	Monopterus_albus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.533	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	60.225	Mus_caroli
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.210	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	60.225	Mus_musculus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.533	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	60.545	Mus_pahari
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.048	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	60.064	Mus_spretus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.629	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	60.176	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.807	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	59.488	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.681	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	88.762	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.000	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	59.614	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000016719	skiv2l	78	61.947	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	77	61.947	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.566	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.776	Ochotona_princeps
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.984	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	60.000	Octodon_degus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	93.025	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	93.025	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.193	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	60.368	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	86.738	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	86.738	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	86.386	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	86.386	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	86.386	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	86.386	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	85.818	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	85.818	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.145	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	60.048	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	56.659	ENSOARG00000002411	-	99	56.706	Ovis_aries
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.096	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	59.634	Pan_paniscus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.193	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	60.337	Panthera_pardus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.790	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	59.936	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.516	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	60.048	Pan_troglodytes
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.342	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	59.044	Papio_anubis
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	77.189	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	76.948	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	83.916	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	83.916	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.645	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	59.711	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	59.792	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	60.192	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.611	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	87.692	Poecilia_formosa
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.449	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	86.964	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.854	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	87.935	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	79.806	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	82.563	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.274	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.808	Pongo_abelii
ENSACIG00000016719	skiv2l	77	62.500	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	62.500	Procavia_capensis
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.274	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	60.208	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.435	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	60.208	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	84.215	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	91.443	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	82.143	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	81.958	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.452	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	60.144	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.408	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	59.109	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.516	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	60.208	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000016719	skiv2l	89	46.172	YLR398C	-	84	45.626	Saccharomyces_cerevisiae
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.677	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.208	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	59.696	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.295	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	80.258	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	80.016	Scleropages_formosus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.368	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	87.368	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	88.655	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	88.655	Seriola_dumerili
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	82.210	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	82.210	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	59.703	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	59.546	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	95	89.050	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	89.136	Stegastes_partitus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	59.856	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.128	Sus_scrofa
ENSACIG00000016719	skiv2l	71	87.166	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	68.762	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	83.603	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	83.603	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000016719	skiv2l	93	61.104	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	93	61.104	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	56.210	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.250	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	60.113	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.288	Ursus_americanus
ENSACIG00000016719	skiv2l	93	61.011	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	61.387	Ursus_maritimus
ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.790	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	60.096	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	57.920	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.600	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.105	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	87.105	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000016719	skiv2l	100	87.935	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	87.773	Xiphophorus_maculatus