EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016888 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7185 bases
Position: chrCCOE01001539.1:1572-8756
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021748	MMR_HSR1	PF01926.23	1.9e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022318	-	918	-	ENSACIP00000021748	305 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016888	-	75	45.690	ENSACIG00000007191	-	65	45.690
ENSACIG00000016888	-	75	57.377	ENSACIG00000007466	-	89	57.377
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ENSACIG00000016888	-	52	47.799	ENSACIG00000000976	-	79	47.799
ENSACIG00000016888	-	67	48.058	ENSACIG00000012718	-	86	48.058
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ENSACIG00000016888	-	69	40.952	ENSACIG00000014716	-	85	40.952
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ENSACIG00000016888	-	73	35.897	ENSACIG00000005587	-	81	35.897
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ENSACIG00000016888	-	70	37.220	ENSACIG00000012159	-	57	37.220
ENSACIG00000016888	-	62	45.789	ENSACIG00000015088	-	75	45.789
ENSACIG00000016888	-	63	53.125	ENSACIG00000001596	-	76	53.125
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ENSACIG00000016888	-	78	56.118	ENSACIG00000002263	-	85	56.596
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ENSACIG00000016888	-	64	33.810	ENSACIG00000003906	-	66	33.810
ENSACIG00000016888	-	66	44.118	ENSACIG00000014680	-	88	44.118
ENSACIG00000016888	-	52	48.750	ENSACIG00000012761	-	70	48.750
ENSACIG00000016888	-	59	50.543	ENSACIG00000005223	-	70	50.543
ENSACIG00000016888	-	65	48.756	ENSACIG00000012707	-	76	48.756
ENSACIG00000016888	-	65	44.500	ENSACIG00000014703	-	83	44.500
ENSACIG00000016888	-	57	57.143	ENSACIG00000008666	-	85	57.143
ENSACIG00000016888	-	79	54.167	ENSACIG00000003582	-	79	53.689
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ENSACIG00000016888	-	77	42.083	ENSACIG00000014662	-	98	42.083
ENSACIG00000016888	-	75	47.679	ENSACIG00000022355	-	81	47.679
ENSACIG00000016888	-	67	46.078	ENSACIG00000020234	-	72	46.078
ENSACIG00000016888	-	63	48.969	ENSACIG00000007158	-	64	48.421
ENSACIG00000016888	-	58	34.270	ENSACIG00000019509	-	82	34.270
ENSACIG00000016888	-	67	45.192	ENSACIG00000014655	-	77	45.192
ENSACIG00000016888	-	88	49.077	ENSACIG00000004245	-	96	49.077
ENSACIG00000016888	-	76	46.154	ENSACIG00000022222	-	74	46.154
ENSACIG00000016888	-	74	45.852	ENSACIG00000005780	-	69	45.852
ENSACIG00000016888	-	71	45.205	ENSACIG00000006478	-	81	45.205
ENSACIG00000016888	-	64	33.166	ENSACIG00000009811	-	82	33.166
ENSACIG00000016888	-	66	49.000	ENSACIG00000000893	-	80	49.000
ENSACIG00000016888	-	78	56.540	ENSACIG00000001455	-	87	56.540
ENSACIG00000016888	-	76	53.680	ENSACIG00000022377	-	84	53.680
ENSACIG00000016888	-	55	46.154	ENSACIG00000022374	-	87	46.154
ENSACIG00000016888	-	72	55.909	ENSACIG00000022370	-	83	55.794
ENSACIG00000016888	-	61	47.872	ENSACIG00000007178	-	65	47.872
ENSACIG00000016888	-	57	38.462	ENSACIG00000014737	-	84	38.462
ENSACIG00000016888	-	57	36.000	ENSACIG00000003050	-	77	36.000
ENSACIG00000016888	-	69	47.143	ENSACIG00000019524	-	88	47.143
ENSACIG00000016888	-	66	31.250	ENSACIG00000007725	-	74	31.250
ENSACIG00000016888	-	75	44.726	ENSACIG00000019149	-	72	44.726
ENSACIG00000016888	-	74	51.754	ENSACIG00000008001	-	91	54.717
ENSACIG00000016888	-	60	37.968	ENSACIG00000014670	-	72	37.968
ENSACIG00000016888	-	74	42.544	ENSACIG00000006484	-	69	42.544
ENSACIG00000016888	-	66	45.320	ENSACIG00000020225	-	99	37.370
ENSACIG00000016888	-	66	44.118	ENSACIG00000016502	-	87	44.118
ENSACIG00000016888	-	66	41.791	ENSACIG00000014745	-	91	41.791
ENSACIG00000016888	-	71	36.681	ENSACIG00000005573	-	90	36.681

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016888	-	75	41.772	ENSAPOG00000014243	-	97	41.772	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	72	45.333	ENSAPOG00000001315	-	69	45.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	66	47.525	ENSAPOG00000007322	-	69	47.525	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	69	48.804	ENSAPOG00000006169	-	62	47.577	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	78	53.782	ENSAPOG00000012716	-	80	53.782	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	68	49.038	ENSAPOG00000006488	-	86	47.788	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	67	45.894	ENSAPOG00000008344	zgc:113625	73	45.894	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	76	55.365	ENSAPOG00000021159	-	76	55.365	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	65	47.264	ENSAPOG00000007333	-	64	45.175	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	78	55.144	ENSAPOG00000008063	-	78	55.144	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	64	48.223	ENSAPOG00000022240	-	57	48.223	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	70	44.340	ENSAPOG00000020897	-	81	43.925	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	75	45.217	ENSAPOG00000014759	-	75	45.217	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	71	43.578	ENSAPOG00000001268	-	54	43.578	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	63	49.485	ENSAPOG00000001262	-	93	49.485	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	67	48.039	ENSAPOG00000011509	-	74	46.847	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016888	-	66	42.365	ENSAOCG00000012651	-	85	42.439	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	69	48.325	ENSAOCG00000008522	-	69	48.325	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	70	48.585	ENSAOCG00000023255	-	75	48.585	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	64	50.769	ENSAOCG00000001993	-	81	48.815	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	66	45.588	ENSAOCG00000011167	-	67	46.040	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	74	48.018	ENSAOCG00000008525	-	65	48.018	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	69	51.429	ENSAOCG00000014702	-	69	51.429	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	66	45.098	ENSAOCG00000011794	-	61	45.098	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	70	46.698	ENSAOCG00000023240	-	78	46.698	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	74	46.460	ENSAOCG00000021905	-	67	46.460	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	65	47.264	ENSAOCG00000011155	-	64	45.175	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016888	-	76	54.310	ENSAPEG00000022374	-	80	54.310	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016888	-	69	47.368	ENSAPEG00000004217	-	71	47.368	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016888	-	68	53.810	ENSAPEG00000022386	-	79	53.810	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016888	-	76	51.724	ENSAPEG00000022382	-	78	51.724	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016888	-	65	47.761	ENSAPEG00000012184	-	64	45.614	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000016888	-	66	45.588	ENSAPEG00000012179	-	69	46.040	Amphiprion_percula
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ENSACIG00000016888	-	66	45.098	ENSAPEG00000000770	-	61	45.098	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016888	-	76	43.265	ENSAPEG00000005551	-	50	43.265	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016888	-	74	52.212	ENSAPEG00000003884	-	73	52.212	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016888	-	69	42.453	ENSATEG00000005844	-	62	42.453	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	69	47.418	ENSATEG00000017202	-	62	45.643	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	63	53.125	ENSATEG00000016536	-	58	53.125	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	77	54.202	ENSATEG00000014028	-	73	57.317	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	85	50.752	ENSATEG00000014085	-	90	50.752	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	75	47.414	ENSATEG00000019003	-	88	47.414	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	76	46.320	ENSATEG00000014013	si:ch211-113e8.5	85	46.320	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	69	46.445	ENSATEG00000020431	zgc:113625	82	46.445	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	66	47.525	ENSATEG00000017198	-	68	47.525	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	66	46.078	ENSATEG00000017193	-	64	44.737	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	77	55.556	ENSATEG00000013008	-	81	55.556	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	66	44.828	ENSATEG00000020391	-	83	44.828	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016888	-	66	47.030	ENSACLG00000023600	-	84	47.030	Astatotilapia_calliptera
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ENSACIG00000016888	-	75	55.702	ENSACLG00000001936	-	82	55.702	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016888	-	63	60.209	ENSACLG00000003401	-	79	60.209	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016888	-	72	45.455	ENSACLG00000023525	-	74	45.455	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016888	-	66	45.050	ENSACLG00000011572	-	84	45.050	Astatotilapia_calliptera
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