EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016932 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5887 bases
Position: chrCCOE01001230.1:433698-439584
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021781	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-18	1	4
ENSACIP00000021781	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-18	2	4
ENSACIP00000021781	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-18	3	4
ENSACIP00000021781	zf-C2H2	PF00096.26	4.4e-18	4	4
ENSACIP00000021781	zf-met	PF12874.7	1.3e-08	1	2
ENSACIP00000021781	zf-met	PF12874.7	1.3e-08	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022353	-	981	-	ENSACIP00000021781	326 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016932	-	73	63.793	ENSACIG00000019102	-	54	63.793
ENSACIG00000016932	-	62	39.873	ENSACIG00000009180	znf652	55	39.873
ENSACIG00000016932	-	71	43.066	ENSACIG00000009717	-	91	43.066
ENSACIG00000016932	-	50	56.522	ENSACIG00000018440	-	98	56.522
ENSACIG00000016932	-	50	43.284	ENSACIG00000003515	-	88	43.284
ENSACIG00000016932	-	63	56.522	ENSACIG00000019791	-	95	59.843
ENSACIG00000016932	-	74	60.432	ENSACIG00000003556	-	83	60.432
ENSACIG00000016932	-	73	64.315	ENSACIG00000010966	-	66	64.315
ENSACIG00000016932	-	75	47.788	ENSACIG00000011541	-	94	47.788
ENSACIG00000016932	-	70	41.584	ENSACIG00000003720	-	97	41.584
ENSACIG00000016932	-	82	52.874	ENSACIG00000007464	-	90	52.874
ENSACIG00000016932	-	74	59.441	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	95	59.441
ENSACIG00000016932	-	73	54.357	ENSACIG00000017013	-	77	54.357
ENSACIG00000016932	-	91	48.092	ENSACIG00000007000	-	87	48.092
ENSACIG00000016932	-	97	32.615	ENSACIG00000004641	-	97	32.615
ENSACIG00000016932	-	73	47.131	ENSACIG00000023162	-	79	47.131
ENSACIG00000016932	-	67	54.745	ENSACIG00000004745	-	96	54.745
ENSACIG00000016932	-	75	47.083	ENSACIG00000022625	-	99	51.111
ENSACIG00000016932	-	52	47.170	ENSACIG00000013149	-	82	47.170
ENSACIG00000016932	-	67	56.221	ENSACIG00000000311	-	80	56.221
ENSACIG00000016932	-	67	60.000	ENSACIG00000018059	-	74	60.000
ENSACIG00000016932	-	67	53.394	ENSACIG00000018952	-	80	53.394
ENSACIG00000016932	-	67	41.176	ENSACIG00000013613	scrt1b	74	41.176
ENSACIG00000016932	-	63	52.991	ENSACIG00000006755	-	90	52.991
ENSACIG00000016932	-	62	48.201	ENSACIG00000023794	-	63	48.201
ENSACIG00000016932	-	95	45.690	ENSACIG00000022645	-	95	48.485
ENSACIG00000016932	-	74	57.851	ENSACIG00000018022	-	75	57.851
ENSACIG00000016932	-	88	61.224	ENSACIG00000004666	-	98	63.043
ENSACIG00000016932	-	75	60.769	ENSACIG00000004041	-	95	60.769
ENSACIG00000016932	-	80	54.128	ENSACIG00000006172	-	97	56.061
ENSACIG00000016932	-	97	30.769	ENSACIG00000008611	-	94	30.769
ENSACIG00000016932	-	77	48.592	ENSACIG00000006806	-	80	48.592
ENSACIG00000016932	-	75	50.336	ENSACIG00000019710	-	89	51.064
ENSACIG00000016932	-	74	51.079	ENSACIG00000011515	-	95	51.079
ENSACIG00000016932	-	65	63.084	ENSACIG00000016944	-	75	63.084
ENSACIG00000016932	-	61	51.799	ENSACIG00000010637	-	68	51.799
ENSACIG00000016932	-	93	45.238	ENSACIG00000015835	-	99	42.767
ENSACIG00000016932	-	67	38.222	ENSACIG00000007096	-	97	38.222
ENSACIG00000016932	-	66	42.149	ENSACIG00000015411	-	81	42.149
ENSACIG00000016932	-	69	41.026	ENSACIG00000023049	znf646	99	41.026
ENSACIG00000016932	-	73	54.128	ENSACIG00000011153	-	94	54.128
ENSACIG00000016932	-	62	47.368	ENSACIG00000009780	-	91	47.368
ENSACIG00000016932	-	73	54.074	ENSACIG00000013604	-	97	57.865
ENSACIG00000016932	-	52	52.778	ENSACIG00000019804	-	66	52.778
ENSACIG00000016932	-	93	54.496	ENSACIG00000017647	-	100	63.525
ENSACIG00000016932	-	80	66.484	ENSACIG00000017050	-	97	66.484
ENSACIG00000016932	-	75	50.833	ENSACIG00000024444	-	82	50.833
ENSACIG00000016932	-	72	38.235	ENSACIG00000006826	-	84	38.235
ENSACIG00000016932	-	75	50.360	ENSACIG00000010647	-	99	50.360
ENSACIG00000016932	-	74	46.104	ENSACIG00000013470	-	92	46.104
ENSACIG00000016932	-	75	59.756	ENSACIG00000008448	-	96	59.756
ENSACIG00000016932	-	75	59.322	ENSACIG00000016182	-	98	57.971
ENSACIG00000016932	-	54	50.000	ENSACIG00000014123	znf236	53	50.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016932	-	60	54.348	ENSG00000267041	ZNF850	89	54.348	Homo_sapiens
ENSACIG00000016932	-	76	59.375	ENSAPOG00000004628	-	99	57.971	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016932	-	63	46.617	ENSAPOG00000008386	-	88	46.617	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016932	-	80	56.296	ENSAPOG00000003666	-	98	57.252	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016932	-	50	53.285	ENSAMEG00000007611	-	100	53.285	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000016932	-	75	50.459	ENSAOCG00000022079	-	92	50.459	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016932	-	80	54.676	ENSAOCG00000022675	-	94	57.823	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016932	-	95	49.123	ENSAPEG00000004189	-	95	49.123	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016932	-	72	58.716	ENSAPEG00000012926	-	90	58.716	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016932	-	78	53.125	ENSAPEG00000004486	-	96	57.353	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016932	-	93	53.782	ENSAPEG00000016118	-	97	53.913	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016932	-	60	55.147	ENSATEG00000001815	-	96	57.143	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016932	-	71	55.147	ENSATEG00000018051	-	94	62.069	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016932	-	51	50.746	ENSACAG00000022421	-	100	50.746	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000016932	-	63	54.264	ENSACAG00000013623	-	99	54.264	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000016932	-	75	45.865	ENSACLG00000000537	-	98	47.059	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	67	42.975	ENSACLG00000022360	-	96	42.975	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	64	47.794	ENSACLG00000023963	-	97	47.794	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	52	51.961	ENSACLG00000019424	-	96	51.961	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	60	47.826	ENSACLG00000017411	-	87	47.826	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	66	46.207	ENSACLG00000015843	-	93	46.207	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	61	46.512	ENSACLG00000022302	-	94	47.273	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	66	46.324	ENSACLG00000021846	-	87	46.324	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	93	56.835	ENSACLG00000017939	-	97	58.993	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	63	48.120	ENSACLG00000023941	-	93	48.120	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	57	47.059	ENSACLG00000001003	-	88	47.059	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016932	-	57	48.750	ENSAMXG00000033299	-	74	48.750	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016932	-	50	54.331	ENSAMXG00000040630	-	96	53.957	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016932	-	60	54.348	ENSCATG00000016499	ZNF850	89	54.348	Cercocebus_atys
ENSACIG00000016932	-	60	54.348	ENSCSAG00000004194	ZNF850	90	54.348	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000016932	-	60	53.285	ENSCPBG00000001181	-	99	57.983	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000016932	-	51	50.000	ENSCSAVG00000004703	-	100	50.000	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016932	-	50	48.739	ENSCSAVG00000008862	-	100	48.227	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016932	-	53	50.735	ENSCSAVG00000001834	-	100	50.735	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016932	-	53	48.201	ENSCSAVG00000000655	-	99	48.201	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016932	-	60	53.509	ENSCSAVG00000004499	-	100	53.982	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016932	-	50	50.400	ENSCSAVG00000009953	-	99	50.400	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016932	-	64	54.348	ENSCANG00000030007	ZNF850	88	54.348	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000016932	-	75	47.826	ENSEBUG00000005186	-	75	47.826	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000016932	-	83	55.396	ENSEBUG00000014739	-	84	55.396	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000016932	-	50	54.412	ENSEBUG00000009291	-	81	54.412	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000016932	-	55	51.799	ENSEASG00005004513	-	93	51.799	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000016932	-	52	50.420	ENSECAG00000020668	-	96	50.000	Equus_caballus
ENSACIG00000016932	-	93	31.657	ENSELUG00000019880	-	99	50.000	Esox_lucius
ENSACIG00000016932	-	97	50.360	ENSELUG00000021499	-	93	50.360	Esox_lucius
ENSACIG00000016932	-	54	52.212	ENSELUG00000021248	-	84	52.212	Esox_lucius
ENSACIG00000016932	-	55	53.097	ENSGACG00000010393	-	100	53.097	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016932	-	64	63.043	ENSGACG00000013652	-	99	63.043	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016932	-	60	45.455	ENSGACG00000001371	-	100	45.455	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016932	-	93	38.191	ENSGACG00000004549	-	99	59.848	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016932	-	54	61.765	ENSGACG00000004765	-	100	61.765	Gasterosteus_aculeatus
ENSACIG00000016932	-	74	54.348	ENSHBUG00000015803	-	99	54.348	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016932	-	60	46.617	ENSHBUG00000005809	-	97	46.617	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000016932	-	73	39.610	ENSHCOG00000015241	-	74	39.610	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016932	-	93	55.963	ENSLBEG00000013570	-	99	55.963	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016932	-	50	39.098	ENSLACG00000007310	-	99	39.098	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000016932	-	52	53.285	ENSLAFG00000031653	-	99	53.285	Loxodonta_africana
ENSACIG00000016932	-	60	54.348	ENSMMUG00000028781	ZNF850	89	54.348	Macaca_mulatta
ENSACIG00000016932	-	60	54.348	ENSMNEG00000035334	ZNF850	86	54.348	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000016932	-	60	55.372	ENSMLEG00000040920	ZNF850	89	55.372	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000016932	-	72	56.296	ENSMZEG00005028104	-	99	57.009	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016932	-	72	48.921	ENSMZEG00005022718	-	99	48.921	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016932	-	60	47.273	ENSMZEG00005028472	-	91	47.273	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016932	-	71	57.831	ENSMZEG00005022845	-	99	57.831	Maylandia_zebra
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ENSACIG00000016932	-	64	45.385	ENSMZEG00005022671	-	90	45.385	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016932	-	61	45.455	ENSMZEG00005020571	-	82	45.455	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016932	-	51	46.847	ENSMZEG00005019955	-	85	46.847	Maylandia_zebra
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ENSACIG00000016932	-	75	48.113	ENSMZEG00005021390	-	80	48.113	Maylandia_zebra
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ENSACIG00000016932	-	73	50.575	ENSMMOG00000006137	-	97	50.575	Mola_mola
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