EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016958 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-34d22.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-34d22.5
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1462 bases
Position: chrCCOE01000840.1:657966-659427
Accession: ZDB-GENE-131121-578
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021820	MMR_HSR1	PF01926.23	0.00017	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022393	-	669	-	ENSACIP00000021820	222 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	37.349	ENSACIG00000006949	RAB17	71	37.349
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	35.542	ENSACIG00000019251	rab5aa	76	35.542
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	68	35.099	ENSACIG00000008620	rab34a	67	35.099
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	74	42.424	ENSACIG00000010619	rab15	76	42.424
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	41.916	ENSACIG00000014625	-	80	41.916
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	80	34.831	ENSACIG00000019803	rab25a	82	34.831
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	36.145	ENSACIG00000014012	rab22a	83	36.145
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	92	31.731	ENSACIG00000013630	RAB7A	94	31.731
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	71	40.506	ENSACIG00000014094	rab6bb	75	40.506
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	87	64.249	ENSACIG00000003102	rab42a	87	64.249
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	86	57.368	ENSACIG00000000154	RAB39B	88	57.368
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	64	39.716	ENSACIG00000019631	rab11bb	72	39.716
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	67	40.523	ENSACIG00000013119	-	75	39.474
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	74	31.515	ENSACIG00000000670	rabl2	71	31.515
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	79	42.857	ENSACIG00000009006	zgc:171927	80	42.857
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	77	40.351	ENSACIG00000014605	rab6a	78	40.351
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	72	30.818	ENSACIG00000017824	rras	79	30.818
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	36.527	ENSACIG00000009617	rab18a	77	36.527
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	74	40.237	ENSACIG00000006558	-	82	40.237
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	78	33.526	ENSACIG00000000642	rab36	65	33.526
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	72	39.752	ENSACIG00000020616	rab12	64	39.752
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	85	34.375	ENSACIG00000011024	si:dkey-13a21.4	92	34.375
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	69	30.719	ENSACIG00000000100	kras	53	30.120
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	31.481	ENSACIG00000017414	rab25b	96	31.481
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	91	37.438	ENSACIG00000007154	rab6ba	87	37.438
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	71	32.278	ENSACIG00000000699	hrasb	86	31.548
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	83	31.034	ENSACIG00000022208	-	96	31.034
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	32.883	ENSACIG00000024376	-	95	32.883
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	79	37.288	ENSACIG00000024374	rab11ba	65	38.650
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	74	40.237	ENSACIG00000018043	rab9a	82	40.237
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	68	42.384	ENSACIG00000021855	rab33ba	62	42.384
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	56	32.000	ENSACIG00000015128	si:ch73-116o1.2	65	31.655
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	77	43.023	ENSACIG00000009306	RAB15	80	43.023
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	74	39.759	ENSACIG00000023222	-	70	39.759
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	77	39.766	ENSACIG00000010914	RAB41	77	39.766
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	35.542	ENSACIG00000010896	rab5c	91	32.710
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	78	33.908	ENSACIG00000004859	rab34b	71	33.908
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	72	30.247	ENSACIG00000008211	rasd4	76	30.247
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	67	41.333	ENSACIG00000021459	zgc:101559	64	41.333
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	77	42.105	ENSACIG00000008584	rab13	80	42.105
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	86	58.421	ENSACIG00000023837	-	88	58.421
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	43.114	ENSACIG00000019049	rab1ab	80	47.500
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	85	36.598	ENSACIG00000022520	rab33a	85	36.598
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	65	35.417	ENSACIG00000020496	rab23	76	33.962
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	35.185	ENSACIG00000003092	rab11a	95	35.185
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	87	31.373	ENSACIG00000018406	rasl11a	79	31.373
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	73	42.857	ENSACIG00000003157	-	83	42.857
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	82	33.871	ENSACIG00000022381	-	87	33.871
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	34.259	ENSACIG00000017403	rab11al	95	34.259
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	71	30.864	ENSACIG00000009139	dnajc27	58	30.864
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	75	41.916	ENSACIG00000008102	rab18b	80	41.916
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	80	37.234	ENSACIG00000007739	rab9b	91	37.234

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	85.135	ENSATEG00000010784	si:dkey-34d22.5	86	85.135	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	59.556	ENSCPBG00000011236	-	99	59.556	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	75.225	ENSCSEG00000019183	si:dkey-34d22.5	100	75.225	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	84.685	ENSCVAG00000017064	si:dkey-34d22.5	100	84.685	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	83	47.568	ENSDARG00000100379	si:dkey-34d22.2	99	47.568	Danio_rerio
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	60.000	ENSFALG00000001373	-	97	60.000	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	84.753	ENSFHEG00000012041	si:dkey-34d22.5	100	84.753	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	86	65.104	ENSGALG00000000994	-	90	65.104	Gallus_gallus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	86.937	ENSGAFG00000008183	si:dkey-34d22.5	100	86.937	Gambusia_affinis
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	93	58.768	ENSGAGG00000004918	-	99	58.768	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	75.566	ENSHCOG00000015692	si:dkey-34d22.5	99	75.566	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	86.486	ENSKMAG00000012778	si:dkey-34d22.5	100	86.486	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	82.805	ENSLBEG00000002926	si:dkey-34d22.5	100	82.805	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	88	62.755	ENSLACG00000012674	si:dkey-34d22.5	92	62.755	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	98	69.266	ENSLOCG00000003467	si:dkey-34d22.5	99	72.018	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	81.532	ENSMMOG00000006846	si:dkey-34d22.5	100	81.532	Mola_mola
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	82.432	ENSMALG00000013152	si:dkey-34d22.5	100	82.432	Monopterus_albus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	84.163	ENSORLG00000014099	si:dkey-34d22.5	99	84.163	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	84.163	ENSORLG00020020277	si:dkey-34d22.5	99	84.163	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	83.710	ENSORLG00015000142	si:dkey-34d22.5	99	83.710	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	91	89.604	ENSOMEG00000017958	si:dkey-34d22.5	99	86.878	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	71.818	ENSPKIG00000021209	si:dkey-34d22.5	99	71.818	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	91	63.184	ENSPSIG00000006606	-	99	63.184	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	80.995	ENSPMGG00000001298	-	99	80.995	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	92	60.488	ENSPCIG00000022399	-	91	60.488	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	87.387	ENSPFOG00000014499	si:dkey-34d22.5	100	87.387	Poecilia_formosa
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	87.387	ENSPLAG00000007773	si:dkey-34d22.5	100	87.387	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	87.387	ENSPMEG00000012932	si:dkey-34d22.5	100	87.387	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	89	62.437	ENSSHAG00000008520	-	88	62.437	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	97	69.302	ENSSFOG00015012088	rab42	96	69.302	Scleropages_formosus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	87.387	ENSSLDG00000002646	si:dkey-34d22.5	100	87.387	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	99	88.688	ENSSPAG00000012955	si:dkey-34d22.5	99	88.688	Stegastes_partitus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	90	48.500	ENSXETG00000020622	rab39a	96	48.500	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	86.036	ENSXCOG00000008410	si:dkey-34d22.5	100	86.036	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000016958	si:dkey-34d22.5	100	86.036	ENSXMAG00000029317	si:dkey-34d22.5	100	86.036	Xiphophorus_maculatus