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Description

Ensembl ID: ENSACIG00000016982 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: smarca5
Alias: SWI/SNF related|matrix associated|actin dependent regulator of chromatin A5|chunp6878|fb26d12|fb49g04|im:7146484|wu:fb26d12|wu:fb49g04|zgc:158434
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 5
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7654 bases
Position: chrCCOE01000627.1:1596878-1604531
Accession: ZDB-GENE-021125-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021869	ResIII	PF04851.15	5.4e-11	1	1
ENSACIP00000021869	DEAD	PF00270.29	2.6e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022444	-	2706	-	ENSACIP00000021869	901 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000016982	smarca5	66	40.789	ENSACIG00000001164	chd1l	62	42.545
ENSACIG00000016982	smarca5	51	47.458	ENSACIG00000012023	-	90	44.378
ENSACIG00000016982	smarca5	57	41.723	ENSACIG00000018996	hells	84	41.723
ENSACIG00000016982	smarca5	51	38.878	ENSACIG00000018326	smarcad1a	78	38.356
ENSACIG00000016982	smarca5	51	34.257	ENSACIG00000013005	rad54b	57	34.257

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSG00000102038	SMARCA1	85	84.053	Homo_sapiens
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.446	ENSAPOG00000016035	smarca5	97	98.446	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.370	ENSAMEG00000015218	SMARCA1	85	83.279	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.446	ENSAOCG00000015578	smarca5	87	98.446	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.446	ENSAPEG00000011117	smarca5	99	98.345	Amphiprion_percula
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.113	ENSATEG00000012894	smarca5	87	98.113	Anabas_testudineus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.045	ENSAPLG00000013149	SMARCA1	92	84.939	Anas_platyrhynchos
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.363	ENSACAG00000011376	SMARCA1	86	85.255	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000016982	smarca5	99	78.906	ENSANAG00000023098	SMARCA1	85	78.848	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000016982	smarca5	100	99.667	ENSACLG00000025356	smarca5	87	99.667	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.676	ENSAMXG00000011227	smarca1	99	86.007	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	95.006	ENSAMXG00000005709	smarca5	87	95.006	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.382	ENSBTAG00000002292	SMARCA1	83	84.361	Bos_taurus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	65.856	WBGene00002169	isw-1	89	65.111	Caenorhabditis_elegans
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSCJAG00000002868	SMARCA1	85	84.053	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	73.932	ENSCAFG00000018673	SMARCA1	99	75.059	Canis_familiaris
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.375	ENSCAFG00020001751	SMARCA1	85	84.275	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.040	ENSCHIG00000009837	SMARCA1	85	83.942	Capra_hircus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.487	ENSTSYG00000004240	SMARCA1	86	85.880	Carlito_syrichta
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.371	ENSCPOG00000013601	SMARCA1	85	83.278	Cavia_porcellus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	81.250	ENSCCAG00000030817	SMARCA1	85	81.174	Cebus_capucinus
ENSACIG00000016982	smarca5	97	85.436	ENSCATG00000015921	SMARCA1	83	85.532	Cercocebus_atys
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.482	ENSCLAG00000002171	SMARCA1	85	83.389	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSCSAG00000008460	SMARCA1	85	84.053	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.045	ENSCPBG00000001146	SMARCA1	85	84.939	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000016982	smarca5	99	76.770	ENSCING00000004110	swi/snf	89	76.770	Ciona_intestinalis
ENSACIG00000016982	smarca5	99	76.412	ENSCSAVG00000004620	-	99	75.850	Ciona_savignyi
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.263	ENSCANG00000007183	SMARCA1	85	84.164	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.259	ENSCGRG00001010776	Smarca1	85	83.167	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.289	ENSCGRG00000015301	Smarca1	86	84.375	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.225	ENSCSEG00000000328	smarca5	87	97.225	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.558	ENSCVAG00000008668	smarca5	99	97.403	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	82.951	ENSDARG00000012776	smarca1	89	82.863	Danio_rerio
ENSACIG00000016982	smarca5	100	94.340	ENSDARG00000052348	smarca5	87	94.340	Danio_rerio
ENSACIG00000016982	smarca5	97	85.092	ENSDNOG00000004315	SMARCA1	83	85.185	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.977	ENSDORG00000009270	Smarca1	83	85.069	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000016982	smarca5	96	79.540	FBgn0011604	Iswi	90	76.591	Drosophila_melanogaster
ENSACIG00000016982	smarca5	84	79.464	ENSETEG00000017426	SMARCA1	78	79.464	Echinops_telfairi
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.502	ENSEBUG00000001239	smarca5	88	83.408	Eptatretus_burgeri
ENSACIG00000016982	smarca5	99	81.153	ENSEASG00005008218	SMARCA1	92	80.858	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.375	ENSECAG00000012106	SMARCA1	85	84.275	Equus_caballus
ENSACIG00000016982	smarca5	80	86.325	ENSEEUG00000014927	SMARCA1	73	86.325	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.676	ENSELUG00000010515	smarca1	87	85.677	Esox_lucius
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.263	ENSFCAG00000018496	SMARCA1	85	84.164	Felis_catus
ENSACIG00000016982	smarca5	93	86.396	ENSFALG00000000209	SMARCA1	91	86.272	Ficedula_albicollis
ENSACIG00000016982	smarca5	97	83.710	ENSFDAG00000009818	SMARCA1	86	83.790	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.447	ENSFHEG00000007687	smarca5	90	97.390	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000016982	smarca5	97	86.452	ENSGALG00000008431	SMARCA1	87	86.333	Gallus_gallus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.224	ENSGAFG00000017731	smarca5	87	98.224	Gambusia_affinis
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.045	ENSGAGG00000023575	SMARCA1	93	84.939	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000016982	smarca5	74	80.165	ENSGGOG00000012841	-	81	80.198	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.185	ENSHGLG00000003080	SMARCA1	85	83.167	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.185	ENSHGLG00100001102	SMARCA1	90	83.167	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.669	ENSHCOG00000005458	smarca5	87	97.669	Hippocampus_comes
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.899	ENSIPUG00000016905	Smarca1	92	84.795	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	95.078	ENSIPUG00000005229	SMARCA5	89	94.895	Ictalurus_punctatus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.929	ENSSTOG00000014524	SMARCA1	88	83.832	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.259	ENSJJAG00000002593	Smarca1	85	83.167	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.558	ENSKMAG00000003777	smarca5	87	97.558	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000016982	smarca5	94	96.679	ENSLBEG00000013295	SMARCA1	100	97.089	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016982	smarca5	100	96.670	ENSLBEG00000018112	smarca5	87	96.670	Labrus_bergylta
ENSACIG00000016982	smarca5	99	86.067	ENSLACG00000016697	SMARCA1	88	85.953	Latimeria_chalumnae
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.922	ENSLOCG00000014591	smarca1	88	85.809	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.594	ENSLAFG00000000896	SMARCA1	90	83.499	Loxodonta_africana
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSMFAG00000002117	SMARCA1	86	85.532	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000016982	smarca5	97	85.436	ENSMMUG00000008818	SMARCA1	90	85.532	Macaca_mulatta
ENSACIG00000016982	smarca5	97	85.436	ENSMNEG00000041768	SMARCA1	86	85.532	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSMLEG00000043198	SMARCA1	85	84.053	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.335	ENSMAMG00000014294	smarca5	87	98.335	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	99.667	ENSMZEG00005009369	smarca5	87	99.667	Maylandia_zebra
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.811	ENSMGAG00000007042	SMARCA1	90	83.716	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.404	ENSMAUG00000008133	Smarca1	82	84.491	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.375	ENSMICG00000015768	SMARCA1	85	84.275	Microcebus_murinus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	82.924	ENSMOCG00000009464	Smarca1	85	82.835	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000016982	smarca5	100	96.337	ENSMMOG00000005547	smarca5	91	96.337	Mola_mola
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.916	ENSMODG00000013187	-	87	84.812	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.002	ENSMALG00000002081	smarca5	87	98.002	Monopterus_albus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.371	MGP_CAROLIEiJ_G0033034	Smarca1	85	83.278	Mus_caroli
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.371	ENSMUSG00000031099	Smarca1	85	83.278	Mus_musculus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.690	MGP_PahariEiJ_G0031579	Smarca1	83	84.722	Mus_pahari
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.371	MGP_SPRETEiJ_G0034192	Smarca1	85	83.278	Mus_spretus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.260	ENSMPUG00000017423	SMARCA1	81	83.169	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000016982	smarca5	99	81.978	ENSMLUG00000029614	SMARCA1	86	81.679	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.748	ENSNGAG00000006492	Smarca1	82	84.838	Nannospalax_galili
ENSACIG00000016982	smarca5	100	99.556	ENSNBRG00000004463	smarca5	91	99.556	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.633	ENSNLEG00000015179	SMARCA1	86	84.722	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000016982	smarca5	93	76.325	ENSMEUG00000008819	SMARCA1	90	76.285	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000016982	smarca5	97	83.597	ENSODEG00000012163	SMARCA1	83	83.676	Octodon_degus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	99.445	ENSONIG00000009993	smarca5	87	99.445	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.491	ENSOANG00000002862	SMARCA1	93	85.382	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.040	ENSOCUG00000001047	SMARCA1	85	83.942	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.336	ENSORLG00000021998	smarca5	87	97.336	Oryzias_latipes
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.336	ENSORLG00020017679	smarca5	87	97.336	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.336	ENSORLG00015017210	smarca5	87	97.336	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.447	ENSOMEG00000000086	smarca5	87	97.447	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.598	ENSOGAG00000004399	SMARCA1	83	84.589	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.040	ENSOARG00000014638	SMARCA1	92	83.942	Ovis_aries
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSPPAG00000034647	SMARCA1	85	84.053	Pan_paniscus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.375	ENSPPRG00000008929	SMARCA1	85	84.275	Panthera_pardus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	82.256	ENSPTIG00000000915	SMARCA1	89	82.174	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSPTRG00000049876	SMARCA1	83	85.532	Pan_troglodytes
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSPANG00000003871	SMARCA1	85	84.053	Papio_anubis
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.151	ENSPKIG00000013411	smarca1	89	84.050	Paramormyrops_kingsleyae
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.045	ENSPSIG00000010101	SMARCA1	93	84.939	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000016982	smarca5	97	84.518	ENSPEMG00000017503	Smarca1	82	84.606	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.379	ENSPCIG00000015460	SMARCA1	88	85.144	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.113	ENSPFOG00000007649	smarca5	87	98.113	Poecilia_formosa
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.113	ENSPLAG00000003363	smarca5	87	98.113	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.224	ENSPMEG00000019849	smarca5	87	98.224	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.224	ENSPREG00000023250	smarca5	87	98.224	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000016982	smarca5	99	81.027	ENSPPYG00000020703	SMARCA1	85	80.952	Pongo_abelii
ENSACIG00000016982	smarca5	78	76.453	ENSPCOG00000020722	SMARCA1	83	80.331	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000016982	smarca5	90	83.742	ENSPVAG00000003805	SMARCA1	77	83.837	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000016982	smarca5	57	100.000	ENSPNYG00000012299	smarca5	78	100.000	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000016982	smarca5	99	83.036	ENSRNOG00000003762	Smarca1	85	82.946	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.263	ENSRROG00000034167	SMARCA1	85	84.164	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSSBOG00000020641	SMARCA1	92	84.053	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000016982	smarca5	100	81.174	ENSSHAG00000013518	SMARCA1	92	81.174	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000016982	smarca5	99	85.347	ENSSFOG00015009043	smarca1	88	85.239	Scleropages_formosus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	93.296	ENSSFOG00015016794	smarca5	93	93.230	Scleropages_formosus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	96.892	ENSSMAG00000004801	smarca5	87	96.892	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.669	ENSSDUG00000020690	smarca5	87	97.669	Seriola_dumerili
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.669	ENSSLDG00000025190	smarca5	87	97.669	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000016982	smarca5	89	84.074	ENSSARG00000000842	SMARCA1	80	84.074	Sorex_araneus
ENSACIG00000016982	smarca5	97	85.829	ENSSPUG00000000590	SMARCA1	85	85.714	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.446	ENSSPAG00000002894	smarca5	95	98.446	Stegastes_partitus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.152	ENSSSCG00000012649	SMARCA1	87	84.053	Sus_scrofa
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.933	ENSTGUG00000003899	-	92	84.828	Taeniopygia_guttata
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.003	ENSTRUG00000014094	smarca5	87	97.003	Takifugu_rubripes
ENSACIG00000016982	smarca5	100	97.780	ENSTNIG00000017717	smarca5	86	97.780	Tetraodon_nigroviridis
ENSACIG00000016982	smarca5	97	82.579	ENSTBEG00000014973	SMARCA1	88	82.648	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000016982	smarca5	97	80.882	ENSTTRG00000006168	SMARCA1	88	80.822	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.263	ENSUAMG00000020201	SMARCA1	85	84.164	Ursus_americanus
ENSACIG00000016982	smarca5	99	80.469	ENSUMAG00000004073	SMARCA1	92	80.046	Ursus_maritimus
ENSACIG00000016982	smarca5	76	87.021	ENSVPAG00000010492	-	70	87.543	Vicugna_pacos
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.375	ENSVVUG00000008878	SMARCA1	90	85.764	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000016982	smarca5	99	84.865	ENSXETG00000001526	smarca1	90	84.761	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.002	ENSXCOG00000011170	smarca5	89	98.002	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000016982	smarca5	100	98.002	ENSXMAG00000009678	smarca5	94	97.735	Xiphophorus_maculatus