EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017013 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6457 bases
Position: chrCCOE01000088.1:5513-11969
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000021873	zf-C2H2	PF00096.26	4e-32	1	6
ENSACIP00000021873	zf-C2H2	PF00096.26	4e-32	2	6
ENSACIP00000021873	zf-C2H2	PF00096.26	4e-32	3	6
ENSACIP00000021873	zf-C2H2	PF00096.26	4e-32	4	6
ENSACIP00000021873	zf-C2H2	PF00096.26	4e-32	5	6
ENSACIP00000021873	zf-C2H2	PF00096.26	4e-32	6	6
ENSACIP00000021873	zf-met	PF12874.7	2.9e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022448	-	1062	-	ENSACIP00000021873	353 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSACIG00000017013	-	73	59.286	ENSACIG00000016944	-	98	59.286
ENSACIG00000017013	-	74	40.493	ENSACIG00000003720	-	97	40.493
ENSACIG00000017013	-	56	48.120	ENSACIG00000003515	-	98	48.120
ENSACIG00000017013	-	57	40.541	ENSACIG00000015411	-	83	40.541
ENSACIG00000017013	-	80	48.221	ENSACIG00000018022	-	86	47.826
ENSACIG00000017013	-	77	37.405	ENSACIG00000003694	znf131	54	37.405
ENSACIG00000017013	-	52	45.122	ENSACIG00000010739	-	82	45.122
ENSACIG00000017013	-	79	54.491	ENSACIG00000024444	-	83	58.363
ENSACIG00000017013	-	83	53.333	ENSACIG00000023162	-	82	53.333
ENSACIG00000017013	-	52	45.802	ENSACIG00000009128	-	71	45.802
ENSACIG00000017013	-	62	51.754	ENSACIG00000019815	-	99	51.754
ENSACIG00000017013	-	53	44.538	ENSACIG00000007855	-	88	44.538
ENSACIG00000017013	-	64	46.789	ENSACIG00000009180	znf652	50	44.586
ENSACIG00000017013	-	81	45.783	ENSACIG00000001860	-	87	45.783
ENSACIG00000017013	-	51	50.376	ENSACIG00000019447	-	68	50.376
ENSACIG00000017013	-	77	54.357	ENSACIG00000016932	-	73	54.357
ENSACIG00000017013	-	57	50.476	ENSACIG00000014123	znf236	62	50.476
ENSACIG00000017013	-	80	51.176	ENSACIG00000013470	-	93	51.176
ENSACIG00000017013	-	61	34.562	ENSACIG00000016133	-	74	34.562
ENSACIG00000017013	-	54	40.541	ENSACIG00000002190	gfi1b	65	40.541
ENSACIG00000017013	-	52	46.328	ENSACIG00000009780	-	74	46.328
ENSACIG00000017013	-	54	38.636	ENSACIG00000014282	znf526	75	35.795
ENSACIG00000017013	-	80	44.444	ENSACIG00000000360	si:ch211-241b2.1	98	44.444
ENSACIG00000017013	-	67	45.833	ENSACIG00000006755	-	93	45.833
ENSACIG00000017013	-	77	59.859	ENSACIG00000004666	-	98	60.870
ENSACIG00000017013	-	52	40.000	ENSACIG00000014233	znf407	66	40.000
ENSACIG00000017013	-	53	44.615	ENSACIG00000007882	-	81	44.615
ENSACIG00000017013	-	61	42.222	ENSACIG00000023313	-	91	42.222
ENSACIG00000017013	-	52	58.586	ENSACIG00000000286	-	74	58.586
ENSACIG00000017013	-	80	40.656	ENSACIG00000015835	-	88	52.809
ENSACIG00000017013	-	78	58.235	ENSACIG00000019791	-	93	62.722
ENSACIG00000017013	-	55	51.282	ENSACIG00000022738	-	98	47.239
ENSACIG00000017013	-	73	53.759	ENSACIG00000018952	-	95	53.759
ENSACIG00000017013	-	67	46.324	ENSACIG00000019804	-	82	46.324
ENSACIG00000017013	-	85	53.968	ENSACIG00000017050	-	99	57.310
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ENSACIG00000017013	-	51	51.587	ENSACIG00000015429	-	74	51.587
ENSACIG00000017013	-	72	39.855	ENSACIG00000008611	-	60	39.855
ENSACIG00000017013	-	55	43.846	ENSACIG00000001369	-	82	43.846
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ENSACIG00000017013	-	81	49.112	ENSACIG00000019102	-	61	49.112
ENSACIG00000017013	-	55	49.425	ENSACIG00000004626	-	84	49.425
ENSACIG00000017013	-	82	58.491	ENSACIG00000011153	-	99	61.404
ENSACIG00000017013	-	65	36.782	ENSACIG00000004096	PRDM15	53	37.952
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ENSACIG00000017013	-	79	55.714	ENSACIG00000010966	-	69	55.714
ENSACIG00000017013	-	80	57.092	ENSACIG00000019710	-	89	57.092
ENSACIG00000017013	-	53	57.803	ENSACIG00000018440	-	96	57.803
ENSACIG00000017013	-	76	45.732	ENSACIG00000009717	-	93	45.732
ENSACIG00000017013	-	83	51.462	ENSACIG00000011515	-	99	51.462
ENSACIG00000017013	-	80	59.036	ENSACIG00000016182	-	93	59.036
ENSACIG00000017013	-	54	44.242	ENSACIG00000000406	prdm5	81	44.242
ENSACIG00000017013	-	80	53.933	ENSACIG00000004041	-	97	53.933
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ENSACIG00000017013	-	52	40.000	ENSACIG00000012604	scrt2	50	40.000
ENSACIG00000017013	-	80	55.488	ENSACIG00000013604	-	98	61.340
ENSACIG00000017013	-	54	43.636	ENSACIG00000011516	-	82	43.636
ENSACIG00000017013	-	71	59.596	ENSACIG00000000311	-	80	59.596
ENSACIG00000017013	-	78	51.389	ENSACIG00000010647	-	99	51.389
ENSACIG00000017013	-	59	42.012	ENSACIG00000012263	znf319b	95	40.000
ENSACIG00000017013	-	56	45.455	ENSACIG00000017644	-	88	45.455
ENSACIG00000017013	-	78	41.228	ENSACIG00000023049	znf646	99	37.805
ENSACIG00000017013	-	50	39.860	ENSACIG00000002180	-	99	39.860
ENSACIG00000017013	-	53	44.304	ENSACIG00000017892	-	81	44.304
ENSACIG00000017013	-	80	37.500	ENSACIG00000006806	-	80	37.500
ENSACIG00000017013	-	79	51.190	ENSACIG00000023212	-	94	51.190
ENSACIG00000017013	-	74	43.382	ENSACIG00000004641	-	76	43.382
ENSACIG00000017013	-	53	49.390	ENSACIG00000023794	-	72	49.390
ENSACIG00000017013	-	83	63.529	ENSACIG00000006172	-	99	60.588
ENSACIG00000017013	-	54	45.000	ENSACIG00000013163	-	77	45.000
ENSACIG00000017013	-	53	37.576	ENSACIG00000019534	-	86	37.576
ENSACIG00000017013	-	58	42.945	ENSACIG00000017683	-	73	41.135
ENSACIG00000017013	-	79	57.143	ENSACIG00000004745	-	96	54.745
ENSACIG00000017013	-	53	53.226	ENSACIG00000003754	-	87	53.226
ENSACIG00000017013	-	53	47.706	ENSACIG00000020938	zbtb47b	70	47.706
ENSACIG00000017013	-	53	52.657	ENSACIG00000012084	-	96	54.194
ENSACIG00000017013	-	88	53.804	ENSACIG00000017647	-	99	56.000
ENSACIG00000017013	-	54	39.344	ENSACIG00000002944	-	87	39.344
ENSACIG00000017013	-	50	48.256	ENSACIG00000009809	si:dkey-77f5.14	78	48.256
ENSACIG00000017013	-	80	51.351	ENSACIG00000008448	-	96	51.351
ENSACIG00000017013	-	81	47.195	ENSACIG00000022625	-	99	56.934
ENSACIG00000017013	-	57	39.286	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	59	34.419
ENSACIG00000017013	-	52	40.336	ENSACIG00000018641	snai2	66	40.336
ENSACIG00000017013	-	80	58.242	ENSACIG00000022658	-	93	58.209
ENSACIG00000017013	-	80	49.780	ENSACIG00000018059	-	76	51.786
ENSACIG00000017013	-	71	39.683	ENSACIG00000012636	ZNF319	99	39.683
ENSACIG00000017013	-	53	64.286	ENSACIG00000010660	-	99	64.286
ENSACIG00000017013	-	59	40.000	ENSACIG00000013613	scrt1b	55	40.000
ENSACIG00000017013	-	51	42.614	ENSACIG00000017653	-	93	42.614
ENSACIG00000017013	-	52	50.420	ENSACIG00000009755	-	74	50.420
ENSACIG00000017013	-	89	54.938	ENSACIG00000003556	-	96	54.938
ENSACIG00000017013	-	53	51.497	ENSACIG00000010637	-	91	51.497
ENSACIG00000017013	-	52	44.865	ENSACIG00000018404	-	75	44.865
ENSACIG00000017013	-	56	41.727	ENSACIG00000008886	znf1164	90	41.727

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017013	-	54	49.112	ENSAMXG00000035683	-	91	49.112	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017013	-	75	37.895	ENSCPBG00000002063	-	79	37.895	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017013	-	81	40.418	ENSGAFG00000019035	-	66	40.767	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017013	-	54	49.419	ENSGAGG00000005331	-	80	49.419	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000017013	-	69	51.240	ENSGAGG00000017640	-	73	51.240	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000017013	-	60	46.479	ENSHCOG00000001292	-	86	46.479	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017013	-	58	47.260	ENSLBEG00000011040	-	62	47.260	Labrus_bergylta
ENSACIG00000017013	-	75	53.237	ENSORLG00020001707	-	98	52.414	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000017013	-	52	56.643	ENSPCIG00000019333	-	86	56.643	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000017013	-	86	41.667	ENSPFOG00000011209	-	66	42.029	Poecilia_formosa
ENSACIG00000017013	-	71	46.185	ENSPFOG00000024567	-	99	57.831	Poecilia_formosa
ENSACIG00000017013	-	82	40.418	ENSPLAG00000010906	-	62	40.767	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000017013	-	79	44.828	ENSPMEG00000016762	-	98	44.828	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000017013	-	82	40.418	ENSPMEG00000023302	-	62	40.767	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000017013	-	54	50.532	ENSPNAG00000009741	-	59	50.532	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000017013	-	55	51.479	ENSPNAG00000008491	-	76	51.479	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000017013	-	52	49.412	ENSPNAG00000018409	-	85	49.412	Pygocentrus_nattereri