EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSACIG00000017099 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: zmp:0000001000
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Amphilophus_citrinellus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 44623 bases
Position: chrCCOE01000438.1:245625-290247
Accession: ZDB-GENE-130530-1003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSACIP00000022007	MIF4G	PF02854.19	3.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSACIT00000022587	-	2031	-	ENSACIP00000022007	676 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.196	ENSG00000134030	CTIF	100	53.343	Homo_sapiens
ENSACIG00000017099	ctif	100	64.380	ENSAPOG00000020192	ctif	100	77.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSACIG00000017099	ctif	78	55.476	ENSAMEG00000006759	CTIF	79	54.352	Ailuropoda_melanoleuca
ENSACIG00000017099	ctif	100	81.657	ENSAOCG00000014275	ctif	100	82.275	Amphiprion_ocellaris
ENSACIG00000017099	ctif	100	85.143	ENSAPEG00000016975	ctif	100	85.449	Amphiprion_percula
ENSACIG00000017099	ctif	100	85.613	ENSATEG00000016752	ctif	100	85.328	Anabas_testudineus
ENSACIG00000017099	ctif	99	59.856	ENSACAG00000018006	CTIF	100	60.000	Anolis_carolinensis
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.901	ENSANAG00000024925	CTIF	100	52.841	Aotus_nancymaae
ENSACIG00000017099	ctif	100	90.143	ENSACLG00000005956	ctif	100	90.143	Astatotilapia_calliptera
ENSACIG00000017099	ctif	50	67.733	ENSAMXG00000015964	ctif	100	65.661	Astyanax_mexicanus
ENSACIG00000017099	ctif	91	87.500	ENSBTAG00000018901	CTIF	98	87.500	Bos_taurus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.295	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	52.436	Callithrix_jacchus
ENSACIG00000017099	ctif	97	52.915	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	52.564	Canis_familiaris
ENSACIG00000017099	ctif	97	52.838	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	52.632	Canis_lupus_dingo
ENSACIG00000017099	ctif	99	52.975	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	51.831	Capra_hircus
ENSACIG00000017099	ctif	81	54.498	ENSTSYG00000030461	CTIF	67	61.413	Carlito_syrichta
ENSACIG00000017099	ctif	99	49.364	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	48.599	Cavia_aperea
ENSACIG00000017099	ctif	99	52.247	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	51.321	Cavia_porcellus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.152	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	52.292	Cebus_capucinus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.912	ENSCATG00000038134	CTIF	98	63.415	Cercocebus_atys
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.957	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	52.924	Chinchilla_lanigera
ENSACIG00000017099	ctif	99	52.999	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	52.168	Chlorocebus_sabaeus
ENSACIG00000017099	ctif	88	89.583	ENSCPBG00000025654	CTIF	70	89.583	Chrysemys_picta_bellii
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.617	ENSCANG00000030916	CTIF	100	55.752	Colobus_angolensis_palliatus
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.793	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	53.485	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSACIG00000017099	ctif	99	51.179	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	49.860	Cricetulus_griseus_crigri
ENSACIG00000017099	ctif	100	79.066	ENSCSEG00000019857	ctif	100	80.481	Cynoglossus_semilaevis
ENSACIG00000017099	ctif	100	77.983	ENSCVAG00000017158	ctif	100	78.409	Cyprinodon_variegatus
ENSACIG00000017099	ctif	99	72.394	ENSDARG00000090617	ctif	100	71.072	Danio_rerio
ENSACIG00000017099	ctif	68	54.979	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	53.942	Dasypus_novemcinctus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.201	ENSDORG00000003221	Ctif	100	51.040	Dipodomys_ordii
ENSACIG00000017099	ctif	78	87.500	ENSEASG00005016094	CTIF	81	87.500	Equus_asinus_asinus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.989	ENSECAG00000020473	CTIF	100	52.908	Equus_caballus
ENSACIG00000017099	ctif	77	57.195	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	55.738	Erinaceus_europaeus
ENSACIG00000017099	ctif	99	66.892	ENSELUG00000008733	ctif	100	67.072	Esox_lucius
ENSACIG00000017099	ctif	88	87.500	ENSFCAG00000000664	CTIF	98	87.500	Felis_catus
ENSACIG00000017099	ctif	99	52.817	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	51.972	Fukomys_damarensis
ENSACIG00000017099	ctif	100	78.200	ENSFHEG00000004334	ctif	99	90.385	Fundulus_heteroclitus
ENSACIG00000017099	ctif	88	89.583	ENSGALG00000035912	-	71	89.583	Gallus_gallus
ENSACIG00000017099	ctif	89	90.385	ENSGAFG00000011896	ctif	99	90.385	Gambusia_affinis
ENSACIG00000017099	ctif	61	56.440	ENSGAGG00000020663	CTIF	86	62.921	Gopherus_agassizii
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.043	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	53.191	Gorilla_gorilla
ENSACIG00000017099	ctif	100	90.286	ENSHBUG00000018092	ctif	100	90.286	Haplochromis_burtoni
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.746	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	52.738	Heterocephalus_glaber_female
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.746	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	52.738	Heterocephalus_glaber_male
ENSACIG00000017099	ctif	84	69.859	ENSHCOG00000011784	ctif	94	70.112	Hippocampus_comes
ENSACIG00000017099	ctif	99	52.654	ENSSTOG00000001967	CTIF	88	62.881	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSACIG00000017099	ctif	99	52.354	ENSJJAG00000013706	Ctif	99	51.136	Jaculus_jaculus
ENSACIG00000017099	ctif	100	77.871	ENSKMAG00000014651	ctif	100	78.992	Kryptolebias_marmoratus
ENSACIG00000017099	ctif	99	67.779	ENSLOCG00000011697	ctif	100	67.536	Lepisosteus_oculatus
ENSACIG00000017099	ctif	99	47.418	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	77.652	Loxodonta_africana
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.912	ENSMFAG00000037903	CTIF	98	63.415	Macaca_fascicularis
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.912	ENSMMUG00000020898	CTIF	98	63.415	Macaca_mulatta
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.912	ENSMNEG00000039395	CTIF	98	63.415	Macaca_nemestrina
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.617	ENSMLEG00000041132	CTIF	98	63.415	Mandrillus_leucophaeus
ENSACIG00000017099	ctif	100	84.539	ENSMAMG00000014741	ctif	100	84.539	Mastacembelus_armatus
ENSACIG00000017099	ctif	89	88.854	ENSMZEG00005019767	ctif	90	88.854	Maylandia_zebra
ENSACIG00000017099	ctif	78	89.583	ENSMGAG00000001378	CTIF	92	89.583	Meleagris_gallopavo
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.339	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	52.900	Mesocricetus_auratus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.638	ENSMICG00000010167	CTIF	100	52.496	Microcebus_murinus
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.481	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	53.182	Microtus_ochrogaster
ENSACIG00000017099	ctif	100	83.138	ENSMMOG00000000831	ctif	100	83.138	Mola_mola
ENSACIG00000017099	ctif	99	51.293	ENSMODG00000003464	CTIF	91	64.917	Monodelphis_domestica
ENSACIG00000017099	ctif	66	88.462	ENSMALG00000020553	ctif	99	88.462	Monopterus_albus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.047	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	51.923	Mus_caroli
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.030	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	51.781	Mus_musculus
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.701	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	53.399	Mus_pahari
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.315	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	88	87.500	Mus_spretus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.627	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	52.916	Mustela_putorius_furo
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.704	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	52.782	Myotis_lucifugus
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.208	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	52.908	Nannospalax_galili
ENSACIG00000017099	ctif	100	85.429	ENSNBRG00000008679	ctif	100	85.429	Neolamprologus_brichardi
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.759	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	52.908	Nomascus_leucogenys
ENSACIG00000017099	ctif	99	48.494	ENSMEUG00000000218	CTIF	82	87.500	Notamacropus_eugenii
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.228	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	52.443	Ochotona_princeps
ENSACIG00000017099	ctif	99	52.859	ENSODEG00000018390	CTIF	100	51.872	Octodon_degus
ENSACIG00000017099	ctif	99	75.931	ENSONIG00000007750	ctif	100	75.215	Oreochromis_niloticus
ENSACIG00000017099	ctif	79	45.499	ENSOANG00000001337	CTIF	99	46.230	Ornithorhynchus_anatinus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.076	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	52.292	Oryctolagus_cuniculus
ENSACIG00000017099	ctif	100	78.451	ENSORLG00000005786	ctif	100	78.732	Oryzias_latipes
ENSACIG00000017099	ctif	100	78.754	ENSORLG00020005385	ctif	100	78.612	Oryzias_latipes_hni
ENSACIG00000017099	ctif	100	79.178	ENSORLG00015011872	ctif	100	79.037	Oryzias_latipes_hsok
ENSACIG00000017099	ctif	100	78.702	ENSOMEG00000007917	ctif	100	79.267	Oryzias_melastigma
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.714	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	52.924	Otolemur_garnettii
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.067	ENSOARG00000003754	CTIF	100	51.915	Ovis_aries
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.043	ENSPPAG00000023554	CTIF	98	63.415	Pan_paniscus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.704	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	52.550	Panthera_pardus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.419	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	52.266	Panthera_tigris_altaica
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.043	ENSPTRG00000010009	CTIF	98	63.415	Pan_troglodytes
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.617	ENSPANG00000017087	CTIF	98	63.415	Papio_anubis
ENSACIG00000017099	ctif	88	87.500	ENSPSIG00000006508	CTIF	98	87.500	Pelodiscus_sinensis
ENSACIG00000017099	ctif	100	75.620	ENSPMGG00000022958	ctif	100	71.367	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.208	ENSPEMG00000022746	Ctif	60	63.934	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSACIG00000017099	ctif	72	54.832	ENSPCIG00000026247	CTIF	97	63.665	Phascolarctos_cinereus
ENSACIG00000017099	ctif	100	78.200	ENSPFOG00000009243	ctif	100	77.778	Poecilia_formosa
ENSACIG00000017099	ctif	100	78.340	ENSPLAG00000019171	ctif	100	78.059	Poecilia_latipinna
ENSACIG00000017099	ctif	100	78.340	ENSPMEG00000020089	ctif	100	77.918	Poecilia_mexicana
ENSACIG00000017099	ctif	100	77.119	ENSPREG00000017326	ctif	100	77.401	Poecilia_reticulata
ENSACIG00000017099	ctif	79	57.522	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	56.460	Pongo_abelii
ENSACIG00000017099	ctif	99	51.631	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	50.780	Propithecus_coquereli
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.339	ENSPVAG00000001965	CTIF	100	53.485	Pteropus_vampyrus
ENSACIG00000017099	ctif	100	90.286	ENSPNYG00000007879	ctif	100	90.286	Pundamilia_nyererei
ENSACIG00000017099	ctif	99	71.049	ENSPNAG00000029174	ctif	100	71.534	Pygocentrus_nattereri
ENSACIG00000017099	ctif	99	54.208	ENSRNOG00000018342	Ctif	90	66.456	Rattus_norvegicus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.901	ENSRBIG00000043937	CTIF	100	53.050	Rhinopithecus_bieti
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.617	ENSRROG00000006039	CTIF	100	52.908	Rhinopithecus_roxellana
ENSACIG00000017099	ctif	88	86.000	ENSSBOG00000028468	CTIF	99	86.000	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSACIG00000017099	ctif	99	51.153	ENSSHAG00000016321	CTIF	91	65.278	Sarcophilus_harrisii
ENSACIG00000017099	ctif	99	68.215	ENSSFOG00015022594	ctif	100	68.713	Scleropages_formosus
ENSACIG00000017099	ctif	100	80.938	ENSSMAG00000005707	ctif	100	82.698	Scophthalmus_maximus
ENSACIG00000017099	ctif	100	84.935	ENSSDUG00000016033	ctif	100	86.906	Seriola_dumerili
ENSACIG00000017099	ctif	55	90.591	ENSSLDG00000007282	ctif	100	84.751	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSACIG00000017099	ctif	84	89.583	ENSSPUG00000014734	CTIF	99	54.282	Sphenodon_punctatus
ENSACIG00000017099	ctif	100	67.903	ENSSPAG00000003721	ctif	100	72.468	Stegastes_partitus
ENSACIG00000017099	ctif	99	53.143	ENSSSCG00000004506	CTIF	100	51.989	Sus_scrofa
ENSACIG00000017099	ctif	64	64.634	ENSTBEG00000002613	CTIF	74	64.634	Tupaia_belangeri
ENSACIG00000017099	ctif	99	51.209	ENSTTRG00000004347	CTIF	100	50.071	Tursiops_truncatus
ENSACIG00000017099	ctif	87	49.106	ENSUAMG00000007299	CTIF	88	48.371	Ursus_americanus
ENSACIG00000017099	ctif	88	87.500	ENSUMAG00000002735	CTIF	98	87.500	Ursus_maritimus
ENSACIG00000017099	ctif	86	90.625	ENSVVUG00000014347	CTIF	98	85.417	Vulpes_vulpes
ENSACIG00000017099	ctif	73	68.015	ENSXETG00000026836	ctif	73	68.015	Xenopus_tropicalis
ENSACIG00000017099	ctif	57	74.390	ENSXCOG00000002477	ctif	98	73.016	Xiphophorus_couchianus
ENSACIG00000017099	ctif	100	77.589	ENSXMAG00000004236	ctif	100	78.895	Xiphophorus_maculatus